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- EMDB-16168: Cryo-EM structure of the Arabidopsis thaliana I+III2 supercomplex... -

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登録情報
データベース: EMDB / ID: EMD-16168
タイトルCryo-EM structure of the Arabidopsis thaliana I+III2 supercomplex (Complete composition)
マップデータComposite density-modified map
試料
  • 複合体: Mitochondrial Arabidopsis thaliana I+III2 supercomplex (Complete composition)
    • タンパク質・ペプチド: x 57種
  • リガンド: x 19種
キーワードPlant / Mitochondria / Complex / MEMBRANE PROTEIN
機能・相同性
機能・相同性情報


plastid outer membrane / anther dehiscence / TIM22 mitochondrial import inner membrane insertion complex / vegetative to reproductive phase transition of meristem / chloroplast outer membrane / mitochondrial processing peptidase / cold acclimation / plant-type cell wall / 付加脱離酵素（リアーゼ）; 炭素-酸素リアーゼ類; デヒドラターゼ類 / P450-containing electron transport chain ...plastid outer membrane / anther dehiscence / TIM22 mitochondrial import inner membrane insertion complex / vegetative to reproductive phase transition of meristem / chloroplast outer membrane / mitochondrial processing peptidase / cold acclimation / plant-type cell wall / 付加脱離酵素（リアーゼ）; 炭素-酸素リアーゼ類; デヒドラターゼ類 / P450-containing electron transport chain / photorespiration / embryo development ending in seed dormancy / protein insertion into mitochondrial inner membrane / NADH dehydrogenase complex / response to abscisic acid / plant-type vacuole / vacuole / respiratory chain complex III / quinol-cytochrome-c reductase / quinol-cytochrome-c reductase activity / cobalt ion binding / response to osmotic stress / regulation of reactive oxygen species metabolic process / plastid / mitochondrial electron transport, ubiquinol to cytochrome c / porin activity / pore complex / protein homotrimerization / ubiquinone binding / acyl carrier activity / electron transport coupled proton transport / NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating) / mitochondrial electron transport, NADH to ubiquinone / respiratory chain complex I / NADH dehydrogenase (ubiquinone) activity / quinone binding / ATP synthesis coupled electron transport / monoatomic ion transport / response to salt stress / proton transmembrane transport / aerobic respiration / chloroplast / respiratory electron transport chain / carbonate dehydratase activity / electron transport chain / mitochondrial membrane / metalloendopeptidase activity / mitochondrial intermembrane space / 2 iron, 2 sulfur cluster binding / NAD binding / fatty acid biosynthetic process / peroxisome / FMN binding / 4 iron, 4 sulfur cluster binding / mitochondrial outer membrane / carbohydrate metabolic process / electron transfer activity / mitochondrial inner membrane / oxidoreductase activity / mitochondrial matrix / copper ion binding / heme binding / nucleolus / protein homodimerization activity / mitochondrion / proteolysis / extracellular region / zinc ion binding / ATP binding / metal ion binding / identical protein binding / nucleus / membrane / plasma membrane / cytosol
類似検索 - 分子機能
NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 2, plant/fungi / Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM22 / NADH-ubiquinone oxidoreductase 11kDa subunit / Putative NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mitochondrial / NADH-ubiquinone oxidoreductase 11 kDa subunit / At2g27730-like / Cytochrome b-c1 complex subunit 8, plants / Cytochrome b-c1 complex subunit 8 / : / : ...NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 2, plant/fungi / Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM22 / NADH-ubiquinone oxidoreductase 11kDa subunit / Putative NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mitochondrial / NADH-ubiquinone oxidoreductase 11 kDa subunit / At2g27730-like / Cytochrome b-c1 complex subunit 8, plants / Cytochrome b-c1 complex subunit 8 / : / : / : / NADH-ubiquinone oxidoreductase, 21kDa subunit, N-terminal / NADH-ubiquinone oxidoreductase complex I, 21 kDa subunit / Adrenodoxin / NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 3, bacterial/plastid / NAD(P)H-quinone oxidoreductase, subunit N/subunit 2 / Cytochrome b-c1 complex, subunit 6 / Cytochrome b-c1 complex subunit 7 / Cytochrome b-c1 complex subunit 7 superfamily / Ubiquinol-cytochrome C reductase complex 14kD subunit / Cytochrome b-c1 complex subunit 8 superfamily / Cytochrome b-c1 complex subunit Rieske, transmembrane domain / Ubiquinol cytochrome reductase transmembrane region / Ubiquinol-cytochrome C reductase hinge domain / Ubiquinol-cytochrome C reductase hinge domain superfamily / Ubiquinol-cytochrome C reductase hinge protein / Cytochrome b-c1 complex subunit 9 / Cytochrome b-c1 complex subunit 9 superfamily / Ubiquinol-cytochrome C reductase, UQCRX/QCR9 like / Cytochrome c1, transmembrane anchor, C-terminal / : / Cytochrome b / Hexapeptide repeat / Ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulphur subunit / : / Cytochrome c1 / Cytochrome C1 family / : / Cytochrome b/b6, C-terminal / Cytochrome b(C-terminal)/b6/petD / Cytochrome b/b6 C-terminal region profile. / Peptidase M16, zinc-binding site / Insulinase family, zinc-binding region signature. / Cytochrome b/b6, C-terminal domain superfamily / Cytochrome b/b6/petB / Tim17/Tim22/Tim23/Pmp24 family / NADH-ubiquinone oxidoreductase, subunit 10 / NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit 10 / Rieske iron-sulphur protein, C-terminal / Bacterial transferase hexapeptide (six repeats) / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 10 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 6, mitochondrial / Cytochrome b/b6, N-terminal / Cytochrome b/b6-like domain superfamily / Cytochrome b/b6 N-terminal region profile. / Di-haem cytochrome, transmembrane / Rieske iron-sulphur protein / : / NADH dehydrogenase [ubiquinone] (complex I), alpha subcomplex subunit 1 / NADH-ubiquinone oxidoreductase MWFE subunit / NADH-ubiquinone oxidoreductase NDSU1/NuoG-like, 4Fe-4S domain / Zinc finger, CHCC-type / Zinc-finger domain / Peptidase M16, C-terminal / Peptidase M16 inactive domain / Peptidase M16, N-terminal / Insulinase (Peptidase family M16) / NADH dehydrogenase subunit 5, C-terminal / NADH dehydrogenase subunit 5 C-terminus / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 3 / NADH-ubiquinone oxidoreductase B12 subunit family / NADH:ubiquinone oxidoreductase, NDUFS5-15kDa / Metalloenzyme, LuxS/M16 peptidase-like / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 7, NDUB7 / NADH-ubiquinone oxidoreductase B18 subunit (NDUFB7) / GRIM-19 / GRIM-19 protein / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9 / NDUFB9, LYR domain / NADH:ubiquinone oxidoreductase, iron-sulphur subunit 5 / NDUFA6, LYR domain / NADH dehydrogenase ubiquinone Fe-S protein 4-like superfamily / NADH dehydrogenase ubiquinone Fe-S protein 4 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] (complex I), alpha subcomplex, subunit 2 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 5 / NADH dehydrogenase ubiquinone Fe-S protein 4, mitochondrial / ETC complex I subunit conserved region / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12 / NADH ubiquinone oxidoreductase subunit NDUFA12 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] (complex I), alpha subcomplex, subunit 6 / Trimeric LpxA-like superfamily / NADH-quinone oxidoreductase, chain G, C-terminal / NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit G, C-terminal / : / SLBB domain / NADH dehydrogenase [ubiquinone] (complex I), alpha subcomplex, subunit 8 / : / : / NADH-quinone oxidoreductase subunit 3, ferredoxin-like domain / Respiratory-chain NADH dehydrogenase 20 Kd subunit signature.
類似検索 - ドメイン・相同性
Cytochrome b-c1 complex subunit 7-2, mitochondrial / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 2 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 2, mitochondrial / Outer envelope pore protein 16-3, chloroplastic/mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 3-A / Acyl carrier protein 2, mitochondrial / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 5 / Cytochrome b / Acyl carrier protein 1, mitochondrial / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6 ...Cytochrome b-c1 complex subunit 7-2, mitochondrial / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 2 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 2, mitochondrial / Outer envelope pore protein 16-3, chloroplastic/mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 3-A / Acyl carrier protein 2, mitochondrial / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 5 / Cytochrome b / Acyl carrier protein 1, mitochondrial / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 2 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L / Cytochrome b-c1 complex subunit 6-1, mitochondrial / Probable mitochondrial-processing peptidase subunit beta, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 7, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8-A, mitochondrial / At4g16450 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 2 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8-B / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13-A / Uncharacterized protein At1g67785 / Transmembrane protein / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9 / Excitatory amino acid transporter / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 10-B / Cytochrome b-c1 complex subunit Rieske-1, mitochondrial / Cytochrome b-c1 complex subunit 10, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3 / Gamma carbonic anhydrase 2, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 1 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 1, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 2 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial / Cytochrome c1 2, heme protein, mitochondrial / Probable NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 5, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial / Gamma carbonic anhydrase 1, mitochondrial / At1g67350 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 6 / Cytochrome b-c1 complex subunit 9, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 5-B / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 6, mitochondrial / Probable NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12 / Cytochrome b-c1 complex subunit 8-1, mitochondrial / At2g31490 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 7 / ESSS subunit of NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I) protein / Gamma carbonic anhydrase-like 2, mitochondrial / 2Fe-2S ferredoxin-like superfamily protein / At2g46540/F11C10.23 / Probable mitochondrial-processing peptidase subunit alpha-1, mitochondrial / Uncharacterized protein At2g27730, mitochondrial
類似検索 - 構成要素
生物種Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
手法単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 2.09 Å
データ登録者Klusch N / Kuehlbrandt W
資金援助 ドイツ, 1件
OrganizationGrant number国
Max Planck Society ドイツ
引用ジャーナル: Nat Plants / 年: 2023
タイトル: Cryo-EM structure of the respiratory I + III supercomplex from Arabidopsis thaliana at 2 Å resolution.
著者: Niklas Klusch / Maximilian Dreimann / Jennifer Senkler / Nils Rugen / Werner Kühlbrandt / Hans-Peter Braun /
要旨: Protein complexes of the mitochondrial respiratory chain assemble into respiratory supercomplexes. Here we present the high-resolution electron cryo-microscopy structure of the Arabidopsis ...Protein complexes of the mitochondrial respiratory chain assemble into respiratory supercomplexes. Here we present the high-resolution electron cryo-microscopy structure of the Arabidopsis respiratory supercomplex consisting of complex I and a complex III dimer, with a total of 68 protein subunits and numerous bound cofactors. A complex I-ferredoxin, subunit B14.7 and P9, a newly defined subunit of plant complex I, mediate supercomplex formation. The component complexes stabilize one another, enabling new detailed insights into their structure. We describe (1) an interrupted aqueous passage for proton translocation in the membrane arm of complex I; (2) a new coenzyme A within the carbonic anhydrase module of plant complex I defining a second catalytic centre; and (3) the water structure at the proton exit pathway of complex III with a co-purified ubiquinone in the Q site. We propose that the main role of the plant supercomplex is to stabilize its components in the membrane.
履歴
登録2022年11月18日-
ヘッダ(付随情報) 公開2023年1月25日-
マップ公開2023年1月25日-
更新2024年11月6日-
現状2024年11月6日処理サイト: PDBe / 状態: 公開

