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- EMDB-0099: tRNA translocation by the eukaryotic 80S ribosome and the impact ... -

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基本情報

登録情報
データベース: EMDB / ID: EMD-0099
タイトルtRNA translocation by the eukaryotic 80S ribosome and the impact of GTP hydrolysis, Translocation-intermediate-POST-2 (TI-POST-2)
マップデータ
試料
  • 複合体: TI-POST-2
    • タンパク質・ペプチド: x 79種
    • RNA: x 7種
  • リガンド: x 3種
生物種Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
手法単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.6 Å
データ登録者Flis J / Holm M / Rundlet EJ / Loerke J / Hilal T / Dabrowski M / Buerger J / Mielke T / Blanchard SC / Spahn CMT / Budkevich TV
資金援助 ドイツ, 米国, 3件
OrganizationGrant number国
German Research FoundationDFG SFB 740 ドイツ
National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS)GM079238 米国
National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS)T32 GM115327-Tan 米国
引用ジャーナル: Cell Rep / 年: 2018
タイトル: tRNA Translocation by the Eukaryotic 80S Ribosome and the Impact of GTP Hydrolysis.
著者: Julia Flis / Mikael Holm / Emily J Rundlet / Justus Loerke / Tarek Hilal / Marylena Dabrowski / Jörg Bürger / Thorsten Mielke / Scott C Blanchard / Christian M T Spahn / Tatyana V Budkevich /
要旨: Translocation moves the tRNA⋅mRNA module directionally through the ribosome during the elongation phase of protein synthesis. Although translocation is known to entail large conformational changes ...Translocation moves the tRNA⋅mRNA module directionally through the ribosome during the elongation phase of protein synthesis. Although translocation is known to entail large conformational changes within both the ribosome and tRNA substrates, the orchestrated events that ensure the speed and fidelity of this critical aspect of the protein synthesis mechanism have not been fully elucidated. Here, we present three high-resolution structures of intermediates of translocation on the mammalian ribosome where, in contrast to bacteria, ribosomal complexes containing the translocase eEF2 and the complete tRNA⋅mRNA module are trapped by the non-hydrolyzable GTP analog GMPPNP. Consistent with the observed structures, single-molecule imaging revealed that GTP hydrolysis principally facilitates rate-limiting, final steps of translocation, which are required for factor dissociation and which are differentially regulated in bacterial and mammalian systems by the rates of deacyl-tRNA dissociation from the E site.
履歴
登録2018年7月3日-
ヘッダ(付随情報) 公開2018年10月24日-
マップ公開2018年12月5日-
更新2022年3月30日-
現状2022年3月30日処理サイト: PDBe / 状態: 公開

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構造の表示

ムービー
  • 表面図（断面を密度値に従い着色）
  • 表面レベル: 2.5
  • UCSF Chimeraによる作画
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  • 原子モデル: PDB-6gz4
  • 表面レベル: 2.5
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ムービービューア
構造ビューアEMマップ:
SurfViewMolmilJmol/JSmol
添付画像

emd_0099.png

ダウンロードとリンク

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マップ

ファイルダウンロード / ファイル: emd_0099.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 253.4 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
投影像・断面図

画像のコントロール

大きさ
明度
コントラスト
その他
軸Z (Sec.)Y (Row.)X (Col.)
0.98 Å/pix.
x 405 pix.
= 394.875 Å		0.98 Å/pix.
x 405 pix.
= 394.875 Å		0.98 Å/pix.
x 405 pix.
= 394.875 Å

表面

投影像

断面 (1/3)

断面 (1/2)

断面 (2/3)

画像は Spider により作成

ボクセルのサイズX=Y=Z: 0.975 Å
密度

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)
表面レベル登録者による: 2.5 / ムービー #1: 2.5
最小 - 最大-3.981005 - 12.587396
平均 (標準偏差)0.3450845 (±0.67152554)
対称性空間群: 1
詳細

EMDB XML:

マップ形状
Axis orderXYZ
Origin000
サイズ405405405
Spacing405405405
セルA=B=C: 394.875 Å
α=β=γ: 90.0 °

CCP4マップ ヘッダ情報:

modeImage stored as Reals
Å/pix. X/Y/Z0.9750.9750.975
M x/y/z405405405
origin x/y/z0.0000.0000.000
length x/y/z394.875394.875394.875
α/β/γ90.00090.00090.000
start NX/NY/NZ000
NX/NY/NZ450450450
MAP C/R/S123
start NC/NR/NS000
NC/NR/NS405405405
D min/max/mean-3.98112.5870.345

-
添付データ

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試料の構成要素

+
全体 : TI-POST-2

全体名称: TI-POST-2
要素
  • 複合体: TI-POST-2
    • タンパク質・ペプチド: ribosomal protein uL2
    • タンパク質・ペプチド: ribosomal protein uS2
    • タンパク質・ペプチド: ribosomal protein uL3
    • タンパク質・ペプチド: ribosomal protein eS1
    • タンパク質・ペプチド: ribosomal protein uL4
    • タンパク質・ペプチド: ribosomal protein eS28
    • RNA: 28S ribosomal RNA
    • RNA: ap/P-site tRNA
    • RNA: mRNA
    • RNA: pe/E-site-tRNA
    • RNA: 18S ribosomal RNA
    • タンパク質・ペプチド: ribosomal protein uS3
    • タンパク質・ペプチド: ribosomal protein uS7
    • タンパク質・ペプチド: ribosomal protein eS10
    • タンパク質・ペプチド: ribosomal protein eS12
    • タンパク質・ペプチド: ribosomal protein uS19
    • タンパク質・ペプチド: ribosomal protein uS9
    • タンパク質・ペプチド: ribosomal protein eS17
    • タンパク質・ペプチド: ribosomal protein uS13
    • タンパク質・ペプチド: ribosomal protein eS19
    • タンパク質・ペプチド: ribosomal protein uS10
    • タンパク質・ペプチド: ribosomal protein uS10
    • タンパク質・ペプチド: ribosomal protein eS28
    • タンパク質・ペプチド: ribosomal protein uS14
    • タンパク質・ペプチド: ribosomal protein eS31
    • タンパク質・ペプチド: ribosomal protein RACK 1
    • タンパク質・ペプチド: ribosomal protein eS4
    • タンパク質・ペプチド: ribosomal protein eS6
    • タンパク質・ペプチド: ribosomal protein eS7
    • タンパク質・ペプチド: ribosomal protein eS8
    • タンパク質・ペプチド: ribosomal protein uS4
    • タンパク質・ペプチド: ribosomal protein uS17
    • タンパク質・ペプチド: ribosomal protein uS15
    • タンパク質・ペプチド: ribosomal protein uS11
    • タンパク質・ペプチド: ribosomal protein eS21
    • タンパク質・ペプチド: ribosomal protein uS8
    • タンパク質・ペプチド: ribosomal protein uS12
    • タンパク質・ペプチド: ribosomal protein eS24
    • タンパク質・ペプチド: ribosomal protein eS26
    • タンパク質・ペプチド: ribosomal protein eS27
    • タンパク質・ペプチド: ribosomal protein eS30
    • RNA: 5.8S ribosomal RNA
    • RNA: 5S ribosomal RNA
    • タンパク質・ペプチド: ribosomal protein uL18
    • タンパク質・ペプチド: ribosomal protein eL6
    • タンパク質・ペプチド: ribosomal protein uL30
    • タンパク質・ペプチド: ribosomal protein eL8
    • タンパク質・ペプチド: ribosomal protein uL6
    • タンパク質・ペプチド: ribosomal protein uL16
    • タンパク質・ペプチド: ribosomal protein uL5
    • タンパク質・ペプチド: ribosomal protein eL13
    • タンパク質・ペプチド: ribosomal protein eL14
    • タンパク質・ペプチド: ribosomal protein eL15
    • タンパク質・ペプチド: ribosomal protein uL13
    • タンパク質・ペプチド: ribosomal protein uL22
    • タンパク質・ペプチド: ribosomal protein eL18
    • タンパク質・ペプチド: ribosomal protein eL19
    • タンパク質・ペプチド: ribosomal protein eL20
    • タンパク質・ペプチド: ribosomal protein eL21
    • タンパク質・ペプチド: ribosomal protein eL22
    • タンパク質・ペプチド: ribosomal protein uL14
    • タンパク質・ペプチド: ribosomal protein eL24
    • タンパク質・ペプチド: ribosomal protein uL23
    • タンパク質・ペプチド: ribosomal protein uL24
    • タンパク質・ペプチド: ribosomal protein eL27
    • タンパク質・ペプチド: ribosomal protein uL15
    • タンパク質・ペプチド: ribosomal protein eL29
    • タンパク質・ペプチド: ribosomal protein eL30
    • タンパク質・ペプチド: ribosomal protein eL31
    • タンパク質・ペプチド: ribosomal protein eL32
    • タンパク質・ペプチド: ribosomal protein eL33
    • タンパク質・ペプチド: ribosomal protein eL34
    • タンパク質・ペプチド: ribosomal protein uL29
    • タンパク質・ペプチド: ribosomal protein eL36
    • タンパク質・ペプチド: ribosomal protein eL37
    • タンパク質・ペプチド: ribosomal protein eL38
    • タンパク質・ペプチド: ribosomal protein eL39
    • タンパク質・ペプチド: ribosomal protein eL40
    • タンパク質・ペプチド: ribosomal protein eL41
    • タンパク質・ペプチド: ribosomal protein eL42
    • タンパク質・ペプチド: ribosomal protein eL43
    • タンパク質・ペプチド: ribosomal protein eL28
    • タンパク質・ペプチド: ribosomal protein uL1
    • タンパク質・ペプチド: ribosomal protein uL11
    • タンパク質・ペプチド: ribosomal protein uL10
    • タンパク質・ペプチド: eukaryotic elongation factor 2 (eEF2)
  • リガンド: MAGNESIUM ION
  • リガンド: ZINC ION
  • リガンド: PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER

+
超分子 #1: TI-POST-2

超分子名称: TI-POST-2 / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#86
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 4.2 MDa

+
分子 #1: ribosomal protein uL2

分子名称: ribosomal protein uL2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 27.456158 KDa
配列文字列: GRVIRGQRKG AGSVFRAHVK HRKGAARLRA VDFAERHGYI KGIVKDIIHD PGRGAPLAKV VFRDPYRFKK RTELFIAAEG IHTGQFVYC GKKAQLNIGN VLPVGTMPEG TIVCCLEEKP GDRGKLARAS GNYATVISHN PETKKTRVKL PSGSKKVISS A NRAVVGVV ...文字列:
GRVIRGQRKG AGSVFRAHVK HRKGAARLRA VDFAERHGYI KGIVKDIIHD PGRGAPLAKV VFRDPYRFKK RTELFIAAEG IHTGQFVYC GKKAQLNIGN VLPVGTMPEG TIVCCLEEKP GDRGKLARAS GNYATVISHN PETKKTRVKL PSGSKKVISS A NRAVVGVV AGGGRIDKPI LKAGRAYHKY KAKRNCWPRV RGVAMNPVEH PFGGGNHQHI GKPSTIRRDA PAGRKVGLIA AR RTGRLRG TKTVQ

+
分子 #2: ribosomal protein uS2

分子名称: ribosomal protein uS2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 24.24574 KDa
配列文字列: LDVLQMKEED VLKFLAAGTH LGGTNLDFQM EQYIYKRKSD GIYIINLKRT WEKLLLAARA IVAIENPADV SVISSRNTGQ RAVLKFAAA TGATPIAGRF TPGTFTNQIQ AAFREPRLLV VTDPRADHQP LTEASYVNLP TIALCNTDSP LRYVDIAIPC N NKGAHSVG ...文字列:
LDVLQMKEED VLKFLAAGTH LGGTNLDFQM EQYIYKRKSD GIYIINLKRT WEKLLLAARA IVAIENPADV SVISSRNTGQ RAVLKFAAA TGATPIAGRF TPGTFTNQIQ AAFREPRLLV VTDPRADHQP LTEASYVNLP TIALCNTDSP LRYVDIAIPC N NKGAHSVG LMWWMLAREV LRMRGTISRE HPWEVMPDLY FYRDPEEIEK EEQAAAE

+
分子 #3: ribosomal protein uL3

分子名称: ribosomal protein uL3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 3 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 45.222949 KDa
配列文字列: SHRKFSAPRH GSLGFLPRKR SSRHRGKVKS FPKDDPSKPV HLTAFLGYKA GMTHIVREVD RPGSKVNKKE VVEAVTIVET PPMVVVGIV GYVETPRGLR TFKTVFAEHI SDECKRRFYK NWHKSKKKAF TKYCKKWQDE DGKKQLEKDF SSMKKYCQVI R VIAHTQMR ...文字列:
SHRKFSAPRH GSLGFLPRKR SSRHRGKVKS FPKDDPSKPV HLTAFLGYKA GMTHIVREVD RPGSKVNKKE VVEAVTIVET PPMVVVGIV GYVETPRGLR TFKTVFAEHI SDECKRRFYK NWHKSKKKAF TKYCKKWQDE DGKKQLEKDF SSMKKYCQVI R VIAHTQMR LLPLRQKKAH LMEIQVNGGT VAEKLDWARE RLEQQVPVNQ VFGQDEMIDV IGVTKGKGYK GVTSRWHTKK LP RKTHRGL RKVACIGAWH PARVAFSVAR AGQKGYHHRT EINKKIYKIG QGYLIKDGKL IKNNASTDYD LSDKSINPLG GFV HYGEVT NDFVMLKGCV VGTKKRVLTL RKSLLVQTKR RALEKIDLKF IDTTSKFGHG RFQTMEEKKA FMGPLKKD

+
分子 #4: ribosomal protein eS1

分子名称: ribosomal protein eS1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 4 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 24.660012 KDa
配列文字列: VDPFSKKDWY DVKAPAMFNI RNIGKTLVTR TQGTKIASDG LKGRVFEVSL ADLQNDEVAF RKFKLITEDV QGKNCLTNFH GMDLTRDKM CSMVKKWQTM IEAHVDVKTT DGYLLRLFCV GFTKKRNNQI RKTSYAQHQQ VRQIRKKMME IMTREVQTND L KEVVNKLI ...文字列:
VDPFSKKDWY DVKAPAMFNI RNIGKTLVTR TQGTKIASDG LKGRVFEVSL ADLQNDEVAF RKFKLITEDV QGKNCLTNFH GMDLTRDKM CSMVKKWQTM IEAHVDVKTT DGYLLRLFCV GFTKKRNNQI RKTSYAQHQQ VRQIRKKMME IMTREVQTND L KEVVNKLI PDSIGKDIEK ACQSIYPLHD VFVRKVKMLK KPKFELGKLM ELHG

+
分子 #5: ribosomal protein uL4

分子名称: ribosomal protein uL4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 5 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 41.171547 KDa
配列文字列: CARPLISVYS EKGESSGKNV TLPAVFKAPI RPDIVNFVHT NLRKNNRQPY AVSELAGHQT SAESWGTGRA VARIPRVRGG GTHRSGQGA FGNMCRGGRM FAPTKTWRRW HRRVNTTQKR YAICSALAAS ALPALVMSKG HRIEEVPELP LVVEDKVEGY K KTKEAVLL ...文字列:
CARPLISVYS EKGESSGKNV TLPAVFKAPI RPDIVNFVHT NLRKNNRQPY AVSELAGHQT SAESWGTGRA VARIPRVRGG GTHRSGQGA FGNMCRGGRM FAPTKTWRRW HRRVNTTQKR YAICSALAAS ALPALVMSKG HRIEEVPELP LVVEDKVEGY K KTKEAVLL LKKLKAWNDI KKVYASQRMR AGKGKMRNRR RIQRRGPCII YNEDNGIIKA FRNIPGITLL NVSKLNILKL AP GGHVGRF CIWTESAFRK LDELYGTWRK AASLKSNYNL PMHKMINTDL SRILKSPEIQ RALRAPRKKI HRRVLKKNPL KNL RIMLKL NPYAKTMRRN TILRQARNHK LRVDKAAAAA AALQAKS

+
分子 #6: ribosomal protein eS28

分子名称: ribosomal protein eS28 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 6 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 24.574971 KDa
配列文字列: DKEWMPVTKL GRLVKDMKIK SLEEIYLFSL PIKESEIIDF FLGASLKDEV LKIMPVQKQT RAGQRTRFKA FVAIGDYNGH VGLGVKCSK EVATAIRGAI ILAKLSIVPV RRGYWGNKIG KPHTVPCKVT GRCGSVLVRL IPAPRGTGIV SAPVPKKLLM M AGIDDCYT ...文字列:
DKEWMPVTKL GRLVKDMKIK SLEEIYLFSL PIKESEIIDF FLGASLKDEV LKIMPVQKQT RAGQRTRFKA FVAIGDYNGH VGLGVKCSK EVATAIRGAI ILAKLSIVPV RRGYWGNKIG KPHTVPCKVT GRCGSVLVRL IPAPRGTGIV SAPVPKKLLM M AGIDDCYT SARGCTATLG NFAKATFDAI SKTYSYLTPD LWKETVFTKS PYQEFTDHLV KTHT

+
分子 #12: ribosomal protein uS3

分子名称: ribosomal protein uS3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 12 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 24.35759 KDa
配列文字列: AVQISKKRKF VADGIFKAEL NEFLTRELAE DGYSGVEVRV TPTRTEIIIL ATRTQNVLGE KGRRIRELTA VVQKRFGFPE GSVELYAEK VATRGLCAIA QAESLRYKLL GGLAVRRACY GVLRFIMESG AKGCEVVVSG KLRGQRAKSM KFVDGLMIHS G DPVNYYVD ...文字列:
AVQISKKRKF VADGIFKAEL NEFLTRELAE DGYSGVEVRV TPTRTEIIIL ATRTQNVLGE KGRRIRELTA VVQKRFGFPE GSVELYAEK VATRGLCAIA QAESLRYKLL GGLAVRRACY GVLRFIMESG AKGCEVVVSG KLRGQRAKSM KFVDGLMIHS G DPVNYYVD TAVRHVLLRQ GVLGIKVKIM LPWDPTGKIG PKKPLPDHVS IVEPKDEILP TT

+
分子 #13: ribosomal protein uS7

分子名称: ribosomal protein uS7 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 13 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 21.424836 KDa
配列文字列: PDIKLFGKWS TDDVQINDIS LQDYIAVKEK YAKYLPHSAG RYAAKRFRKA QCPIVERLTN SMMMHGRNNG KKLMTVRIVK HAFEIIHLL TGENPLQVLV NAIINSGPRE DSTRIGRAGT VRRQAVDVSP LRRVNQAIWL LCTGAREAAF RNIKTIAECL A DELINAAK ...文字列:
PDIKLFGKWS TDDVQINDIS LQDYIAVKEK YAKYLPHSAG RYAAKRFRKA QCPIVERLTN SMMMHGRNNG KKLMTVRIVK HAFEIIHLL TGENPLQVLV NAIINSGPRE DSTRIGRAGT VRRQAVDVSP LRRVNQAIWL LCTGAREAAF RNIKTIAECL A DELINAAK GSSNSYAIKK KDELERVAKS NR

