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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 6pzk | ||||||
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タイトル | Cryo-EM Structure of the Respiratory Syncytial Virus Polymerase (L) Protein Bound by the Tetrameric Phosphoprotein (P) | ||||||
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![]() | VIRAL PROTEIN / RNA-binding protein / RSV / RdRp / RNA-dependent RNA polymerase / PRNTase / polyribonucleotidyl transferase / RNA capping / viral replication | ||||||
機能・相同性 | ![]() NNS virus cap methyltransferase / GDP polyribonucleotidyltransferase / Respiratory syncytial virus genome transcription / Translation of respiratory syncytial virus mRNAs / negative stranded viral RNA replication / Respiratory syncytial virus genome replication / RSV-host interactions / Maturation of hRSV A proteins / Assembly and release of respiratory syncytial virus (RSV) virions / Respiratory syncytial virus (RSV) attachment and entry ...NNS virus cap methyltransferase / GDP polyribonucleotidyltransferase / Respiratory syncytial virus genome transcription / Translation of respiratory syncytial virus mRNAs / negative stranded viral RNA replication / Respiratory syncytial virus genome replication / RSV-host interactions / Maturation of hRSV A proteins / Assembly and release of respiratory syncytial virus (RSV) virions / Respiratory syncytial virus (RSV) attachment and entry / 加水分解酵素; 酸無水物に作用; リン含有酸無水物に作用 / viral life cycle / virion component / mRNA 5'-cap (guanine-N7-)-methyltransferase activity / host cell cytoplasm / RNA-directed RNA polymerase / RNA-dependent RNA polymerase activity / GTPase activity / ATP binding / metal ion binding 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | 電子顕微鏡法 / 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.2 Å | ||||||
![]() | Gilman, M.S.A. / McLellan, J.S. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Structure of the Respiratory Syncytial Virus Polymerase Complex. 著者: Morgan S A Gilman / Cheng Liu / Amy Fung / Ishani Behera / Paul Jordan / Peter Rigaux / Nina Ysebaert / Sergey Tcherniuk / Julien Sourimant / Jean-François Eléouët / Priscila Sutto-Ortiz / ...著者: Morgan S A Gilman / Cheng Liu / Amy Fung / Ishani Behera / Paul Jordan / Peter Rigaux / Nina Ysebaert / Sergey Tcherniuk / Julien Sourimant / Jean-François Eléouët / Priscila Sutto-Ortiz / Etienne Decroly / Dirk Roymans / Zhinan Jin / Jason S McLellan / ![]() ![]() ![]() 要旨: Numerous interventions are in clinical development for respiratory syncytial virus (RSV) infection, including small molecules that target viral transcription and replication. These processes are ...Numerous interventions are in clinical development for respiratory syncytial virus (RSV) infection, including small molecules that target viral transcription and replication. These processes are catalyzed by a complex comprising the RNA-dependent RNA polymerase (L) and the tetrameric phosphoprotein (P). RSV P recruits multiple proteins to the polymerase complex and, with the exception of its oligomerization domain, is thought to be intrinsically disordered. Despite their critical roles in RSV transcription and replication, structures of L and P have remained elusive. Here, we describe the 3.2-Å cryo-EM structure of RSV L bound to tetrameric P. The structure reveals a striking tentacular arrangement of P, with each of the four monomers adopting a distinct conformation. The structure also rationalizes inhibitor escape mutants and mutations observed in live-attenuated vaccine candidates. These results provide a framework for determining the molecular underpinnings of RSV replication and transcription and should facilitate the design of effective RSV inhibitors. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
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構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 328.3 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 244.7 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 923.2 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 933.9 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 48 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 74.8 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 254482.750 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() 株: A2 / 細胞株 (発現宿主): Sf9 発現宿主: ![]() ![]() 参照: UniProt: P28887, RNA-directed RNA polymerase, mRNA (guanine-N7)-methyltransferase, 転移酵素; リンを含む基を移すもの; 核酸を移すもの, GDP polyribonucleotidyltransferase |
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#2: タンパク質 | 分子量: 29062.895 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() 株: A2 / 細胞株 (発現宿主): Sf9 発現宿主: ![]() ![]() 参照: UniProt: P03421 |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 電子顕微鏡法 |
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EM実験 | 試料の集合状態: PARTICLE / 3次元再構成法: 単粒子再構成法 |
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試料調製
構成要素 | 名称: Respiratory Syncytial Virus Polymerase (L) Protein Bound by the Tetrameric Phosphoprotein (P) タイプ: COMPLEX / Entity ID: all / 由来: RECOMBINANT | |||||||||||||||||||||||||
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分子量 | 値: 0.37 MDa / 実験値: NO | |||||||||||||||||||||||||
由来(天然) | 生物種: ![]() | |||||||||||||||||||||||||
由来(組換発現) | 生物種: ![]() ![]() | |||||||||||||||||||||||||
緩衝液 | pH: 8 | |||||||||||||||||||||||||
緩衝液成分 |
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試料 | 濃度: 0.29 mg/ml / 包埋: NO / シャドウイング: NO / 染色: NO / 凍結: YES | |||||||||||||||||||||||||
試料支持 | グリッドの材料: GOLD | |||||||||||||||||||||||||
急速凍結 | 装置: FEI VITROBOT MARK IV / 凍結剤: ETHANE |
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電子顕微鏡撮影
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |
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顕微鏡 | モデル: FEI TITAN KRIOS |
電子銃 | 電子線源: ![]() |
電子レンズ | モード: BRIGHT FIELD |
撮影 | 電子線照射量: 48 e/Å2 / 検出モード: COUNTING フィルム・検出器のモデル: GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k) |
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解析
EMソフトウェア |
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CTF補正 | タイプ: PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION | |||||||||||||||
対称性 | 点対称性: C1 (非対称) | |||||||||||||||
3次元再構成 | 解像度: 3.2 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 粒子像の数: 196720 / 対称性のタイプ: POINT |