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- EMDB-40619: cryo-EM structure of sea urchin sperm doublet microtubule (48-nm ... -

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基本情報

登録情報
データベース: EMDB / ID: EMD-40619
タイトルcryo-EM structure of sea urchin sperm doublet microtubule (48-nm periodicity)
マップデータ
試料
  • 細胞器官・細胞要素: sea urchin sperm doublet microtubule
    • タンパク質・ペプチド: x 55種
  • リガンド: x 3種
キーワードsperm / doublet microtubule / DMT / microtubule inner protein / cilia / flagella / FAP / CFAP / MIP / MAP / cytoskeleton / tublin / sea urchin / TEX / Tektin / SAXO / ODF / SPATA / RIB / STRUCTURAL PROTEIN
機能・相同性
機能・相同性情報


: / cilium-dependent cell motility / regulation of cilium beat frequency involved in ciliary motility / cilium movement involved in cell motility / axoneme assembly / axonemal microtubule / cilium organization / nucleoside-diphosphate kinase / UTP biosynthetic process / CTP biosynthetic process ...: / cilium-dependent cell motility / regulation of cilium beat frequency involved in ciliary motility / cilium movement involved in cell motility / axoneme assembly / axonemal microtubule / cilium organization / nucleoside-diphosphate kinase / UTP biosynthetic process / CTP biosynthetic process / motile cilium / positive regulation of cell motility / GTP biosynthetic process / nucleoside diphosphate kinase activity / ciliary base / regulation of neuron projection development / axoneme / microtubule-based process / mitotic cytokinesis / cilium assembly / alpha-tubulin binding / sperm flagellum / phosphatase binding / Hsp70 protein binding / phosphorylation / mitotic spindle organization / acrosomal vesicle / ciliary basal body / Hsp90 protein binding / structural constituent of cytoskeleton / mitotic spindle / microtubule cytoskeleton organization / microtubule cytoskeleton / mitotic cell cycle / protein-folding chaperone binding / spermatogenesis / microtubule binding / vesicle / microtubule / calmodulin binding / cytoskeleton / hydrolase activity / neuron projection / GTPase activity / centrosome / calcium ion binding / GTP binding / positive regulation of transcription by RNA polymerase II / ATP binding / nucleus / plasma membrane / cytoplasm / cytosol
類似検索 - 分子機能
Coiled-coil domain-containing protein 81 / Testicular haploid expressed repeat / Uncharacterised protein family C20orf85 / Protein of unknown function DUF4562 / Testis-expressed protein 33 / Protein of unknown function DUF4586 / Hemingway/CFA97 / CFAP97 domain-containing protein 1/2 / Testicular haploid expressed gene protein-like / Hemingway/CFA97 ...Coiled-coil domain-containing protein 81 / Testicular haploid expressed repeat / Uncharacterised protein family C20orf85 / Protein of unknown function DUF4562 / Testis-expressed protein 33 / Protein of unknown function DUF4586 / Hemingway/CFA97 / CFAP97 domain-containing protein 1/2 / Testicular haploid expressed gene protein-like / Hemingway/CFA97 / Testicular haploid expressed repeat / Normal lung function maintenance, Low in Lung Cancer 1 protein / Domain of unknown function (DUF4562) / Cilia-and flagella-associated protein 96 / Testis-expressed sequence 33 protein family / Repeats in THEG (testicular haploid expressed gene) and several fly proteins. / Protein phosphatase 1 regulatory subunit 32 / Testis, prostate and placenta-expressed protein / Testis-expressed protein 49 / Protein phosphatase 1 regulatory subunit 32 / Protein of unknown function DUF1143 / Protein of unknown function DUF4541 / Protein of unknown function DUF4513 / CCDC81, HU domain 1 / CCDC81, HU domain 2 / Cilia- and flagella-associated protein 68 / CCDC81 eukaryotic HU domain 1 / Sperm-associated microtubule inner protein 10 / Cilia and flagella associated protein 90 / CCDC81 eukaryotic HU domain 2 / Sperm-tail PG-rich repeat / Coiled-coil domain-containing protein 105 / Sperm-tail PG-rich repeat / FAM183 family / FAM183A and FAM183B related / Sperm-associated antigen 8 / Cilia- and flagella-associated protein 95 / NDPK7, first NDPk domain / Cilia- and flagella-associated protein 107 / Protein CFAP95 / Tektin / Cilia- and flagella-associated protein 276 / Tektin family / Protein of unknown function (DUF3695) / Cilia- and flagella-associated protein 77 / Cilia- and flagella-associated protein 77 / Uncharacterised protein FAM166/UPF0605 / Protein Flattop / Ciliary microtubule inner protein 2B-like / Nucleoside diphosphate kinase 7 / Meiosis-specific nuclear structural protein 1 / Piercer of microtubule wall 1/2 / Cilia- and flagella-associated protein 141 / Cilia- and flagella-associated protein 45 / NDPK7, second NDPk domain / Cilia- and flagella- associated protein 210 / CFAP53/TCHP / Trichohyalin-plectin-homology domain / Trichohyalin-plectin-homology domain / Piercer of microtubule wall 1/2 / Cilia- and flagella-associated protein 141 / RIB43A / RIB43A / DM10 domain / EF-hand domain-containing protein EFHC1/EFHC2/EFHB / DM10 domain / DM10 domain profile. / Domains in hypothetical proteins in Drosophila, C. elegans and mammals. Occurs singly in some nucleoside diphosphate kinases. / Enkurin domain / Calmodulin-binding / Enkurin domain profile. / CFA20 domain / Cilia- and flagella-associated protein 20/CFAP20DC / CFA20 domain / Parkin co-regulated protein / Parkin co-regulated protein / Nucleoside diphosphate kinase, active site / Nucleoside diphosphate kinase (NDPK) active site signature. / Nucleoside diphosphate kinase / Nucleoside diphosphate kinase-like domain / Nucleoside diphosphate kinase / NDK / Nucleoside diphosphate kinase-like domain superfamily / Alpha tubulin / Tubulin-beta mRNA autoregulation signal. / Beta tubulin, autoregulation binding site / Beta tubulin / Tubulin / Tubulin, C-terminal / Tubulin C-terminal domain / Tubulin, conserved site / Tubulin subunits alpha, beta, and gamma signature. / Tubulin/FtsZ family, C-terminal domain / Tubulin/FtsZ-like, C-terminal domain / Tubulin/FtsZ, C-terminal / Tubulin/FtsZ, 2-layer sandwich domain / Tubulin/FtsZ family, GTPase domain / Tubulin/FtsZ family, GTPase domain / Tubulin/FtsZ, GTPase domain / Tubulin/FtsZ, GTPase domain superfamily
類似検索 - ドメイン・相同性
Uncharacterized protein / Uncharacterized protein / Uncharacterized protein / Cilia- and flagella-associated protein 97 / Uncharacterized protein / Uncharacterized protein / Protein FAM166B / Uncharacterized protein / Flagellar FliJ protein / TEPP protein ...Uncharacterized protein / Uncharacterized protein / Uncharacterized protein / Cilia- and flagella-associated protein 97 / Uncharacterized protein / Uncharacterized protein / Protein FAM166B / Uncharacterized protein / Flagellar FliJ protein / TEPP protein / Sperm-associated antigen 8 / Cilia- and flagella-associated protein 126 / Cilia- and flagella-associated protein 45 / Meiosis-specific nuclear structural protein 1 / Uncharacterized protein / Tubulin beta chain / Cilia- and flagella-associated protein 52 / Protein phosphatase 1 regulatory subunit 32 / Coiled-coil domain-containing protein 81 / Cilia- and flagella-associated protein 161 / Uncharacterized protein / Uncharacterized protein / Uncharacterized protein / Coiled-coil domain-containing protein 105 / Outer dense fiber protein 3 / RIB43A-like with coiled-coils protein 2 / Uncharacterized protein / Meiosis-specific nuclear structural protein 1 / Uncharacterized protein / Trichohyalin-plectin-homology domain-containing protein / Uncharacterized protein / EF-hand domain-containing protein / Uncharacterized protein / Testicular haploid expressed gene protein-like / Enkurin domain-containing protein / Tubulin alpha chain / Uncharacterized protein / Uncharacterized protein / Trichohyalin-plectin-homology domain-containing protein / EF-hand domain-containing family member C2 / Uncharacterized protein / Uncharacterized protein / Outer dense fiber protein 3 / CFA20 domain-containing protein / Nucleoside diphosphate kinase / Tektin / Uncharacterized protein / Cilia- and flagella-associated protein 77 / Uncharacterized protein / Uncharacterized protein / Uncharacterized protein / Tektin / Flagellar protofilament ribbon protein rib74 / Tektin
類似検索 - 構成要素
生物種Strongylocentrotus purpuratus (ムラサキウニ) / purple sea urchin (ムラサキウニ)
手法単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.3 Å
データ登録者Zeng J / Zhang R
資金援助 米国, 1件
OrganizationGrant number国
National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS)1R01GM138854 米国
引用ジャーナル: Cell / 年: 2023
タイトル: Structural specializations of the sperm tail.
著者: Miguel Ricardo Leung / Jianwei Zeng / Xiangli Wang / Marc C Roelofs / Wei Huang / Riccardo Zenezini Chiozzi / Johannes F Hevler / Albert J R Heck / Susan K Dutcher / Alan Brown / Rui Zhang / ...著者: Miguel Ricardo Leung / Jianwei Zeng / Xiangli Wang / Marc C Roelofs / Wei Huang / Riccardo Zenezini Chiozzi / Johannes F Hevler / Albert J R Heck / Susan K Dutcher / Alan Brown / Rui Zhang / Tzviya Zeev-Ben-Mordehai /
要旨: Sperm motility is crucial to reproductive success in sexually reproducing organisms. Impaired sperm movement causes male infertility, which is increasing globally. Sperm are powered by a microtubule- ...Sperm motility is crucial to reproductive success in sexually reproducing organisms. Impaired sperm movement causes male infertility, which is increasing globally. Sperm are powered by a microtubule-based molecular machine-the axoneme-but it is unclear how axonemal microtubules are ornamented to support motility in diverse fertilization environments. Here, we present high-resolution structures of native axonemal doublet microtubules (DMTs) from sea urchin and bovine sperm, representing external and internal fertilizers. We identify >60 proteins decorating sperm DMTs; at least 15 are sperm associated and 16 are linked to infertility. By comparing DMTs across species and cell types, we define core microtubule inner proteins (MIPs) and analyze evolution of the tektin bundle. We identify conserved axonemal microtubule-associated proteins (MAPs) with unique tubulin-binding modes. Additionally, we identify a testis-specific serine/threonine kinase that links DMTs to outer dense fibers in mammalian sperm. Our study provides structural foundations for understanding sperm evolution, motility, and dysfunction at a molecular level.
履歴
登録2023年4月26日-
ヘッダ(付随情報) 公開2023年6月28日-
マップ公開2023年6月28日-
更新2023年6月28日-
現状2023年6月28日処理サイト: RCSB / 状態: 公開