+
分子 #14: ribosomal protein eS10

分子名称: ribosomal protein eS10 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 14 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 11.773953 KDa
配列文字列:
MLMPKKNRIA IYELLFKEGV MVAKKDVHMP KHPELADKNV PNLHVMKAMQ SLKSRGYVKE QFAWRHFYWY LTNEGIQYLR DYLHLPPEI VPATLRRSR

+
分子 #15: ribosomal protein eS12

分子名称: ribosomal protein eS12 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 15 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 13.393658 KDa
配列文字列:
VMDVNTALQE VLKTALIHDG LARGIREAAK ALDKRQAHLC VLASNCDEPM YVKLVEALCA EHQINLIKVD DNKKLGEWVG LCKIDREGK PRKVVGCSCV VVKDYGKESQ AKDVIEEYFK C

+
分子 #16: ribosomal protein uS19

分子名称: ribosomal protein uS19 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 16 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 14.273879 KDa
配列文字列:
FRKFTYRGVD LDQLLDMSYE QLMQLYSARQ RRRLNRGLRR KQHSLLKRLR KAKKEAPPME KPEVVKTHLR DMIILPEMVG SMVGVYNGK TFNQVEIKPE MIGHYLGEFS ITYKPVKHGR P

+
分子 #17: ribosomal protein uS9

分子名称: ribosomal protein uS9 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 17 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 15.76548 KDa
配列文字列:
QSVQVFGRKK TATAVAHCKR GNGLIKVNGR PLEMIEPRTL QYKLLEPVLL LGKERFAGVD IRVRVKGGGH VAQIYAIRQS ISKALVAYY QKYVDEASKK EIKDILIQYD RTLLVADPRR CESKKFGGPG ARARYQKSYR

+
分子 #18: ribosomal protein eS17

分子名称: ribosomal protein eS17 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 18 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 14.447793 KDa
配列文字列:
GRVRTKTVKK AARVIIEKYY TRLGNDFHTN KRVCEEIAII PSKKLRNKIA GYVTHLMKRI QRGPVRGISI KLQEEERERR DNYVPEVSA LDQEIIEVDP DTKEMLKLLD FGSLSNLQVT QPTVGM

+
分子 #19: ribosomal protein uS13

分子名称: ribosomal protein uS13 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 19 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 16.383064 KDa
配列文字列:
VIPEKFQHIL RVLNTNIDGR RKIAFAITAI KGVGRRYAHV VLRKADIDLT KRAGELTEDE VERVITIMQN PRQYKIPDWF LNRQKDVKD GKYSQVLANG LDNKLREDLE RLKKIRAHRG LRHFWGLRVR GQHTKTTGRR

+
分子 #20: ribosomal protein eS19

分子名称: ribosomal protein eS19 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 20 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 15.822219 KDa
配列文字列:
PGVTVKDVNQ QEFVRALAAF LKKSGKLKVP EWVDTVKLAK HKELAPYDEN WFYTRAASTA RHLYLRGGAG VGSMTKIYGG RQRNGVMPS HFSRGSKSVA RRVLQALEGL KMVEKDQDGG RKLTPQGQRD LDRIAGQVAA ANKK

+
分子 #21: ribosomal protein uS10

分子名称: ribosomal protein uS10 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 21 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 11.029072 KDa
配列文字列:
IRITLTSRNV KSLEKVCADL IRGAKEKNLK VKGPVRMPTK TLRITTRKTP CGEGSKTWDR FQMRIHKRLI DLHSPSEIVK QITSISIEP GVEVEVTI

+
分子 #22: ribosomal protein uS10

分子名称: ribosomal protein uS10 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 22 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 9.801748 KDa
配列文字列:
GKAKKKKWSK GKVRDKLNNL VLFDKATYDK LCKEVPNYKL ITPAVVSERL KIRGSLARAA LQELLSKGLI KLVSKHRAQV IYTRNT

+
分子 #23: ribosomal protein eS28

分子名称: ribosomal protein eS28 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 23 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 7.007069 KDa
配列文字列:
QPIKLARVTK VLGRTGSQGQ CTQVRVEFMD DTSRSIIRNV KGPVREGDVL TLLESEREAR RL

+
分子 #24: ribosomal protein uS14

分子名称: ribosomal protein uS14 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 24 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 6.12121 KDa
配列文字列:
QLYWSHPRKF GQGSRSCRVC SNRHGLIRKY GLNMCRQCFR QYAKDIGFIK L

+
分子 #25: ribosomal protein eS31

分子名称: ribosomal protein eS31 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 25 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 8.645277 KDa
配列文字列:
KRKKKSYTTP KKNKHKRKKV KLAVLKYYKV DENGKISRLR RECPSDECGA GVFMASHFDR HYCGKCCLTY CFN

+
分子 #26: ribosomal protein RACK 1

分子名称: ribosomal protein RACK 1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 26 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 34.726164 KDa
配列文字列: TEQMTLRGTL KGHNGWVTQI ATTPQFPDMI LSASRDKTII MWKLTRDETN YGIPQRALRG HSHFVSDVVI SSDGQFALSG SWDGTLRLW DLTTGTTTRR FVGHTKDVLS VAFSSDNRQI VSGSRDKTIK LWNTLGVCKY TVQDESHSEW VSCVRFSPNS S NPIIVSCG ...文字列:
TEQMTLRGTL KGHNGWVTQI ATTPQFPDMI LSASRDKTII MWKLTRDETN YGIPQRALRG HSHFVSDVVI SSDGQFALSG SWDGTLRLW DLTTGTTTRR FVGHTKDVLS VAFSSDNRQI VSGSRDKTIK LWNTLGVCKY TVQDESHSEW VSCVRFSPNS S NPIIVSCG WDKLVKVWNL ANCKLKTNHI GHTGYLNTVT VSPDGSLCAS GGKDGQAMLW DLNEGKHLYT LDGGDIINAL CF SPNRYWL CAATGPSIKI WDLEGKIIVD ELKQEVISTS SKAEPPQCTS LAWSADGQTL FAGYTDNLVR VWQVTIG

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分子 #27: ribosomal protein eS4

分子名称: ribosomal protein eS4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 27 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 28.893043 KDa
配列文字列: ARGPKKHLKR VAAPKHWMLD KLTGVFAPRP STGPHKLREC LPLIVFLRNR LKYALTGDEV KKICMQRFIK IDGKVRVDVT YPAGFMDVI SIEKTGEHFR LVYDTKGRFA VHRITVEEAK YKLCKVRKIT VGVKGIPHLV THDARTIRYP DPVIKVNDTV Q IDLGTGKI ...文字列:
ARGPKKHLKR VAAPKHWMLD KLTGVFAPRP STGPHKLREC LPLIVFLRNR LKYALTGDEV KKICMQRFIK IDGKVRVDVT YPAGFMDVI SIEKTGEHFR LVYDTKGRFA VHRITVEEAK YKLCKVRKIT VGVKGIPHLV THDARTIRYP DPVIKVNDTV Q IDLGTGKI INFIKFDTGN LCMVIGGANL GRVGVITNRE RHPGSFDVVH VKDANGNSFA TRLSNIFVIG NGNKPWISLP RG KGIRLTV AEERDKRLAT

+
分子 #28: ribosomal protein eS6

分子名称: ribosomal protein eS6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 28 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 26.913867 KDa
配列文字列: MKLNISFPAT GCQKLIEVDD ERKLRTFYEK RMATEVAADA LGEEWKGYVV RISGGNDKQG FPMKQGVLTH GRVRLLLSKG HSCYRPRRT GERKRKSVRG CIVDANLSVL NLVIVKKGEK DIPGLTDTTV PRRLGPKRAS RIRKLFNLSK EDDVRQYVVR K PLNKEGKK ...文字列:
MKLNISFPAT GCQKLIEVDD ERKLRTFYEK RMATEVAADA LGEEWKGYVV RISGGNDKQG FPMKQGVLTH GRVRLLLSKG HSCYRPRRT GERKRKSVRG CIVDANLSVL NLVIVKKGEK DIPGLTDTTV PRRLGPKRAS RIRKLFNLSK EDDVRQYVVR K PLNKEGKK PRTKAPKIQR LVTPRVLQHK RRRIALKKQR TKKNKEEAAE YAKLLAKRMK EAKEKRQEQI AKRR

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分子 #29: ribosomal protein eS7

分子名称: ribosomal protein eS7 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 29 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 20.990465 KDa
配列文字列:
NGEKPDEFES GISQALLELE MNSDLKAQLR ELNITAAKEI EVGGGRKAII IFVPVPQLKS FQKIQVRLVR ELEKKFSGKH VVFIAQRRI LPKPTRKSRT KNKQKRPRSR TLTAVHDAIL EDLVFPSEIV GKRIRVKLDG SRLIKVHLDK AQQNNVEHKV E TFSGVYKK LTGKDVNFEF PEFQL

+
分子 #30: ribosomal protein eS8

分子名称: ribosomal protein eS8 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 30 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 24.132191 KDa
配列文字列: GISRDNWHKR RKTGGKRKPY HKKRKYELGR PAANTKIGPR RIHTVRVRGG NKKYRALRLD VGNFSWGSEC CTRKTRIIDV VYNASNNEL VRTKTLVKNC IVLIDSTPYR QWYESHYALP LGRKKGAKLT PEEEEILNKK RSKKIQKKYD ERKKNAKISS L LEEQFQQG ...文字列:
GISRDNWHKR RKTGGKRKPY HKKRKYELGR PAANTKIGPR RIHTVRVRGG NKKYRALRLD VGNFSWGSEC CTRKTRIIDV VYNASNNEL VRTKTLVKNC IVLIDSTPYR QWYESHYALP LGRKKGAKLT PEEEEILNKK RSKKIQKKYD ERKKNAKISS L LEEQFQQG KLLACIASRP GQCGRADGYV LEGKELEFYL RKIKARKGK

