EMDB-16172: Cryo-EM structure of the Arabidopsis thaliana I+III2 supercomplex...

基本情報

登録情報

データベース: EMDB / ID: EMD-16172

• タイトル: Cryo-EM structure of the Arabidopsis thaliana I+III2 supercomplex (Complete conformation 2 composition)

試料

• 複合体: Mitochondrial Arabidopsis thaliana I+III2 supercomplex (Complete conformation 2 composition)
  • タンパク質・ペプチド: x 57種
• リガンド: x 12種

機能・相同性

分子機能:

plastid outer membrane / TIM22 mitochondrial import inner membrane insertion complex / anther dehiscence / vegetative to reproductive phase transition of meristem / chloroplast outer membrane / mitochondrial processing peptidase / cold acclimation / plant-type cell wall / P450-containing electron transport chain / 付加脱離酵素（リアーゼ）; 炭素-酸素リアーゼ類; デヒドラターゼ類 / NADH dehydrogenase complex / photorespiration / response to abscisic acid / protein insertion into mitochondrial inner membrane / embryo development ending in seed dormancy / respiratory chain complex III / plant-type vacuole / : / vacuole / quinol-cytochrome-c reductase / ubiquinol-cytochrome-c reductase activity / regulation of reactive oxygen species metabolic process / response to osmotic stress / porin activity / plastid / cobalt ion binding / mitochondrial electron transport, ubiquinol to cytochrome c / pore complex / protein homotrimerization / NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating) / NADH dehydrogenase activity / respiratory chain complex I / : / mitochondrial respiratory chain complex I assembly / mitochondrial electron transport, NADH to ubiquinone / electron transport coupled proton transport / acyl carrier activity / NADH dehydrogenase (ubiquinone) activity / ATP synthesis coupled electron transport / quinone binding / : / monoatomic ion transport / response to salt stress / aerobic respiration / respiratory electron transport chain / proton transmembrane transport / chloroplast / carbonate dehydratase activity / mitochondrial membrane / electron transport chain / metalloendopeptidase activity / mitochondrial intermembrane space / fatty acid biosynthetic process / 2 iron, 2 sulfur cluster binding / NAD binding / peroxisome / FMN binding / 4 iron, 4 sulfur cluster binding / mitochondrial outer membrane / carbohydrate metabolic process / mitochondrial inner membrane / electron transfer activity / oxidoreductase activity / mitochondrial matrix / copper ion binding / heme binding / nucleolus / protein homodimerization activity / mitochondrion / proteolysis / zinc ion binding / extracellular region / ATP binding / identical protein binding / membrane / nucleus / metal ion binding / plasma membrane / cytosol

ドメイン・相同性:

Cytochrome b-c1 complex subunit 8, plants / Cytochrome b-c1 complex subunit 8 / Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM22 / Putative NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 2, plant/fungi / NADH-ubiquinone oxidoreductase 11kDa subunit / NADH-ubiquinone oxidoreductase 11 kDa subunit / At2g27730-like / : / : / : / NADH-ubiquinone oxidoreductase, 21kDa subunit, N-terminal / NADH-ubiquinone oxidoreductase complex I, 21 kDa subunit / Adrenodoxin / NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 3, bacterial/plastid / NAD(P)H-quinone oxidoreductase, subunit N/subunit 2 / Cytochrome b-c1 complex, subunit 6 / Cytochrome b-c1 complex subunit 7 / Cytochrome b-c1 complex subunit 7 superfamily / Ubiquinol-cytochrome C reductase complex 14kD subunit / Cytochrome b-c1 complex subunit 9 / Cytochrome b-c1 complex subunit 8 superfamily / Cytochrome b-c1 complex subunit 9 superfamily / Ubiquinol-cytochrome C reductase, UQCRX/QCR9 like / Cytochrome b-c1 complex subunit Rieske, transmembrane domain / Ubiquinol cytochrome reductase transmembrane region / Ubiquinol-cytochrome C reductase hinge domain / Ubiquinol-cytochrome C reductase hinge domain superfamily / Ubiquinol-cytochrome C reductase hinge protein / Cytochrome c1, transmembrane anchor, C-terminal / : / Cytochrome b / : / Ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulphur subunit / Cytochrome c1 / Cytochrome C1 family / : / Hexapeptide repeat / Cytochrome b/b6, C-terminal / Cytochrome b(C-terminal)/b6/petD / Cytochrome b/b6 C-terminal region profile. / Cytochrome b/b6, C-terminal domain superfamily / Cytochrome b/b6/petB / Peptidase M16, zinc-binding site / Insulinase family, zinc-binding region signature. / Rieske iron-sulphur protein, C-terminal / Cytochrome b/b6, N-terminal / Cytochrome b/b6-like domain superfamily / Cytochrome b/b6 N-terminal region profile. / Di-haem cytochrome, transmembrane / Tim17/Tim22/Tim23/Pmp24 family / Bacterial transferase hexapeptide (six repeats) / NADH-ubiquinone oxidoreductase, subunit 10 / NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit 10 / Rieske iron-sulphur protein / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 10 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 6, mitochondrial / : / Peptidase M16, C-terminal / Peptidase M16 inactive domain / NADH dehydrogenase [ubiquinone] (complex I), alpha subcomplex subunit 1 / NADH-ubiquinone oxidoreductase MWFE subunit / Peptidase M16, N-terminal / Insulinase (Peptidase family M16) / NADH-ubiquinone oxidoreductase NDSU1/NuoG-like, 4Fe-4S domain / Zinc finger, CHCC-type / Zinc-finger domain / Metalloenzyme, LuxS/M16 peptidase-like / NADH dehydrogenase subunit 5, C-terminal / NADH dehydrogenase subunit 5 C-terminus / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 3 / NADH-ubiquinone oxidoreductase B12 subunit family / NADH:ubiquinone oxidoreductase, NDUFS5-15kDa / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 7, NDUB7 / NADH-ubiquinone oxidoreductase B18 subunit (NDUFB7) / GRIM-19 / GRIM-19 protein / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9 / NDUFB9, LYR domain / NADH:ubiquinone oxidoreductase, iron-sulphur subunit 5 / NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6, subunit NuoJ / NADH:ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase, chain 6 / NDUFA6, LYR domain / NADH dehydrogenase ubiquinone Fe-S protein 4-like superfamily / NADH dehydrogenase ubiquinone Fe-S protein 4 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] (complex I), alpha subcomplex, subunit 2 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 5 / NADH dehydrogenase ubiquinone Fe-S protein 4, mitochondrial / Trimeric LpxA-like superfamily / ETC complex I subunit conserved region / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12 / NADH ubiquinone oxidoreductase subunit NDUFA12 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] (complex I), alpha subcomplex, subunit 6 / NADH-quinone oxidoreductase, chain G, C-terminal / : / NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit G, C-terminal / NADH-quinone oxidoreductase subunit 3, ferredoxin-like domain / SLBB domain / : / NADH dehydrogenase [ubiquinone] (complex I), alpha subcomplex, subunit 8

構成要素:

(thale cress) hypothetical protein / (thale cress) hypothetical protein / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6 / Cytochrome b / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L / (thale cress) hypothetical protein / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 5 / Cytochrome b-c1 complex subunit 7-2, mitochondrial / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 2 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 2, mitochondrial / Outer envelope pore protein 16-3, chloroplastic/mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 3-A / Acyl carrier protein 2, mitochondrial / Acyl carrier protein 1, mitochondrial / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 2 / Cytochrome b-c1 complex subunit 6-1, mitochondrial / Probable mitochondrial-processing peptidase subunit beta, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 7, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8-A, mitochondrial / At4g16450 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 2 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8-B / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13-A / Uncharacterized protein At1g67785 / Transmembrane protein / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9 / Excitatory amino acid transporter / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 10-B / Cytochrome b-c1 complex subunit Rieske-1, mitochondrial / Cytochrome b-c1 complex subunit 10, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3 / Gamma carbonic anhydrase 2, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 1 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 1, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 2 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial / Cytochrome c1 2, heme protein, mitochondrial / Probable NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 5, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial / Gamma carbonic anhydrase 1, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 6 / Cytochrome b-c1 complex subunit 9, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 5-B / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 6, mitochondrial / Probable NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12 / Cytochrome b-c1 complex subunit 8-1, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 7 / ESSS subunit of NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I) protein / Gamma carbonic anhydrase-like 2, mitochondrial / At2g46540/F11C10.23 / Probable mitochondrial-processing peptidase subunit alpha-1, mitochondrial / Uncharacterized protein At2g27730, mitochondrial