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構造の表示

添付画像

emd_40619.png

ダウンロードとリンク

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マップ

ファイルダウンロード / ファイル: emd_40619.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 512 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
ボクセルのサイズX=Y=Z: 1.34 Å
密度
表面レベルBy SOFTWARE: 6.63
最小 - 最大0.0 - 26.701248
平均 (標準偏差)0.24355884 (±1.1436546)
対称性空間群: 1
詳細

EMDB XML:

マップ形状
Axis orderXYZ
Origin000
サイズ512512512
Spacing512512512
セルA=B=C: 686.08 Å
α=β=γ: 90.0 °

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添付データ

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追加マップ: #1

ファイルemd_40619_additional_1.map
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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ハーフマップ: #1

ファイルemd_40619_half_map_1.map
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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ハーフマップ: #2

ファイルemd_40619_half_map_2.map
投影像・断面図
軸ZYX

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断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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試料の構成要素

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全体 : sea urchin sperm doublet microtubule

全体名称: sea urchin sperm doublet microtubule
要素
  • 細胞器官・細胞要素: sea urchin sperm doublet microtubule
    • タンパク質・ペプチド: CFAP96(C4orf47)
    • タンパク質・ペプチド: Coiled-coil domain-containing protein 105
    • タンパク質・ペプチド: Coiled-coil domain-containing protein 81
    • タンパク質・ペプチド: FAM166C
    • タンパク質・ペプチド: Protein FAM166B
    • タンパク質・ペプチド: CFAP144(FAM183A)
    • タンパク質・ペプチド: Outer dense fiber protein 3
    • タンパク質・ペプチド: Tex33
    • タンパク質・ペプチド: C20Orf85
    • タンパク質・ペプチド: ATP6V1FNB
    • タンパク質・ペプチド: Tex26(LOC100888047)
    • タンパク質・ペプチド: Meiosis-specific nuclear structural protein 1
    • タンパク質・ペプチド: Enkurin domain-containing protein
    • タンパク質・ペプチド: CFAP107
    • タンパク質・ペプチド: Cilia- and flagella-associated protein 126
    • タンパク質・ペプチド: Flagellar FliJ protein
    • タンパク質・ペプチド: Meiosis-specific nuclear structural protein 1
    • タンパク質・ペプチド: Cilia- and flagella-associated protein 161
    • タンパク質・ペプチド: CFA20 domain-containing protein
    • タンパク質・ペプチド: CFAP21
    • タンパク質・ペプチド: Trichohyalin-plectin-homology domain-containing protein
    • タンパク質・ペプチド: CFAP276
    • タンパク質・ペプチド: Cilia- and flagella-associated protein 45
    • タンパク質・ペプチド: Cilia- and flagella-associated protein 52
    • タンパク質・ペプチド: Trichohyalin-plectin-homology domain-containing protein
    • タンパク質・ペプチド: Nucleoside diphosphate kinase
    • タンパク質・ペプチド: Cilia- and flagella-associated protein 77
    • タンパク質・ペプチド: Cilia- and flagella-associated protein 97
    • タンパク質・ペプチド: HeLo_like_N(LOC577943)
    • タンパク質・ペプチド: Outer dense fiber protein 3
    • タンパク質・ペプチド: PACRG
    • タンパク質・ペプチド: Pierce1
    • タンパク質・ペプチド: Protein phosphatase 1 regulatory subunit 32
    • タンパク質・ペプチド: RIB35
    • タンパク質・ペプチド: RIB43A-like with coiled-coils protein 2
    • タンパク質・ペプチド: EF-hand domain-containing family member C2
    • タンパク質・ペプチド: Flagellar protofilament ribbon protein rib74
    • タンパク質・ペプチド: SAXO3(LOC115918676)
    • タンパク質・ペプチド: TEPP protein
    • タンパク質・ペプチド: SPATA48
    • タンパク質・ペプチド: Sperm-associated antigen 8
    • タンパク質・ペプチド: Testicular haploid expressed gene protein-like
    • タンパク質・ペプチド: Tektin A1
    • タンパク質・ペプチド: Tektin B1
    • タンパク質・ペプチド: Tektin C1
    • タンパク質・ペプチド: Tex43
    • タンパク質・ペプチド: Tex36(CFAP95, C9orf135)
    • タンパク質・ペプチド: CFAP90(C5orf49)
    • タンパク質・ペプチド: Tex49
    • タンパク質・ペプチド: Tex49_homologue(LOC580808)
    • タンパク質・ペプチド: CFAP68(UPF0686, C11orf1)
    • タンパク質・ペプチド: SPATA45
    • タンパク質・ペプチド: C4orf45
    • タンパク質・ペプチド: Tubulin alpha chain
    • タンパク質・ペプチド: Tubulin beta chain
  • リガンド: GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE
  • リガンド: MAGNESIUM ION
  • リガンド: GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE

+
超分子 #1: sea urchin sperm doublet microtubule

超分子名称: sea urchin sperm doublet microtubule / タイプ: organelle_or_cellular_component / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#55
由来(天然)生物種: Strongylocentrotus purpuratus (ムラサキウニ)

+
分子 #1: CFAP96(C4orf47)

分子名称: CFAP96(C4orf47) / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: purple sea urchin (ムラサキウニ)
分子量理論値: 33.406297 KDa
配列文字列: MSGKTDMERI GLFQEMGYVS IGDRYVPPGS KAFNEAAGKS KQMLPGGSKV RSALQAGYFD DKYTRVFESE GYSDAVKRRR QDRLKESKK NIGKAFLPSS GEKLMSGLGN HYGTLSGPVP ALSPVKKAGK AHKSDGKNVI TNPSKKGTGY GYPGLTLGKG I TYSPNAYD ...文字列:
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+
分子 #2: Coiled-coil domain-containing protein 105

分子名称: Coiled-coil domain-containing protein 105 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / コピー数: 4 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: purple sea urchin (ムラサキウニ)
分子量理論値: 49.945527 KDa
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+
分子 #3: Coiled-coil domain-containing protein 81

分子名称: Coiled-coil domain-containing protein 81 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 3 / コピー数: 9 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: purple sea urchin (ムラサキウニ)
分子量理論値: 79.691844 KDa
配列文字列: MTEVLSELVS DAKRHKFSTI PKLSDDDIVS VWENVANFVE RHMALQKGVQ IHGLGTFTFT QKKIDIGNNK FILIQRPVFV LSEKFAQTH RLSYTKHFTS GQVPIVQLNF AVLSNESPFD RDSVEGCVRE VLQALSRAVQ SKRNVEFSFT GIGRLTIRDS K VKMKFYKD ...文字列:
MTEVLSELVS DAKRHKFSTI PKLSDDDIVS VWENVANFVE RHMALQKGVQ IHGLGTFTFT QKKIDIGNNK FILIQRPVFV LSEKFAQTH RLSYTKHFTS GQVPIVQLNF AVLSNESPFD RDSVEGCVRE VLQALSRAVQ SKRNVEFSFT GIGRLTIRDS K VKMKFYKD FLTMMDGSGH LVEALKNRPD TADSVLSRAS VFRPSTSGTL VLPRITQGAG KDGFSFENGE AERQMPAIEE AR EYEEQEE ARLEYAPNQE DEGLGKEIEE EARKKPATPM RPSSRQVIPT AKATSIGFLD DLAPSPRPQS RGLKGTPSPP PGK PPSPKG ELPPPRLAAE IRESLANEAE AMERAESASC SHAHEKAGQE LCYLCHQRAV RNVPVSFESE RRRKEQEQDR LLQQ FQHLK DTESILRDQA QNMSNKHHSQ KIAAFNLGVS EAIKNKQKER STEFNRSYVF QNRARTPPRF LKQEEYATDL GSQVE AKAV DKIKRRQDTD FLERLEQVQL AEELSAQRER YLRDKHQQTD MYRKALSAQV RFKPLPLPGA VADSKEPIFG KFDATN EQL AERRRRAIEV FQDQISTVEN RRKNNLTNHV KTQNDETDML EKTRRELIAD RAARFEQAFQ TRKSLEETWK EADALKK SR EEEQVLKLQS SGILLHEQCD QYHRCEQCLR VLKNCGESNI WSESRYIPGS RLIM

+
分子 #4: FAM166C

分子名称: FAM166C / タイプ: protein_or_peptide / ID: 4 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: purple sea urchin (ムラサキウニ)
分子量理論値: 23.728354 KDa
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MSRSAGTLQT THQATYIPPR LMPGYKGHCP TMKFDYGETY GNATAKCLQD YRSTTLNNSK TNYSNGGQFP TVYTHNPDQV IGARDRTRE RFRTTPQYSL SNVNHDRKED INHFDKLAQE QREHYKDRTG TVGRVNEFLI PRSAQEMYHQ DSALIDEHVD M REEASTNM ARNIPVERMS IPPIRTFSKS STVRDRAMRD VHYEHR

+
分子 #5: Protein FAM166B

分子名称: Protein FAM166B / タイプ: protein_or_peptide / ID: 5 / コピー数: 4 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: purple sea urchin (ムラサキウニ)
分子量理論値: 48.701172 KDa
配列文字列: MTSTIGCSRR AMFTFSVSFI HSHTSSVLNN QEIKSYKSQY NSTALIHDRK DIVRTYLRTS ERLFWSFEEK NMAKTSDSKT VAVQTNPNI PTGKSVLTNA EHYHTPGYCG FCPQFKFQIG ETFGRTTTRL LKDPSVPKSQ RTVLANIKPI SPGYPDRNTP A GRELLFQS ...文字列:
MTSTIGCSRR AMFTFSVSFI HSHTSSVLNN QEIKSYKSQY NSTALIHDRK DIVRTYLRTS ERLFWSFEEK NMAKTSDSKT VAVQTNPNI PTGKSVLTNA EHYHTPGYCG FCPQFKFQIG ETFGRTTTRL LKDPSVPKSQ RTVLANIKPI SPGYPDRNTP A GRELLFQS RKTSFGDQKF TEQMVPGYTG YIPKSQHYYG NRYAEECREA IATFEQDQQA ERKKRNTMKT VQQVQSGKLK PS KLPEETS VCRTCPLRQL PEVKPVRFNY ASANEKQHYM SPYYMKDENP QKKFMSGYTG YVPNARDVTG VGYPILTNRA LVK FTNDPN HPMVTGPPEG KGCTADTTGN VPVGCPVRTC QTSGKMPPME EKIIDEMRRL CGRQLPVIYP IESGLVPHYT GHIP GEKFR YGTTFGHSTR NAKREPNKKS NRTT