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構造の表示

添付画像

emd_16168.png

ダウンロードとリンク

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マップ

ファイルダウンロード / ファイル: emd_16168.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 1.6 GB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
注釈Composite density-modified map
投影像・断面図

画像のコントロール

大きさ
明度
コントラスト
その他
軸Z (Sec.)Y (Row.)X (Col.)
0.57 Å/pix.
x 750 pix.
= 429.75 Å		0.57 Å/pix.
x 750 pix.
= 429.75 Å		0.57 Å/pix.
x 750 pix.
= 429.75 Å

表面

投影像

断面 (1/3)

断面 (1/2)

断面 (2/3)

画像は Spider により作成

ボクセルのサイズX=Y=Z: 0.573 Å
密度

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)
表面レベル登録者による: 0.6
最小 - 最大-12.511953 - 24.80058
平均 (標準偏差)0.000044749926 (±0.15962407)
対称性空間群: 1
詳細

EMDB XML:

マップ形状
Axis orderXYZ
Origin000
サイズ750750750
Spacing750750750
セルA=B=C: 429.75 Å
α=β=γ: 90.0 °

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添付データ

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試料の構成要素

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全体 : Mitochondrial Arabidopsis thaliana I+III2 supercomplex (Complete ...

全体名称: Mitochondrial Arabidopsis thaliana I+III2 supercomplex (Complete composition)
要素
  • 複合体: Mitochondrial Arabidopsis thaliana I+III2 supercomplex (Complete composition)
    • タンパク質・ペプチド: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 7, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 2
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 2, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 1, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8-A, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6
    • タンパク質・ペプチド: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L
    • タンパク質・ペプチド: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 5
    • タンパク質・ペプチド: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4
    • タンパク質・ペプチド: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 2
    • タンパク質・ペプチド: 2Fe-2S ferredoxin-like superfamily protein
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 6, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 2
    • タンパク質・ペプチド: Acyl carrier protein 1, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: Acyl carrier protein 2, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: Probable NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 5, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 6
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8-B
    • タンパク質・ペプチド: Outer envelope pore protein 16-3, chloroplastic/mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13-A
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 1
    • タンパク質・ペプチド: At2g46540/F11C10.23
    • タンパク質・ペプチド: Transmembrane protein
    • タンパク質・ペプチド: Excitatory amino acid transporter
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 5-B
    • タンパク質・ペプチド: At4g16450
    • タンパク質・ペプチド: ESSS subunit of NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I) protein
    • タンパク質・ペプチド: At1g67350
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 2
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 3-A
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: AT2G31490 protein
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 7
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 10-B
    • タンパク質・ペプチド: Probable NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12
    • タンパク質・ペプチド: Uncharacterized protein At1g67785
    • タンパク質・ペプチド: Uncharacterized protein At2g27730, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: Gamma carbonic anhydrase-like 2, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: Gamma carbonic anhydrase 2, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: Gamma carbonic anhydrase 1, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: Probable mitochondrial-processing peptidase subunit alpha-1, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: Probable mitochondrial-processing peptidase subunit beta, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: Cytochrome b
    • タンパク質・ペプチド: Cytochrome b-c1 complex subunit Rieske-1, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: Cytochrome c1 2, heme protein, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: Cytochrome b-c1 complex subunit 7-2, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: Cytochrome b-c1 complex subunit 8-1, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: Cytochrome b-c1 complex subunit 6-1, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: Cytochrome b-c1 complex subunit 9, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: Cytochrome b-c1 complex subunit 10, mitochondrial
  • リガンド: (1S)-2-{[{[(2R)-2,3-DIHYDROXYPROPYL]OXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(PALMITOYLOXY)METHYL]ETHYL STEARATE
  • リガンド: IRON/SULFUR CLUSTER
  • リガンド: PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE
  • リガンド: FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER
  • リガンド: FLAVIN MONONUCLEOTIDE
  • リガンド: Ubiquinone-9
  • リガンド: 2-{[(4-O-alpha-D-glucopyranosyl-alpha-D-glucopyranosyl)oxy]methyl}-4-{[(3beta,9beta,14beta,17beta,25R)-spirost-5-en-3-yl]oxy}butyl 4-O-alpha-D-glucopyranosyl-alpha-D-glucopyranoside
  • リガンド: 1,2-DIACYL-GLYCEROL-3-SN-PHOSPHATE
  • リガンド: (7S)-4-HYDROXY-N,N,N-TRIMETHYL-9-OXO-7-[(PALMITOYLOXY)METHYL]-3,5,8-TRIOXA-4-PHOSPHAHEXACOSAN-1-AMINIUM 4-OXIDE
  • リガンド: 2,3-DIMETHOXY-5-METHYL-6-(3,11,15,19-TETRAMETHYL-EICOSA-2,6,10,14,18-PENTAENYL)-[1,4]BENZOQUINONE
  • リガンド: FE (III) ION
  • リガンド: NADPH DIHYDRO-NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE
  • リガンド: ZINC ION
  • リガンド: S-[2-({N-[(2R)-2-hydroxy-3,3-dimethyl-4-(phosphonooxy)butanoyl]-beta-alanyl}amino)ethyl] dodecanethioate
  • リガンド: CARDIOLIPIN
  • リガンド: CROTONYL COENZYME A
  • リガンド: PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE
  • リガンド: UBIQUINONE-7
  • リガンド: water

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超分子 #1: Mitochondrial Arabidopsis thaliana I+III2 supercomplex (Complete ...

超分子名称: Mitochondrial Arabidopsis thaliana I+III2 supercomplex (Complete composition)
タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#57
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)

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分子 #1: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3

分子名称: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 13.969396 KDa
配列文字列:
(FME)MLEFAPIFI YLVISLLVSL ILLGVPFLFA SNSSTYPEKL SAYECGFDPF GDARSRFDIR FYLVSILFLI FDLEVT FFF PWAVSLNKID LFGFWSMMAF LFILTIGFLY EWKRGALDWE

UniProtKB: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3

+
分子 #2: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 7, mitochondrial

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 7, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 24.071949 KDa
配列文字列: MAMITRNTAT RLPLLLQSQR AVAAASVSHL HTSLPALSPS TSPTSYTRPG PPSTSPPPPG LSKAAEFVIS KVDDLMNWAR TGSIWPMTF GLACCAVEMM HTGAARYDLD RFGIIFRPSP RQSDCMIVAG TLTNKMAPAL RKVYDQMPEP RWVISMGSCA N GGGYYHYS ...文字列:
MAMITRNTAT RLPLLLQSQR AVAAASVSHL HTSLPALSPS TSPTSYTRPG PPSTSPPPPG LSKAAEFVIS KVDDLMNWAR TGSIWPMTF GLACCAVEMM HTGAARYDLD RFGIIFRPSP RQSDCMIVAG TLTNKMAPAL RKVYDQMPEP RWVISMGSCA N GGGYYHYS YSVVRGCDRI VPVDIYVPGC PPTAEALLYG LLQLQKKINR RKDFLHWWNK

