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基本情報
登録情報 | データベース: EMDB / ID: EMD-30543 | |||||||||
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タイトル | Mouse KCC2 | |||||||||
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![]() | transporter / MEMBRANE PROTEIN | |||||||||
機能・相同性 | ![]() Cation-coupled Chloride cotransporters / ammonium transmembrane transport => GO:0072488 / thermosensory behavior / intracellular pH reduction / potassium:chloride symporter activity / hypotonic response / intracellular chloride ion homeostasis / response to xenobiotic stimulus => GO:0009410 / chloride ion homeostasis / intracellular monoatomic ion homeostasis ...Cation-coupled Chloride cotransporters / ammonium transmembrane transport => GO:0072488 / thermosensory behavior / intracellular pH reduction / potassium:chloride symporter activity / hypotonic response / intracellular chloride ion homeostasis / response to xenobiotic stimulus => GO:0009410 / chloride ion homeostasis / intracellular monoatomic ion homeostasis / dendritic spine development / ammonium channel activity / potassium ion homeostasis / cell volume homeostasis / chloride transport / chloride transmembrane transporter activity / plasma membrane => GO:0005886 / potassium ion import across plasma membrane / monoatomic ion transport / chloride transmembrane transport / dendrite membrane / dendritic shaft / learning / cell periphery / potassium ion transport / multicellular organism growth / chemical synaptic transmission / perikaryon / membrane => GO:0016020 / neuron projection / neuronal cell body / synapse / protein kinase binding / plasma membrane 類似検索 - 分子機能 | |||||||||
生物種 | ![]() ![]() | |||||||||
手法 | 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.8 Å | |||||||||
![]() | Zhang S / Yang M | |||||||||
![]() | ![]() タイトル: The structural basis of function and regulation of neuronal cotransporters NKCC1 and KCC2. 著者: Sensen Zhang / Jun Zhou / Yuebin Zhang / Tianya Liu / Perrine Friedel / Wei Zhuo / Suma Somasekharan / Kasturi Roy / Laixing Zhang / Yang Liu / Xianbin Meng / Haiteng Deng / Wenwen Zeng / ...著者: Sensen Zhang / Jun Zhou / Yuebin Zhang / Tianya Liu / Perrine Friedel / Wei Zhuo / Suma Somasekharan / Kasturi Roy / Laixing Zhang / Yang Liu / Xianbin Meng / Haiteng Deng / Wenwen Zeng / Guohui Li / Biff Forbush / Maojun Yang / ![]() ![]() 要旨: NKCC and KCC transporters mediate coupled transport of Na+K+Cl and K+Cl across the plasma membrane, thus regulating cell Cl concentration and cell volume and playing critical roles in transepithelial ...NKCC and KCC transporters mediate coupled transport of Na+K+Cl and K+Cl across the plasma membrane, thus regulating cell Cl concentration and cell volume and playing critical roles in transepithelial salt and water transport and in neuronal excitability. The function of these transporters has been intensively studied, but a mechanistic understanding has awaited structural studies of the transporters. Here, we present the cryo-electron microscopy (cryo-EM) structures of the two neuronal cation-chloride cotransporters human NKCC1 (SLC12A2) and mouse KCC2 (SLC12A5), along with computational analysis and functional characterization. These structures highlight essential residues in ion transport and allow us to propose mechanisms by which phosphorylation regulates transport activity. | |||||||||
履歴 |
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構造の表示
ムービー |
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構造ビューア | EMマップ: ![]() ![]() ![]() |
添付画像 |
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ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 9.3 MB | ![]() | |
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ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 10.1 KB 10.1 KB | 表示 表示 | ![]() |