• 生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ) / thale cress (シロイヌナズナ)
• 手法: 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 2.8 Å
• データ登録者: Klusch N / Kuehlbrandt W

資金援助

ドイツ, 1件

Organization	Grant number	国
Max Planck Society		ドイツ

• 引用: ジャーナル: Nat Plants / 年: 2023; タイトル: Cryo-EM structure of the respiratory I + III supercomplex from Arabidopsis thaliana at 2 Å resolution.; 著者: Niklas Klusch / Maximilian Dreimann / Jennifer Senkler / Nils Rugen / Werner Kühlbrandt / Hans-Peter Braun / ; 要旨: Protein complexes of the mitochondrial respiratory chain assemble into respiratory supercomplexes. Here we present the high-resolution electron cryo-microscopy structure of the Arabidopsis respiratory supercomplex consisting of complex I and a complex III dimer, with a total of 68 protein subunits and numerous bound cofactors. A complex I-ferredoxin, subunit B14.7 and P9, a newly defined subunit of plant complex I, mediate supercomplex formation. The component complexes stabilize one another, enabling new detailed insights into their structure. We describe (1) an interrupted aqueous passage for proton translocation in the membrane arm of complex I; (2) a new coenzyme A within the carbonic anhydrase module of plant complex I defining a second catalytic centre; and (3) the water structure at the proton exit pathway of complex III with a co-purified ubiquinone in the Q site. We propose that the main role of the plant supercomplex is to stabilize its components in the membrane.

履歴

登録	2022年11月18日	-
ヘッダ(付随情報) 公開	2023年5月10日	-
マップ公開	2023年5月10日	-
更新	2023年5月10日	-
現状	2023年5月10日	処理サイト: PDBe / 状態: 公開

マップ

• ファイル: ダウンロード / ファイル: emd_16172.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 1.6 GB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
• ボクセルのサイズ: X=Y=Z: 0.573 Å

密度

表面レベル	登録者による: 0.013
最小 - 最大	-0.037389472 - 0.08770524
平均 (標準偏差)	0.00016931392 (±0.0018781789)

• 対称性: 空間群: 1

詳細

EMDB XML:

マップ形状	Axis order X Y Z Origin 0 0 0 サイズ 750 750 750 Spacing 750 750 750
セル	A=B=C: 429.75 Å α=β=γ: 90.0 °

添付データ

試料の構成要素

全体 : Mitochondrial Arabidopsis thaliana I+III2 supercomplex (Complete ...

• 全体: 名称: Mitochondrial Arabidopsis thaliana I+III2 supercomplex (Complete conformation 2 composition)

要素

• 複合体: Mitochondrial Arabidopsis thaliana I+III2 supercomplex (Complete conformation 2 composition)
  • タンパク質・ペプチド: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3
  • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 7, mitochondrial
  • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3
  • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 2
  • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 2, mitochondrial
  • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial
  • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 1, mitochondrial
  • タンパク質・ペプチド: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1
  • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8-A, mitochondrial
  • タンパク質・ペプチド: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6
  • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase subunit 4L
  • タンパク質・ペプチド: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 5
  • タンパク質・ペプチド: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4
  • タンパク質・ペプチド: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 2
  • タンパク質・ペプチド: AT3G07480.1
  • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial
  • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial
  • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 6, mitochondrial
  • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 2
  • タンパク質・ペプチド: Acyl carrier protein 1, mitochondrial
  • タンパク質・ペプチド: Acyl carrier protein 2, mitochondrial
  • タンパク質・ペプチド: Probable NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 5, mitochondrial
  • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 6
  • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8-B
  • タンパク質・ペプチド: Outer envelope pore protein 16-3, chloroplastic/mitochondrial
  • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13-A
  • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 1
  • タンパク質・ペプチド: At2g46540/F11C10.23
  • タンパク質・ペプチド: Transmembrane protein
  • タンパク質・ペプチド: Excitatory amino acid transporter
  • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 5-B
  • タンパク質・ペプチド: At4g16450
  • タンパク質・ペプチド: ESSS subunit of NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I) protein
  • タンパク質・ペプチド: P1
  • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 2
  • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 3-A
  • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mitochondrial
  • タンパク質・ペプチド: B15 -- 1 beta subcomplex subunit 4
  • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9
  • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 7
  • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 10-B
  • タンパク質・ペプチド: Probable NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12
  • タンパク質・ペプチド: Uncharacterized protein At1g67785
  • タンパク質・ペプチド: Uncharacterized protein At2g27730, mitochondrial
  • タンパク質・ペプチド: Gamma carbonic anhydrase-like 2, mitochondrial
  • タンパク質・ペプチド: Gamma carbonic anhydrase 2, mitochondrial
  • タンパク質・ペプチド: Gamma carbonic anhydrase 1, mitochondrial
  • タンパク質・ペプチド: Probable mitochondrial-processing peptidase subunit alpha-1, mitochondrial
  • タンパク質・ペプチド: Probable mitochondrial-processing peptidase subunit beta, mitochondrial
  • タンパク質・ペプチド: Cytochrome b
  • タンパク質・ペプチド: Cytochrome b-c1 complex subunit Rieske-1, mitochondrial
  • タンパク質・ペプチド: Cytochrome c1 2, heme protein, mitochondrial
  • タンパク質・ペプチド: Cytochrome b-c1 complex subunit 7-2, mitochondrial
  • タンパク質・ペプチド: Cytochrome b-c1 complex subunit 8-1, mitochondrial
  • タンパク質・ペプチド: Cytochrome b-c1 complex subunit 6-1, mitochondrial
  • タンパク質・ペプチド: Cytochrome b-c1 complex subunit 9, mitochondrial
  • タンパク質・ペプチド: Cytochrome b-c1 complex subunit 10, mitochondrial
• リガンド: IRON/SULFUR CLUSTER
• リガンド: FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER
• リガンド: FLAVIN MONONUCLEOTIDE
• リガンド: Ubiquinone-9
• リガンド: FE (III) ION
• リガンド: NADPH DIHYDRO-NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE
• リガンド: ZINC ION
• リガンド: S-[2-({N-[(2R)-2-hydroxy-3,3-dimethyl-4-(phosphonooxy)butanoyl]-beta-alanyl}amino)ethyl] dodecanethioate
• リガンド: CROTONYL COENZYME A
• リガンド: PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE
• リガンド: 2,3-DIMETHOXY-5-METHYL-6-(3,11,15,19-TETRAMETHYL-EICOSA-2,6,10,14,18-PENTAENYL)-[1,4]BENZOQUINONE
• リガンド: UBIQUINONE-7

超分子 #1: Mitochondrial Arabidopsis thaliana I+III2 supercomplex (Complete ...