UniProtKB: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 7, mitochondrial

+
分子 #3: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3
タイプ: protein_or_peptide / ID: 3 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 22.91091 KDa
配列文字列: MDNQFIFKYS WETLPKKWVK KMERSEHGNR FDTNTDYLFQ LLCFLKLHTY TRVQVLIDIC GVDYPSRKRR FEVVYNLLST RYNSRIRVQ TSADEVTRIS SVVSLFPSAG WWEREVWDMF GVSFINHPDL RRILTDYGFE GHPLRKDFPL SGYVQVRYDD P EKRVVSEP ...文字列:
MDNQFIFKYS WETLPKKWVK KMERSEHGNR FDTNTDYLFQ LLCFLKLHTY TRVQVLIDIC GVDYPSRKRR FEVVYNLLST RYNSRIRVQ TSADEVTRIS SVVSLFPSAG WWEREVWDMF GVSFINHPDL RRILTDYGFE GHPLRKDFPL SGYVQVRYDD P EKRVVSEP IEMTQEFRYF DFASPWEQRS DG

UniProtKB: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3

+
分子 #4: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 2

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 2
タイプ: protein_or_peptide / ID: 4 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 45.062922 KDa
配列文字列: MTTRKRQIKN FTLNFGPQHP AAHGVLRLVL EMNGEVVERA EPHIGLLHRG TEKLIEYKTY LQALPYFDRL DYVSMMAQEH AYSLAVEKL LNCEVPLRAQ YIRVLFCEIT RILNHLLALT THAMDVGALT PFLWAFEERE KLLEFYERVS GARMHASFIR P GGVAQDLP ...文字列:
MTTRKRQIKN FTLNFGPQHP AAHGVLRLVL EMNGEVVERA EPHIGLLHRG TEKLIEYKTY LQALPYFDRL DYVSMMAQEH AYSLAVEKL LNCEVPLRAQ YIRVLFCEIT RILNHLLALT THAMDVGALT PFLWAFEERE KLLEFYERVS GARMHASFIR P GGVAQDLP LGLCRDIDSF TQQFASRIDE LEEMLTGNRI WKQRLVDIGT VTAQQAKDWG FSGVMLRGSG VCWDLRRAAP YD VYDQLDF DVPVGTRGDC YDRYCIRIEE MRQSLRIIVQ CLNQMPSGMI KADDRKLCPP SRCRMKLSME SLIHHFELYT EGF SVPASS TYTAVEAPKG EFGVFLVSNG SNRPYRCKIR APGFAHLQGL DFMSKHHMLA DVVTIIGTQD IVFGEVDR

UniProtKB: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 2

+
分子 #5: NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 2, mitochondrial

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 2, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 5 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 28.423607 KDa
配列文字列: MLARLAAKRL LEIRQVFRQP TSQVTRSLST ALNYHLDSPD NKPDLPWEFS EANQSKVKEI LSYYPSNYKQ SAVIPLLDLA QQQNGGWLP VSAMNAVAKV IEVAPIRVYE VATFYSMFNR AKVGKYHLLV CGTTPCMIRG SRDIESALLD HLGVKRGEVT K DGLFSVGE ...文字列:
MLARLAAKRL LEIRQVFRQP TSQVTRSLST ALNYHLDSPD NKPDLPWEFS EANQSKVKEI LSYYPSNYKQ SAVIPLLDLA QQQNGGWLP VSAMNAVAKV IEVAPIRVYE VATFYSMFNR AKVGKYHLLV CGTTPCMIRG SRDIESALLD HLGVKRGEVT K DGLFSVGE MECMGCCVNA PMITVADYSN GSEGYTYNYF EDVTPEKVVE IVEKLRKGEK PPHGTQNPKR IKCGPEGGNK TL LGEPKPP QFRDLDAC

UniProtKB: NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 2, mitochondrial

+
分子 #6: NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 6 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 53.522418 KDa
配列文字列: MAPVRGILGL QRAVSIWKES NRLTPALRSF STQAASTSTT PQPPPPPPPP EKTHFGGLKD EDRIFTNLYG LHDPFLKGAM KRGDWHRTK DLVLKGTDWI VNEMKKSGLR GRGGAGFPSG LKWSFMPKVS DGRPSYLVVN ADESEPGTCK DREIMRHDPH K LLEGCLIA ...文字列:
MAPVRGILGL QRAVSIWKES NRLTPALRSF STQAASTSTT PQPPPPPPPP EKTHFGGLKD EDRIFTNLYG LHDPFLKGAM KRGDWHRTK DLVLKGTDWI VNEMKKSGLR GRGGAGFPSG LKWSFMPKVS DGRPSYLVVN ADESEPGTCK DREIMRHDPH K LLEGCLIA GVGMRASAAY IYIRGEYVNE RLNLEKARRE AYAAGLLGKN ACGSGYDFEV YIHFGAGAYI CGEETALLES LE GKQGKPR LKPPFPANAG LYGCPTTVTN VETVAVSPTI LRRGPEWFSS FGRKNNAGTK LFCISGHVNK PCTVEEEMSI PLK ELIERH CGGVRGGWDN LLAIIPGGSS VPLIPKNICE DVLMDFDALK AVQSGLGTAA VIVMDKSTDV VDAIARLSYF YKHE SCGQC TPCREGTGWL WMIMERMKVG NAKLEEIDML QEVTKQIEGH TICALGDAAA WPVQGLIRHF RPELERRIRE RAERE LLQA AA

UniProtKB: NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial

+
分子 #7: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 1, mitochondrial

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 1, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 7 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 81.619367 KDa
配列文字列: MGLGILASRT IRPASRLLQS QTSNFFLRTI VSKPELQSPE SAAVSEPEPP TQILPPRNPV GGARVHFSNP EDAIEVFVDG YAVKVPKGF TVLQACEVAG VDIPRFCYHS RLSIAGNCRM CLVEVEKSPK PVASCAMPAL PGMKIKTDTP IAKKAREGVM E FLLMNHPL ...文字列:
MGLGILASRT IRPASRLLQS QTSNFFLRTI VSKPELQSPE SAAVSEPEPP TQILPPRNPV GGARVHFSNP EDAIEVFVDG YAVKVPKGF TVLQACEVAG VDIPRFCYHS RLSIAGNCRM CLVEVEKSPK PVASCAMPAL PGMKIKTDTP IAKKAREGVM E FLLMNHPL DCPICDQGGE CDLQDQSMAF GSDRGRFTEM KRSVVDKNLG PLVKTVMTRC IQCTRCVRFA SEVAGVQDLG IL GRGSGEE IGTYVEKLMT SELSGNVIDI CPVGALTSKP FAFKARNWEL KATETIDVSD AVGSNIRVDS RGPEVMRIIP RLN EDINEE WISDKTRFCY DGLKRQRLSD PMIRDSDGRF KAVSWRDALA VVGDIIHQVK PDEIVGVAGQ LSDAESMMVL KDFV NRMGS DNVWCEGTAA GVDADLRYSY LMNTSISGLE NADLFLLIGT QPRVEAAMVN ARICKTVRAS NAKVGYVGPP AEFNY DCKH LGTGPDTLKE IAEGRHPFCT ALKNAKNPAI IVGAGLFNRT DKNAILSSVE SIAQANNVVR PDWNGLNFLL QYAAQA AAL DLGLIQQSAK ALESAKFVYL MGADDVNVDK IPKDAFVVYQ GHHGDKAVYR ANVILPASAF TEKEGTYENT EGFTQQT VP AVPTVGDARD DWKIVRALSE VSGVKLPYNS IEGVRSRIKS VAPNLVHTDE REPAAFGPSL KPECKEAMST TPFQTVVE N FYMTNSITRA SKIMAQCSAV LLKKPFV

UniProtKB: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 1, mitochondrial

+
分子 #8: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1

分子名称: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 8 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 36.02007 KDa
配列文字列: MYIAVPAEIL GIILPLLLGV AFLVLAERKV MAFVQRRKGP DVVGSFGLLQ PLADGLKLIL KEPISPSSAN FFLFRMAPVA TFMLSLVAW AVVPFDYGMV LSDLNIGLLY LFAISSLGVY GIIIAGRSSN SKYAFLGALR SAAQMVSYEV SIGLILITVL I CVGSCNLS ...文字列:
MYIAVPAEIL GIILPLLLGV AFLVLAERKV MAFVQRRKGP DVVGSFGLLQ PLADGLKLIL KEPISPSSAN FFLFRMAPVA TFMLSLVAW AVVPFDYGMV LSDLNIGLLY LFAISSLGVY GIIIAGRSSN SKYAFLGALR SAAQMVSYEV SIGLILITVL I CVGSCNLS EIVMAQKQIW FGIPLFPVLV MFFISCLAET NRAPFDLPEA EAELVAGYNV EYSSMGFALF FLGEYANMIL MS GLCTLFF LGGWLPILDL PIFKKIPGSI WFSIKVLFFL FLYIWVRAAF PRYRYDQLMG LGWKVFLPLS LAWVVSVSGL LVT FQWLP

UniProtKB: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1

+
分子 #9: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8-A, mitochondrial

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8-A, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 9 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 25.536801 KDa
配列文字列: MASILARRSL NTLRARHLVL SGQALQGSHL SRLQSRGISY GSNKDDEEAE QLSKEISKDW NTVFERSINT LFLTEMVRGL SLTLKYFFD PKVTINYPFE KGPLSPRFRG EHALRRYPTG EERCIACKLC EAVCPAQAIT IEAEEREDGS RRTTRYDIDM T KCIYCGFC ...文字列:
MASILARRSL NTLRARHLVL SGQALQGSHL SRLQSRGISY GSNKDDEEAE QLSKEISKDW NTVFERSINT LFLTEMVRGL SLTLKYFFD PKVTINYPFE KGPLSPRFRG EHALRRYPTG EERCIACKLC EAVCPAQAIT IEAEEREDGS RRTTRYDIDM T KCIYCGFC QEACPVDAIV EGPNFEFATE THEELLYDKE KLLENGDRWE TEIAENLRSE SLYR