+
分子 #6: CFAP144(FAM183A)

分子名称: CFAP144(FAM183A) / タイプ: protein_or_peptide / ID: 6 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: purple sea urchin (ムラサキウニ)
分子量理論値: 16.431441 KDa
配列文字列:
MAAAQAKKPE KDPVNIVHQN AILCETIKKE NECQRLYTNY SINPFKKMYT LTGKPNSLHD SADGEEDDNF LRIIKRSTQE PGKKFEFPQ TEAQEVGWYY KPLLPQDRGD KRIHYPRQNT EITKYMDEAW KQKEQQENLQ

+
分子 #7: Outer dense fiber protein 3

分子名称: Outer dense fiber protein 3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 7 / コピー数: 13 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: purple sea urchin (ムラサキウニ)
分子量理論値: 27.28083 KDa
配列文字列: MNSSNYTPTI PRAPIAAHFT GPGPNVMLPS CLGNGTAINK REMPQFSFGV RHKSYSTDYS PGPCHNFPAG VTRKGNDGTP KYSLYARSK ELTAFKTPGP GSYSPEKAGR SAHLHAPEHT FGSRTKGITF DKSPAPNNYS LPSILGGRSC VKPSKPVYSM R GRNKMGGF ...文字列:
MNSSNYTPTI PRAPIAAHFT GPGPNVMLPS CLGNGTAINK REMPQFSFGV RHKSYSTDYS PGPCHNFPAG VTRKGNDGTP KYSLYARSK ELTAFKTPGP GSYSPEKAGR SAHLHAPEHT FGSRTKGITF DKSPAPNNYS LPSILGGRSC VKPSKPVYSM R GRNKMGGF DEDLQKTPGP GSYDVVDPAI YKNKSPMYSI TGRNQLPCDS TRKPGPGQHS PEKVTVNKRM APKFSFGVPH SQ YTTPLII QSDY

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分子 #8: Tex33

分子名称: Tex33 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 8 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: purple sea urchin (ムラサキウニ)
分子量理論値: 40.544223 KDa
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+
分子 #9: C20Orf85

分子名称: C20Orf85 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 9 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: purple sea urchin (ムラサキウニ)
分子量理論値: 23.738551 KDa
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MQAVNLKKNP NYVHIAERWK DHVRHEHRAW RNWPERWGFI TNEYTRMYKR LRGEQVSPDP EDKYFYDDCE RDGERESSVG PDESISRRF HPSDQSVSPS HSGAKLKHAS AYSDLPNIIN GSSWKERQSP NSTSIETVVN VTDIDVAHKA KSEKLPTIKT A PPAGYART TASLIGWKQA NKLETFGRNA KGYKGILKQF NWPMQGIM

+
分子 #10: ATP6V1FNB

分子名称: ATP6V1FNB / タイプ: protein_or_peptide / ID: 10 / コピー数: 5 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: purple sea urchin (ムラサキウニ)
分子量理論値: 21.973307 KDa
配列文字列:
MGELFDVQRQ NFWTESIHKE AYTRLAWHEK YSKEFARESR EGGQAAVARK KRPDMVPKVK LIPVQSLKTK KTKKAADKTD ASKAQENSK KELEKIAGKD PNALLVEMRP VTSDVREQLF KGFSKEGTGR YAYLQMRKLK KPEMKYEVPL TSSWEYGWRL N DVVKEFRA PTYGRSRIVK DSFFRTNGIF

+
分子 #11: Tex26(LOC100888047)

分子名称: Tex26(LOC100888047) / タイプ: protein_or_peptide / ID: 11 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: purple sea urchin (ムラサキウニ)
分子量理論値: 19.625033 KDa
配列文字列:
MPNSGFQGQI NQSFYGTHKA HLVPLGDQYV SGNLPNPAFW RRFIRDPVSS IENPSGTRVL TTTEVLAPVW QSNNCAANLS KNDRATSNT LPRLHTSSTW TTNEGSDHAP LRPQVPSSAR GRFRDAHIPL VALNSLAPFA TTYKPTCGYF FSRSTNNKKK Q MGIPATDL VKYRYYVK

+
分子 #12: Meiosis-specific nuclear structural protein 1

分子名称: Meiosis-specific nuclear structural protein 1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 12 / コピー数: 4 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: purple sea urchin (ムラサキウニ)
分子量理論値: 17.323562 KDa
配列文字列:
MSQQQYHWEA LRKQRVIDRR LAAMKKMTDE ERQMEELSTE GMARDELQSR QMDHAKRREL AEQIQHRDRR GIRNSYKERE QTIQKLVSE RTWHDNLIAK MDQSEKDDLL KDLLRDHAQK SKTLRDRGVY RGDAKFFIDP QYN

+
分子 #13: Enkurin domain-containing protein

分子名称: Enkurin domain-containing protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 13 / コピー数: 4 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: purple sea urchin (ムラサキウニ)
分子量理論値: 30.122543 KDa
配列文字列: MATMYGQQES IYNLIPQEEV KQEKQARYTS KFRGNVKVEE KTKKTSSKTM GPAKVELKKP EEFHKKHSKE PQLPPKTKFS YPDEETKRP AVPKRDEKPL MGLKSNKNFV NTNAVENIMS VPKKPAANFV DTVNGATHPL TPSGLMPKYV KKKGYGEVPT Y LQQRNEEV ...文字列:
MATMYGQQES IYNLIPQEEV KQEKQARYTS KFRGNVKVEE KTKKTSSKTM GPAKVELKKP EEFHKKHSKE PQLPPKTKFS YPDEETKRP AVPKRDEKPL MGLKSNKNFV NTNAVENIMS VPKKPAANFV DTVNGATHPL TPSGLMPKYV KKKGYGEVPT Y LQQRNEEV QRAQEEYDEY IKEHYRRGAM KCLTEEERKA IMDGLKKNWE EIHHQYQGLS VVTDTAPKKA RKERMEAEMK QL ERDIELL EKHKVIYISN H

+
分子 #14: CFAP107

分子名称: CFAP107 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 14 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: purple sea urchin (ムラサキウニ)
分子量理論値: 27.343648 KDa
配列文字列: MAHGDPQKWN LPGWRIEQRY AGNVLIGNWS EERQKFGRGG EKHTSTHRMD YLNNRNFAPD VMTRRAAKMR NEGLDQTLLF AHHNKNLKN NLISWYDEQF NKRERSGGDQ LPELRHWDGQ KLAWEPEKTD HPVKGAPTNF GLKDRLQEKW KTEEADKKLS D YSTTYGLD ...文字列:
MAHGDPQKWN LPGWRIEQRY AGNVLIGNWS EERQKFGRGG EKHTSTHRMD YLNNRNFAPD VMTRRAAKMR NEGLDQTLLF AHHNKNLKN NLISWYDEQF NKRERSGGDQ LPELRHWDGQ KLAWEPEKTD HPVKGAPTNF GLKDRLQEKW KTEEADKKLS D YSTTYGLD YKNKPRAALV TEHFAPQRAQ SSRMHPVNKI NKDTNLRSTS ILQTPQQIHM RTRNEAVSRS GPAPVSV

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分子 #15: Cilia- and flagella-associated protein 126

分子名称: Cilia- and flagella-associated protein 126 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 15 / コピー数: 3 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: purple sea urchin (ムラサキウニ)
分子量理論値: 15.883667 KDa
配列文字列:
MSSHFSANQY KQAFDSRRLQ NSQIPQTYKE RPSSYEGFTQ IIANDRGHLK QGVPRSKDSP WGGFVGTWEM PKKIPGNVTT YMSRGDPAI DNIQKTRAEH NEYMRQAVSP DKTLAMEPKP QVTKVAEEDR PGNPSPNDAI PA

+
分子 #16: Flagellar FliJ protein

分子名称: Flagellar FliJ protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 16 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: purple sea urchin (ムラサキウニ)
分子量理論値: 14.037033 KDa
配列文字列:
MSEATSYRFE NNIENKSLQR ALHRQKERIK YDELMAAREG IVKNELLINQ KAVWTEKLEE ASAHRRLKTE KSAVKGEIAI AGKTLIAVR RAALRQLIDQ EYGQFEEELR AQGKAFYFKR D

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分子 #17: Meiosis-specific nuclear structural protein 1

分子名称: Meiosis-specific nuclear structural protein 1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 17 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: purple sea urchin (ムラサキウニ)
分子量理論値: 61.705172 KDa
配列文字列: MTTTRRQNLT HATQERMMVQ ARHQEDTRED HLKRLANEKV LEANMASEER VENKRHIRRV QQEEMERNMS ESILKAQQDR IQREQQMEQ EERITNRLQQ LKLETQRQEK VRQQIRENSL ELRELEAKLR AGYMNRERAA QIAEKEASKY EKTARDAEIA R LMMDESAR ...文字列:
MTTTRRQNLT HATQERMMVQ ARHQEDTRED HLKRLANEKV LEANMASEER VENKRHIRRV QQEEMERNMS ESILKAQQDR IQREQQMEQ EERITNRLQQ LKLETQRQEK VRQQIRENSL ELRELEAKLR AGYMNRERAA QIAEKEASKY EKTARDAEIA R LMMDESAR AESQEQRKLV EQYQESVHYQ QELEKQLEEK EKRKQEDYEE FLKEKLMIDE IVRKIHEEDE REREIYYEKQ HA TKRYIDE DAVARQKWKD LERQKMEQEN MEILKFATLQ QHREEDRMEN KRQQEEAKAS VQKNLSDDIA RKRAMEEEME RVR EELYHE EQEETQRQKE MAEIERQIRQ RLELQKTYQE QLRLKRMRRQ AEMGEEEEFK RQMLAKFEED DRIEQMNAQR RRMK QQEHK RRVEDLLADR RAQFAADKER ERDEREEAEN LERLRMQIIE EERQRLLKEH ASKLLGFLPK GVIRNEQDLE LFDDD FKRN YSGRQRNIHS AEGWE