• 超分子: 名称: Mitochondrial Arabidopsis thaliana I+III2 supercomplex (Complete conformation 2 composition); タイプ: complex / ID: 1 / キメラ: Yes / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#57
• 由来(天然): 生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)

分子 #1: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3

• 分子: 名称: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
• 由来(天然): 生物種: thale cress (シロイヌナズナ)
• 分子量: 理論値: 13.969396 KDa

配列

文字列:

(FME)MLEFAPIFI YLVISLLVSL ILLGVPFLFA SNSSTYPEKL SAYECGFDPF GDARSRFDIR FYLVSILFLI FDLEVT FFF PWAVSLNKID LFGFWSMMAF LFILTIGFLY EWKRGALDWE

分子 #2: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 7, mitochondrial

• 分子: 名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 7, mitochondrial; タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
• 由来(天然): 生物種: thale cress (シロイヌナズナ)
• 分子量: 理論値: 24.071949 KDa

配列

文字列:

MAMITRNTAT RLPLLLQSQR AVAAASVSHL HTSLPALSPS TSPTSYTRPG PPSTSPPPPG LSKAAEFVIS KVDDLMNWAR TGSIWPMTF GLACCAVEMM HTGAARYDLD RFGIIFRPSP RQSDCMIVAG TLTNKMAPAL RKVYDQMPEP RWVISMGSCA N GGGYYHYS YSVVRGCDRI VPVDIYVPGC PPTAEALLYG LLQLQKKINR RKDFLHWWNK

分子 #3: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3

• 分子: 名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3; タイプ: protein_or_peptide / ID: 3 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
• 由来(天然): 生物種: thale cress (シロイヌナズナ)
• 分子量: 理論値: 22.91091 KDa

配列

文字列:

MDNQFIFKYS WETLPKKWVK KMERSEHGNR FDTNTDYLFQ LLCFLKLHTY TRVQVLIDIC GVDYPSRKRR FEVVYNLLST RYNSRIRVQ TSADEVTRIS SVVSLFPSAG WWEREVWDMF GVSFINHPDL RRILTDYGFE GHPLRKDFPL SGYVQVRYDD P EKRVVSEP IEMTQEFRYF DFASPWEQRS DG

分子 #4: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 2

• 分子: 名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 2; タイプ: protein_or_peptide / ID: 4 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
• 由来(天然): 生物種: thale cress (シロイヌナズナ)
• 分子量: 理論値: 45.062922 KDa

配列

文字列:

MTTRKRQIKN FTLNFGPQHP AAHGVLRLVL EMNGEVVERA EPHIGLLHRG TEKLIEYKTY LQALPYFDRL DYVSMMAQEH AYSLAVEKL LNCEVPLRAQ YIRVLFCEIT RILNHLLALT THAMDVGALT PFLWAFEERE KLLEFYERVS GARMHASFIR P GGVAQDLP LGLCRDIDSF TQQFASRIDE LEEMLTGNRI WKQRLVDIGT VTAQQAKDWG FSGVMLRGSG VCWDLRRAAP YD VYDQLDF DVPVGTRGDC YDRYCIRIEE MRQSLRIIVQ CLNQMPSGMI KADDRKLCPP SRCRMKLSME SLIHHFELYT EGF SVPASS TYTAVEAPKG EFGVFLVSNG SNRPYRCKIR APGFAHLQGL DFMSKHHMLA DVVTIIGTQD IVFGEVDR

分子 #5: NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 2, mitochondrial

• 分子: 名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 2, mitochondrial; タイプ: protein_or_peptide / ID: 5 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
• 由来(天然): 生物種: thale cress (シロイヌナズナ)
• 分子量: 理論値: 28.423607 KDa

配列

文字列:

MLARLAAKRL LEIRQVFRQP TSQVTRSLST ALNYHLDSPD NKPDLPWEFS EANQSKVKEI LSYYPSNYKQ SAVIPLLDLA QQQNGGWLP VSAMNAVAKV IEVAPIRVYE VATFYSMFNR AKVGKYHLLV CGTTPCMIRG SRDIESALLD HLGVKRGEVT K DGLFSVGE MECMGCCVNA PMITVADYSN GSEGYTYNYF EDVTPEKVVE IVEKLRKGEK PPHGTQNPKR IKCGPEGGNK TL LGEPKPP QFRDLDAC

分子 #6: NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial

• 分子: 名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial; タイプ: protein_or_peptide / ID: 6 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
• 由来(天然): 生物種: thale cress (シロイヌナズナ)
• 分子量: 理論値: 53.522418 KDa

配列

文字列:

MAPVRGILGL QRAVSIWKES NRLTPALRSF STQAASTSTT PQPPPPPPPP EKTHFGGLKD EDRIFTNLYG LHDPFLKGAM KRGDWHRTK DLVLKGTDWI VNEMKKSGLR GRGGAGFPSG LKWSFMPKVS DGRPSYLVVN ADESEPGTCK DREIMRHDPH K LLEGCLIA GVGMRASAAY IYIRGEYVNE RLNLEKARRE AYAAGLLGKN ACGSGYDFEV YIHFGAGAYI CGEETALLES LE GKQGKPR LKPPFPANAG LYGCPTTVTN VETVAVSPTI LRRGPEWFSS FGRKNNAGTK LFCISGHVNK PCTVEEEMSI PLK ELIERH CGGVRGGWDN LLAIIPGGSS VPLIPKNICE DVLMDFDALK AVQSGLGTAA VIVMDKSTDV VDAIARLSYF YKHE SCGQC TPCREGTGWL WMIMERMKVG NAKLEEIDML QEVTKQIEGH TICALGDAAA WPVQGLIRHF RPELERRIRE RAERE LLQA AA

分子 #7: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 1, mitochondrial

• 分子: 名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 1, mitochondrial; タイプ: protein_or_peptide / ID: 7 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
• 由来(天然): 生物種: thale cress (シロイヌナズナ)
• 分子量: 理論値: 81.619367 KDa

配列

文字列:

MGLGILASRT IRPASRLLQS QTSNFFLRTI VSKPELQSPE SAAVSEPEPP TQILPPRNPV GGARVHFSNP EDAIEVFVDG YAVKVPKGF TVLQACEVAG VDIPRFCYHS RLSIAGNCRM CLVEVEKSPK PVASCAMPAL PGMKIKTDTP IAKKAREGVM E FLLMNHPL DCPICDQGGE CDLQDQSMAF GSDRGRFTEM KRSVVDKNLG PLVKTVMTRC IQCTRCVRFA SEVAGVQDLG IL GRGSGEE IGTYVEKLMT SELSGNVIDI CPVGALTSKP FAFKARNWEL KATETIDVSD AVGSNIRVDS RGPEVMRIIP RLN EDINEE WISDKTRFCY DGLKRQRLSD PMIRDSDGRF KAVSWRDALA VVGDIIHQVK PDEIVGVAGQ LSDAESMMVL KDFV NRMGS DNVWCEGTAA GVDADLRYSY LMNTSISGLE NADLFLLIGT QPRVEAAMVN ARICKTVRAS NAKVGYVGPP AEFNY DCKH LGTGPDTLKE IAEGRHPFCT ALKNAKNPAI IVGAGLFNRT DKNAILSSVE SIAQANNVVR PDWNGLNFLL QYAAQA AAL DLGLIQQSAK ALESAKFVYL MGADDVNVDK IPKDAFVVYQ GHHGDKAVYR ANVILPASAF TEKEGTYENT EGFTQQT VP AVPTVGDARD DWKIVRALSE VSGVKLPYNS IEGVRSRIKS VAPNLVHTDE REPAAFGPSL KPECKEAMST TPFQTVVE N FYMTNSITRA SKIMAQCSAV LLKKPFV

分子 #8: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1

• 分子: 名称: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 8 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
• 由来(天然): 生物種: thale cress (シロイヌナズナ)
• 分子量: 理論値: 36.02007 KDa

配列

文字列:

MYIAVPAEIL GIILPLLLGV AFLVLAERKV MAFVQRRKGP DVVGSFGLLQ PLADGLKLIL KEPISPSSAN FFLFRMAPVA TFMLSLVAW AVVPFDYGMV LSDLNIGLLY LFAISSLGVY GIIIAGRSSN SKYAFLGALR SAAQMVSYEV SIGLILITVL I CVGSCNLS EIVMAQKQIW FGIPLFPVLV MFFISCLAET NRAPFDLPEA EAELVAGYNV EYSSMGFALF FLGEYANMIL MS GLCTLFF LGGWLPILDL PIFKKIPGSI WFSIKVLFFL FLYIWVRAAF PRYRYDQLMG LGWKVFLPLS LAWVVSVSGL LVT FQWLP

分子 #9: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8-A, mitochondrial

• 分子: 名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8-A, mitochondrial; タイプ: protein_or_peptide / ID: 9 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
• 由来(天然): 生物種: thale cress (シロイヌナズナ)
• 分子量: 理論値: 25.536801 KDa