UniProtKB: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8-A, mitochondrial

+
分子 #10: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6

分子名称: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 10 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 23.690385 KDa
配列文字列: MILSVLSSLA LVSGLMVVRA KNPVHSVLFF ILVFCDTSGL LLLLGLDFFA MIFLVVYIGA IAVLFLFVVM MFHIQIAEIH EEVLRYLPV SGIIGLIFWW EMFFILDNES IPLLPTQRNT TSLRYTVYAG KVRSWTNLET LGNLLYTYYF VWFLVSSLIL L VAMIGAIV ...文字列:
MILSVLSSLA LVSGLMVVRA KNPVHSVLFF ILVFCDTSGL LLLLGLDFFA MIFLVVYIGA IAVLFLFVVM MFHIQIAEIH EEVLRYLPV SGIIGLIFWW EMFFILDNES IPLLPTQRNT TSLRYTVYAG KVRSWTNLET LGNLLYTYYF VWFLVSSLIL L VAMIGAIV LTMHRTTKVK RQDVFRRNAI DFRRTIMRRT TDPLTIY

UniProtKB: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6

+
分子 #11: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L

分子名称: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L / タイプ: protein_or_peptide / ID: 11 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 11.193559 KDa
配列文字列:
(FME)DLIKYFTFS MIIFILGIWG ILLNRRNILI MLMSIELMLL AVNLNFLVFS VSLDDMMGQV FALLVLTVAA AESAIG LAI FVITFRVRGT IAVEFINSIQ G

UniProtKB: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L

+
分子 #12: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 5

分子名称: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 12 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 74.497977 KDa
配列文字列: MYLLIVFLPL LGSSVAGFFG RFLGSEGSAI MTTTCVSFSS ILSLIAFYEV ALGASACYLR IAPWISSEMF DASWGFLFDS LTVVMLIVV TFISSLVHLY SISYMSEDPH SPRFMCYLSI FTFFMLMLVT GDNFLQLFLG WEGVGLASYL LIHFWFTRLQ A DKAAIKAM ...文字列:
MYLLIVFLPL LGSSVAGFFG RFLGSEGSAI MTTTCVSFSS ILSLIAFYEV ALGASACYLR IAPWISSEMF DASWGFLFDS LTVVMLIVV TFISSLVHLY SISYMSEDPH SPRFMCYLSI FTFFMLMLVT GDNFLQLFLG WEGVGLASYL LIHFWFTRLQ A DKAAIKAM LVNRVGDFGL ALGILGCFTL FQTVDFSTIF ACASVPRNSW IFCNMRLNAI SLICILLFIG AVGKSAQIGL HT WLPDAME GPTPVSALIH AATMVTAGVF MIARCSPLFE YSPTALIVIT FAGAMTSFLA ATTGILQNDL KRVIAYSTCS QLG YMIFAC GISNYSVSVF HLMNHAFFKA LLFLSAGSVI HAMSDEQDMR KMGGLASSFP LTYAMMLIGS LSLIGFPFLT GFYS KDVIL ELAYTKYTIS GNFAFWLGSV SVLFTSYYSF RLLFLTFLVP TNSFGRDISR CHDAPIPMAI PLILLALGSL FVGYL AKDM MIGLGTNFWA NSLLVLPKNE ILAESEFAAP TIIKLIPILF STLGAFVAYN VNLVADQFQR AFQTSTFCNR LYSFFN KRW FFDQVLNDFL VRSFLRFGYE VSFEALDKGA IEILGPYGIS YTFRRLAERI SQLQSGFVYH YAFAMLLGLT LFVTFFC MW DSLSSWVDNR LSFILIVSSF YTKSSQE

UniProtKB: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 5

+
分子 #13: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4

分子名称: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 13 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 55.995664 KDa
配列文字列: MLEHFCECYF NLSGLILCPV LGSIILLFIP NSRIRLIRLI GLCASLITFL YSLVLWIQFD SSTAKFQFVE SLRWLPYENI NFYLGIDGI SLFFVILTTF LIPICILVGW SGMRSYGKEY IIAFLICEFL MIAVFCMLDL LLFYVFFESV LIPMFIIIGV W GSRQRKIK ...文字列:
MLEHFCECYF NLSGLILCPV LGSIILLFIP NSRIRLIRLI GLCASLITFL YSLVLWIQFD SSTAKFQFVE SLRWLPYENI NFYLGIDGI SLFFVILTTF LIPICILVGW SGMRSYGKEY IIAFLICEFL MIAVFCMLDL LLFYVFFESV LIPMFIIIGV W GSRQRKIK AAYQFFLYTL LGSLFMLLAI LLILFQTGTT DLQILLTTEF SERRQIFLWI AFFASFAVKV PMVPVHIWLP EA HVEAPTA GSVILAGILL KFGTYGFLRF SIPMFPEATL CFTPFIYTLS AIAIIYTSLT TLRQIDLKKI IAYSSVAHMN LVT IGMFSL NIQGIGGSIL LMLSHGLVSS ALFLCVGVLY DRHKTRLVRY YGGLVSTMPN FSTIFFFFTL ANMSLPGTSS FIGE FLILV GAFQRNSLVA TLAALGMILG AAYSLWLYNR VVSGNLKPDF LHKFSDLNGR EVFIFIPFLV GLVWMGVYPK VFLDC MHTS VSNLVQHGKF H

UniProtKB: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4

+
分子 #14: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 2

分子名称: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 14 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 55.486836 KDa
配列文字列: MKAEFVRILP HMFNLFLAVF PEIFIINATF ILLIHGVVFS TSKKYDYPPL ASNVGWLGLL SVLITLLLLA AGAPLLTIAH LFWNNLFRR DNFTYFCQIF LLLSTAGTIS MCFDFFDQER FDAFEFIVLI LLSTCGMLFM ISAYDLIAMY LAIELQSLCF Y VIAASKRK ...文字列:
MKAEFVRILP HMFNLFLAVF PEIFIINATF ILLIHGVVFS TSKKYDYPPL ASNVGWLGLL SVLITLLLLA AGAPLLTIAH LFWNNLFRR DNFTYFCQIF LLLSTAGTIS MCFDFFDQER FDAFEFIVLI LLSTCGMLFM ISAYDLIAMY LAIELQSLCF Y VIAASKRK SEFSTEAGLK YLILGAFSSG ILLFGCSMIY GSTGATHFDQ LAKILTGYEI TGARSSGIFM GILFIAVGFL FK ITAVPFH MWAPDIYEGS PTPVTAFLSI APKISIFANI LRVFIYGSYG ATLQQIFFFC SIASMILGAL AAMAQTKVKR LLA YSSIGH VGYICIGFSC GTIEGIQSLL IGIFIYALMT MDAFAIVLAL RQTRVKYIAD LGALAKTNPI LAITFSITMF SYAG IPPLA GFCSKFYLFF AALGCGAYFL ALVGVVTSVI GCFYYIRLVK RMFFDTPRTW ILYEPMDRNK SLLLAMTSFF ITLFL LYPS PLFSVTHQMA LSLYL

UniProtKB: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 2

+
分子 #15: 2Fe-2S ferredoxin-like superfamily protein

分子名称: 2Fe-2S ferredoxin-like superfamily protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 15 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 17.626197 KDa
配列文字列:
MATTLQKLSS QIHRLSPFTR SLIVRTSATS APSPSLGSKK VSDRIVKLSA IDPDGYKQDI IGLSGQTLLR ALTHTGLIDP ASHRLDDIE ACSAECEVQI AEEWLEKLPP RTYDEEYVLK RSSRSRILNK HSRLGCQVVL TQELQGMVVA VPEAKPWDIP

UniProtKB: 2Fe-2S ferredoxin-like superfamily protein

+
分子 #16: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mit...