+
分子 #31: ribosomal protein uS4

分子名称: ribosomal protein uS4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 31 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 21.222221 KDa
配列文字列:
PVARSWVCRK TYVTPRRPFE KSRLDQELKL IGEYGLRNKR EVWRVKFTLA KIRKAARELL TLDEKDPRRL FEGNALLRRL VRIGVLDEG KMKLDYILGL KIEDFLERRL QTQVFKLGLA KSIHHARVLI RQRHIRVRKQ VVNIPSFIVR LDSQKHIDFS L RSPYGGGR PGRVKRKNAK K

+
分子 #32: ribosomal protein uS17

分子名称: ribosomal protein uS17 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 32 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 17.910176 KDa
配列文字列:
TERAYQKQPT IFQNKKRVLL GETGKEKLPR YYKNIGLGFK TPKEAIEGTY IDKKCPFTGN VSIRGRILSG VVTKMKMQRT IVIRRDYLH YIRKYNRFEK RHKNMSVHLS PCFRDVQIGD IVTVGECRPL SKTVRFNVLK VTKAAGTKKQ FQKF

+
分子 #33: ribosomal protein uS15

分子名称: ribosomal protein uS15 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 33 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 17.057113 KDa
配列文字列:
GRMHAPGKGL SQSALPYRRS VPTWLKLTSD DVKEQIYKLA KKGLTPSQIG VILRDSHGVA QVRFVTGNKI LRILKSKGLA PDLPEDLYH LIKKAVAVRK HLERNRKDKD AKFRLILIES RIHRLARYYK TKRVLPPNWK YESSTASALV

+
分子 #34: ribosomal protein uS11

分子名称: ribosomal protein uS11 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 34 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 14.544659 KDa
配列文字列:
SLGPQVAEGE NVFGVCHIFA SFNDTFVHVT DLSGKETICR VTGGMKVKAD RDESSPYAAM LAAQDVAQRC KELGITALHI KLRATGGNR TKTPGPGAQS ALRALARSGM KIGRIEDVTP IPSDSTRRKG GRRGRRL

+
分子 #35: ribosomal protein eS21

分子名称: ribosomal protein eS21 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 35 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 8.863111 KDa
配列文字列:
MQNDAGEFVD LYVPRKCSAS NRIIGAKDHA SIQMNVAEVD KVTGRFNGQF KTYAICGAIR RMGESDDSIL RLAKADGIVS K

+
分子 #36: ribosomal protein uS8

分子名称: ribosomal protein uS8 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 36 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 14.734357 KDa
配列文字列:
VRMNVLADAL KSINNAEKRG KRQVLIRPCS KVIVRFLTVM MKHGYIGEFE IIDDHRAGKI VVNLTGRLNK CGVISPRFDV QLKDLEKWQ NNLLPSRQFG FIVLTTSAGI MDHEEARRKH TGGKILGFFF

+
分子 #37: ribosomal protein uS12

分子名称: ribosomal protein uS12 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 37 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 15.626392 KDa
配列文字列:
GKCRGLRTAR KLRSHRRDQK WHDKQYKKAH LGTALKANPF GGASHAKGIV LEKVGVEAKQ PNSAIRKCVR VQLIKNGKKI TAFVPNDGC LNFIEENDEV LVAGFGRKGH AVGDIPGVRF KVVKVANVSL LALYKGKKER PR

+
分子 #38: ribosomal protein eS24

分子名称: ribosomal protein eS24 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 38 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 14.489176 KDa
配列文字列:
TVTIRTRKFM TNRLLQRKQM VIDVLHPGKA TVPKTEIREK LAKMYKTTPD VIFVFGFRTH FGGGKTTGFG MIYDSLDYAK KNEPKHRLA RHGLYEKKKT SRKQRKERKN RMKKVRGTAK ANVGAG

+
分子 #39: ribosomal protein eS26

分子名称: ribosomal protein eS26 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 39 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 11.087117 KDa
配列文字列:
TKKRRNNGRA KKGRGHVQPI RCTNCARCVP KDKAIKKFVI RNIVEAAAVR DISEASVFDA YVLPKLYVKL HYCVSCAIHS KVVRNRSRE ARKDRTPP

+
分子 #40: ribosomal protein eS27

分子名称: ribosomal protein eS27 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 40 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 9.00057 KDa
配列文字列:
AKDLLHPSPE EEKRKHKKKR LVQSPNSYFM DVKCPGCYKI TTVFSHAQTV VLCVGCSTVL CQPTGGKARL TEGCSFRRKQ

+
分子 #41: ribosomal protein eS30

分子名称: ribosomal protein eS30 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 41 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 6.239447 KDa
配列文字列:
HGSLARAGKV RGQTPKVAKQ EKKKKKTGRA KRRMQYNRRF VNVVPTFGKK KGPNA

+
分子 #44: ribosomal protein uL18

分子名称: ribosomal protein uL18 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 44 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 34.091371 KDa
配列文字列: VKVVKNKAYF KRYQVKFRRR REGKTDYYAR KRLVIQDKNK YNTPKYRMIV RVTNRDIICQ IAYARIEGDM IVCAAYAHEL PKYGVKVGL TNYAAAYCTG LLLARRLLNR FGMDKIYEGQ VEVTGDEYNV ESIDGQPGAF TCYLDAGLAR TTTGNKVFGA L KGAVDGGL ...文字列:
VKVVKNKAYF KRYQVKFRRR REGKTDYYAR KRLVIQDKNK YNTPKYRMIV RVTNRDIICQ IAYARIEGDM IVCAAYAHEL PKYGVKVGL TNYAAAYCTG LLLARRLLNR FGMDKIYEGQ VEVTGDEYNV ESIDGQPGAF TCYLDAGLAR TTTGNKVFGA L KGAVDGGL SIPHSTKRFP GYDSESKEFN AEVHRKHIMG QNVADYMRYL MEEDEDAYKK QFSQYIKNSV TPDMMEEMYK KA HAAIREN PVYEKKPKKE VKKKRWNRPK MSLAQKKDRV AQKKASFLRA QERAAES

+
分子 #45: ribosomal protein eL6

分子名称: ribosomal protein eL6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 45 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 22.262428 KDa
配列文字列: PVGGDKNGGT RVVKLRKMPR YYPTEDVPRK LLSHGKKPFS QHVRKLRASI TPGTILIILT GRHRGKRVVF LKQLASGLLL VTGPLVLNR VPLRRTHQKF VIATSTKIDI SNVKIPKHLT DAYFKKKKLR KPRHQEGEIF DTEKEKYEIT EQRKIDQKAV D SQILPKIK ...文字列:
PVGGDKNGGT RVVKLRKMPR YYPTEDVPRK LLSHGKKPFS QHVRKLRASI TPGTILIILT GRHRGKRVVF LKQLASGLLL VTGPLVLNR VPLRRTHQKF VIATSTKIDI SNVKIPKHLT DAYFKKKKLR KPRHQEGEIF DTEKEKYEIT EQRKIDQKAV D SQILPKIK AIPQLQGYLR SVFALTNGIY PHKLVF

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分子 #46: ribosomal protein uL30

分子名称: ribosomal protein uL30 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 46 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 27.733146 KDa
配列文字列: PETLKKKRRN FAELKIKRLR KKFAQKMLRK ARRKLIYEKA KHYHKEYRQM YRTEIRMARM ARKAGNFYVP AEPKLAFVIR IRGINGVSP KVRKVLQLLR LRQIFNGTFV KLNKASINML RIVEPYIAWG YPNLKSVNEL IYKRGYGKIN KKRIALTDNA L IARSLGKY ...文字列:
PETLKKKRRN FAELKIKRLR KKFAQKMLRK ARRKLIYEKA KHYHKEYRQM YRTEIRMARM ARKAGNFYVP AEPKLAFVIR IRGINGVSP KVRKVLQLLR LRQIFNGTFV KLNKASINML RIVEPYIAWG YPNLKSVNEL IYKRGYGKIN KKRIALTDNA L IARSLGKY GIICMEDLIH EIYTVGKRFK EANNFLWPFK LSSPRGGMKK KTTHFVEGGD AGNREDQINR LIRRMN

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分子 #47: ribosomal protein eL8

分子名称: ribosomal protein eL8 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 47 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 26.724568 KDa
配列文字列: NPLFEKRPKN FGIGQDIQPK RDLTRFVKWP RYIRLQRQRA ILYKRLKVPP AINQFTQALD RQTATQLLKL AHKYRPETKQ EKKQRLLAR AEKKAAGKGD VPTKRPPVLR AGVNTVTTLV ENKKAQLVVI AHDVDPIELV VFLPALCRKM GVPYCIIKGK A RLGRLVHR ...文字列:
NPLFEKRPKN FGIGQDIQPK RDLTRFVKWP RYIRLQRQRA ILYKRLKVPP AINQFTQALD RQTATQLLKL AHKYRPETKQ EKKQRLLAR AEKKAAGKGD VPTKRPPVLR AGVNTVTTLV ENKKAQLVVI AHDVDPIELV VFLPALCRKM GVPYCIIKGK A RLGRLVHR KTCTTVAFTQ VNSEDKGALA KLVEAIRTNY NDRYDEIRRH WGGNVLGPKS VARIAKLEKA KAKELA