配列

文字列:

MASILARRSL NTLRARHLVL SGQALQGSHL SRLQSRGISY GSNKDDEEAE QLSKEISKDW NTVFERSINT LFLTEMVRGL SLTLKYFFD PKVTINYPFE KGPLSPRFRG EHALRRYPTG EERCIACKLC EAVCPAQAIT IEAEEREDGS RRTTRYDIDM T KCIYCGFC QEACPVDAIV EGPNFEFATE THEELLYDKE KLLENGDRWE TEIAENLRSE SLYR

分子 #10: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6

• 分子: 名称: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 10 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
• 由来(天然): 生物種: thale cress (シロイヌナズナ)
• 分子量: 理論値: 23.690385 KDa

配列

文字列:

MILSVLSSLA LVSGLMVVRA KNPVHSVLFF ILVFCDTSGL LLLLGLDFFA MIFLVVYIGA IAVLFLFVVM MFHIQIAEIH EEVLRYLPV SGIIGLIFWW EMFFILDNES IPLLPTQRNT TSLRYTVYAG KVRSWTNLET LGNLLYTYYF VWFLVSSLIL L VAMIGAIV LTMHRTTKVK RQDVFRRNAI DFRRTIMRRT TDPLTIY

分子 #11: NADH dehydrogenase subunit 4L

• 分子: 名称: NADH dehydrogenase subunit 4L / タイプ: protein_or_peptide / ID: 11 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: thale cress (シロイヌナズナ)
• 分子量: 理論値: 11.193559 KDa

配列

文字列:

(FME)DLIKYFTFS MIIFILGIWG ILLNRRNILI MLMSIELMLL AVNLNFLVFS VSLDDMMGQV FALLVLTVAA AESAIG LAI FVITFRVRGT IAVEFINSIQ G

分子 #12: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 5

• 分子: 名称: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 12 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
• 由来(天然): 生物種: thale cress (シロイヌナズナ)
• 分子量: 理論値: 74.497977 KDa

配列

文字列:

MYLLIVFLPL LGSSVAGFFG RFLGSEGSAI MTTTCVSFSS ILSLIAFYEV ALGASACYLR IAPWISSEMF DASWGFLFDS LTVVMLIVV TFISSLVHLY SISYMSEDPH SPRFMCYLSI FTFFMLMLVT GDNFLQLFLG WEGVGLASYL LIHFWFTRLQ A DKAAIKAM LVNRVGDFGL ALGILGCFTL FQTVDFSTIF ACASVPRNSW IFCNMRLNAI SLICILLFIG AVGKSAQIGL HT WLPDAME GPTPVSALIH AATMVTAGVF MIARCSPLFE YSPTALIVIT FAGAMTSFLA ATTGILQNDL KRVIAYSTCS QLG YMIFAC GISNYSVSVF HLMNHAFFKA LLFLSAGSVI HAMSDEQDMR KMGGLASSFP LTYAMMLIGS LSLIGFPFLT GFYS KDVIL ELAYTKYTIS GNFAFWLGSV SVLFTSYYSF RLLFLTFLVP TNSFGRDISR CHDAPIPMAI PLILLALGSL FVGYL AKDM MIGLGTNFWA NSLLVLPKNE ILAESEFAAP TIIKLIPILF STLGAFVAYN VNLVADQFQR AFQTSTFCNR LYSFFN KRW FFDQVLNDFL VRSFLRFGYE VSFEALDKGA IEILGPYGIS YTFRRLAERI SQLQSGFVYH YAFAMLLGLT LFVTFFC MW DSLSSWVDNR LSFILIVSSF YTKSSQE

分子 #13: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4

• 分子: 名称: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 13 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
• 由来(天然): 生物種: thale cress (シロイヌナズナ)
• 分子量: 理論値: 55.995664 KDa

配列

文字列:

MLEHFCECYF NLSGLILCPV LGSIILLFIP NSRIRLIRLI GLCASLITFL YSLVLWIQFD SSTAKFQFVE SLRWLPYENI NFYLGIDGI SLFFVILTTF LIPICILVGW SGMRSYGKEY IIAFLICEFL MIAVFCMLDL LLFYVFFESV LIPMFIIIGV W GSRQRKIK AAYQFFLYTL LGSLFMLLAI LLILFQTGTT DLQILLTTEF SERRQIFLWI AFFASFAVKV PMVPVHIWLP EA HVEAPTA GSVILAGILL KFGTYGFLRF SIPMFPEATL CFTPFIYTLS AIAIIYTSLT TLRQIDLKKI IAYSSVAHMN LVT IGMFSL NIQGIGGSIL LMLSHGLVSS ALFLCVGVLY DRHKTRLVRY YGGLVSTMPN FSTIFFFFTL ANMSLPGTSS FIGE FLILV GAFQRNSLVA TLAALGMILG AAYSLWLYNR VVSGNLKPDF LHKFSDLNGR EVFIFIPFLV GLVWMGVYPK VFLDC MHTS VSNLVQHGKF H

分子 #14: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 2

• 分子: 名称: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 14 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
• 由来(天然): 生物種: thale cress (シロイヌナズナ)
• 分子量: 理論値: 55.486836 KDa

配列

文字列:

MKAEFVRILP HMFNLFLAVF PEIFIINATF ILLIHGVVFS TSKKYDYPPL ASNVGWLGLL SVLITLLLLA AGAPLLTIAH LFWNNLFRR DNFTYFCQIF LLLSTAGTIS MCFDFFDQER FDAFEFIVLI LLSTCGMLFM ISAYDLIAMY LAIELQSLCF Y VIAASKRK SEFSTEAGLK YLILGAFSSG ILLFGCSMIY GSTGATHFDQ LAKILTGYEI TGARSSGIFM GILFIAVGFL FK ITAVPFH MWAPDIYEGS PTPVTAFLSI APKISIFANI LRVFIYGSYG ATLQQIFFFC SIASMILGAL AAMAQTKVKR LLA YSSIGH VGYICIGFSC GTIEGIQSLL IGIFIYALMT MDAFAIVLAL RQTRVKYIAD LGALAKTNPI LAITFSITMF SYAG IPPLA GFCSKFYLFF AALGCGAYFL ALVGVVTSVI GCFYYIRLVK RMFFDTPRTW ILYEPMDRNK SLLLAMTSFF ITLFL LYPS PLFSVTHQMA LSLYL

分子 #15: AT3G07480.1

• 分子: 名称: AT3G07480.1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 15 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: thale cress (シロイヌナズナ)
• 分子量: 理論値: 17.626197 KDa

配列

文字列:

MATTLQKLSS QIHRLSPFTR SLIVRTSATS APSPSLGSKK VSDRIVKLSA IDPDGYKQDI IGLSGQTLLR ALTHTGLIDP ASHRLDDIE ACSAECEVQI AEEWLEKLPP RTYDEEYVLK RSSRSRILNK HSRLGCQVVL TQELQGMVVA VPEAKPWDIP

分子 #16: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mit...

