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基本情報
登録情報 | データベース: SASBDB / ID: SASDCL7 |
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![]() | Truncated monomeric Cytohesin-3 (Grp1; amino acids 63-390)
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機能・相同性 | ![]() Intra-Golgi traffic / Golgi vesicle transport / establishment of epithelial cell polarity / regulation of ARF protein signal transduction / phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate binding / positive regulation of cell adhesion / bicellular tight junction / ruffle / guanyl-nucleotide exchange factor activity / adherens junction ...Intra-Golgi traffic / Golgi vesicle transport / establishment of epithelial cell polarity / regulation of ARF protein signal transduction / phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate binding / positive regulation of cell adhesion / bicellular tight junction / ruffle / guanyl-nucleotide exchange factor activity / adherens junction / nucleoplasm / plasma membrane / cytoplasm / cytosol 類似検索 - 分子機能 |
生物種 | ![]() ![]() |
![]() | ![]() タイトル: Structural Dynamics Control Allosteric Activation of Cytohesin Family Arf GTPase Exchange Factors. 著者: Andrew W Malaby / Sanchaita Das / Srinivas Chakravarthy / Thomas C Irving / Osman Bilsel / David G Lambright / ![]() 要旨: Membrane dynamic processes including vesicle biogenesis depend on Arf guanosine triphosphatase (GTPase) activation by guanine nucleotide exchange factors (GEFs) containing a catalytic Sec7 domain and ...Membrane dynamic processes including vesicle biogenesis depend on Arf guanosine triphosphatase (GTPase) activation by guanine nucleotide exchange factors (GEFs) containing a catalytic Sec7 domain and a membrane-targeting module such as a pleckstrin homology (PH) domain. The catalytic output of cytohesin family Arf GEFs is controlled by autoinhibitory interactions that impede accessibility of the exchange site in the Sec7 domain. These restraints can be relieved through activator Arf-GTP binding to an allosteric site comprising the PH domain and proximal autoinhibitory elements (Sec7-PH linker and C-terminal helix). Small-angle X-ray scattering and negative-stain electron microscopy were used to investigate the structural organization and conformational dynamics of cytohesin-3 (Grp1) in autoinhibited and active states. The results support a model in which hinge dynamics in the autoinhibited state expose the activator site for Arf-GTP binding, while subsequent C-terminal helix unlatching and repositioning unleash conformational entropy in the Sec7-PH linker to drive exposure of the exchange site. |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
-Data source
SASBDBのページ | ![]() |
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-関連構造データ
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外部リンク
「今月の分子」の関連する項目 |
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-モデル
モデル #1550 | ![]() タイプ: mix / ソフトウェア: (CORAL05) / 対称性: P1 コメント: Sec7 and PH domains derived from 2R09; MSE converted to MET カイ2乗値: 1.24 / P-value: 0.003800 ![]() |
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モデル #1551 | ![]() タイプ: mix / ソフトウェア: (2.1) / 対称性: P1 コメント: Sec7 and PH domains derived from 2R09; MSE converted to MET カイ2乗値: 1.079 / P-value: 0.004000 ![]() |
モデル #1552 | ![]() タイプ: mix / ソフトウェア: (2.1) / 対称性: P1 コメント: Sec7 and PH domains derived from 2R09; MSE converted to MET カイ2乗値: 1.079 / P-value: 0.004000 ![]() |
モデル #1553 | ![]() タイプ: mix / ソフトウェア: (2.1) / 対称性: P1 コメント: Sec7 and PH domains derived from 2R09; MSE converted to MET カイ2乗値: 1.079 / P-value: 0.004000 ![]() |
モデル #1554 | ![]() タイプ: dummy / ソフトウェア: (r2835) / ダミー原子の半径: 2.00 A / 対称性: P1 / コメント: Most representative of 100 dammif models / カイ2乗値: 2.579236 / P-value: 0.000960 ![]() |
モデル #1555 | ![]() タイプ: dummy / ダミー原子の半径: 2.25 A / 対称性: P1 コメント: Filtered average of 10 filtered averages of 10 dammif models カイ2乗値: 2.579236 / P-value: 0.000960 ![]() |
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試料
![]() | 名称: Truncated monomeric Cytohesin-3 (Grp1; amino acids 63-390) 試料濃度: 2 mg/ml |
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バッファ | 名称: 20 mM Tris, 150 mM NaCl, 2 mM MgCl2, 0.001 mM inositol 1,3,4,5-tetrakisphosphate pH: 8 |
要素 #790 | 名称: Cyth3 / タイプ: protein / 記述: Cytohesin-3 / 分子量: 40.355 / 分子数: 1 / 由来: Mus musculus / 参照: UniProt: O08967 配列: MGHHHHHHGS TTQRNAQIAM GRKKFNMDPK KGIQFLIEND LLQSSPEDVA QFLYKGEGLN KTVIGDYLGE RDDFNIKVLQ AFVELHEFAD LNLVQALRQF LWSFRLPGEA QKIDRMMEAF ASRYCLCNPG VFQSTDTCYV LSFAIIMLNT SLHNHNVRDK PTAERFITMN ...配列: MGHHHHHHGS TTQRNAQIAM GRKKFNMDPK KGIQFLIEND LLQSSPEDVA QFLYKGEGLN KTVIGDYLGE RDDFNIKVLQ AFVELHEFAD LNLVQALRQF LWSFRLPGEA QKIDRMMEAF ASRYCLCNPG VFQSTDTCYV LSFAIIMLNT SLHNHNVRDK PTAERFITMN RGINEGGDLP EELLRNLYES IKNEPFKIPE DDGNDLTYTF FNPDREGWLL KLGGRVKTWK RRWFILTDNC LYYFEYTTDK EPRGIIPLEN LSIREVEDPR KPNCFELYNP SHKGQVIKAC KTEADGRVVE GNHVVYRISA PSPEEKEEWM KSIKASISRD PFYDMLATRK RRIANKK |
-実験情報
ビーム | 設備名称: Advanced Photon Source (APS) BioCAT 18ID / 地域: Argonne, IL / 国: USA ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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検出器 | 名称: MAR 165 CCD | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
スキャン | 測定日: 2013年3月21日 / セル温度: 20 °C / 照射時間: 1 sec. / フレーム数: 1 / 単位: 1/A /
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距離分布関数 P(R) |
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結果 |
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