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 16 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 43.988652 KDa
配列文字列: MQVVSRRLVQ RPLVGGASIY SSSSLRSLYG VSNHLNGTDN CRYSSSLATK GVGHLARKGT GGRSSVSGIV ATVFGATGFL GRYLVQQLA KMGSQVLVPF RGSEDSPRHL KLMGDLGQVV PMKFDPRDED SIKAVMAKAN VVINLIGREY ETRNFSFEDA N HHIAEKLA ...文字列:
MQVVSRRLVQ RPLVGGASIY SSSSLRSLYG VSNHLNGTDN CRYSSSLATK GVGHLARKGT GGRSSVSGIV ATVFGATGFL GRYLVQQLA KMGSQVLVPF RGSEDSPRHL KLMGDLGQVV PMKFDPRDED SIKAVMAKAN VVINLIGREY ETRNFSFEDA N HHIAEKLA LVAKEHGGIM RYIQVSCLGA SVSSPSRMLR AKAAAEEAVL NALPEATIMR PATMIGTEDR ILNPWSMFVK KY GFLPLIG GGTTKFQPVY VVDVAAAIVA ALKDDGSSMG KTYELGGPDV FTTHELAEIM YDMIREWPRY VKLPFPIAKA MAA PRDFMV NKVPFPLPSP QIFNLDQINA LTTDTLVSDN ALKFQDLDLV PHKLKGYPVE FLIQYRKGGP NFGSTVSEKI PTDF YP

UniProtKB: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial

+
分子 #17: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 17 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 17.160445 KDa
配列文字列:
MALCATTQRT IRIAATLRRV ARPFATDAVV ESDYKRGEIG KVSGIPEEHL SRKVIIYSPA RTATQSGSGK LGKWKINFVS TLKWENPLM GWTSTGDPYA NVGDSALAFD SEEAAKSFAE RHGWDYKVKK PNTPLLKVKS YSDNFKWKGN PQPEN

UniProtKB: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial

+
分子 #18: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 6, mitochondrial

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 6, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 18 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 12.251122 KDa
配列文字列:
MASNLLKALI RSQILPSSRR NFSVATTQLG IPTDDLVGNH TAKWMQDRSK KSPMELISEV PPIKVDGRIV ACEGDTNPAL GHPIEFICL DLNEPAICKY CGLRYVQDHH H

UniProtKB: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 6, mitochondrial

+
分子 #19: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 2

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 2
タイプ: protein_or_peptide / ID: 19 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 10.865765 KDa
配列文字列:
MAWRGSISKS MKELRILLCQ SSPASAPTRT FVEKNYKDLK SLNPKLPILI RECSGVQPQM WARYDMGVER CVNLDGLTEP QILKALENL VKSGATKA

UniProtKB: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 2

+
分子 #20: Acyl carrier protein 1, mitochondrial

分子名称: Acyl carrier protein 1, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 20 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 13.735628 KDa
配列文字列:
MALRNAILRH LRVPVQTLGL NQSKIGFLGT IRSFSSHDDH LSREAVVDRV LDVVKSFPKV DPSKVTPEVH FQNDLGLDSL DTVEIVMAI EEEFKLEIPD KEADKIDSCS LAIEYVYNHP MSS

UniProtKB: Acyl carrier protein 1, mitochondrial

+
分子 #21: Acyl carrier protein 2, mitochondrial

分子名称: Acyl carrier protein 2, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 21 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 14.183111 KDa
配列文字列:
MAARGAMLRY LRVNVNPTIQ NPRECVLPFS ILLRRFSEEV RGSFLDKSEV TDRVLSVVKN FQKVDPSKVT PKANFQNDLG LDSLDSVEV VMALEEEFGF EIPDNEADKI QSIDLAVDFI ASHPQAK

UniProtKB: Acyl carrier protein 2, mitochondrial

+
分子 #22: Probable NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subun...

分子名称: Probable NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 5, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 22 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 19.201906 KDa
配列文字列:
MFLRAIGRPL LAKVKQTTGI VGLDVVPNAR AVLIDLYSKT LKEIQAVPED EGYRKAVESF TRQRLNVCKE EEDWEMIEKR LGCGQVEEL IEEARDELTL IGKMIEWDPW GVPDDYECEV IENDAPIPKH VPQHRPGPLP EQFYKTLEGL IAESKTEIPA A TPSDPQLK E

UniProtKB: Probable NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 5, mitochondrial

+
分子 #23: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 6

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 6
タイプ: protein_or_peptide / ID: 23 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 15.102261 KDa
配列文字列:
MAAPFALRKI GVPPNSANLT EARRRVFDFF RAACRSIPTI MDIYNLQDVV APSQLRYAIS AQIRNNAHIT DPKVIDLLIF KGMEELTDI VDHAKQRHHI IGQYVVGEGL VQNTGNKDQG KTDFLKNFYT SNYF

UniProtKB: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 6

+
分子 #24: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8-B

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8-B
タイプ: protein_or_peptide / ID: 24 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 11.985954 KDa
配列文字列:
MSSAVDATGN PIPTSAVLTA SAKHIGMRCM PENVAFLKCK KNDPNPEKCL DKGRDVTRCV LGLLKDLHQK CQKEMDDYVG CMYYYTNEF DLCRKEQEAF EKVCPLK

UniProtKB: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8-B

+
分子 #25: Outer envelope pore protein 16-3, chloroplastic/mitochondrial

分子名称: Outer envelope pore protein 16-3, chloroplastic/mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 25 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 17.017348 KDa
配列文字列:
MDPAEMRYLE EEDGPLMKTI KGSITGFGAG TIYGTILATW KDVPRVERNV ALPGLIRTLK MMGTHGLTFA AIGGVYIGVE QLVQNFRSK RDFYNGAIGG FVAGASVLGY RARSIPTAIA AGATLAVTSA LIDSGGQTTR VDNGREYYPY TVEKRAEADS

UniProtKB: Outer envelope pore protein 16-3, chloroplastic/mitochondrial

+
分子 #26: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13-A

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13-A
タイプ: protein_or_peptide / ID: 26 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 16.145584 KDa
配列文字列:
MTEAMIRNKP GMASVKDMPL LQDGPPPGGF APVRYARRIS NTGPSAMAMF LAVSGAFAWG MYQVGQGNKI RRALKEEKYA ARRTILPIL QAEEDERFVS EWKKYLEYEA DVMKDVPGWK VGENVYNSGR WMPPATGELR PDVW

UniProtKB: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13-A

+
分子 #27: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 1

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 1
タイプ: protein_or_peptide / ID: 27 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 7.349628 KDa
配列文字列:
MSLVWLEAML PLGIIGGMLC IMGNSQYYIH KAYHGRPKHI GHDEWDVAME RRDKKVVEKA AAPSS

UniProtKB: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 1

+
分子 #28: At2g46540/F11C10.23

分子名称: At2g46540/F11C10.23 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 28 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 6.810177 KDa
配列文字列:
MPVMEKLRMF VAQEPVVAAS CLIGGVGLFL PAVVRPILDS LEASKQVKAP PLTDVIAGVT GKKQS

UniProtKB: At2g46540/F11C10.23

+
分子 #29: Transmembrane protein

分子名称: Transmembrane protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 29 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 9.876422 KDa
配列文字列:
MGGGDHGHGA EGGDFRAKVW SMTGGPNCRP KHWRRNTAIA MFGVFLVCIP IAKLSAKLEQ RPHMPVRPIP SQIWCKNFGT KDDYEKEH

UniProtKB: Transmembrane protein

+
分子 #30: Excitatory amino acid transporter

分子名称: Excitatory amino acid transporter / タイプ: protein_or_peptide / ID: 30 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 9.220749 KDa
配列文字列:
MPISATMVGA LLGLGTQMYS NALRKLPYMR HPWEHVVGMG LGAVFANQLV KWDVKLKEDL DVMLAKARAA NERRYFDEDR D

UniProtKB: Excitatory amino acid transporter

+
分子 #31: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 5-B

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 5-B
タイプ: protein_or_peptide / ID: 31 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 9.914133 KDa
配列文字列:
MASGWGITGN KGRCYDFWMD FSECMSHCRE PKDCTLLRED YLECLHHSKE FQRRNRIYKE EQRKLRAASR KGEETGDGTH THH

UniProtKB: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 5-B

+
分子 #32: At4g16450

分子名称: At4g16450 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 32 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 11.383019 KDa
配列文字列:
(FME)NTDITALEK AQYPVVDRNP AFTKVVGNFS TLDYLRFSTI TGISVTVGYL SGIKPGIKGP SMVTGGLIGL MGGFMY AYQ NSAGRLMGFF PNDGEVASYQ KRGGFSK

UniProtKB: At4g16450

+
分子 #33: ESSS subunit of NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I) protein

分子名称: ESSS subunit of NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I) protein
タイプ: protein_or_peptide / ID: 33 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 12.648286 KDa
配列文字列:
MPSTQSLTVA AKTLRNRIFS RSGSTSAGPS RWATPGHEER PKGYFMNRTP PAPGQSRKWE DWELPCYITS FLTIVILGVG LNAKPDLSI ETWAHQKALE RLEMEKLATA GDSSD

UniProtKB: ESSS subunit of NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I) protein

+
分子 #34: At1g67350

分子名称: At1g67350 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 34 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 11.808244 KDa
配列文字列:
MGFIMEFAEN LVLRLMENPE ERDRKAREHI YEMHERCKKI KEMWALPIRP YGFWTFERHN AQLRWDPQIS QVAGRRDPYD DLLEDNYTP PSSSSSSSD

UniProtKB: At1g67350

+
分子 #35: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 2

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 2
タイプ: protein_or_peptide / ID: 35 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 7.58259 KDa
配列文字列:
MGGGGHGGGI TYKGVTVHTP KTWHTVTGKG LCAVMWFWIL YRAKQDGPVV MGWRHPWDGH GDHGHGDHH

UniProtKB: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 2

+
分子 #36: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 3-A

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 3-A
タイプ: protein_or_peptide / ID: 36 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 8.064313 KDa
配列文字列:
MAKPLGTTGE FFRRRDEWRK HPMLSNQMRH ALPGIGIGVG AFCVYLVGEQ IYSKLMAPSS QSSHQKQPAP SH

UniProtKB: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 3-A

+
分子 #37: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mito...