• 分子: 名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial; タイプ: protein_or_peptide / ID: 16 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: thale cress (シロイヌナズナ)
• 分子量: 理論値: 43.988652 KDa

配列

文字列:

MQVVSRRLVQ RPLVGGASIY SSSSLRSLYG VSNHLNGTDN CRYSSSLATK GVGHLARKGT GGRSSVSGIV ATVFGATGFL GRYLVQQLA KMGSQVLVPF RGSEDSPRHL KLMGDLGQVV PMKFDPRDED SIKAVMAKAN VVINLIGREY ETRNFSFEDA N HHIAEKLA LVAKEHGGIM RYIQVSCLGA SVSSPSRMLR AKAAAEEAVL NALPEATIMR PATMIGTEDR ILNPWSMFVK KY GFLPLIG GGTTKFQPVY VVDVAAAIVA ALKDDGSSMG KTYELGGPDV FTTHELAEIM YDMIREWPRY VKLPFPIAKA MAA PRDFMV NKVPFPLPSP QIFNLDQINA LTTDTLVSDN ALKFQDLDLV PHKLKGYPVE FLIQYRKGGP NFGSTVSEKI PTDF YP

分子 #17: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial

• 分子: 名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial; タイプ: protein_or_peptide / ID: 17 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: thale cress (シロイヌナズナ)
• 分子量: 理論値: 17.160445 KDa

配列

文字列:

MALCATTQRT IRIAATLRRV ARPFATDAVV ESDYKRGEIG KVSGIPEEHL SRKVIIYSPA RTATQSGSGK LGKWKINFVS TLKWENPLM GWTSTGDPYA NVGDSALAFD SEEAAKSFAE RHGWDYKVKK PNTPLLKVKS YSDNFKWKGN PQPEN

分子 #18: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 6, mitochondrial

• 分子: 名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 6, mitochondrial; タイプ: protein_or_peptide / ID: 18 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: thale cress (シロイヌナズナ)
• 分子量: 理論値: 12.251122 KDa

配列

文字列:

MASNLLKALI RSQILPSSRR NFSVATTQLG IPTDDLVGNH TAKWMQDRSK KSPMELISEV PPIKVDGRIV ACEGDTNPAL GHPIEFICL DLNEPAICKY CGLRYVQDHH H

分子 #19: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 2

• 分子: 名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 2; タイプ: protein_or_peptide / ID: 19 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: thale cress (シロイヌナズナ)
• 分子量: 理論値: 10.865765 KDa

配列

文字列:

MAWRGSISKS MKELRILLCQ SSPASAPTRT FVEKNYKDLK SLNPKLPILI RECSGVQPQM WARYDMGVER CVNLDGLTEP QILKALENL VKSGATKA

分子 #20: Acyl carrier protein 1, mitochondrial

• 分子: 名称: Acyl carrier protein 1, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 20 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: thale cress (シロイヌナズナ)
• 分子量: 理論値: 13.735628 KDa

配列

文字列:

MALRNAILRH LRVPVQTLGL NQSKIGFLGT IRSFSSHDDH LSREAVVDRV LDVVKSFPKV DPSKVTPEVH FQNDLGLDSL DTVEIVMAI EEEFKLEIPD KEADKIDSCS LAIEYVYNHP MSS

分子 #21: Acyl carrier protein 2, mitochondrial

• 分子: 名称: Acyl carrier protein 2, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 21 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: thale cress (シロイヌナズナ)
• 分子量: 理論値: 14.183111 KDa

配列

文字列:

MAARGAMLRY LRVNVNPTIQ NPRECVLPFS ILLRRFSEEV RGSFLDKSEV TDRVLSVVKN FQKVDPSKVT PKANFQNDLG LDSLDSVEV VMALEEEFGF EIPDNEADKI QSIDLAVDFI ASHPQAK

分子 #22: Probable NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subun...

• 分子: 名称: Probable NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 5, mitochondrial; タイプ: protein_or_peptide / ID: 22 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: thale cress (シロイヌナズナ)
• 分子量: 理論値: 19.201906 KDa

配列

文字列:

MFLRAIGRPL LAKVKQTTGI VGLDVVPNAR AVLIDLYSKT LKEIQAVPED EGYRKAVESF TRQRLNVCKE EEDWEMIEKR LGCGQVEEL IEEARDELTL IGKMIEWDPW GVPDDYECEV IENDAPIPKH VPQHRPGPLP EQFYKTLEGL IAESKTEIPA A TPSDPQLK E

分子 #23: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 6

• 分子: 名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 6; タイプ: protein_or_peptide / ID: 23 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: thale cress (シロイヌナズナ)
• 分子量: 理論値: 15.102261 KDa

配列

文字列:

MAAPFALRKI GVPPNSANLT EARRRVFDFF RAACRSIPTI MDIYNLQDVV APSQLRYAIS AQIRNNAHIT DPKVIDLLIF KGMEELTDI VDHAKQRHHI IGQYVVGEGL VQNTGNKDQG KTDFLKNFYT SNYF

分子 #24: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8-B

• 分子: 名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8-B; タイプ: protein_or_peptide / ID: 24 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: thale cress (シロイヌナズナ)
• 分子量: 理論値: 11.985954 KDa

配列

文字列:

MSSAVDATGN PIPTSAVLTA SAKHIGMRCM PENVAFLKCK KNDPNPEKCL DKGRDVTRCV LGLLKDLHQK CQKEMDDYVG CMYYYTNEF DLCRKEQEAF EKVCPLK

分子 #25: Outer envelope pore protein 16-3, chloroplastic/mitochondrial

• 分子: 名称: Outer envelope pore protein 16-3, chloroplastic/mitochondrial; タイプ: protein_or_peptide / ID: 25 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: thale cress (シロイヌナズナ)
• 分子量: 理論値: 17.017348 KDa

配列

文字列:

MDPAEMRYLE EEDGPLMKTI KGSITGFGAG TIYGTILATW KDVPRVERNV ALPGLIRTLK MMGTHGLTFA AIGGVYIGVE QLVQNFRSK RDFYNGAIGG FVAGASVLGY RARSIPTAIA AGATLAVTSA LIDSGGQTTR VDNGREYYPY TVEKRAEADS

分子 #26: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13-A

• 分子: 名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13-A; タイプ: protein_or_peptide / ID: 26 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: thale cress (シロイヌナズナ)
• 分子量: 理論値: 16.145584 KDa

配列

文字列:

MTEAMIRNKP GMASVKDMPL LQDGPPPGGF APVRYARRIS NTGPSAMAMF LAVSGAFAWG MYQVGQGNKI RRALKEEKYA ARRTILPIL QAEEDERFVS EWKKYLEYEA DVMKDVPGWK VGENVYNSGR WMPPATGELR PDVW

分子 #27: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 1

• 分子: 名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 1; タイプ: protein_or_peptide / ID: 27 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: thale cress (シロイヌナズナ)
• 分子量: 理論値: 7.349628 KDa

配列

文字列:

MSLVWLEAML PLGIIGGMLC IMGNSQYYIH KAYHGRPKHI GHDEWDVAME RRDKKVVEKA AAPSS

分子 #28: At2g46540/F11C10.23

• 分子: 名称: At2g46540/F11C10.23 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 28 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: thale cress (シロイヌナズナ)
• 分子量: 理論値: 6.810177 KDa

配列

文字列:

MPVMEKLRMF VAQEPVVAAS CLIGGVGLFL PAVVRPILDS LEASKQVKAP PLTDVIAGVT GKKQS

分子 #29: Transmembrane protein

• 分子: 名称: Transmembrane protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 29 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: thale cress (シロイヌナズナ)
• 分子量: 理論値: 9.876422 KDa

配列

文字列:

MGGGDHGHGA EGGDFRAKVW SMTGGPNCRP KHWRRNTAIA MFGVFLVCIP IAKLSAKLEQ RPHMPVRPIP SQIWCKNFGT KDDYEKEH

分子 #30: Excitatory amino acid transporter

• 分子: 名称: Excitatory amino acid transporter / タイプ: protein_or_peptide / ID: 30 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: thale cress (シロイヌナズナ)
• 分子量: 理論値: 9.220749 KDa

配列

文字列:

MPISATMVGA LLGLGTQMYS NALRKLPYMR HPWEHVVGMG LGAVFANQLV KWDVKLKEDL DVMLAKARAA NERRYFDEDR D

分子 #31: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 5-B

• 分子: 名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 5-B; タイプ: protein_or_peptide / ID: 31 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: thale cress (シロイヌナズナ)
• 分子量: 理論値: 9.914133 KDa

配列

文字列:

MASGWGITGN KGRCYDFWMD FSECMSHCRE PKDCTLLRED YLECLHHSKE FQRRNRIYKE EQRKLRAASR KGEETGDGTH THH

分子 #32: At4g16450

• 分子: 名称: At4g16450 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 32 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: thale cress (シロイヌナズナ)
• 分子量: 理論値: 11.383019 KDa

配列

文字列:

(FME)NTDITALEK AQYPVVDRNP AFTKVVGNFS TLDYLRFSTI TGISVTVGYL SGIKPGIKGP SMVTGGLIGL MGGFMY AYQ NSAGRLMGFF PNDGEVASYQ KRGGFSK