+
分子 #18: Cilia- and flagella-associated protein 161

分子名称: Cilia- and flagella-associated protein 161 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 18 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: purple sea urchin (ムラサキウニ)
分子量理論値: 32.48074 KDa
配列文字列: MSVRSYNPSV RVGNWNEDTC LEEDMVKDFL EKKEKGELLI QKASNLRSTI LKPSDLSVTV DGFVHFGDTV VIMNEAAADQ VRTQPGVEP RQANVLSVNM SETKMHETMR FEGTCTASAS KSLNPCVRNT FVIAPAQDGI PPGSPLTYGQ HFRLCTLPGV G GNLVLQSD ...文字列:
MSVRSYNPSV RVGNWNEDTC LEEDMVKDFL EKKEKGELLI QKASNLRSTI LKPSDLSVTV DGFVHFGDTV VIMNEAAADQ VRTQPGVEP RQANVLSVNM SETKMHETMR FEGTCTASAS KSLNPCVRNT FVIAPAQDGI PPGSPLTYGQ HFRLCTLPGV G GNLVLQSD RVSFHASAEK SRKQLISFVD EVQSPYLTEW RILCFNPQIR MESEGLPVPA NQRIIFNHCK SNEDLCVVSG MS VRTPFGR EYEVVAHTDL DSHRAEKDVN HWIIKTGEPA QPTTLAKTLP VGDQQ

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分子 #19: CFA20 domain-containing protein

分子名称: CFA20 domain-containing protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 19 / コピー数: 7 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: purple sea urchin (ムラサキウニ)
分子量理論値: 22.892596 KDa
配列文字列: MFKNTFQSGF LSILYSIGSK PLQIWDKKVR NGHIKRITDN DIQSLVLEIV GTNVSTTLIE CPADARKTLG IKLPFLVMII KNLKKYFTF EVQVLDDKNV RRRFRASNYQ STTRVKPFIC TMPMRLDDGW NQIQFNLSDF TRRAYGTNYI ETIRVNIHAN C RIRRVYFS ...文字列:
MFKNTFQSGF LSILYSIGSK PLQIWDKKVR NGHIKRITDN DIQSLVLEIV GTNVSTTLIE CPADARKTLG IKLPFLVMII KNLKKYFTF EVQVLDDKNV RRRFRASNYQ STTRVKPFIC TMPMRLDDGW NQIQFNLSDF TRRAYGTNYI ETIRVNIHAN C RIRRVYFS DRLYSEDELP AEFKLYLPIQ KGMATKN

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分子 #20: CFAP21

分子名称: CFAP21 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 20 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: purple sea urchin (ムラサキウニ)
分子量理論値: 66.165797 KDa
配列文字列: MAAIASPPTN GILRQTPPNS QGSEAIIASN TGKFKDRNSD MTAAGKLISM EGETTRDCMN IPRVQTPPLV KKFRNTTRPE PQVRRVFYG KAEDPDIAST VSHGVITTGS LKAGEVVNPN PKTLFTQRLS DKKESQYASK QKAPLGSSHD QRPGLPKDLN T LEKTFGTP ...文字列:
MAAIASPPTN GILRQTPPNS QGSEAIIASN TGKFKDRNSD MTAAGKLISM EGETTRDCMN IPRVQTPPLV KKFRNTTRPE PQVRRVFYG KAEDPDIAST VSHGVITTGS LKAGEVVNPN PKTLFTQRLS DKKESQYASK QKAPLGSSHD QRPGLPKDLN T LEKTFGTP NIFDCSAGEL VSPAKTYQQV YVESEEGREL YRKTHHNFHV GEPVDREYDW SQYSKDGLFG IPTPHENNGK NV AQTLKWL RNDHLDKGTK VVSKRVDDFR ERTQPQLGMV HDPIKETMTV PADHSYGVLL KPDEYGAGDL IHGRYPGSYL RGK DRERGL VAAIRQQLKK ANYHNFNNLQ AAFNHYDKNG DGKIDINELR LCCDQFSLPI EPELLEQLIL YCDANTNGCI DYFE FANFL NWKDKMNEGE TLTNPASAAV KGESQESKEG TPERLKKQID QAIGGHRTSA QMINAVVGGV STKGYRTYGV PTVRS DIAA PRTKRISDTK NYGDESDAFG LINPSMYSNK GIYEKDFFQP REPEQIKGIF SDIGVEMDPE TFHKLWSVAT SRSDQG QVS VESFRNVLDE VQALQLADEA QNLGRPELV

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分子 #21: Trichohyalin-plectin-homology domain-containing protein

分子名称: Trichohyalin-plectin-homology domain-containing protein
タイプ: protein_or_peptide / ID: 21 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: purple sea urchin (ムラサキウニ)
分子量理論値: 65.783406 KDa
配列文字列: MAQEQVRHGR RRGQKKNSPI GNRSGGAPPA GPGMMLPDGS DLRQVTVLSK ADWSRIRAQL ERKQREEEAF RAKREAKEAL HQQSKDMVK NWSNTIAGQR LQKLEARKIR EEKEEAERVQ IDIEEAKYQA EKRKEAIDKA KTLQYYQTDR VKGFHGALLL T EVLKERDA ...文字列:
MAQEQVRHGR RRGQKKNSPI GNRSGGAPPA GPGMMLPDGS DLRQVTVLSK ADWSRIRAQL ERKQREEEAF RAKREAKEAL HQQSKDMVK NWSNTIAGQR LQKLEARKIR EEKEEAERVQ IDIEEAKYQA EKRKEAIDKA KTLQYYQTDR VKGFHGALLL T EVLKERDA QLDLKRAREA AMEGNDMELY LRAQRELEEG ILADQEKALK RMQDRKANSE FQTQQIQEHL QQAEIDNIQD VR EGRELKE QVDYYNAERA KIERIRLGEK QDLMHSHLKT VADRDLIRAA QEQKEEEEEE EIRIFAAAKK KMTKLRRKRE KEL WQEKQD NVTRMVNDLD SQMKAKADDE DDRIAKAVAD REAAREKEMQ EKESRLEDDL KQMALHRTQQ MKQKEKEERQ ERRR ELEAL HLKIEADRLF ATKQEEKMKQ IRQENENLKG FHSNQIQERH ELKLLGRAEQ LEMDKKNIDL LALEEQQFQE YAGKV IKHC KEGERNVYPL EKAAREGHGG GHGPVFDGKG GIRPSYLTND RVGVELPYYQ KGSTDEVKYA HIGKPSNTRK RLGFVW

+
分子 #22: CFAP276

分子名称: CFAP276 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 22 / コピー数: 3 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: purple sea urchin (ムラサキウニ)
分子量理論値: 19.508793 KDa
配列文字列:
MSNIEMSNRD PYPFEKLEND TSFFGTNETQ KMPYGEPTHI AQTKDPWQRL NSTCTLASSR REVYHHDPKA PRDSLDFILK ANYDHHGEL LKNRSETLMQ PETLGANHGR ILKNRVPEKV AEPVSPTGKL TIVSIHTPKK ESIHSVKGAI ESHHTPATNQ G FSRKHDGG FYTT

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分子 #23: Cilia- and flagella-associated protein 45

分子名称: Cilia- and flagella-associated protein 45 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 23 / コピー数: 4 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: purple sea urchin (ムラサキウニ)
分子量理論値: 64.116262 KDa
配列文字列: MPHSVISDSS TSSASRRAKT RQYYTVSKTS QVDESLFGSN NKNGSNKNTQ PTENTEPRRA SGGRNKKKQK EEVQVITKDL IRKLVVAQE DPSGQSVVLP FDEYRRIMGA ARTMSHEEKV ADFKRRQADK QKQQDASNEI KLHMQALDRK RQKNEKLTDL E EEAKEQGE ...文字列:
MPHSVISDSS TSSASRRAKT RQYYTVSKTS QVDESLFGSN NKNGSNKNTQ PTENTEPRRA SGGRNKKKQK EEVQVITKDL IRKLVVAQE DPSGQSVVLP FDEYRRIMGA ARTMSHEEKV ADFKRRQADK QKQQDASNEI KLHMQALDRK RQKNEKLTDL E EEAKEQGE YLLAKAREQQ EEQEDEIKHL NELMLNAKCH AIRDAQILEK GIIKEETTDE EKRLDAMMEV ERQRALLLQE EI EEQRKVE RYEGKSMILT QISQREEERL LQQEKKDQEA QQMLKYLGKL QVEDLKDLDR KRQIQLEAQK EIARSNEESE ELK KKKQEQ EKLADLKVNE YTKQKAEREA AFEAEQERIR IEKEKEIARL RAMQERAKDY QAEKDALRAK RNQEQREREW RQKE KEEVI IKAETEFMLK EAREVQVQNK EHFLAVQAQR ERAEFERVLR AQQEAMNKDR AEEEETKYNR LTHADDVRKQ IREKE QIRV SDRNAFFEEG VKINDEARDR RAKLDAIKKK KLGELRDAGV PDKYCAEVER KTMAVKH