+
分子 #48: ribosomal protein uL6

分子名称: ribosomal protein uL6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 48 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 21.770355 KDa
配列文字列: MKTILSNQTV DIPENVDITL KGRTVIVKGP RGTLRRDFNH INVELSLLGK KKKRLRVDKW WGNRKELATV RTICSHVQNM IKGVTLGFR YKMRSVYAHF PINVVIQENG SLVEIRNFLG EKYIRRVRMR PGVACSVSQA QKDELILEGN DIELVSNSAA L IQQATTVK ...文字列:
MKTILSNQTV DIPENVDITL KGRTVIVKGP RGTLRRDFNH INVELSLLGK KKKRLRVDKW WGNRKELATV RTICSHVQNM IKGVTLGFR YKMRSVYAHF PINVVIQENG SLVEIRNFLG EKYIRRVRMR PGVACSVSQA QKDELILEGN DIELVSNSAA L IQQATTVK NKDIRKFLDG IYVSEKGTVQ QAD

+
分子 #49: ribosomal protein uL16

分子名称: ribosomal protein uL16 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 49 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 24.150484 KDa
配列文字列: RRPARCYRYC KNKPYPKSRF CRGVPDAKIR IFDLGRKKAK VDEFPLCGHM VSDEYEQLSS EALEAARICA NKYMVKSCGK DGFHIRVRL HPFHVIRINK MLSADRLQTG MRGAFGKPQG TVARVHIGQV IMSIRTKLQN KEHVIEALRR AKFKFPGRQK I HISKKWGF ...文字列:
RRPARCYRYC KNKPYPKSRF CRGVPDAKIR IFDLGRKKAK VDEFPLCGHM VSDEYEQLSS EALEAARICA NKYMVKSCGK DGFHIRVRL HPFHVIRINK MLSADRLQTG MRGAFGKPQG TVARVHIGQV IMSIRTKLQN KEHVIEALRR AKFKFPGRQK I HISKKWGF TKFNADEFED MVAEKRLIPD GCGVKYIPNR GPLDKWRALH

+
分子 #50: ribosomal protein uL5

分子名称: ribosomal protein uL5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 50 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 19.270318 KDa
配列文字列:
ENPMRELRIR KLCLNICVGE SGDRLTRAAK VLEQLTGQTP VFSKARYTVR SFGIRRNEKI AVHCTVRGAK AEEILEKGLK VREYELRKN NFSDTGNFGF GIQEHIDLGI KYDPSIGIYG LDFYVVLGRP GFSIADKKRR TGCIGAKHRI SKEEAMRWFQ Q KYDGIILP G

+
分子 #51: ribosomal protein eL13

分子名称: ribosomal protein eL13 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 51 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 23.574697 KDa
配列文字列: APSRNGMVLK PHFHKDWQRR VATWFNQPAR KIRRRKARQA KARRIAPRPA SGPIRPIVRC PTVRYHTKVR AGRGFSLEEL RVAGIHKKV ARTIGISVDP RRRNKSTESL QANVQRLKEY RSKLILFPRK PSAPKKGDSS AEELKLATQL TGPVMPVRNV Y KKEKARVI ...文字列:
APSRNGMVLK PHFHKDWQRR VATWFNQPAR KIRRRKARQA KARRIAPRPA SGPIRPIVRC PTVRYHTKVR AGRGFSLEEL RVAGIHKKV ARTIGISVDP RRRNKSTESL QANVQRLKEY RSKLILFPRK PSAPKKGDSS AEELKLATQL TGPVMPVRNV Y KKEKARVI TEEEKNFKAF ASLRMARANA RLFGIRAKRA KEAAEQD

+
分子 #52: ribosomal protein eL14

分子名称: ribosomal protein eL14 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 52 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 16.220309 KDa
配列文字列:
VFRRFVEVGR VAYVSFGPHA GKLVAIVDVI DQNRALVDGP CTQVRRQAMP FKCMQLTDFI LKFPHSAHQK YVRQAWQKAD INTKWAATR WAKKIEARER KAKMTDFDRF KVMKAKKMRN RIIKNEVKKL QKAALLKASP

+
分子 #53: ribosomal protein eL15

分子名称: ribosomal protein eL15 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 53 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 24.076088 KDa
配列文字列: GAYKYIQELW RKKQSDVMRF LLRVRCWQYR QLSALHRAPR PTRPDKARRL GYKAKQGYVI YRIRVRRGGR KRPVPKGATY GKPVHHGVN QLKFARSLQS VAEERAGRHC GALRVLNSYW VGEDSTYKFF EVILIDPFHK AIRRNPDTQW ITKPVHKHRE M RGLTSAGR ...文字列:
GAYKYIQELW RKKQSDVMRF LLRVRCWQYR QLSALHRAPR PTRPDKARRL GYKAKQGYVI YRIRVRRGGR KRPVPKGATY GKPVHHGVN QLKFARSLQS VAEERAGRHC GALRVLNSYW VGEDSTYKFF EVILIDPFHK AIRRNPDTQW ITKPVHKHRE M RGLTSAGR KSRGLGKGHK FHHTIGGSRR AAWRRRNTLQ LHRYR

+
分子 #54: ribosomal protein uL13

分子名称: ribosomal protein uL13 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 54 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 22.820395 KDa
配列文字列: QVLVLDGRGH LLGRLAAIVA KQVLLGRKVV VVRCEGINIS GNFYRNKLKY LAFLRKRMNT NPSRGPYHFR APSRIFWRTV RGMLPHKTK RGQAALDRLK VFDGIPPPYD KKKRMVVPAA LKVVRLKPTR KFAYLGRLAH EVGWKYQAVT ATLEEKRKEK A KIHYRKKK ...文字列:
QVLVLDGRGH LLGRLAAIVA KQVLLGRKVV VVRCEGINIS GNFYRNKLKY LAFLRKRMNT NPSRGPYHFR APSRIFWRTV RGMLPHKTK RGQAALDRLK VFDGIPPPYD KKKRMVVPAA LKVVRLKPTR KFAYLGRLAH EVGWKYQAVT ATLEEKRKEK A KIHYRKKK QLMRLRKQAE KNVEKKIDKY TEVLKTH

+
分子 #55: ribosomal protein uL22

分子名称: ribosomal protein uL22 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 55 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 17.757627 KDa
配列文字列:
VRYSLDPENP TKSCKSRGSN LRVHFKNTRE TAQAIKGMHI RKATKYLKDV TLQKQCVPFR RYNGGVGRCA QAKQWGWTQG RWPKKSAEF LLHMLKNAES NAELKGLDVD SLVIEHIQVN KAPKMRRRTY RAHGRINPYM SSPCHIEMIL TEKE

+
分子 #56: ribosomal protein eL18

分子名称: ribosomal protein eL18 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 56 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 21.556482 KDa
配列文字列:
GVDIRHNKDR KVRRKEPKSQ DIYLRLLVKL YRFLARRTNS TFNQVVLKRL FMSRTNRPPL SLSRMIRKMK LPGRENKTAV VVGTITDDV RVQEVPKLKV CALRVTSRAR SRILRAGGKI LTFDQLALDS PKGCGTVLLS GPRKGREVYR HFGKAPGTPH S HTKPYVRS KGRKFERARG RRASRGYKN

+
分子 #57: ribosomal protein eL19

分子名称: ribosomal protein eL19 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 57 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 21.742146 KDa
配列文字列:
SMLRLQKRLA SSVLRCGKKK VWLDPNETNE IANANSRQQI RKLIKDGLII RKPVTVHSRA RCRKNTLARR KGRHMGIGKR KGTANARMP EKVTWMRRMR ILRRLLRRYR ESKKIDRHMY HSLYLKVKGN VFKNKRILME HIHKLKADKA RKKLLADQAE A RRSKTKEA RKRREERLQA KKE

+
分子 #58: ribosomal protein eL20

分子名称: ribosomal protein eL20 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 58 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 20.66134 KDa
配列文字列:
MKASGTLREY KVVGRCLPTP KCHTPPLYRM RIFAPNHVVA KSRFWYFVSQ LKKMKKSSGE IVYCGQVFEK SPLRVKNFGI WLRYDSRSG THNMYREYRD LTTAGAVTQC YRDMGARHRA RAHSIQIMKV EEIAASKCRR PAVKQFHDSK IKFPLPHRVL R RQHKPRFT TKRPNTF

+
分子 #59: ribosomal protein eL21

分子名称: ribosomal protein eL21 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 59 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 18.276518 KDa
配列文字列:
TNTKGKRRGT RYMFSRPFRK HGVVPLATYM RIYKKGDIVD IKGMGTVQKG MPHKCYHGKT GRVYNVTQHA VGIVVNKQVK GKILAKRIN VRIEHIKHSK SRDSFLKRVK ENDQKKKEAK EKGTWVQLKR QPAPPREAHF VRTNGKEPEL LEPIPYEF

+
分子 #60: ribosomal protein eL22

分子名称: ribosomal protein eL22 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 60 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 11.481248 KDa
配列文字列:
VLKFTLDCTH PVEDGIMDAA NFEQFLQERI KVNGKAGNLG GGVVTIERSK SKITVTSEVP FSKRYLKYLT KKYLKKNNLR DWLRVVANS KESYELRYFQ

+
分子 #61: ribosomal protein uL14

分子名称: ribosomal protein uL14 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 61 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 13.828295 KDa
配列文字列:
AKFRISLGLP VGAVINCADN TGAKNLYIIS VKGIKGRLNR LPAAGVGDMV MATVKKGKPE LRKKVHPAVV IRQRKSYRRK DGVFLYFED NAGVIVNNKG EMKGSAITGP VAKECADLWP RIASNAGSIA