分子 #33: ESSS subunit of NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I) protein

• 分子: 名称: ESSS subunit of NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I) protein; タイプ: protein_or_peptide / ID: 33 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: thale cress (シロイヌナズナ)
• 分子量: 理論値: 12.648286 KDa

配列

文字列:

MPSTQSLTVA AKTLRNRIFS RSGSTSAGPS RWATPGHEER PKGYFMNRTP PAPGQSRKWE DWELPCYITS FLTIVILGVG LNAKPDLSI ETWAHQKALE RLEMEKLATA GDSSD

分子 #34: P1

• 分子: 名称: P1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 34 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: thale cress (シロイヌナズナ)
• 分子量: 理論値: 11.808244 KDa

配列

文字列:

MGFIMEFAEN LVLRLMENPE ERDRKAREHI YEMHERCKKI KEMWALPIRP YGFWTFERHN AQLRWDPQIS QVAGRRDPYD DLLEDNYTP PSSSSSSSD

分子 #35: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 2

• 分子: 名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 2; タイプ: protein_or_peptide / ID: 35 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: thale cress (シロイヌナズナ)
• 分子量: 理論値: 7.58259 KDa

配列

文字列:

MGGGGHGGGI TYKGVTVHTP KTWHTVTGKG LCAVMWFWIL YRAKQDGPVV MGWRHPWDGH GDHGHGDHH

分子 #36: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 3-A

• 分子: 名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 3-A; タイプ: protein_or_peptide / ID: 36 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: thale cress (シロイヌナズナ)
• 分子量: 理論値: 8.064313 KDa

配列

文字列:

MAKPLGTTGE FFRRRDEWRK HPMLSNQMRH ALPGIGIGVG AFCVYLVGEQ IYSKLMAPSS QSSHQKQPAP SH

分子 #37: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mito...

• 分子: 名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mitochondrial; タイプ: protein_or_peptide / ID: 37 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: thale cress (シロイヌナズナ)
• 分子量: 理論値: 13.225222 KDa

配列

文字列:

MAGRLSGVAS RIMGGNGVVA RSVGSSLRQR AGMGLPVGKH IVPDKPLSVN DELMWDNGTA FPEPCIDRIA DTVGKYEALA WLSGGLGFF VGLGLLAVLN DKASKVPFTP RVYPYDNLRV ELGGEP

分子 #38: B15 -- 1 beta subcomplex subunit 4

• 分子: 名称: B15 -- 1 beta subcomplex subunit 4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 38 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: thale cress (シロイヌナズナ)
• 分子量: 理論値: 8.305539 KDa

配列

文字列:

MGGGMETNKN KFIEDWGSAR ENLEHNFRWT RRNFALIGIF GIALPIIVYK GIVKDFHMQD EDAGRPHRKF L

分子 #39: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9

• 分子: 名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9; タイプ: protein_or_peptide / ID: 39 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: thale cress (シロイヌナズナ)
• 分子量: 理論値: 13.638335 KDa

配列

文字列:

MSGVSTAAYF ARRAAQKERV RILYRRALKD TLNWAVHRHI FYRDASDLRE KFNVNQDVED VDRIDKLIAH GEAEYNKWRH PDPYIVPWA PGGSKFCRNP TPPAGIEIVY NYGLEDNP

分子 #40: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 7

• 分子: 名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 7; タイプ: protein_or_peptide / ID: 40 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: thale cress (シロイヌナズナ)
• 分子量: 理論値: 11.757832 KDa

配列

文字列:

MEVPGSSKKM IATQEEMSAA KIALGSRDMC AHLLIPLNKC RQAEFYLPWK CEDERHVYEK CEYELVMERM LAMKKIREEE ALAKQNKLQ GNAAVPLIPK TANA

分子 #41: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 10-B

• 分子: 名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 10-B; タイプ: protein_or_peptide / ID: 41 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: thale cress (シロイヌナズナ)
• 分子量: 理論値: 12.462276 KDa

配列

文字列:

MGRKKGLPEF EESAPDGFDP ENPYKDPVAM VEMREHIVRE KWIQIEKAKI LREKVKWCYR VEGVNHYQKC RHLVQQYLDS TRGVGWGKD HRPISLHGPK PEAVEAE

分子 #42: Probable NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12

• 分子: 名称: Probable NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12; タイプ: protein_or_peptide / ID: 42 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: thale cress (シロイヌナズナ)
• 分子量: 理論値: 18.346736 KDa

配列

文字列:

MALTVAKSAL EAIREKGLGG FMRMIREEGF MRCLPDGNLL QTKIHNIGAT LVGVDKFGNK YYQKLGDTQY GRHRWVEYAS KDRYNASQV PAEWHGWLHF ITDHTGDELL SLKPKRYGLE HKENFSGEGD AYIYHSKGHT LNPGQKNWTR YQSWVPTKTQ

分子 #43: Uncharacterized protein At1g67785

• 分子: 名称: Uncharacterized protein At1g67785 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 43 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: thale cress (シロイヌナズナ)
• 分子量: 理論値: 7.54679 KDa

配列

文字列:

MVKVLTYFGM TLAAFAFWQS MDKVHVWIAL HQDEKQERME KEAEVRRVRA ELLRKAREED PLA

分子 #44: Uncharacterized protein At2g27730, mitochondrial

• 分子: 名称: Uncharacterized protein At2g27730, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 44 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: thale cress (シロイヌナズナ)
• 分子量: 理論値: 11.96552 KDa

配列

文字列:

MATRNALRIV SRRFSSGKVL SEEERAAENV FIKKMEQEKL QKLARQGPGE QAAGSASEAK VAGATASASA ESGPKVSEDK NRNYAVVAG VVAIVGSIGW YLKAGGKKQP EVQE

分子 #45: Gamma carbonic anhydrase-like 2, mitochondrial

• 分子: 名称: Gamma carbonic anhydrase-like 2, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 45 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: thale cress (シロイヌナズナ)
• 分子量: 理論値: 27.985113 KDa

配列

文字列:

MATSLARISK RSITSAVSSN LIRRYFAAEA VAVATTETPK PKSQVTPSPD RVKWDYRGQR QIIPLGQWLP KVAVDAYVAP NVVLAGQVT VWDGSSVWNG AVLRGDLNKI TVGFCSNVQE RCVVHAAWSS PTGLPAQTLI DRYVTVGAYS LLRSCTIEPE C IIGQHSIL MEGSLVETRS ILEAGSVLPP GRRIPSGELW GGNPARFIRT LTNEETLEIP KLAVAINHLS GDYFSEFLPY ST IYLEVEK FKKSLGIAI

分子 #46: Gamma carbonic anhydrase 2, mitochondrial

• 分子: 名称: Gamma carbonic anhydrase 2, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 46 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO; EC番号: 付加脱離酵素（リアーゼ）; 炭素-酸素リアーゼ類; デヒドラターゼ類
• 由来(天然): 生物種: thale cress (シロイヌナズナ)
• 分子量: 理論値: 30.102207 KDa

配列

文字列:

MGTLGRAIYT VGNWIRGTGQ ALDRVGSLLQ GSHRIEEHLS RHRTLMNVFD KSPLVDKDVF VAPSASVIGD VQIGKGSSIW YGCVLRGDV NNISVGSGTN IQDNTLVHVA KTNISGKVLP TLIGDNVTVG HSAVIHGCTV EDDAFVGMGA TLLDGVVVEK H AMVAAGSL VKQNTRIPSG EVWGGNPAKF MRKLTDEEIV YISQSAKNYI NLAQIHASEN SKSFEQIEVE RALRKKYARK DE DYDSMLG ITRETPPELI LPDNVLPGGK PVAKVPSTQY F

分子 #47: Gamma carbonic anhydrase 1, mitochondrial

• 分子: 名称: Gamma carbonic anhydrase 1, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 47 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO; EC番号: 付加脱離酵素（リアーゼ）; 炭素-酸素リアーゼ類; デヒドラターゼ類
• 由来(天然): 生物種: thale cress (シロイヌナズナ)
• 分子量: 理論値: 30.010039 KDa

配列

文字列:

MGTLGRAFYS VGFWIRETGQ ALDRLGCRLQ GKNYFREQLS RHRTLMNVFD KAPIVDKEAF VAPSASVIGD VHIGRGSSIW YGCVLRGDV NTVSVGSGTN IQDNSLVHVA KSNLSGKVHP TIIGDNVTIG HSAVLHGCTV EDETFIGMGA TLLDGVVVEK H GMVAAGAL VRQNTRIPSG EVWGGNPARF LRKLTDEEIA FISQSATNYS NLAQAHAAEN AKPLNVIEFE KVLRKKHALK DE EYDSMLG IVRETPPELN LPNNILPDKE TKRPSNVN

分子 #48: Probable mitochondrial-processing peptidase subunit alpha-1, mito...