+
分子 #24: Cilia- and flagella-associated protein 52

分子名称: Cilia- and flagella-associated protein 52 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 24 / コピー数: 3 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: purple sea urchin (ムラサキウニ)
分子量理論値: 70.455148 KDa
配列文字列: MGDQQRKAVN GGEENNSDDI DRLELMSTIG FNGSSQGSLS VHPDRNHIVY PLGNTVIVEN LNSKKQDFLQ GHTNTVTCVT ISRSGRFIA SGQQTHMGFK AMIIVWDYEK RSVHCKLDLH KVKVQDLAFS PNDLYLVSLG GQDDGAIVIW DVMKKEAVCG S EAAVKSAG ...文字列:
MGDQQRKAVN GGEENNSDDI DRLELMSTIG FNGSSQGSLS VHPDRNHIVY PLGNTVIVEN LNSKKQDFLQ GHTNTVTCVT ISRSGRFIA SGQQTHMGFK AMIIVWDYEK RSVHCKLDLH KVKVQDLAFS PNDLYLVSLG GQDDGAIVIW DVMKKEAVCG S EAAVKSAG TTYCVAAANQ SDFLFFSGGE RTLRVWDLDV ENRKIRPTDV SLGQLKRIVK SIVVAPEDDY FYCATTTGDI LR IIASTKM LSCYGPKKDL FGMGVTSLVL VKDGTFLLGT GDGTVAHAKF IDDKFKVIKK KKIDKAGHIT SLTLRGQGHQ FFV GTSNSH IYRFNFSEFT YEMIRTCHYE EVNDIAFPKG CSELFVTSSK NDIRVWETAS CKELMRINVP NMECHAVCIM PDGK SIVSA WNDNKIRSFL PQSGKLLYEI ADAHNKAVTA LAVTSNNKRI ISGGGEGQVR VWDIFPREQK LRQTLKEHKG VVAFV RVNH SDTECVSAST DGTCIIWDLH KFVRSQVVFA NTLFRCVCYS AEQSQIITCG TDRKIAYWQA GDSSQIREVE GSKGGA INA MDMSSDGSNF VTGGDDALIK VWDYVNGVVT SIGVGHCSEI KRLRICPHQK YIISVSKDGA IFRWKYPSNC SL

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分子 #25: Trichohyalin-plectin-homology domain-containing protein

分子名称: Trichohyalin-plectin-homology domain-containing protein
タイプ: protein_or_peptide / ID: 25 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: purple sea urchin (ムラサキウニ)
分子量理論値: 62.040836 KDa
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MLATQKPRRT REFTGPTPHS VAIRAKMPSK LPPDHLILER RKRDDQREEA EAATKYNALC DLKNDWEKTT DRRIQSNTVK RRVRSLMQQ EEFSLEDRRQ RLREMLAEEN DQYLVEMEAS QETLLERQSK MRERAKFLKE KREKERLKIV AEKLDQKWRE E CEELRSTL TRRHMDEVCM DRSHQLETKA RMQAHDQEVE RMYADLWEKD RLAKEAKEEK IAQEQHGRNM EMLSVLQKQM AA IEAKRQE EKQLRIDGGK LRKEEAALRK LEEQRAMAEK RALQQEMRDG LDQNIKLKAK RMAKEVQEEL ALDMKILEKL LEE SRNEAM EITQRKKELR QEDQRYRKYL QEQMRLEQQR EAEIDRMISA EVERQWQKRL SQWAKERNAR KRLMEEVLAI RRQQ VEERL AANANAQAEL AKEREAMQAA MEEHKRLDDE KQAAILAANK NYEQNLLGQM EYTNRQQEQA KDEEYREYLH GLETE AEYQ AKLKEALARP VIDKAHPVRR QHMSARKSPQ IA

+
分子 #26: Nucleoside diphosphate kinase

分子名称: Nucleoside diphosphate kinase / タイプ: protein_or_peptide / ID: 26 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: purple sea urchin (ムラサキウニ)
分子量理論値: 42.906504 KDa
配列文字列: MASSAQDGRY SFICEWYDPN AGLTRRYQFL FYPKDNTIEM FDLKNRRMFL KRSACDSVHL ADLYVGSTVN VHSRQLNLVE YSDDFTRRA LTTVKEKTLG LIKPDAISKF GPIFDMTYEA GFLVTNAKMT RLSRNAAEEF YAEHVGKPFY NNLVSFMCSG P IIALELMA ...文字列:
MASSAQDGRY SFICEWYDPN AGLTRRYQFL FYPKDNTIEM FDLKNRRMFL KRSACDSVHL ADLYVGSTVN VHSRQLNLVE YSDDFTRRA LTTVKEKTLG LIKPDAISKF GPIFDMTYEA GFLVTNAKMT RLSRNAAEEF YAEHVGKPFY NNLVSFMCSG P IIALELMA NNGIGEWRRL LGPTDSSTAR SEAPNSIRAR FGTDNTRNAC HGSDSVDSSN RETNFFFGPS ARMRNTSTLD NC TCCIIKP TAVKEGKAGQ IMSAICNEGF EVVALEMFHM EKANSEEFFE VYKGVVAEYM DMVTELTSGP CYALEIRCSK SDD VTKAFR DFVGPADPEI ARQLRPRTLR ARFGNDKVHN AVHCTDLPTD ALLEVEYFFK ILSE

+
分子 #27: Cilia- and flagella-associated protein 77

分子名称: Cilia- and flagella-associated protein 77 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 27 / コピー数: 4 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: purple sea urchin (ムラサキウニ)
分子量理論値: 27.690299 KDa
配列文字列: MSAPSTPPFD NPLLKKSQLG RPLQRGYSLP GDVNFTYGRP NVTKDNGASE ALSGWSPSGP LMPITGHTER KPERDFIALN KACIGAGLV TASDQFQYRA THDVRRRISD EEKSKSKVKR IPASMTFGIS TRPSTPVFDL LEHKYQDRWL QERRKTELTK R ERHQQKQN ...文字列:
MSAPSTPPFD NPLLKKSQLG RPLQRGYSLP GDVNFTYGRP NVTKDNGASE ALSGWSPSGP LMPITGHTER KPERDFIALN KACIGAGLV TASDQFQYRA THDVRRRISD EEKSKSKVKR IPASMTFGIS TRPSTPVFDL LEHKYQDRWL QERRKTELTK R ERHQQKQN MNRGIYETRA SLLRKFCPPV EDPPLWQMSR FSRQLPHLET FRSPNAHHEA FAHHATDCTA RTGTFGHGIY ES AKS

+
分子 #28: Cilia- and flagella-associated protein 97

分子名称: Cilia- and flagella-associated protein 97 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 28 / コピー数: 3 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: purple sea urchin (ムラサキウニ)
分子量理論値: 27.701848 KDa
配列文字列: MHRAYQPITP ANNKLLKKRW DEKRFDNHLQ KVQSARPVID DKPPKTYVHL HLKLKKMQME EERLTIIERD NRILLEKMCH IMLTRGNVD NKNFYDGKSL NRMARQRELL RVTHENQAIM RRILAKQATY SHHQWEDEWA MNLMYLKNIA KYPQWYEHAY D QWNKRDNH ...文字列:
MHRAYQPITP ANNKLLKKRW DEKRFDNHLQ KVQSARPVID DKPPKTYVHL HLKLKKMQME EERLTIIERD NRILLEKMCH IMLTRGNVD NKNFYDGKSL NRMARQRELL RVTHENQAIM RRILAKQATY SHHQWEDEWA MNLMYLKNIA KYPQWYEHAY D QWNKRDNH DSRNGSHYEP KKSSMMASLE KFSKKAEGNK KPNSEKKRAP RRSTKQSRDR QAKRGSANGC GVS

+
分子 #29: HeLo_like_N(LOC577943)

分子名称: HeLo_like_N(LOC577943) / タイプ: protein_or_peptide / ID: 29 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: purple sea urchin (ムラサキウニ)
分子量理論値: 34.673039 KDa
配列文字列: MTDTVPVPAV RPPVDKPMRL VGVSHSNNSY SLVDHASAND QLHYIFLVVK QHIAGILADV QYYKIAELKN EIIALGTDVA ALVRDRSFE ESRDKYHSHF WRADDEAENK RLIVKLSEVA YALLDYKQNC CTQSRGPYAL DEAKLEILCK KHLYELQNFR R ELAQFVNT ...文字列:
MTDTVPVPAV RPPVDKPMRL VGVSHSNNSY SLVDHASAND QLHYIFLVVK QHIAGILADV QYYKIAELKN EIIALGTDVA ALVRDRSFE ESRDKYHSHF WRADDEAENK RLIVKLSEVA YALLDYKQNC CTQSRGPYAL DEAKLEILCK KHLYELQNFR R ELAQFVNT ARDRNAQVTR LSAPLQSQLE WYQYKSPLDD PSIRRPLPYE CTLTSRETIR PRTEPPEVDG HISGVKHVPS QW DVPNLSG KPGAANSGTH GNLTSQGRYG GRHMYERNIN ERRKPCEQEI QHVSSRYKHY HGLCE

+
分子 #30: Outer dense fiber protein 3

分子名称: Outer dense fiber protein 3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 30 / コピー数: 4 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: purple sea urchin (ムラサキウニ)
分子量理論値: 30.624738 KDa
配列文字列: MSQQEEKTKQ KKRDMNDSPY AQPMSAKSKK SAEKPIIAAR ERGPGPGRYG LPSTSGFVAH DFTKHMKPAY SFGHRLENSM FQKDCSPGP GYKIHSEITR VGKDGTPAYS MLARQKDPNT FITPSPYAYS PEKVHPQGER HAPVHSMGSR TRFRKRDQAP A PNSYDLPV ...文字列:
MSQQEEKTKQ KKRDMNDSPY AQPMSAKSKK SAEKPIIAAR ERGPGPGRYG LPSTSGFVAH DFTKHMKPAY SFGHRLENSM FQKDCSPGP GYKIHSEITR VGKDGTPAYS MLARQKDPNT FITPSPYAYS PEKVHPQGER HAPVHSMGSR TRFRKRDQAP A PNSYDLPV LLGSKVPNKY SSASHSMTGR PHVGSYLEDH AKCPGPGSHD AIHPDVTKFK KPSYSMLGRH DLANDSATKP GP GAHSPEK VTVNKRKYPS HSLGIRHSEF VCPLIVVVKD

+
分子 #31: PACRG

分子名称: PACRG / タイプ: protein_or_peptide / ID: 31 / コピー数: 6 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: purple sea urchin (ムラサキウニ)
分子量理論値: 26.652809 KDa
配列文字列: MMRSKASPKG NERKLKAEGF TTKSRMKNAV VVAPPAAGAF AEKPLLQGTS FRKFYNRGDF PIALEHDTKG NKIAWKVEIE KLDYHHYLP MFFDGLCETT HPYEFFARQG VHDMLEHGGS KILPVIPQLI IPIKSALNMK NRMVLCTTLK VLQHLVVSGE N VGEALVPY ...文字列:
MMRSKASPKG NERKLKAEGF TTKSRMKNAV VVAPPAAGAF AEKPLLQGTS FRKFYNRGDF PIALEHDTKG NKIAWKVEIE KLDYHHYLP MFFDGLCETT HPYEFFARQG VHDMLEHGGS KILPVIPQLI IPIKSALNMK NRMVLCTTLK VLQHLVVSGE N VGEALVPY YRQILPVLNT FKNNNLNSGD SIDYGQQRRE NIGDLIHEVL VAFEKKGGDD AFINIKYMVP THESSVLN