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 37 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 13.225222 KDa
配列文字列:
MAGRLSGVAS RIMGGNGVVA RSVGSSLRQR AGMGLPVGKH IVPDKPLSVN DELMWDNGTA FPEPCIDRIA DTVGKYEALA WLSGGLGFF VGLGLLAVLN DKASKVPFTP RVYPYDNLRV ELGGEP

UniProtKB: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mitochondrial

+
分子 #38: AT2G31490 protein

分子名称: AT2G31490 protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 38 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 8.305539 KDa
配列文字列:
MGGGMETNKN KFIEDWGSAR ENLEHNFRWT RRNFALIGIF GIALPIIVYK GIVKDFHMQD EDAGRPHRKF L

UniProtKB: At2g31490

+
分子 #39: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9
タイプ: protein_or_peptide / ID: 39 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 13.638335 KDa
配列文字列:
MSGVSTAAYF ARRAAQKERV RILYRRALKD TLNWAVHRHI FYRDASDLRE KFNVNQDVED VDRIDKLIAH GEAEYNKWRH PDPYIVPWA PGGSKFCRNP TPPAGIEIVY NYGLEDNP

UniProtKB: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9

+
分子 #40: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 7

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 7
タイプ: protein_or_peptide / ID: 40 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 11.757832 KDa
配列文字列:
MEVPGSSKKM IATQEEMSAA KIALGSRDMC AHLLIPLNKC RQAEFYLPWK CEDERHVYEK CEYELVMERM LAMKKIREEE ALAKQNKLQ GNAAVPLIPK TANA

UniProtKB: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 7

+
分子 #41: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 10-B

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 10-B
タイプ: protein_or_peptide / ID: 41 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 12.462276 KDa
配列文字列:
MGRKKGLPEF EESAPDGFDP ENPYKDPVAM VEMREHIVRE KWIQIEKAKI LREKVKWCYR VEGVNHYQKC RHLVQQYLDS TRGVGWGKD HRPISLHGPK PEAVEAE

UniProtKB: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 10-B

+
分子 #42: Probable NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12

分子名称: Probable NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12
タイプ: protein_or_peptide / ID: 42 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 18.346736 KDa
配列文字列:
MALTVAKSAL EAIREKGLGG FMRMIREEGF MRCLPDGNLL QTKIHNIGAT LVGVDKFGNK YYQKLGDTQY GRHRWVEYAS KDRYNASQV PAEWHGWLHF ITDHTGDELL SLKPKRYGLE HKENFSGEGD AYIYHSKGHT LNPGQKNWTR YQSWVPTKTQ

UniProtKB: Probable NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12

+
分子 #43: Uncharacterized protein At1g67785

分子名称: Uncharacterized protein At1g67785 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 43 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 7.54679 KDa
配列文字列:
MVKVLTYFGM TLAAFAFWQS MDKVHVWIAL HQDEKQERME KEAEVRRVRA ELLRKAREED PLA

UniProtKB: Uncharacterized protein At1g67785

+
分子 #44: Uncharacterized protein At2g27730, mitochondrial

分子名称: Uncharacterized protein At2g27730, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 44 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 11.96552 KDa
配列文字列:
MATRNALRIV SRRFSSGKVL SEEERAAENV FIKKMEQEKL QKLARQGPGE QAAGSASEAK VAGATASASA ESGPKVSEDK NRNYAVVAG VVAIVGSIGW YLKAGGKKQP EVQE

UniProtKB: Uncharacterized protein At2g27730, mitochondrial

+
分子 #45: Gamma carbonic anhydrase-like 2, mitochondrial

分子名称: Gamma carbonic anhydrase-like 2, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 45 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 27.985113 KDa
配列文字列: MATSLARISK RSITSAVSSN LIRRYFAAEA VAVATTETPK PKSQVTPSPD RVKWDYRGQR QIIPLGQWLP KVAVDAYVAP NVVLAGQVT VWDGSSVWNG AVLRGDLNKI TVGFCSNVQE RCVVHAAWSS PTGLPAQTLI DRYVTVGAYS LLRSCTIEPE C IIGQHSIL ...文字列:
MATSLARISK RSITSAVSSN LIRRYFAAEA VAVATTETPK PKSQVTPSPD RVKWDYRGQR QIIPLGQWLP KVAVDAYVAP NVVLAGQVT VWDGSSVWNG AVLRGDLNKI TVGFCSNVQE RCVVHAAWSS PTGLPAQTLI DRYVTVGAYS LLRSCTIEPE C IIGQHSIL MEGSLVETRS ILEAGSVLPP GRRIPSGELW GGNPARFIRT LTNEETLEIP KLAVAINHLS GDYFSEFLPY ST IYLEVEK FKKSLGIAI

UniProtKB: Gamma carbonic anhydrase-like 2, mitochondrial

+
分子 #46: Gamma carbonic anhydrase 2, mitochondrial

分子名称: Gamma carbonic anhydrase 2, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 46 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
EC番号: 付加脱離酵素（リアーゼ）; 炭素-酸素リアーゼ類; デヒドラターゼ類
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 30.102207 KDa
配列文字列: MGTLGRAIYT VGNWIRGTGQ ALDRVGSLLQ GSHRIEEHLS RHRTLMNVFD KSPLVDKDVF VAPSASVIGD VQIGKGSSIW YGCVLRGDV NNISVGSGTN IQDNTLVHVA KTNISGKVLP TLIGDNVTVG HSAVIHGCTV EDDAFVGMGA TLLDGVVVEK H AMVAAGSL ...文字列:
MGTLGRAIYT VGNWIRGTGQ ALDRVGSLLQ GSHRIEEHLS RHRTLMNVFD KSPLVDKDVF VAPSASVIGD VQIGKGSSIW YGCVLRGDV NNISVGSGTN IQDNTLVHVA KTNISGKVLP TLIGDNVTVG HSAVIHGCTV EDDAFVGMGA TLLDGVVVEK H AMVAAGSL VKQNTRIPSG EVWGGNPAKF MRKLTDEEIV YISQSAKNYI NLAQIHASEN SKSFEQIEVE RALRKKYARK DE DYDSMLG ITRETPPELI LPDNVLPGGK PVAKVPSTQY F

UniProtKB: Gamma carbonic anhydrase 2, mitochondrial

+
分子 #47: Gamma carbonic anhydrase 1, mitochondrial

分子名称: Gamma carbonic anhydrase 1, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 47 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
EC番号: 付加脱離酵素（リアーゼ）; 炭素-酸素リアーゼ類; デヒドラターゼ類
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 30.010039 KDa
配列文字列: MGTLGRAFYS VGFWIRETGQ ALDRLGCRLQ GKNYFREQLS RHRTLMNVFD KAPIVDKEAF VAPSASVIGD VHIGRGSSIW YGCVLRGDV NTVSVGSGTN IQDNSLVHVA KSNLSGKVHP TIIGDNVTIG HSAVLHGCTV EDETFIGMGA TLLDGVVVEK H GMVAAGAL ...文字列:
MGTLGRAFYS VGFWIRETGQ ALDRLGCRLQ GKNYFREQLS RHRTLMNVFD KAPIVDKEAF VAPSASVIGD VHIGRGSSIW YGCVLRGDV NTVSVGSGTN IQDNSLVHVA KSNLSGKVHP TIIGDNVTIG HSAVLHGCTV EDETFIGMGA TLLDGVVVEK H GMVAAGAL VRQNTRIPSG EVWGGNPARF LRKLTDEEIA FISQSATNYS NLAQAHAAEN AKPLNVIEFE KVLRKKHALK DE EYDSMLG IVRETPPELN LPNNILPDKE TKRPSNVN

UniProtKB: Gamma carbonic anhydrase 1, mitochondrial

+
分子 #48: Probable mitochondrial-processing peptidase subunit alpha-1, mito...

分子名称: Probable mitochondrial-processing peptidase subunit alpha-1, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 48 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 54.459766 KDa
配列文字列: MYRTAASRAR ALKGVLTRSL RPARYASSSA VAETSSSTPA YLSWLSGGSR AALTSLDMPL QGVSLPPPLA DKVEPSKLQI TTLPNGLKI ASETTPNPAA SIGLYVDCGS IYEAPYFHGA THLLERMAFK STLNRTHFRL VREIEAIGGN TSASASREQM S YTIDALKT ...文字列:
MYRTAASRAR ALKGVLTRSL RPARYASSSA VAETSSSTPA YLSWLSGGSR AALTSLDMPL QGVSLPPPLA DKVEPSKLQI TTLPNGLKI ASETTPNPAA SIGLYVDCGS IYEAPYFHGA THLLERMAFK STLNRTHFRL VREIEAIGGN TSASASREQM S YTIDALKT YVPEMVEVLI DSVRNPAFLD WEVNEELRKM KVEIAELAKN PMGFLLEAIH SAGYSGPLAS PLYAPESALD RL NGELLEE FMTENFTAAR MVLAASGVEH EELLKVAEPL TSDLPNVPPQ LAPKSQYVGG DFRQHTGGEA THFAVAFEVP GWN NEKEAV TATVLQMLMG GGGSFSAGGP GKGMHSWLYR RVLNEYQEVQ SCTAFTSIFN DTGLFGIYGC SSPQFAAKAI ELAA KELKD VAGGKVNQAH LDRAKAATKS AVLMNLESRM IAAEDIGRQI LTYGERKPVD QFLKSVDQLT LKDIADFTSK VISKP LTMG SFGDVLAVPS YDTISSKFR

UniProtKB: Probable mitochondrial-processing peptidase subunit alpha-1, mitochondrial

+
分子 #49: Probable mitochondrial-processing peptidase subunit beta, mitocho...