画像 | ![]() | 68.8 KB | ||
Filedesc metadata | ![]() | 5.6 KB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 368.8 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 368.4 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 6.5 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 7.4 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
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マップ
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ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 1.091 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
CCP4マップ ヘッダ情報:
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-添付データ
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試料の構成要素
-全体 : mouse KCC2
全体 | 名称: mouse KCC2 |
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要素 |
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-超分子 #1: mouse KCC2
超分子 | 名称: mouse KCC2 / タイプ: organelle_or_cellular_component / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: all |
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由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
-分子 #1: Solute carrier family 12 member 5
分子 | 名称: Solute carrier family 12 member 5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 126.402328 KDa |
組換発現 | 生物種: ![]() |
配列 | 文字列: MSRRFTVTSL PPAASAASAD PESRRHSVAD PRRLPREDVK GDGNPKESSP FINSTDTEKG REYDGRNMAL FEEEMDTSPM VSSLLSGLA NYTNLPQGSR EHEEAENNEG GKKKPVQAPR MGTFMGVYLP CLQNIFGVIL FLRLTWVVGI AGIMESFCMV F ICCSCTML ...文字列: MSRRFTVTSL PPAASAASAD PESRRHSVAD PRRLPREDVK GDGNPKESSP FINSTDTEKG REYDGRNMAL FEEEMDTSPM VSSLLSGLA NYTNLPQGSR EHEEAENNEG GKKKPVQAPR MGTFMGVYLP CLQNIFGVIL FLRLTWVVGI AGIMESFCMV F ICCSCTML TAISMSAIAT NGVVPAGGSY YMISRSLGPE FGGAVGLCFY LGTTFAGAMY ILGTIEILLA YLFPAMAIFK AE DASGEAA AMLNNMRVYG TCVLTCMATV VFVGVKYVNK FALVFLGCVI LSILAIYAGV IKSAFDPPNF PICLLGNRTL SRH GFDVCA KLAWEGNETV TTRLWGLFCS SRLLNATCDE YFTRNNVTEI QGIPGAASGL IKENLWSSYL TKGVIVERRG MPSV GLADG TPVDMDHPYV FSDMTSYFTL LVGIYFPSVT GIMAGSNRSG DLRDAQKSIP TGTILAIATT SAVYISSVVL FGACI EGVV LRDKFGEAVN GNLVVGTLAW PSPWVIVIGS FFSTCGAGLQ SLTGAPRLLQ AISRDGIVPF LQVFGHGKAN GEPTWA LLL TACICEIGIL IASLDEVAPI LSMFFLMCYM FVNLACAVQT LLRTPNWRPR FRYYHWTLSF LGMSLCLALM FICSWYY AL VAMLIAGLIY KYIEYRGAEK EWGDGIRGLS LSAARYALLR LEEGPPHTKN WRPQLLVLVR VDQDQNVVHP QLLSLTSQ L KAGKGLTIVG SVLEGTFLDN HPQAQRAEES IRRLMEAEKV KGFCQVVISS NLRDGVSHLI QSGGLGGLQH NTVLVGWPR NWRQKEDHQT WRNFIELVRE TTAGHLALLV TKNVSMFPGN PERFSEGSID VWWIVHDGGM LMLLPFLLRH HKVWRKCKMR IFTVAQMDD NSIQMKKDLT TFLYHLRITA EVEVVEMHES DISAYTYEKT LVMEQRSQIL KQMHLTKNER EREIQSITDE S RGSIRRKN PANPRLRLNV PEETACDNEE KPEEEVQLIH DQSAPSCPSS SPSPGEEPEG ERETDPEVHL TWTKDKSVAE KN KGPSPVS SEGIKDFFSM KPEWENLNQS NVRRMHTAVR LNEVIVNKSR DAKLVLLNMP GPPRNRNGDE NYMEFLEVLT EQL DRVMLV RGGGREVITI YS UniProtKB: Solute carrier family 12 member 5 |
-実験情報
-構造解析
手法 | クライオ電子顕微鏡法 |
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![]() | 単粒子再構成法 |
試料の集合状態 | particle |
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試料調製
緩衝液 | pH: 7.4 |
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凍結 | 凍結剤: ETHANE |
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電子顕微鏡法
顕微鏡 | FEI TITAN KRIOS |
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撮影 | フィルム・検出器のモデル: GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k) 平均電子線量: 50.0 e/Å2 |
電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD |
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |
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画像解析
初期モデル | モデルのタイプ: NONE |
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最終 再構成 | 解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 3.8 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 使用した粒子像数: 66000 |
初期 角度割当 | タイプ: ANGULAR RECONSTITUTION |
最終 角度割当 | タイプ: ANGULAR RECONSTITUTION |