• 分子: 名称: Probable mitochondrial-processing peptidase subunit alpha-1, mitochondrial; タイプ: protein_or_peptide / ID: 48 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: thale cress (シロイヌナズナ)
• 分子量: 理論値: 54.459766 KDa

配列

文字列:

MYRTAASRAR ALKGVLTRSL RPARYASSSA VAETSSSTPA YLSWLSGGSR AALTSLDMPL QGVSLPPPLA DKVEPSKLQI TTLPNGLKI ASETTPNPAA SIGLYVDCGS IYEAPYFHGA THLLERMAFK STLNRTHFRL VREIEAIGGN TSASASREQM S YTIDALKT YVPEMVEVLI DSVRNPAFLD WEVNEELRKM KVEIAELAKN PMGFLLEAIH SAGYSGPLAS PLYAPESALD RL NGELLEE FMTENFTAAR MVLAASGVEH EELLKVAEPL TSDLPNVPPQ LAPKSQYVGG DFRQHTGGEA THFAVAFEVP GWN NEKEAV TATVLQMLMG GGGSFSAGGP GKGMHSWLYR RVLNEYQEVQ SCTAFTSIFN DTGLFGIYGC SSPQFAAKAI ELAA KELKD VAGGKVNQAH LDRAKAATKS AVLMNLESRM IAAEDIGRQI LTYGERKPVD QFLKSVDQLT LKDIADFTSK VISKP LTMG SFGDVLAVPS YDTISSKFR

分子 #49: Probable mitochondrial-processing peptidase subunit beta, mitocho...

• 分子: 名称: Probable mitochondrial-processing peptidase subunit beta, mitochondrial; タイプ: protein_or_peptide / ID: 49 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO / EC番号: mitochondrial processing peptidase
• 由来(天然): 生物種: thale cress (シロイヌナズナ)
• 分子量: 理論値: 59.23475 KDa

配列

文字列:

MAMKNLLSLA RRSQRRLFLT QATRSSSSFS AIDSVPASAS PTALSPPPPH LMPYDHAAEI IKNKIKKLEN PDKRFLKYAS PHPILASHN HILSAPETRV TTLPNGLRVA TESNLSAKTA TVGVWIDAGS RFESDETNGT AHFLEHMIFK GTDRRTVRAL E EEIEDIGG HLNAYTSREQ TTYYAKVLDS NVNQALDVLA DILQNSKFEE QRINRERDVI LREMQEVEGQ TDEVVLDHLH AT AFQYTPL GRTILGPAQN VKSITREDLQ NYIKTHYTAS RMVIAAAGAV KHEEVVEQVK KLFTKLSSDP TTTSQLVANE PAS FTGSEV RMIDDDLPLA QFAVAFEGAS WTDPDSVALM VMQTMLGSWN KNVGGGKHVG SDLTQRVAIN EIAESIMAFN TNYK DTGLF GVYAVAKADC LDDLSYAIMY EVTKLAYRVS DADVTRARNQ LKSSLLLHMD GTSPIAEDIG RQLLTYGRRI PTAEL FARI DAVDASTVKR VANKYIYDKD IAISAIGPIQ DLPDYNKFRR RTYWNRY

分子 #50: Cytochrome b

• 分子: 名称: Cytochrome b / タイプ: protein_or_peptide / ID: 50 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: thale cress (シロイヌナズナ)
• 分子量: 理論値: 44.310609 KDa

配列

文字列:

MTIRNQRFSL LKQPISSTLN QHLVDYPTPS NLSYWWGFGS LAGICLVIQI VTGVFLAMHY TPHVDLAFNS VEHIMRDVEG GWLLRYMHA NGASMFFIVV YLHIFRGLYY ASYSSPREFV WCLGVVIFLL MIVTAFIGYV LPWGQMSFWG ATVITSLASA I PVVGDTIV TWLWGGFSVD NATLNRFFSL HYLLPFILVG ASLLHLAALH QYGSNNPLGV HSEMDKIAFY PYFYVKDLVG WV AFAIFFS IWIFYAPNVL GHPDNYIPAN PMSTPPHIVP EWYFLPIYAI LRSIPDKAGG VAAIALVFIC LLALPFFKSM YVR SSSFRP IYQGMFWLLL ADCLLLGWIG CQPVEAPFVT IGQISSLVFF LFFAITPILG RVGRGIPNSY TDETDHT

分子 #51: Cytochrome b-c1 complex subunit Rieske-1, mitochondrial

• 分子: 名称: Cytochrome b-c1 complex subunit Rieske-1, mitochondrial; タイプ: protein_or_peptide / ID: 51 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO / EC番号: quinol-cytochrome-c reductase
• 由来(天然): 生物種: thale cress (シロイヌナズナ)
• 分子量: 理論値: 29.645584 KDa

配列

文字列:

MLRVAGRRLF SVSQRSSTAT SFVVSRDHTL SDGGGDSSSA PRSLPSADLS SYHRSLIRGF SSQVLAQGNE IGFGSEVPAT VEAVKTPNS KIVYDDHNHE RYPPGDPSKR AFAYFVLSGG RFVYASVLRL LVLKLIVSMS ASKDVLALAS LEVDLGSIEP G TTVTVKWR GKPVFIRRRT EDDIKLANSV DVGSLRDPQE DSVRVKNPEW LVVVGVCTHL GCIPLPNAGD YGGWFCPCHG SH YDISGRI RKGPAPYNLE VPTYSFLEEN KLLIG

分子 #52: Cytochrome c1 2, heme protein, mitochondrial

• 分子: 名称: Cytochrome c1 2, heme protein, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 52 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: thale cress (シロイヌナズナ)
• 分子量: 理論値: 33.728238 KDa

配列

文字列:

MVGGGVIRQL LRRKLHSQSV ATPVLSWLSS KKANEDAGSA GLRAFALMGA GITGLLSFST VASADEAEHG LECPNYPWPH EGILSSYDH ASIRRGHQVY QQVCASCHSM SLISYRDLVG VAYTEEEAKA MAAEIEVVDG PNDEGEMFTR PGKLSDRLPE P YSNESAAR FANGGAYPPD LSLVTKARHN GQNYVFALLT GYRDPPAGIS IREGLHYNPY FPGGAIAMPK MLNDEAVEYE DG TPATEAQ MGKDVVSFLS WAAEPEMEER KLMGFKWIFL LSLALLQAAY YRRLKWSVLK SRKLVLDVVN

分子 #53: Cytochrome b-c1 complex subunit 7-2, mitochondrial

• 分子: 名称: Cytochrome b-c1 complex subunit 7-2, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 53 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: thale cress (シロイヌナズナ)
• 分子量: 理論値: 14.620021 KDa

配列

文字列:

MASFLQRLVD PRKNFLARMH MKSVSNRLRR YGLRYDDLYD PLYDLDIKEA LNRLPREIVD ARNQRLMRAM DLSMKHEYLP DNLQAVQTP FRSYLQDMLA LVKRERAERE ALGALPLYQR TIP

分子 #54: Cytochrome b-c1 complex subunit 8-1, mitochondrial

• 分子: 名称: Cytochrome b-c1 complex subunit 8-1, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 54 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: thale cress (シロイヌナズナ)
• 分子量: 理論値: 8.517977 KDa