分子名称: Probable mitochondrial-processing peptidase subunit beta, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 49 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO / EC番号: mitochondrial processing peptidase
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 59.23475 KDa
配列文字列: MAMKNLLSLA RRSQRRLFLT QATRSSSSFS AIDSVPASAS PTALSPPPPH LMPYDHAAEI IKNKIKKLEN PDKRFLKYAS PHPILASHN HILSAPETRV TTLPNGLRVA TESNLSAKTA TVGVWIDAGS RFESDETNGT AHFLEHMIFK GTDRRTVRAL E EEIEDIGG ...文字列:
MAMKNLLSLA RRSQRRLFLT QATRSSSSFS AIDSVPASAS PTALSPPPPH LMPYDHAAEI IKNKIKKLEN PDKRFLKYAS PHPILASHN HILSAPETRV TTLPNGLRVA TESNLSAKTA TVGVWIDAGS RFESDETNGT AHFLEHMIFK GTDRRTVRAL E EEIEDIGG HLNAYTSREQ TTYYAKVLDS NVNQALDVLA DILQNSKFEE QRINRERDVI LREMQEVEGQ TDEVVLDHLH AT AFQYTPL GRTILGPAQN VKSITREDLQ NYIKTHYTAS RMVIAAAGAV KHEEVVEQVK KLFTKLSSDP TTTSQLVANE PAS FTGSEV RMIDDDLPLA QFAVAFEGAS WTDPDSVALM VMQTMLGSWN KNVGGGKHVG SDLTQRVAIN EIAESIMAFN TNYK DTGLF GVYAVAKADC LDDLSYAIMY EVTKLAYRVS DADVTRARNQ LKSSLLLHMD GTSPIAEDIG RQLLTYGRRI PTAEL FARI DAVDASTVKR VANKYIYDKD IAISAIGPIQ DLPDYNKFRR RTYWNRY

UniProtKB: Probable mitochondrial-processing peptidase subunit beta, mitochondrial

+
分子 #50: Cytochrome b

分子名称: Cytochrome b / タイプ: protein_or_peptide / ID: 50 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 44.310609 KDa
配列文字列: MTIRNQRFSL LKQPISSTLN QHLVDYPTPS NLSYWWGFGS LAGICLVIQI VTGVFLAMHY TPHVDLAFNS VEHIMRDVEG GWLLRYMHA NGASMFFIVV YLHIFRGLYY ASYSSPREFV WCLGVVIFLL MIVTAFIGYV LPWGQMSFWG ATVITSLASA I PVVGDTIV ...文字列:
MTIRNQRFSL LKQPISSTLN QHLVDYPTPS NLSYWWGFGS LAGICLVIQI VTGVFLAMHY TPHVDLAFNS VEHIMRDVEG GWLLRYMHA NGASMFFIVV YLHIFRGLYY ASYSSPREFV WCLGVVIFLL MIVTAFIGYV LPWGQMSFWG ATVITSLASA I PVVGDTIV TWLWGGFSVD NATLNRFFSL HYLLPFILVG ASLLHLAALH QYGSNNPLGV HSEMDKIAFY PYFYVKDLVG WV AFAIFFS IWIFYAPNVL GHPDNYIPAN PMSTPPHIVP EWYFLPIYAI LRSIPDKAGG VAAIALVFIC LLALPFFKSM YVR SSSFRP IYQGMFWLLL ADCLLLGWIG CQPVEAPFVT IGQISSLVFF LFFAITPILG RVGRGIPNSY TDETDHT

UniProtKB: Cytochrome b

+
分子 #51: Cytochrome b-c1 complex subunit Rieske-1, mitochondrial

分子名称: Cytochrome b-c1 complex subunit Rieske-1, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 51 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO / EC番号: quinol-cytochrome-c reductase
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 29.645584 KDa
配列文字列: MLRVAGRRLF SVSQRSSTAT SFVVSRDHTL SDGGGDSSSA PRSLPSADLS SYHRSLIRGF SSQVLAQGNE IGFGSEVPAT VEAVKTPNS KIVYDDHNHE RYPPGDPSKR AFAYFVLSGG RFVYASVLRL LVLKLIVSMS ASKDVLALAS LEVDLGSIEP G TTVTVKWR ...文字列:
MLRVAGRRLF SVSQRSSTAT SFVVSRDHTL SDGGGDSSSA PRSLPSADLS SYHRSLIRGF SSQVLAQGNE IGFGSEVPAT VEAVKTPNS KIVYDDHNHE RYPPGDPSKR AFAYFVLSGG RFVYASVLRL LVLKLIVSMS ASKDVLALAS LEVDLGSIEP G TTVTVKWR GKPVFIRRRT EDDIKLANSV DVGSLRDPQE DSVRVKNPEW LVVVGVCTHL GCIPLPNAGD YGGWFCPCHG SH YDISGRI RKGPAPYNLE VPTYSFLEEN KLLIG

UniProtKB: Cytochrome b-c1 complex subunit Rieske-1, mitochondrial

+
分子 #52: Cytochrome c1 2, heme protein, mitochondrial

分子名称: Cytochrome c1 2, heme protein, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 52 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 33.728238 KDa
配列文字列: MVGGGVIRQL LRRKLHSQSV ATPVLSWLSS KKANEDAGSA GLRAFALMGA GITGLLSFST VASADEAEHG LECPNYPWPH EGILSSYDH ASIRRGHQVY QQVCASCHSM SLISYRDLVG VAYTEEEAKA MAAEIEVVDG PNDEGEMFTR PGKLSDRLPE P YSNESAAR ...文字列:
MVGGGVIRQL LRRKLHSQSV ATPVLSWLSS KKANEDAGSA GLRAFALMGA GITGLLSFST VASADEAEHG LECPNYPWPH EGILSSYDH ASIRRGHQVY QQVCASCHSM SLISYRDLVG VAYTEEEAKA MAAEIEVVDG PNDEGEMFTR PGKLSDRLPE P YSNESAAR FANGGAYPPD LSLVTKARHN GQNYVFALLT GYRDPPAGIS IREGLHYNPY FPGGAIAMPK MLNDEAVEYE DG TPATEAQ MGKDVVSFLS WAAEPEMEER KLMGFKWIFL LSLALLQAAY YRRLKWSVLK SRKLVLDVVN

UniProtKB: Cytochrome c1 2, heme protein, mitochondrial

+
分子 #53: Cytochrome b-c1 complex subunit 7-2, mitochondrial

分子名称: Cytochrome b-c1 complex subunit 7-2, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 53 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 14.620021 KDa
配列文字列:
MASFLQRLVD PRKNFLARMH MKSVSNRLRR YGLRYDDLYD PLYDLDIKEA LNRLPREIVD ARNQRLMRAM DLSMKHEYLP DNLQAVQTP FRSYLQDMLA LVKRERAERE ALGALPLYQR TIP

UniProtKB: Cytochrome b-c1 complex subunit 7-2, mitochondrial

+
分子 #54: Cytochrome b-c1 complex subunit 8-1, mitochondrial

分子名称: Cytochrome b-c1 complex subunit 8-1, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 54 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 8.517977 KDa
配列文字列:
MGKQPVKLKA VVYALSPFQQ KIMTGLWKDL PEKIHHKVSE NWISATLLVT PVVGTYWYAQ YFKEQEKLEH RF

UniProtKB: Cytochrome b-c1 complex subunit 8-1, mitochondrial

+
分子 #55: Cytochrome b-c1 complex subunit 6-1, mitochondrial

分子名称: Cytochrome b-c1 complex subunit 6-1, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 55 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 7.997315 KDa
配列文字列:
MADDEVVDPK KYLEESCKPK CVKPLLEYQA CVKRIQGDDS GHKHCTGQYF DYWQCIDKCV APKLFAKLK

UniProtKB: Cytochrome b-c1 complex subunit 6-1, mitochondrial

+
分子 #56: Cytochrome b-c1 complex subunit 9, mitochondrial

分子名称: Cytochrome b-c1 complex subunit 9, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 56 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 8.461634 KDa
配列文字列:
MEYAARRNQK GAFEGFYKLI MRRNSVYVTF IIAGAFFGER AVDYGVHKLW ERNNVGKRYE DISVLGQRPV EE

UniProtKB: Cytochrome b-c1 complex subunit 9, mitochondrial

+
分子 #57: Cytochrome b-c1 complex subunit 10, mitochondrial

分子名称: Cytochrome b-c1 complex subunit 10, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 57 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 5.980947 KDa
配列文字列:
MAGTSGLLNA VKPKIQTIDI QAAAGWGIAA AAGAIWVVQP FGWIKKTFID PPPTEEK

UniProtKB: Cytochrome b-c1 complex subunit 10, mitochondrial

+
分子 #58: (1S)-2-{[{[(2R)-2,3-DIHYDROXYPROPYL]OXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-...