+
分子 #62: ribosomal protein eL24

分子名称: ribosomal protein eL24 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 62 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 14.087417 KDa
配列文字列:
KVELCSFSGY KIYPGHGRRY ARTDGKVFQF LNAKCESAFL SKRNPRQINW TVLYRRKHKK GQSEEIQKKR TRRAVKFQRA ITGASLADI MAKRNQKPEV RKAQREQAIR AAKEAKKAKQ AS

+
分子 #63: ribosomal protein uL23

分子名称: ribosomal protein uL23 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 63 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 13.614023 KDa
配列文字列:
KIRTSPTFRR PKTLRLRRQP KYPRKSAPRR NKLDHYAIIK FPLTTESAMK KIEDNNTLVF IVDVKANKHQ IKQAVKKLYD IDVAKVNTL IRPDGEKKAY VRLAPDYDAL DVANKIGI

+
分子 #64: ribosomal protein uL24

分子名称: ribosomal protein uL24 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 64 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 15.161899 KDa
配列文字列:
MKFNPFVTSD RSKNRKRHFN APSHIRRKIM SSPLSKELRQ KYNVRSMPIR KDDEVQVVRG HYKGQQIGKV VQVYRKKYVI YIERVQREK ANGTTVHVGI HPSKVVITRL KLDKDRKKIL ERKAKSRQ

+
分子 #65: ribosomal protein eL27

分子名称: ribosomal protein eL27 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 65 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 15.647584 KDa
配列文字列:
KFMKPGKVVL VLAGRYSGRK AVIVKNIDDG TSDRPYSHAL VAGIDRYPRK VTAAMGKKKI AKRSKIKSFV KVYNYNHLMP TRYSVDIPL DKTVVNKDVF RDPALKRKAR REAKVKFEER YKTGKNKWFF QKLRF

+
分子 #66: ribosomal protein uL15

分子名称: ribosomal protein uL15 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 66 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 16.47334 KDa
配列文字列:
PSRLRKTRKL RGHVSHGHGR IGKHRKHPGG RGNAGGLHHH RINFDKYHPG YFGKVGMKHY HLKRNQSFCP TVNLDKLWTL VSEQTRVNA AKNKTGAAPI IDVVRSGYYK VLGKGKLPKQ PVIVKAKFFS RRAEEKIKSV GGACVLVA

+
分子 #67: ribosomal protein eL29

分子名称: ribosomal protein eL29 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 67 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 7.996388 KDa
配列文字列:
AKSKNHTTHN QSRKWHRNGI KKPRSQRYES LKGVDPKFLR NMRFAKKHNK KGLKKMQANN AKAMSARA

+
分子 #68: ribosomal protein eL30

分子名称: ribosomal protein eL30 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 68 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 11.500556 KDa
配列文字列:
TKKSLESINS RLQLVMKSGK YVLGYKQTLK MIRQGKAKLV ILANNCPALR KSEIEYYAML AKTGVHHYSG NNIELGTACG KYYRVCTLA IIDPGDSDII RSMP

+
分子 #69: ribosomal protein eL31

分子名称: ribosomal protein eL31 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 69 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 12.506581 KDa
配列文字列:
NEVVTREYTI NIHKRIHGVG FKKRAPRALK EIRKFAMKEM GTPDVRIDTR LNKAVWAKGI RNVPYRIRVR LSRKRNEDED SPNKLYTLV TYVPVTTFKN LQTVNVD

+
分子 #70: ribosomal protein eL32

分子名称: ribosomal protein eL32 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 70 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 15.179215 KDa
配列文字列:
AALRPLVKPK IVKKRTKKFI RHQSDRYVKI KRNWRKPRGI DNRVRRRFKG QILMPNIGYG SNKKTKHMLP SGFRKFLVHN VKELEVLLM CNKSYCAEIA HNVSSKNRKA IVERAAQLAI RVTNPNARLR

+
分子 #71: ribosomal protein eL33

分子名称: ribosomal protein eL33 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 71 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 12.433548 KDa
配列文字列:
SGRLWSKAIF AGYKRGLRNQ REHTALLKIE GVYARDETEF YLGKRCAYVY KAKNNTVTPG GKPNKTRVIW GKVTRAHGNS GMVRAKFRS NLPAKAIGHR IRVMLYPSRI

+
分子 #72: ribosomal protein eL34

分子名称: ribosomal protein eL34 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 72 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 12.994621 KDa
配列文字列:
VQRLTYRRRL SYNTASNKTR LSRTPGNRIV YLYTKKVGKA PKSACGVCPG RLRGVRAVRP KVLMRLSKTK KHVSRAYGGS MCAKCVRDR IKRAFLIEEQ KIVVKVLKAQ AQSQK

+
分子 #73: ribosomal protein uL29

分子名称: ribosomal protein uL29 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 73 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 14.462429 KDa
配列文字列:
AKIKARDLRG KKKEELLKQL DDLKVELSQL RVAKVTGGAA SKLSKIRVVR KSIARVLTVI NQTQKENLRK FYKGKKYKPL DLRPKKTRA MRRRLNKHEE NLKTKKQQRK ERLYPLRKYA VKA

+
分子 #74: ribosomal protein eL36

分子名称: ribosomal protein eL36 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 74 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 11.373708 KDa
配列文字列:
YPMAVGLNKG HKVTKNVSKP RHSRRRGRLT KHTKFVRDMI REVCGFAPYE RRAMELLKVS KDKRALKFIK KRVGTHIRAK RKREELSNV LAAMRKAA

+
分子 #75: ribosomal protein eL37

分子名称: ribosomal protein eL37 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 75 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 9.864596 KDa
配列文字列:
TKGTSSFGKR RNKTHTLCRR CGSKAYHLQK STCGKCGYPA KRKRKYNWSA KAKRRNTTGT GRMRHLKIVY RRFRHGFREG TTPK

+
分子 #76: ribosomal protein eL38

分子名称: ribosomal protein eL38 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 76 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 8.107752 KDa
配列文字列:
PRKIEEIKDF LLTARRKDAK SVKIKKNKDN VKFKVRCSRY LYTLVITDKE KAEKLKQSLP PGLAVKELK

+
分子 #77: ribosomal protein eL39

分子名称: ribosomal protein eL39 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 77 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 6.295562 KDa
配列文字列:
SSHKTFRIKR FLAKKQKQNR PIPQWIRMKT GNKIRYNSKR RHWRRTKLGL

+
分子 #78: ribosomal protein eL40

分子名称: ribosomal protein eL40 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 78 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 5.957237 KDa
配列文字列:
IEPSLRQLAQ KYNCDKMICR KCYARLHPRA VNCRKKKCGH TNNLRPKKKV

+
分子 #79: ribosomal protein eL41

分子名称: ribosomal protein eL41 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 79 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 3.473451 KDa
配列文字列:
MRAKWRKKRM RRLKRKRRKM RQRSK

+
分子 #80: ribosomal protein eL42

分子名称: ribosomal protein eL42 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 80 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 12.345776 KDa
配列文字列:
VNVPKTRRTF CKKCGKHQPH KVTQYKKGKD SLYAQGKRRY DRKQSGYGGQ TKPIFRKKAK TTKKIVLRLE CVEPNCRSKR MLAIKRCKH FELGGDKKRK GQVIQF

+
分子 #81: ribosomal protein eL43

分子名称: ribosomal protein eL43 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 81 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 10.168153 KDa
配列文字列:
AKRTKKVGIV GKYGTRYGAS LRKMVKKIEI SQHAKYTCSF CGKTKMKRRA VGIWHCGSCM KTVAGGAWTY NTTSAVTVKS AIRRLKELK DQ

+
分子 #82: ribosomal protein eL28

分子名称: ribosomal protein eL28 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 82 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 13.991366 KDa
配列文字列:
SAHLQWMVVR NCSSFLIKRN KQTYSTEPNN LKARNSFRYN GLIHRKTVGV EPAADGKGVV VVIKRRSGQR KPATSYVRTT INKNARATL SSIRHMIRKN KYRPDLRMAA IRRASAILRS QKP

+
分子 #83: ribosomal protein uL1

分子名称: ribosomal protein uL1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 83 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 24.879422 KDa
配列文字列: MSSKVSRDTL YEAVREVLHG NQRKRRKFLE TVELQISLKN YDPQKDKRFS GTVRLKSTPR PKFSVCVLGD QQHCDEAKAV DIPHMDIEA LKKLNKNKKL VKKLAKKYDA FLASESLIKQ IPRILGPGLN KAGKFPSLLT HNENMVAKVD EVKSTIKFQM K KVLCLAVA ...文字列:
MSSKVSRDTL YEAVREVLHG NQRKRRKFLE TVELQISLKN YDPQKDKRFS GTVRLKSTPR PKFSVCVLGD QQHCDEAKAV DIPHMDIEA LKKLNKNKKL VKKLAKKYDA FLASESLIKQ IPRILGPGLN KAGKFPSLLT HNENMVAKVD EVKSTIKFQM K KVLCLAVA VGHVKMTDDE LVYNIHLAVN FLVSLLKKNW QNVRALYIKS TMGKPQRLY

+
分子 #84: ribosomal protein uL11

分子名称: ribosomal protein uL11 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 84 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 16.290794 KDa
配列文字列:
VYLRCTGGEV GATSALAPKI GPLGLSPKKV GDDIAKATGD WKGLRITVKL TIQNRQAQIE VVPSASALII KALKEPPRDR KKQKNIKHS GNITFDEIVN IARQMRHRSL ARELSGTIKE ILGTAQSVGC NVDGRHPHDI IDDINSGAVE CP

