ChemComp-HMU: 5-HYDROXYMETHYL URACIL

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: HMU
• 名称: 名称: 5-hydroxymethyl uracil / 別称: 5-(HYDROXYMETHYL)PYRIMIDINE-2,4(1H,3H)-DIONE / 日化辞名称: 5-ヒドロキシメチルウラシル

Chemical information

組成

組成式: C₅H₆N₂O₃ / 原子数: 16 / 化学式量: 142.113 / 形式電荷: 0

• その他: タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: HMU

履歴

作成	2003年3月19日
記述子を修正	2011年6月4日
Modify synonyms	2021年3月13日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / BindingDB / Brenda / ChEBI / ChEMBL / ChemicalBook / CompTox / HMDB / KEGG_Ligand / Metabolights / NMRShiftDB / 日化辞 / PubChem / PubChem_TPharma / Rhea / SureChEMBL / ZINC / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 10.04: O=C1C(=CNC(=O)N1)CO
• CACTVS 3.341: OCC1=CNC(=O)NC1=O
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: C1=C(C(=O)NC(=O)N1)CO

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.341: OCC1=CNC(=O)NC1=O
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: C1=C(C(=O)NC(=O)N1)CO

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C5H6N2O3/c8-2-3-1-6-5(10)7-4(3)9/h1,8H,2H2,(H2,6,7,9,10)

InChIKey

• InChI 1.03: JDBGXEHEIRGOBU-UHFFFAOYSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 10.04: 5-(hydroxymethyl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: 5-(hydroxymethyl)-1H-pyrimidine-2,4-dione

PDBエントリ

全3件を表示しています

PDB-1oe6:
Xenopus SMUG1, an anti-mutator uracil-DNA Glycosylase

PDB-4fnc:
Human TDG in a post-reactive complex with 5-hydroxymethyluracil (5hmU)

PDB-5c3r:
Crystal structure of the full-length Neurospora crassa T7H in complex with alpha-KG and 5-hydroxymethyluracil (5hmU)