分子名称: (1S)-2-{[{[(2R)-2,3-DIHYDROXYPROPYL]OXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(PALMITOYLOXY)METHYL]ETHYL STEARATE
タイプ: ligand / ID: 58 / コピー数: 10 / 式: PGT
分子量理論値: 751.023 Da
Chemical component information

ChemComp-PGT:
(1S)-2-{[{[(2R)-2,3-DIHYDROXYPROPYL]OXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(PALMITOYLOXY)METHYL]ETHYL STEARATE / リン脂質*YM

+
分子 #59: IRON/SULFUR CLUSTER

分子名称: IRON/SULFUR CLUSTER / タイプ: ligand / ID: 59 / コピー数: 6 / 式: SF4
分子量理論値: 351.64 Da
Chemical component information

ChemComp-FS1:
IRON/SULFUR CLUSTER / 一硫化鉄

+
分子 #60: PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE

分子名称: PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE / タイプ: ligand / ID: 60 / コピー数: 14 / 式: PTY
分子量理論値: 734.039 Da
Chemical component information

ChemComp-PTY:
PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE / リン脂質*YM

+
分子 #61: FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER

分子名称: FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER / タイプ: ligand / ID: 61 / コピー数: 4 / 式: FES
分子量理論値: 175.82 Da
Chemical component information

ChemComp-FES:
FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER

+
分子 #62: FLAVIN MONONUCLEOTIDE

分子名称: FLAVIN MONONUCLEOTIDE / タイプ: ligand / ID: 62 / コピー数: 1 / 式: FMN
分子量理論値: 456.344 Da
Chemical component information

ChemComp-FMN:
FLAVIN MONONUCLEOTIDE / FMN

+
分子 #63: Ubiquinone-9

分子名称: Ubiquinone-9 / タイプ: ligand / ID: 63 / コピー数: 1 / 式: UQ9
分子量理論値: 795.226 Da
Chemical component information

ChemComp-UQ9:
Ubiquinone-9

+
分子 #64: 2-{[(4-O-alpha-D-glucopyranosyl-alpha-D-glucopyranosyl)oxy]methyl...

分子名称: 2-{[(4-O-alpha-D-glucopyranosyl-alpha-D-glucopyranosyl)oxy]methyl}-4-{[(3beta,9beta,14beta,17beta,25R)-spirost-5-en-3-yl]oxy}butyl 4-O-alpha-D-glucopyranosyl-alpha-D-glucopyranoside
タイプ: ligand / ID: 64 / コピー数: 6 / 式: Q7G
分子量理論値: 1.165315 KDa
Chemical component information

ChemComp-Q7G:
2-{[(4-O-alpha-D-glucopyranosyl-alpha-D-glucopyranosyl)oxy]methyl}-4-{[(3beta,9beta,14beta,17beta,25R)-spirost-5-en-3-yl]oxy}butyl 4-O-alpha-D-glucopyranosyl-alpha-D-glucopyranoside

+
分子 #65: 1,2-DIACYL-GLYCEROL-3-SN-PHOSPHATE

分子名称: 1,2-DIACYL-GLYCEROL-3-SN-PHOSPHATE / タイプ: ligand / ID: 65 / コピー数: 11 / 式: 3PH
分子量理論値: 704.998 Da
Chemical component information

ChemComp-3PH:
1,2-DIACYL-GLYCEROL-3-SN-PHOSPHATE / ジステアロイルホスファチジン酸

+
分子 #66: (7S)-4-HYDROXY-N,N,N-TRIMETHYL-9-OXO-7-[(PALMITOYLOXY)METHYL]-3,5...

分子名称: (7S)-4-HYDROXY-N,N,N-TRIMETHYL-9-OXO-7-[(PALMITOYLOXY)METHYL]-3,5,8-TRIOXA-4-PHOSPHAHEXACOSAN-1-AMINIUM 4-OXIDE
タイプ: ligand / ID: 66 / コピー数: 9 / 式: PC7
分子量理論値: 763.1 Da
Chemical component information

ChemComp-PC7:
(7S)-4-HYDROXY-N,N,N-TRIMETHYL-9-OXO-7-[(PALMITOYLOXY)METHYL]-3,5,8-TRIOXA-4-PHOSPHAHEXACOSAN-1-AMINIUM 4-OXIDE / リン脂質*YM

+
分子 #67: 2,3-DIMETHOXY-5-METHYL-6-(3,11,15,19-TETRAMETHYL-EICOSA-2,6,10,14...

分子名称: 2,3-DIMETHOXY-5-METHYL-6-(3,11,15,19-TETRAMETHYL-EICOSA-2,6,10,14,18-PENTAENYL)-[1,4]BENZOQUINONE
タイプ: ligand / ID: 67 / コピー数: 4 / 式: UQ5
分子量理論値: 522.758 Da
Chemical component information

ChemComp-UQ5:
2,3-DIMETHOXY-5-METHYL-6-(3,11,15,19-TETRAMETHYL-EICOSA-2,6,10,14,18-PENTAENYL)-[1,4]BENZOQUINONE / ユビキノン5

+
分子 #68: FE (III) ION

分子名称: FE (III) ION / タイプ: ligand / ID: 68 / コピー数: 1 / 式: FE
分子量理論値: 55.845 Da

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分子 #69: NADPH DIHYDRO-NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE

分子名称: NADPH DIHYDRO-NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE
タイプ: ligand / ID: 69 / コピー数: 1 / 式: NDP
分子量理論値: 745.421 Da
Chemical component information

ChemComp-NDP:
NADPH DIHYDRO-NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE / NADPH

+
分子 #70: ZINC ION

分子名称: ZINC ION / タイプ: ligand / ID: 70 / コピー数: 4 / 式: ZN
分子量理論値: 65.409 Da

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分子 #71: S-[2-({N-[(2R)-2-hydroxy-3,3-dimethyl-4-(phosphonooxy)butanoyl]-b...

分子名称: S-[2-({N-[(2R)-2-hydroxy-3,3-dimethyl-4-(phosphonooxy)butanoyl]-beta-alanyl}amino)ethyl] dodecanethioate
タイプ: ligand / ID: 71 / コピー数: 2 / 式: 8Q1
分子量理論値: 540.651 Da
Chemical component information

ChemComp-8Q1:
S-[2-({N-[(2R)-2-hydroxy-3,3-dimethyl-4-(phosphonooxy)butanoyl]-beta-alanyl}amino)ethyl] dodecanethioate

+
分子 #72: CARDIOLIPIN

分子名称: CARDIOLIPIN / タイプ: ligand / ID: 72 / コピー数: 9 / 式: CDL
分子量理論値: 1.464043 KDa
Chemical component information

ChemComp-CDL:
CARDIOLIPIN / リン脂質*YM

+
分子 #73: CROTONYL COENZYME A

分子名称: CROTONYL COENZYME A / タイプ: ligand / ID: 73 / コピー数: 1 / 式: COO
分子量理論値: 835.608 Da
Chemical component information

ChemComp-COO:
CROTONYL COENZYME A

+
分子 #74: PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE

分子名称: PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE / タイプ: ligand / ID: 74 / コピー数: 6 / 式: HEM
分子量理論値: 616.487 Da
Chemical component information

ChemComp-HEM:
PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE

+
分子 #75: UBIQUINONE-7

分子名称: UBIQUINONE-7 / タイプ: ligand / ID: 75 / コピー数: 1 / 式: UQ7
分子量理論値: 658.992 Da
Chemical component information

ChemComp-UQ7:
UBIQUINONE-7 / ユビキノンQ7

+
分子 #76: water

分子名称: water / タイプ: ligand / ID: 76 / コピー数: 4834 / 式: HOH
分子量理論値: 18.015 Da
Chemical component information

ChemComp-HOH:
WATER

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実験情報

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構造解析

手法クライオ電子顕微鏡法
解析単粒子再構成法
試料の集合状態particle

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試料調製

濃度0.18 mg/mL
緩衝液pH: 7.4
グリッドモデル: Quantifoil R1.2/1.3 / 材質: COPPER / メッシュ: 400 / 支持フィルム - #0 - Film type ID: 1 / 支持フィルム - #0 - 材質: CARBON / 支持フィルム - #0 - トポロジー: CONTINUOUS / 支持フィルム - #1 - Film type ID: 2 / 支持フィルム - #1 - 材質: GRAPHENE / 支持フィルム - #1 - トポロジー: CONTINUOUS / 前処理 - タイプ: GLOW DISCHARGE / 前処理 - 時間: 15 sec.
凍結凍結剤: ETHANE / チャンバー内湿度: 70 % / チャンバー内温度: 283.15 K / 装置: FEI VITROBOT MARK IV

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電子顕微鏡法

顕微鏡FEI TITAN KRIOS
撮影フィルム・検出器のモデル: FEI FALCON IV (4k x 4k)
平均電子線量: 50.0 e/Å2
電子線加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD / 最大 デフォーカス（公称値）: 1.5 µm / 最小 デフォーカス（公称値）: 0.5 µm / 倍率（公称値）: 215000
実験機器
モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company

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画像解析

粒子像選択選択した数: 1215138
初期モデルモデルのタイプ: EMDB MAP
EMDB ID:

11878

最終 再構成想定した対称性 - 点群: C1 (非対称) / 解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 2.09 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 3.1.3) / 使用した粒子像数: 213993
初期 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD / ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 3.1.3)
FSC曲線 (解像度の算出)

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原子モデル構築 1

ソフトウェア名称: Coot (ver. 0.9.5)
精密化空間: REAL
得られたモデル

PDB-8bpx:
Cryo-EM structure of the Arabidopsis thaliana I+III2 supercomplex (Complete composition)

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万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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