+
分子 #85: ribosomal protein uL10

分子名称: ribosomal protein uL10 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 85 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 22.21784 KDa
配列文字列: DRATWKSNYF LKIIQLLDDY PKCFIVGADN VGSKQMQQIR MSLRGKAVVL MGKNTMMRKA IRGHLENNPA LEKLLPHIRG NVGFVFTKE DLTEIRDMLR ANKVPAAARA GAIAPCEVTV PAQNTGLGPE KTSFFQALGI TTKISRGTIE ILSDVQLIKT G DKVGASEA ...文字列:
DRATWKSNYF LKIIQLLDDY PKCFIVGADN VGSKQMQQIR MSLRGKAVVL MGKNTMMRKA IRGHLENNPA LEKLLPHIRG NVGFVFTKE DLTEIRDMLR ANKVPAAARA GAIAPCEVTV PAQNTGLGPE KTSFFQALGI TTKISRGTIE ILSDVQLIKT G DKVGASEA TLLNMLNISP FSFGLVIQQV FDNGSIYNPE VLDI

+
分子 #86: eukaryotic elongation factor 2 (eEF2)

分子名称: eukaryotic elongation factor 2 (eEF2) / タイプ: protein_or_peptide / ID: 86 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 95.056734 KDa
配列文字列: TVDQIRAIMD KKANIRNMSV IAHVDHGKST LTDSLVCKAG IIASARAGET RFTDTRKDEQ ERCITIKSTA ISLFYELSEN DLNFIKQSK DGAGFLINLI DSPGHVDFSS EVTAALRVTD GALVVVDCVS GVCVQTETVL RQAIAERIKP VLMMNKMDRA L LELQLEPE ...文字列:
TVDQIRAIMD KKANIRNMSV IAHVDHGKST LTDSLVCKAG IIASARAGET RFTDTRKDEQ ERCITIKSTA ISLFYELSEN DLNFIKQSK DGAGFLINLI DSPGHVDFSS EVTAALRVTD GALVVVDCVS GVCVQTETVL RQAIAERIKP VLMMNKMDRA L LELQLEPE ELYQTFQRIV ENVNVIISTY GEGESGPMGN IMIDPVLGTV GFGSGLHGWA FTLKQFAEMY VAKFAAKGEG QL GPAERAK KVEDMMKKLW GDRYFDPANG KFSKSATSPE GKKLPRTFCQ LILDPIFKVF DAIMNFKKEE TAKLIEKLDI KLD SEDKDK EGKPLLKAVM RRWLPAGDAL LQMITIHLPS PVTAQKYRCE LLYEGPPDDE AAMGIKSCDP KGPLMMYISK MVPT SDKGR FYAFGRVFSG LVSTGLKVRI MGPNYTPGKK EDLYLKPIQR TILMMGRYVE PIEDVPCGNI VGLVGVDQFL VKTGT ITTF EHAHNMRVMK FSVSPVVRVA VEAKNPADLP KLVEGLKRLA KSDPMVQCII EESGEHIIAG AGELHLEICL KDLEED HAC IPIKKSDPVV SYRETVSEES NVLCLSKSPN KHNRLYMKAR PFPDGLAEDI DKGEVSARQE LKQRARYLAE KYEWDVA EA RKIWCFGPDG TGPNILTDIT KGVQYLNEIK DSVVAGFQWA TKEGALCEEN MRGVRFDVHD VTLHADAI(DDE)R GGGQ IIPTA RRCLYASVLT AQPRLMEPIY LVEIQCPEQV VGGIYGVLNR KRGHVFEESQ VAGTPMFVVK AYLPVNESFG FTADL RSNT GGQAFPQCVF DHWQILPGDP FDNSSRPSQV VAETRKRKGL KEIPALDNFL DKL

+
分子 #7: 28S ribosomal RNA

分子名称: 28S ribosomal RNA / タイプ: rna / ID: 7 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 1.170164875 MDa
配列文字列: CGCGACCUCA GAUCAGACGU GGCGACCCGC UGAAUUUAAG CAUAUUAGUC AGCGGAGGAA AAGAAACUAA CCAGGAUUCC CUCAGUAAC GGCGAGUGAA CAGGGAAGAG CCCAGCGCCG AAUCCCCGCC CCGCGGGGCG CGGGACAUGU GGCGUACGGA A GACCCGCU ...文字列:
CGCGACCUCA GAUCAGACGU GGCGACCCGC UGAAUUUAAG CAUAUUAGUC AGCGGAGGAA AAGAAACUAA CCAGGAUUCC CUCAGUAAC GGCGAGUGAA CAGGGAAGAG CCCAGCGCCG AAUCCCCGCC CCGCGGGGCG CGGGACAUGU GGCGUACGGA A GACCCGCU CCCCGGCGCC GCUCGUGGGG GGCCCAAGUC CUUCUGAUCG AGGCCCAGCC CGUGGACGGU GUGAGGCCGG UA GCGGCCC CCGGCGCGCG CCCGGGUCUU CCCGGAGUCG GGUUGCUUGG GAAUGCAGCC CAAAGCGGGU GGUAAACUCC AUC UAAGGC UAAAUACCGG CACGAGACCG AUAGUCAACA AGUACCGUAA GGGAAAGUUG AAAAGAACUU UGAAGAGAGA GUUC AAGAG GGCGUGAAAC CGUUAAGAGG UAAACGGGUG GGGUCCGCGC AGUCCGCCCG GAGGAUUCAA CCCGGCGGCG GGUCC GGCC GUGUCGGCGG CCCGGCGGAU CUUUCCCGCC CCCGGGGUCG GCGGGGGACC GUCCCCCGGA CCGGCGACCG GCCGCC GCC GGGCGCAUUU CCAGGCGGUG CGCCGCGACC GGCUCCGGGA CGGCUGGGAA GGCCCGGCGG GGAAGGUGGC UCGGGGC CC CCGAGUGUUA CAGCCCCCCC GGCAGCAGCA CUCGCCGAAU CCCGGGGCCG AGGGAGCGAG ACCCGUCGCC GCGCUCUC C CCCCUGGGGG GGCCGGGCCA CCCCUCCCAC GGCGCGACCG CUCUCCCAGG GGGCGGGGCG GACUGUCCCC AGUGCGCCC CGGGCGGGUC GCGCCGUCGG GCCCGGGGGG CCACGCGCGC GUCCCGGGAC GGCGGAGCGA GCGCACGGGG UCGGCGGCGA CGUCGGCUA CCCACCCGAC CCGUCUUGAA ACACGGACCA AGGAGUCUAA CACGUGCGCG AGUCGGGGGC UCGCACGAAA G CCGCCGUG GCGCAAUGAA GGUGAAGGCC GGCGCGCUCG CCGGCCGAGG UGGGAUCCCG AGGCCUCUCC AGUCCGCCGA GG GGCACCA CCGGCCCGUC UCGCCCGCCG CGCCGGGGAG GUGGAGCACG AGCGCACGUG UUAGGACCCG AAAGAUGGUG AAC UAUGCC UGGGCAGGGC GAAGCCAGAG GAAACUCUGG UGGAGGUCCG UAGCGGUCCU GACGUGCAAA UCGGUCGUCC GACC UGGGU AUAGGGGCGA AAGACUAAUC GAACCAUCUA GUAGCUGGUU CCCUCCGAAG UUUCCCUCAG GAUAGCUGGC GCUCU CGCC CACGCAGUUU UAUCCGGUAA AGCGAAUGAU UAGAGGUCUU GGGGCCGAAA CGAUCUCAAC CUAUUCUCAA ACUUUA AAU GGGUAAGAAG CCCGGCUCGC UGGCGUGGAG CCGGGGUGGA AUGCGAGUGC CUAGUGGGCC ACUUUUGGUA AGCAGAA CU GGCGCUGCGG GAUGAACCGA ACGCCGGGUU AAGGCGCCCG AUGCCGACGC UCAUCAGACC CCAGAAAAGG UGUUGGUU G AUAUAGACAG CAGGACGGUG GCCAUGGAAG UCGGAAUCCG CUAAGGAGUG UGUAACAACU CACCUGCCGA AUCAACUAG CCCUGAAAAU GGAUGGCGCU GGAGCGUCGG GCCCAUACCC GGCCGUCGCC GGCCUACGCC GCGACGAGUA GGAGGGCCGC UGCGGUGAG CCUUGAAGCC UAGGGCGCGG GCCCGGGUGG AGCCGCCGCA GGUGCAGAUC UUGGUGGUAG UAGCAAAUAU U CAAACGAG AACUUUGAAG GCCGAAGUGG AGAAGGGUUC CAUGUGAACA GCAGUUGAAC AUGGGUCAGU CGGUCCUGAG AG AUGGGCG AGCGCCGUUC CGAAGGGACG GGCGAUGGCC UCCGUUGCCC UCGGCCGAUC GAAAGGGAGU CGGGUUCAGA UCC CCGAAU CCGGAGUGGC GGAGAUGGGC GCCGCGAGGC GUCCAGUGCG GUAACGCGAC CGAUCCCGGA GAAGCCGGCG GGAG CCCCG GGGAGAGUUC UCUUUUCUUU GUGAAGGGCA GGGCGCCCUG GAAUGGGUUC GCCCCGAGAG AGGGGCCCGU GCCUU GGAA AGCGUCGCGG UUCCGGCGGC GUCCGGUGAG CUCUCGCUGG CCCUUGAAAA UCCGGGGGAG AGGGUGUAAA UCUCGC GCC GGGCCGUACC CAUAUCCGCA GCAGGUCUCC AAGGUGAACA GCCUCUGGCA UGUUGGAACA AUGUAGGUAA GGGAAGU CG GCAAGCCGGA UCCGUAACUU CGGGAUAAGG AUUGGCUCUA AGGGCUGGCA GCCGACUUAG AACUGGUGCG GACCAGGG G AAUCCGACUG UUUAAUUAAA ACAAAGCAUC GCGAAGGCCC GCGGCGGGUG UUGACGCGAU GUGAUUUCUG CCCAGUGCU CUGAAUGUCA AAGUGAAGAA AUUCAAUGAA GCGCGGGUAA ACGGCGGGAG UAACUAUGAC UCUCUUAAGG UAGCCAAAUG CCUCGUCAU CUAAUUAGUG ACGCGCAUGA AUGGAUGAAC GAGAUUCCCA CUGUCCCUAC CUACUAUCCA GCGAAACCAC A GCCAAGGG AACGGGCUUG GCGGAAUCAG CGGGGAAAGA AGACCCUGUU GAGCUUGACU CUAGUCUGGC ACGGUGAAGA GA CAUGAGA GGUGUAGAAU AAGUGGGAGG CCCGGGCCGC CGGUGAAAUA CCACUACUCU GAUCGUUUUU UCACUGACCC GGU GAGGCG GGGGGGCGAG CCCGAGGGGC UCUCGCUUCU GGCGCCAAGC GCCCGCCCGG CCGGGCGCGA CCCGCUCCGG GGAC AGUGC CAGGUGGGGA GUUUGACUGG GGCGGUACAC CUGUCAAACG GUAACGCAGG UGUCCUAAGG CGAGCUCAGG GAGGA CAGA AACCUCCCGU GGAGCAGAAG GGCAAAAGCU CGCUUGAUCU UGAUUUUCAG UACGAAUACA GACCGUGAAA GCGGGG CCU CACGAUCCUU CUGACCUUUU GGGUUUUAAG CAGGAGGUGU CAGAAAAGUU ACCACAGGGA UAACUGGCUU GUGGCGG CC AAGCGUUCAU AGCGACGUCG CUUUUUGAUC CUUCGAUGUC GGCUCUUCCU AUCAUUGUGA AGCAGAAUUC GCCAAGCG U UGGAUUGUUC ACCCACUAAU AGGGAACGUG AGCUGGGUUU AGACCGUCGU GAGACAGGUU AGUUUUACCC UACUGAUGA UGUGUUGUUG CCAUGGUAAU CCUGCUCAGU ACGAGAGGAA CCGCAGGUUC AGACAUUUGG UGUAUGUGCU UGGCUGAGGA GCCAAUGGG GCGAAGCUAC CAUCUGUGGG AUUAUGACUG AACGCCUCUA AGUCAGAAUC CCGCCCAGGC GGAACGAUAC G GCAGCGCC GCGGAGCCUC GGUUGGCCUC GGAUAGCCGG UCCGGGGUCC GGUGCGGAGU GCCCUUCGUC CUGGGAAACG GG GCGCGGC CGGAAAGGCG GCCGCCCCCU CGCCCGUCAC GCACCGCACG UUCGUGGGGA ACCUGGCGCU AAACCAUUCG UAG ACGACC UGCUUCUGGG UCGGGGUUUC GUACGUAGCA GAGCAGCUCC CUCGCUGCGA UCUAUUGAAA GUCAGCCCUC GACA CAAGG GUUUGUC