+
分子 #32: Pierce1

分子名称: Pierce1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 32 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: purple sea urchin (ムラサキウニ)
分子量理論値: 13.920258 KDa
配列文字列:
MEQSGNQAQH HHAGAGQMET ERKERDQVLA TTTLEKNQGA KTSDHYRTQN LPHRFENPDV FEGYNHKPQN PLYYTTNMGY GSIPPTVDT VPTCFHAKTN KFSEHLGKCG MYRNEGLNTG MESS

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分子 #33: Protein phosphatase 1 regulatory subunit 32

分子名称: Protein phosphatase 1 regulatory subunit 32 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 33 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: purple sea urchin (ムラサキウニ)
分子量理論値: 52.795879 KDa
配列文字列: MGRLPVGEPT AHMSATQGPD ANLMKFYSTS YATSFGVKHE PFVPRTTKHV GTGYQSNFRP GVYYSQRLDE VDNPAMGRIV SDNYNSITT KHYKPSIRSD GKDRFPENLN QVKSGFTEQN PINFPTVGQV RKVFVNTRDH GLGLKINGVL PKHRPLLYKL Q AKDPVSLE ...文字列:
MGRLPVGEPT AHMSATQGPD ANLMKFYSTS YATSFGVKHE PFVPRTTKHV GTGYQSNFRP GVYYSQRLDE VDNPAMGRIV SDNYNSITT KHYKPSIRSD GKDRFPENLN QVKSGFTEQN PINFPTVGQV RKVFVNTRDH GLGLKINGVL PKHRPLLYKL Q AKDPVSLE NAGHGPNFMS TEAKTRFSGR PSERKDCSTL TVGPKEGSGY THAYNVEPIS FHPGSPFKNT TPGTWTNRPT GN SIMKTDF LPSQQPSGDE RLPAIANRSD HETGFTHEKA KPLYVHRVMT DAYTKRDQVP GRVEDRIRKE DPAEYLNMTN PDN HSSIFK KSYEGQQRPS PSANEMQGRL FVGNKEMSGY SDNNDKPQAQ IPVEPYRWIS HYDTKFYDMN TKGRARAGRT FGAV MKQLP DGYTKSTSVH SYGPTLDTTH ELRSLHPYVA RSIKARDVFF DDHTHDAKKH VTINPIPQFL AASC

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分子 #34: RIB35

分子名称: RIB35 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 34 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: purple sea urchin (ムラサキウニ)
分子量理論値: 34.957242 KDa
配列文字列: MSVTSANPAT PYTRAEFFNA CTSVLEGLNC LQRQQSVIDE RSWEVLNRLG QMVSDLRPEV KGNKEYWVDG PLVKFLTANV LKAKSVLQE MKRTCSQKSA ATNGPEYIER HLLQHVEDIR TSLEELETYH QQTLYRTDTT GIDAGVGQRM HTITQGPTEM T AGGLTQTP ...文字列:
MSVTSANPAT PYTRAEFFNA CTSVLEGLNC LQRQQSVIDE RSWEVLNRLG QMVSDLRPEV KGNKEYWVDG PLVKFLTANV LKAKSVLQE MKRTCSQKSA ATNGPEYIER HLLQHVEDIR TSLEELETYH QQTLYRTDTT GIDAGVGQRM HTITQGPTEM T AGGLTQTP PAEISLEPKG SGTFMKDLNN AKIATNDSYP GTSSQPMTGM WSSGLPHHPE TSKPGVFEHI QEMTNIYPEH DP NWPKREQ KPKLPFERTQ PPLVYPGIRD MHNYSNLPQF TGKDLPMPKI PNGEMGLRAP HVPHWDSTNH YSY

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分子 #35: RIB43A-like with coiled-coils protein 2

分子名称: RIB43A-like with coiled-coils protein 2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 35 / コピー数: 4 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: purple sea urchin (ムラサキウニ)
分子量理論値: 45.16207 KDa
配列文字列: MYKLDLPIDL KENAAIERRR NLELERQSRI FNAKVRTIGV DVQVLKEQVH DRDLQEQREN DREEAFASDM IRNDKISELL QRRQEQDIR NLNSAMNEFR DLHQQPEGRR EWDLYDPEAK KKDKPARVSD DDPRCGPSSI QKFDGEDLGG KERKKLMEEQ M REWSTKQA ...文字列:
MYKLDLPIDL KENAAIERRR NLELERQSRI FNAKVRTIGV DVQVLKEQVH DRDLQEQREN DREEAFASDM IRNDKISELL QRRQEQDIR NLNSAMNEFR DLHQQPEGRR EWDLYDPEAK KKDKPARVSD DDPRCGPSSI QKFDGEDLGG KERKKLMEEQ M REWSTKQA KEKALQKKRQ EEADRLYDLH RREMDQRACE LAAAEEECRR AINLSTKDYN KSLADEQAEK DRLRREQELD DN FTELANH INGDMLTENP DVASSAFGPH RVITDRWKGM SPEQLEDIRR TQELQRQEKE RIKSDEAERD REWEAQRIAD ARA GILMDR EQERLRKELE RQQIASNSRL AEEQNAHQNF MDKEVYTNPP TAAYFQQFNK TSR

+
分子 #36: EF-hand domain-containing family member C2

分子名称: EF-hand domain-containing family member C2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 36 / コピー数: 4 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: purple sea urchin (ムラサキウニ)
分子量理論値: 85.763664 KDa
配列文字列: MSLPFLPGNS FNPRLGRDKF HKSQHFDYSN EVPMLVGGHK PGIGGDKLLG QTSQPQTSNI PLGQGNASPA WVAFDKQVLH FDAFFQEAV HEMRQQYRIR KCKIYFYLED DSIQVIEPLV ENSGIPQGTL IRRHRIPLPP PNDDQFYTVE HFNVDQEITL Y GRTFKITG ...文字列:
MSLPFLPGNS FNPRLGRDKF HKSQHFDYSN EVPMLVGGHK PGIGGDKLLG QTSQPQTSNI PLGQGNASPA WVAFDKQVLH FDAFFQEAV HEMRQQYRIR KCKIYFYLED DSIQVIEPLV ENSGIPQGTL IRRHRIPLPP PNDDQFYTVE HFNVDQEITL Y GRTFKITG CDQFTYNFLK KLGVRIKAPA ETPKDPYTGF RKGMDEAQQP LRPYEKVDTL KQFLDHDRHV LRFLCFWDDR DN MFGDLRE FYLHYFLADD TIEIKEIIQP NAGRDKTPMF LRRGRMSKIS PESLRQPGEI TGRTVLNVFG PTGHGGRYIL DSL KTGAVH SEFYMENDLT IGSTINANGR WLTLADCDDF TKEYYKQKYG VNDYSPVNYR NDPAGANKRH WPPYTGFGSE EDSL CSCMG LLPKPPRRDF IKFMEKDRHG LDSNVIRFVA RLDTTKPIDV DRRFIISYFL SDDTVAVFEP PERNSGIIGG KFLER GRIK KPNQARFGTE LSDYFTARDL YVGSRLNFHS FFFVLIDADE YAFRYMEKHA EEFPMSNIGF ISQKISTIAS QHKEKI KEF LNRNDPSNSG HLEFDLFRNL LVQLGGSQLS EHEIIVLARY YSDTQDVKLS VETLVSIVQE QLKKNSFENF TKLLEGF LQ HDTDKSGYLD GALVRSTCNA FHLPLPDDLL RALISRLEAN EDGLVNYNAL VTYLNWRDHP MTTAQYVAPP ANFDESWT G KDNGDRVKRV NYIALLQSIF PDM

+
分子 #37: Flagellar protofilament ribbon protein rib74

分子名称: Flagellar protofilament ribbon protein rib74 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 37 / コピー数: 3 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: purple sea urchin (ムラサキウニ)
分子量理論値: 74.127648 KDa
配列文字列: MALPFLPGNS FTDPTQRKFH RSQSLGYKNG YALPARPEVG IGGEPLEVNQ LTLSELDELN NKRPTLTYGQ AKQAPPEDFI PAHVAFDKK VLKFNGFYKQ TVHESPSEYF RVRPVILYYY LEDDSISVIE PHVENSGMPQ GKLIKRMRLP KNDQGDHWHW K DINLNINV ...文字列:
MALPFLPGNS FTDPTQRKFH RSQSLGYKNG YALPARPEVG IGGEPLEVNQ LTLSELDELN NKRPTLTYGQ AKQAPPEDFI PAHVAFDKK VLKFNGFYKQ TVHESPSEYF RVRPVILYYY LEDDSISVIE PHVENSGMPQ GKLIKRMRLP KNDQGDHWHW K DINLNINV TFYGKVFHIT DCDRWTSDFM ASEGIELNAP VGAPTDPYTD SRKEKSAVDA FTTPSTFDKL KQFLDLDRKV LR FFCVWDD RSSMFGEQRP FIIQYYLVDD TVEVREVHDP NDGRDPFPLF LKRQRVPKDR DNVDSSFRAV VMELSNHEIK DWY NPPDFG IGKTVFIYNR PFLIYDADNF TKAYMQQNYG VQGSGPIKVS TEARNLAKMD LPPYNGFGSY EDSLQSCLSL VPQP PKKDF IKMLENDHKI LRFEAIMDSV RPEDKGRRFI ISYRLADDMI KIFEPPVRNS GIISGTFLER TRVTMPGSTP ENPKF YGPQ DLTVGSCLEV FNHRFVITDA DDYVLNYLEA HRQDFPGCEK TIHSIQATRA MGLPNKPLTL ASQKGAPMTV QRTPND LKR LLAEVKGQLR KDNYINFTSL TEAFLQYDRD RSGNIDVNEL KAACHKQNLP LDDDVMQALI AECGDENGRI SHAEFMK FL TWD

+
分子 #38: SAXO3(LOC115918676)