配列

文字列:

MGKQPVKLKA VVYALSPFQQ KIMTGLWKDL PEKIHHKVSE NWISATLLVT PVVGTYWYAQ YFKEQEKLEH RF

分子 #55: Cytochrome b-c1 complex subunit 6-1, mitochondrial

• 分子: 名称: Cytochrome b-c1 complex subunit 6-1, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 55 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: thale cress (シロイヌナズナ)
• 分子量: 理論値: 7.997315 KDa

配列

文字列:

MADDEVVDPK KYLEESCKPK CVKPLLEYQA CVKRIQGDDS GHKHCTGQYF DYWQCIDKCV APKLFAKLK

分子 #56: Cytochrome b-c1 complex subunit 9, mitochondrial

• 分子: 名称: Cytochrome b-c1 complex subunit 9, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 56 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: thale cress (シロイヌナズナ)
• 分子量: 理論値: 8.461634 KDa

配列

文字列:

MEYAARRNQK GAFEGFYKLI MRRNSVYVTF IIAGAFFGER AVDYGVHKLW ERNNVGKRYE DISVLGQRPV EE

分子 #57: Cytochrome b-c1 complex subunit 10, mitochondrial

• 分子: 名称: Cytochrome b-c1 complex subunit 10, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 57 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
• 由来(天然): 生物種: thale cress (シロイヌナズナ)
• 分子量: 理論値: 5.980947 KDa

配列

文字列:

MAGTSGLLNA VKPKIQTIDI QAAAGWGIAA AAGAIWVVQP FGWIKKTFID PPPTEEK

分子 #58: IRON/SULFUR CLUSTER

• 分子: 名称: IRON/SULFUR CLUSTER / タイプ: ligand / ID: 58 / コピー数: 6 / 式: SF4
• 分子量: 理論値: 351.64 Da

Chemical component information

ChemComp-FS1:
IRON/SULFUR CLUSTER / 一硫化鉄

分子 #59: FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER

• 分子: 名称: FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER / タイプ: ligand / ID: 59 / コピー数: 4 / 式: FES
• 分子量: 理論値: 175.82 Da

Chemical component information

ChemComp-FES:
FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER

分子 #60: FLAVIN MONONUCLEOTIDE

• 分子: 名称: FLAVIN MONONUCLEOTIDE / タイプ: ligand / ID: 60 / コピー数: 1 / 式: FMN
• 分子量: 理論値: 456.344 Da

Chemical component information

ChemComp-FMN:
FLAVIN MONONUCLEOTIDE / FMN

分子 #61: Ubiquinone-9

• 分子: 名称: Ubiquinone-9 / タイプ: ligand / ID: 61 / コピー数: 1 / 式: UQ9
• 分子量: 理論値: 795.226 Da

Chemical component information

ChemComp-UQ9:
Ubiquinone-9

分子 #62: FE (III) ION

• 分子: 名称: FE (III) ION / タイプ: ligand / ID: 62 / コピー数: 1 / 式: FE
• 分子量: 理論値: 55.845 Da

分子 #63: NADPH DIHYDRO-NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE

• 分子: 名称: NADPH DIHYDRO-NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE; タイプ: ligand / ID: 63 / コピー数: 1 / 式: NDP
• 分子量: 理論値: 745.421 Da

Chemical component information

ChemComp-NDP:
NADPH DIHYDRO-NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE / NADPH

分子 #64: ZINC ION

• 分子: 名称: ZINC ION / タイプ: ligand / ID: 64 / コピー数: 4 / 式: ZN
• 分子量: 理論値: 65.409 Da

分子 #65: S-[2-({N-[(2R)-2-hydroxy-3,3-dimethyl-4-(phosphonooxy)butanoyl]-b...

• 分子: 名称: S-[2-({N-[(2R)-2-hydroxy-3,3-dimethyl-4-(phosphonooxy)butanoyl]-beta-alanyl}amino)ethyl] dodecanethioate; タイプ: ligand / ID: 65 / コピー数: 2 / 式: 8Q1
• 分子量: 理論値: 540.651 Da

Chemical component information

ChemComp-8Q1:
S-[2-({N-[(2R)-2-hydroxy-3,3-dimethyl-4-(phosphonooxy)butanoyl]-beta-alanyl}amino)ethyl] dodecanethioate

分子 #66: CROTONYL COENZYME A

• 分子: 名称: CROTONYL COENZYME A / タイプ: ligand / ID: 66 / コピー数: 1 / 式: COO
• 分子量: 理論値: 835.608 Da

Chemical component information

ChemComp-COO:
CROTONYL COENZYME A

分子 #67: PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE

• 分子: 名称: PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE / タイプ: ligand / ID: 67 / コピー数: 6 / 式: HEM
• 分子量: 理論値: 616.487 Da

Chemical component information

ChemComp-HEM:
PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE

分子 #68: 2,3-DIMETHOXY-5-METHYL-6-(3,11,15,19-TETRAMETHYL-EICOSA-2,6,10,14...

• 分子: 名称: 2,3-DIMETHOXY-5-METHYL-6-(3,11,15,19-TETRAMETHYL-EICOSA-2,6,10,14,18-PENTAENYL)-[1,4]BENZOQUINONE; タイプ: ligand / ID: 68 / コピー数: 3 / 式: UQ5
• 分子量: 理論値: 522.758 Da

Chemical component information

ChemComp-UQ5:
2,3-DIMETHOXY-5-METHYL-6-(3,11,15,19-TETRAMETHYL-EICOSA-2,6,10,14,18-PENTAENYL)-[1,4]BENZOQUINONE / ユビキノン5

分子 #69: UBIQUINONE-7

• 分子: 名称: UBIQUINONE-7 / タイプ: ligand / ID: 69 / コピー数: 1 / 式: UQ7
• 分子量: 理論値: 658.992 Da

Chemical component information

ChemComp-UQ7:
UBIQUINONE-7 / 3-メチル-5,6-ジメトキシ-2-(3,7,11,15,19,23,27-ヘプタメチル-2,6,10,14,18,2(以下略)

実験情報

構造解析

• 手法: クライオ電子顕微鏡法
• 解析: 単粒子再構成法
• 試料の集合状態: particle

試料調製

• 濃度: 0.18 mg/mL
• 緩衝液: pH: 7.4
• グリッド: モデル: Quantifoil R1.2/1.3 / 材質: COPPER / メッシュ: 400 / 支持フィルム - #0 - Film type ID: 1 / 支持フィルム - #0 - 材質: CARBON / 支持フィルム - #0 - トポロジー: CONTINUOUS / 支持フィルム - #1 - Film type ID: 2 / 支持フィルム - #1 - 材質: GRAPHENE / 支持フィルム - #1 - トポロジー: CONTINUOUS / 前処理 - タイプ: GLOW DISCHARGE / 前処理 - 時間: 15 sec.
• 凍結: 凍結剤: ETHANE / チャンバー内湿度: 70 % / チャンバー内温度: 283.15 K / 装置: FEI VITROBOT MARK IV

電子顕微鏡法

• 顕微鏡: FEI TITAN KRIOS
• 撮影: フィルム・検出器のモデル: FEI FALCON IV (4k x 4k); 平均電子線量: 50.0 e/Ų
• 電子線: 加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
• 電子光学系: 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD / 最大 デフォーカス（公称値）: 1.5 µm / 最小 デフォーカス（公称値）: 0.5 µm / 倍率（公称値）: 215000
• 実験機器: モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company

画像解析

• 粒子像選択: 選択した数: 1215138

初期モデル

モデルのタイプ: EMDB MAP
EMDB ID:

11878

• 最終 再構成: 想定した対称性 - 点群: C₁ (非対称) / 解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 2.8 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 3.1.3) / 使用した粒子像数: 50886
• 初期 角度割当: タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD / ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 3.1.3)
• 最終 角度割当: タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD / ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 3.1.3)

原子モデル構築 1

• 精密化: 空間: REAL

得られたモデル

PDB-8bq6:
Cryo-EM structure of the Arabidopsis thaliana I+III2 supercomplex (Complete conformation 2 composition)