分子名称: SAXO3(LOC115918676) / タイプ: protein_or_peptide / ID: 38 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: purple sea urchin (ムラサキウニ)
分子量理論値: 37.032676 KDa
配列文字列: MTGADRRFDL HQTSSGRGLD YRPEYYFPAS DFKTTINNPL PPQLAKQDEI IKPFQTTTGG AHDYKYHGGL MANPQHHKAP GHWNMHYNK DLREKLQQRG WRKPLTMGNQ ESEVQAQYKG DQMQMGVDFD NRLSGNPQPS DLQTHHQNCP APVRDSVPKY K PTLVRDDG ...文字列:
MTGADRRFDL HQTSSGRGLD YRPEYYFPAS DFKTTINNPL PPQLAKQDEI IKPFQTTTGG AHDYKYHGGL MANPQHHKAP GHWNMHYNK DLREKLQQRG WRKPLTMGNQ ESEVQAQYKG DQMQMGVDFD NRLSGNPQPS DLQTHHQNCP APVRDSVPKY K PTLVRDDG ALQLLDIYVP TSHHVHKRFT RHELDDYPKK DAATYWRCED YTQAWGHGTK HNPLPKGAEI HQRAPMVDEM VF KTAIKEP ARWPERFKRV PHAGMKTTMT SSYKTPSDPK MTELFSCPVD TPWVIPEAGP IQTFSVPNMY TTEYKTYASG KPI TV

+
分子 #39: TEPP protein

分子名称: TEPP protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 39 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: purple sea urchin (ムラサキウニ)
分子量理論値: 21.414076 KDa
配列文字列:
MPTVEVPYYV PQYPTFRRAQ LAAVKEGLYH PSLPTFRRMD MDTAAHRLPD EHCRTTTGVG PADFQNATAT YFQPPANTYN GANITDTGR LLRETMKDDV KSLRLDWAKA KDIKELPQIK NTGQLRFSGY AVRYQKPAIS GSWRYTFTQE PRLDQYGQRP V PANIYSRY RDTFPQYSRN MSTDAFR

+
分子 #40: SPATA48

分子名称: SPATA48 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 40 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Strongylocentrotus purpuratus (ムラサキウニ)
分子量理論値: 23.009598 KDa
配列文字列: MTEQACLPVP KFRPPSSTLE RNADLVKYRP WRYDVGPATW QEITPPVWDR IQERARIKPR QSYPRPTPVI NTTAFTPIPA INRPKSGKS KLKDGGSISV NETITDLVKR ERLTSTYVRQ CPGYAGYRPR SPLRIPMENL NEPNLRMTTT MKASYRPLMF P LINMDHFP ...文字列:
MTEQACLPVP KFRPPSSTLE RNADLVKYRP WRYDVGPATW QEITPPVWDR IQERARIKPR QSYPRPTPVI NTTAFTPIPA INRPKSGKS KLKDGGSISV NETITDLVKR ERLTSTYVRQ CPGYAGYRPR SPLRIPMENL NEPNLRMTTT MKASYRPLMF P LINMDHFP HMGPMSRTVT LTYPCNPFNK VEKLRSYGGN DV

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分子 #41: Sperm-associated antigen 8

分子名称: Sperm-associated antigen 8 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 41 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: purple sea urchin (ムラサキウニ)
分子量理論値: 23.161557 KDa
配列文字列: MATLNPARTL NNSGGRCLME NWVEERQVFQ TGLDSAGVNS TESYTSNSSL PYKDGHKGIL TRELDTAVEK ESNSMGSYQR PAQCGVRTV GRKKELMERA LYAKVSQELQ EEINEPSPVE EYKSVTQKDF YDDEFESELP APLYEHNVNT EQPITFWSHH K EKIPGVSQ ...文字列:
MATLNPARTL NNSGGRCLME NWVEERQVFQ TGLDSAGVNS TESYTSNSSL PYKDGHKGIL TRELDTAVEK ESNSMGSYQR PAQCGVRTV GRKKELMERA LYAKVSQELQ EEINEPSPVE EYKSVTQKDF YDDEFESELP APLYEHNVNT EQPITFWSHH K EKIPGVSQ IKTLDTPFKK NSAFSKPIAE GTDQPQPYEQ ETHPFL

+
分子 #42: Testicular haploid expressed gene protein-like

分子名称: Testicular haploid expressed gene protein-like / タイプ: protein_or_peptide / ID: 42 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: purple sea urchin (ムラサキウニ)
分子量理論値: 30.135172 KDa
配列文字列: MATEVEASQS GSQSSRRPPR LDVLSRPKQL PSTYREDRRS VYWVDKPPLM PGSDGTTKFA CTDWVGSLSN HKPIYSRYLS DRPSPKSVV SKAAQSAEAS DRVTVLAGPK DWARHFTLHR PVMTHVSKGA KQAGPSERIE SLAKPKTYQP LQIKDSWDFD I NVWDNEIS ...文字列:
MATEVEASQS GSQSSRRPPR LDVLSRPKQL PSTYREDRRS VYWVDKPPLM PGSDGTTKFA CTDWVGSLSN HKPIYSRYLS DRPSPKSVV SKAAQSAEAS DRVTVLAGPK DWARHFTLHR PVMTHVSKGA KQAGPSERIE SLAKPKTYQP LQIKDSWDFD I NVWDNEIS SAAKNARCSE RLETLAEPKA LHNHFRFANP IRWNTEDSTL KAIATLRLQQ LARPKSRGKN EYFDPYKVSS AA VHARATP RIDELCAPIP RKVRQKKAGA P

+
分子 #43: Tektin A1

分子名称: Tektin A1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 43 / コピー数: 4 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: purple sea urchin (ムラサキウニ)
分子量理論値: 53.036789 KDa
配列文字列: MDAGATLLSR SYAPTIPVYP TQTTVGTKTD QALSQDLAKM SGLGETGVYG VPTGAPAAQG FRSGKHTTQE WHESNYNKYF QSFTDRDNA ERLCHESKQL SNETHALTMR TQADVTKKLG DRMNDINFWK FELNREIEEM IEETDLLCAQ KKRLENALDA T EVPLKIAR ...文字列:
MDAGATLLSR SYAPTIPVYP TQTTVGTKTD QALSQDLAKM SGLGETGVYG VPTGAPAAQG FRSGKHTTQE WHESNYNKYF QSFTDRDNA ERLCHESKQL SNETHALTMR TQADVTKKLG DRMNDINFWK FELNREIEEM IEETDLLCAQ KKRLENALDA T EVPLKIAR DNLTCRSRRQ DIDLVGDRVE MALNKEVDII TKVQDLLKRT LEQSDRQIKL NRGSKHKLTM DWSDKLSAFK ID EKCTGLN NNSTEIQYKE GSAKFEAVQT NPQSWAEFSH DNVVRAEHER LASQQLRNLI DQILTDTSND MREQCNTVNT EFA RRIEEM NDAKTKMENH LLKTVEDIAG MEKNIKDLTQ AVKDKEAPMK VAQTRLDHRT HRPNVELCRD PAQYRMVQEV GEIQ DSIDK LQQKLAESKA SLKDLMDTRM ALEKEIALKK NSIFVDRDKC LKFRTRYPST SKLVGYQ

+
分子 #44: Tektin B1

分子名称: Tektin B1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 44 / コピー数: 5 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: purple sea urchin (ムラサキウニ)
分子量理論値: 49.845398 KDa
配列文字列: MSIKTDIASK PVTHFAPSDW HTNSHLLSTN AEKLRDNSHS TRQESSQLRN ETYNRTSWGI HDNTTRLSNR IDDIETWRET LEKTLADVD EEIRKLEEDK DLAERALEAK ALPLDVASEC KTLRDGRRDI DVVDDLANSE VGKEIDVIEG IKDALQAKVS S AFEQLCLL ...文字列:
MSIKTDIASK PVTHFAPSDW HTNSHLLSTN AEKLRDNSHS TRQESSQLRN ETYNRTSWGI HDNTTRLSNR IDDIETWRET LEKTLADVD EEIRKLEEDK DLAERALEAK ALPLDVASEC KTLRDGRRDI DVVDDLANSE VGKEIDVIEG IKDALQAKVS S AFEQLCLL QEARQQLHAD LRDKTEAKKI DTYCHDLTIS SPDICYQPNS TRTPKGSTTP QTWEDFSRYN KDRADAEMRS SQ RLREAIH STVAQTDNDL EAQRQATEFA LRKRIHEMKR AKDEDEWQKK NTEEEIAKQE RNIRELEQAI KDKENPLKLA MTR LENRTY RPNVELCRDN AQYGLVNEVH EIQDSIKALE KKLQDAHNAR DACEKQLYRI NKDLELKNNS LDLDNKCMQV REKL TTGPV TQTMNNLSTF KTDRELYTAQ RSLLA

+
分子 #45: Tektin C1

分子名称: Tektin C1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 45 / コピー数: 5 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: purple sea urchin (ムラサキウニ)
分子量理論値: 46.691652 KDa
配列文字列: MSKLIKAPQR FTHGEWNYSN HANYNSAEKQ RASAERLIDE SDRLIDETDE ATKKTQRDVN KKFEQRLDDV TYWKDELDRK LKDSKDEIE MLLAYKTRLE NALEACREPL AIVNQCLNDR EGRIGIDLVH DDVEKNLLKE REVIMGVMAL LQKTLDQVIE Q IRIMRSRR ...文字列:
MSKLIKAPQR FTHGEWNYSN HANYNSAEKQ RASAERLIDE SDRLIDETDE ATKKTQRDVN KKFEQRLDDV TYWKDELDRK LKDSKDEIE MLLAYKTRLE NALEACREPL AIVNQCLNDR EGRIGIDLVH DDVEKNLLKE REVIMGVMAL LQKTLDQVIE Q IRIMRSRR YNLEKDLTDK FGALDIDQDC RNLRDDNSTL QFKGGVAKIE TNSVTPEDWQ SFSNENILKA ERDRKNSADL RA VVDSLLK TTADDMQQQV DDTNLAFSKR IRETDMTKGK LETHLAKVEG QMREMEENIQ KLQKGVDDKM GPKKLSETRL DAR TNRPNV ELCRDPVQYR LIGEVTEINT SIARLQATLA QAQSELKGLI RNQLNLQEDI DIKSQSLNVD DTQCMTLRRS INIK RY

+
分子 #46: Tex43

分子名称: Tex43 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 46 / コピー数: 3 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: purple sea urchin (ムラサキウニ)
分子量理論値: 14.191163 KDa
配列文字列:
MAEKKQNGTS YQSIPRFSKL HPVIPRRYVP EWKNDMKNRE LLVKNCEMSG IIPKGPHDES LFLDKRERMN EVEPRVRVEA KHPNFERYD GLRPEFHTAQ SKYQSSLMFR KDNTVGQDFQ

+
分子 #47: Tex36(CFAP95, C9orf135)

分子名称: Tex36(CFAP95, C9orf135) / タイプ: protein_or_peptide / ID: 47 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: purple sea urchin (ムラサキウニ)
分子量理論値: 25.701264 KDa
配列文字列: MNSYTTLPDY VERKGSLFLR SNHMDYSRPT LNSNWHQARE AEPKDYDING FETLQDRKLH NTTYRRIGDV TDGSFPLTTT QDHLEQANL KKDFEEKEPR KTMVNIDTIA HVDLDRDTGK PKTGFGSVLP RHNPEHDKRH LETTNRADYK PPYPYTAAPE Q LPDFADNS ...文字列:
MNSYTTLPDY VERKGSLFLR SNHMDYSRPT LNSNWHQARE AEPKDYDING FETLQDRKLH NTTYRRIGDV TDGSFPLTTT QDHLEQANL KKDFEEKEPR KTMVNIDTIA HVDLDRDTGK PKTGFGSVLP RHNPEHDKRH LETTNRADYK PPYPYTAAPE Q LPDFADNS NAYRKCHSQF TDTADYRHFG RNTYKDESGI YANTQLKRNI YQTTNTIPKV LE

+
分子 #48: CFAP90(C5orf49)

分子名称: CFAP90(C5orf49) / タイプ: protein_or_peptide / ID: 48 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: purple sea urchin (ムラサキウニ)
分子量理論値: 19.712092 KDa
配列文字列:
MAYPGEGQGM SNYGPSQQTS QQQKLLWVEI VGREQRIKKC HLAVKGGLSG IYKESENQQT SQKTGKMKEI TYFNNNKKSN STYDRLFHV KHGYQNKLHR DDREHTRGLK VYEEESSKAV PALSSSAYGH RPPLEKTTRK HARIEHVMKG FYRHRGTNLP E YGTETDLG THH

+
分子 #49: Tex49

分子名称: Tex49 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 49 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: purple sea urchin (ムラサキウニ)
分子量理論値: 17.482893 KDa
配列文字列:
MSFFNLTELG YQYPIRAQVK EPNSVYSYHL ANSLPAGSYV SHRPETAKLP PINMHKYNKV IEPVDNPEHH GSYVKFTERL HKHTRCAKG PNDIYRNPVT TAQLPGSWYR KEVPLKQSEP WTYVPRHVCV SSEMTKFVKE MSVTNREFSL F

+
分子 #50: Tex49_homologue(LOC580808)

分子名称: Tex49_homologue(LOC580808) / タイプ: protein_or_peptide / ID: 50 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: purple sea urchin (ムラサキウニ)
分子量理論値: 20.695467 KDa
配列文字列:
MTAQCMGNFG AHKWRYPEFM ADRYGRSNGS VDPESRHKQY DAGVSDQTVW VNKRYIPTDL RSTAPVPRRK LLASARLPHV ERDWVPLGE ASCRQISRAM EERQLYVSQP STRSEDWSTL RQILPSKGLP LRDSPPNWGT GNAYAPPMLG ARQRRFPHIN S PMTRYTDN MHTTHKLFKL H

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分子 #51: CFAP68(UPF0686, C11orf1)

分子名称: CFAP68(UPF0686, C11orf1) / タイプ: protein_or_peptide / ID: 51 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: purple sea urchin (ムラサキウニ)
分子量理論値: 17.679635 KDa
配列文字列:
MASGDEVAFR SMVRGSGLGE VWTHTTDLEK FQQYGWRTTT KEDCYTPDTL IGNWNEERFD IKRIRVPKSL PSQYDHYFDT TQKSSYVSG PKPVPKHILH LAARESRSFP ASQPELDPPA VKERYNSFET TSRASYVDPK LRKNPVHQTE TSQR

+
分子 #52: SPATA45

分子名称: SPATA45 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 52 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: purple sea urchin (ムラサキウニ)
分子量理論値: 9.870922 KDa
配列文字列:
MDPQKNYEMN NQRESWCAVE LSPLQDWCKS ERKHHGENFK SSVFNAKQGQ PESEARCTFE VNDKTHREKR HFPNKTSYSH LAI

+
分子 #53: C4orf45

分子名称: C4orf45 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 53 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: purple sea urchin (ムラサキウニ)
分子量理論値: 32.467586 KDa
配列文字列: MAAATDSRRT SAVAESMASR PYTDATWMTQ SGTHPMGKGQ ILFTGPSGIR DYKVNVVTDD RMVGIGTMSQ EGTSDLQYIW RGAPGAPPP RRRSQWVGEV GWFIPPYHDT KNTLSGNQIQ LKVFRKAQEE KYTHRFQEPW YLAPNDPDYK QNFPFTQGSK R NWRAPGQQ ...文字列:
MAAATDSRRT SAVAESMASR PYTDATWMTQ SGTHPMGKGQ ILFTGPSGIR DYKVNVVTDD RMVGIGTMSQ EGTSDLQYIW RGAPGAPPP RRRSQWVGEV GWFIPPYHDT KNTLSGNQIQ LKVFRKAQEE KYTHRFQEPW YLAPNDPDYK QNFPFTQGSK R NWRAPGQQ RSAEQLPPRP HTSFHSNDSR LPNVNNNAPP SSRPFTVQPP SSESISRPAS GQSAHSYSAH SYTPPGSRPG SG GGHESAY SSRSRGSQST LRSRGSSQTS HPSRRRITPA ATSVSSVYRA PTSDPDY

+
分子 #54: Tubulin alpha chain

分子名称: Tubulin alpha chain / タイプ: protein_or_peptide / ID: 54 / コピー数: 148 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: purple sea urchin (ムラサキウニ)
分子量理論値: 50.184496 KDa
配列文字列: MRECISIHVG QAGVQIGNAC WELYCLEHGI QPDGQMPSDK TIGGGDDSFN TFFSETGAGK HVPRAVFVDL EPTVVDEVRT GTYRQLFHP EQLITGKEDA ANNYARGHYT IGKEIVDLVL DRIRKLADQC TGLQGFLIFH SFGGGTGSGF ASLLMERLSV D YGKKSKLE ...文字列:
MRECISIHVG QAGVQIGNAC WELYCLEHGI QPDGQMPSDK TIGGGDDSFN TFFSETGAGK HVPRAVFVDL EPTVVDEVRT GTYRQLFHP EQLITGKEDA ANNYARGHYT IGKEIVDLVL DRIRKLADQC TGLQGFLIFH SFGGGTGSGF ASLLMERLSV D YGKKSKLE FAIYPAPQIS TAVVEPYNTI LTTHTTLEHS DCAFMVDNEA IYDICRRNLD IERPTYTNLN RLIAQIVSSI TA SLRFDGA LNVDLTEFQT NLVPYPRIHF PLATYAPVIS AEKAYHEQLS VAEITNACFE PANQMVKCDP RHGKYMACCM LYR GDVVPK DVNAAIATIK TKRTIQFVDW CPTGFKVGIN YQPPTVVPGG DLAKVQRAVC MLSNTTAIAE AWARLDHKFD LMYA KRAFV HWYVGEGMEE GEFSEAREDL AALEKDYEEV GVDSVEGEAE EEGEEY

+
分子 #55: Tubulin beta chain

分子名称: Tubulin beta chain / タイプ: protein_or_peptide / ID: 55 / コピー数: 150 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: purple sea urchin (ムラサキウニ)
分子量理論値: 50.097988 KDa
配列文字列: MREIVHMQAG QCGNQIGAKF WEVISDEHGI DPTGTYHGDS DLQLERINVY YNEATGGKYV PRAVLVDLEP GTMDSVRSGP FGQIFRPDN FVFGQSGAGN NWAKGHYTEG AELVDSVLDV VRKEAESCDC LQGFQLTHSL GGGTGSGMGT LLISKIREEY P DRIMNTFS ...文字列:
MREIVHMQAG QCGNQIGAKF WEVISDEHGI DPTGTYHGDS DLQLERINVY YNEATGGKYV PRAVLVDLEP GTMDSVRSGP FGQIFRPDN FVFGQSGAGN NWAKGHYTEG AELVDSVLDV VRKEAESCDC LQGFQLTHSL GGGTGSGMGT LLISKIREEY P DRIMNTFS VVPSPKVSDT VVEPYNATLS VHQLVENTDE TYCIDNEALY DICFRTLKLT TPTYGDLNHL VSATMSGVTT CL RFPGQLN ADLRKLAVNM VPFPRLHFFM PGFAPLTSRG SQQYRALTVP ELTQQMFDAK NMMAACDPRH GRYLTVAAIF RGR MSMKEV DEQMLNVQNK NSSYFVEWIP NNVKTAVCDI PPRGLKMSAT FIGNSTAIQE LFKRISEQFT AMFRRKAFLH WYTG EGMDE MEFTEAESNM NDLVSEYQQY QDATAEEEGE FDEEEEGDEE AA

+
分子 #56: GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE

分子名称: GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE / タイプ: ligand / ID: 56 / コピー数: 148 / 式: GTP
分子量理論値: 523.18 Da
Chemical component information

ChemComp-GTP:
GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE / GTP / GTP, エネルギー貯蔵分子*YM

+
分子 #57: MAGNESIUM ION

分子名称: MAGNESIUM ION / タイプ: ligand / ID: 57 / コピー数: 148 / 式: MG
分子量理論値: 24.305 Da

+
分子 #58: GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE

分子名称: GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE / タイプ: ligand / ID: 58 / コピー数: 150 / 式: GDP
分子量理論値: 443.201 Da
Chemical component information

ChemComp-GDP:
GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE / GDP / GDP, エネルギー貯蔵分子*YM

-
実験情報

-
構造解析

手法クライオ電子顕微鏡法
解析単粒子再構成法
試料の集合状態filament

-
試料調製

緩衝液pH: 7.4
凍結凍結剤: ETHANE

-
電子顕微鏡法

顕微鏡FEI TITAN KRIOS
撮影フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 BIOQUANTUM (6k x 4k)
平均電子線量: 34.0 e/Å2
電子線加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD / 最大 デフォーカス（公称値）: 2.5 µm / 最小 デフォーカス（公称値）: 0.5 µm
実験機器
モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company

-
画像解析

初期モデルモデルのタイプ: EMDB MAP
EMDB ID:

20631

最終 再構成解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 3.3 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 使用した粒子像数: 127673
初期 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD
最終 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD

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万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbjlvh1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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