+
分子 #8: ap/P-site tRNA

分子名称: ap/P-site tRNA / タイプ: rna / ID: 8 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 24.437535 KDa
配列文字列:
GUUUCCGUAG UGUAGUGGUU AUCACGUUCG CCUAACACGC GAAAGGUCCC CGGUUCGAAA CCGGGCGGAA ACACCA

+
分子 #9: mRNA

分子名称: mRNA / タイプ: rna / ID: 9 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 3.492122 KDa
配列文字列:
UUCGUUAAAG A

+
分子 #10: pe/E-site-tRNA

分子名称: pe/E-site-tRNA / タイプ: rna / ID: 10 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 24.533586 KDa
配列文字列:
GCGGACUUAG CUCAGUUGGG AGAGCGCCAG ACUGAAGAUC UGGAGGUCCU GUGUUCGAUC CACAGAGUUC GCACCA

+
分子 #11: 18S ribosomal RNA

分子名称: 18S ribosomal RNA / タイプ: rna / ID: 11 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 551.108188 KDa
配列文字列: UACCUGGUUG AUCCUGCCAG UAGCAUAUGC UUGUCUCAAA GAUUAAGCCA UGCAUGUCUA AGUACGCACG GCCGGUACAG UGAAACUGC GAAUGGCUCA UUAAAUCAGU UAUGGUUCCU UUGGUCGACU UGGAUAACUG UGGUAAUUCU AGAGCUAAUA C AUGCCGAC ...文字列:
UACCUGGUUG AUCCUGCCAG UAGCAUAUGC UUGUCUCAAA GAUUAAGCCA UGCAUGUCUA AGUACGCACG GCCGGUACAG UGAAACUGC GAAUGGCUCA UUAAAUCAGU UAUGGUUCCU UUGGUCGACU UGGAUAACUG UGGUAAUUCU AGAGCUAAUA C AUGCCGAC GGGCGCUGAC CCCCUUCGCG GGGGGGAUGC GUGCAUUUAU CAGAUCAAAA CCAACCCGGG CUUUGGUGAC UC UAGAUAA CCUCGGGCCG AUCGCACGCC CCCCGUGGCG GCGACGACCC AUUCGAACGU CUGCCCUAUC AACUUUCGAU GGU AGUCGC CGUGCCUACC AUGGUGACCA CGGGUGACGG GGAAUCAGGG UUCGAUUCCG GAGAGGGAGC CUGAGAAACG GCUA CCACA UCCAAGGAAG GCAGCAGGCG CGCAAAUUAC CCACUCCCGA CCCGGGGAGG UAGUGACGAA AAAUAACAAU ACAGG ACUC UUUCGAGGCC CUGUAAUUGG AAUGAGUCCA CUUUAAAUCC UUUAACGAGG AUCCAUUGGA GGGCAAGUCU GGUGCC AGC AGCCGCGGUA AUUCCAGCUC CAAUAGCGUA UAUUAAAGUU GCUGCAGUUA AAAAGCUCGU AGUUGGAUCU UGGGAGC GG CCCCUUGCCU CUCGCCCGAA GCGUUUACUU UGAAAAAAUU AGAGUGUUCA AAGCAGGCCC GAGCCGCCUG GAUACCGC A GCUAGGAAUA AUGGAAUAGG ACCGCGGUUC UAUUUUGUUG GUUUUCGGAA CUGAGGCCAU GAUUAAGAGG GACGGCCGG GGGCAUUCGU AUUGCGCCGC UAGAGGUGAA AUUCUUGGAC CGGCGCAAGA CGGACCAGAG CGAAAGCAUU UGCCAAGAAU GUUUUCAUU AAUCAAGAAC GAAAGUCGGA GGUUCGAAGA CGAUCAGAUA CCGUCGUAGU UCCGACCAUA AACGAUGCCG A CCGGCGAU GCGGCGGCGU UAUUCCCAUG ACCCGCCGGG CAGCUUCCGG GAAACCAAAG UCUUUGGGUU CCGGGGGGAG UA UGGUUGC AAAGCUGAAA CUUAAAGGAA UUGACGGAAG GGCACCACCA GGAGUGGAGC CUGCGGCUUA AUUUGACUCA ACA CGGGAA ACCUCACCCG GCCCGGACAC GGACAGGAUU GACAGAUUGA UAGCUCUUUC UCGAUUCCGU GGGUGGUGGU GCAU GGCCG UUCUUAGUUG GUGGAGCGAU UUGUCUGGUU AAUUCCGAUA ACGAACGAGA CUCUGGCAUG CUAACUAGUU ACGCG ACCC CCGAGCGGUA ACUUCUUAGA GGGACAAGUG GCGUUCAGCC ACCCGAGAUU GAGCAAUAAC AGGUCUGUGA UGCCCU UAG AUGUCCGGGG CUGCACGCGC GCUACACUGA CUGGCUCAGC GUGUGCCUAC CCUACGCCGG CAGGCGCGGG UAACCCG UU GAACCCCAUU CGUGAUGGGG AUCGGGGAUU GCAAUUAUUC CCCAUGAACG AGGAAUUCCC AGUAAGUGCG GGUCAUAA G CUUGCGUUGA UUAAGUCCCU GCCCUUUGUA CACACCGCCC GUCGCUACUA CCGAUUGGAU GGUUUAGUGA GGCCCUCGG AUCGGCCCCG CCGUGGCGGA GCGCUGAGAA GACGGUCGAA CUUGACUAUC UAGAGGAAGU AAAAGUCGUA ACAAGGUUUC CGUAGGUGA ACCUGCGGAA GGAUCAUUA

+
分子 #42: 5.8S ribosomal RNA

分子名称: 5.8S ribosomal RNA / タイプ: rna / ID: 42 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 50.449812 KDa
配列文字列:
CGACUCUUAG CGGUGGAUCA CUCGGCUCGU GCGUCGAUGA AGAACGCAGC UAGCUGCGAG AAUUAAUGUG AAUUGCAGGA CACAUUGAU CAUCGACACU UCGAACGCAC UUGCGGCCCC GGGUUCCUCC CGGGGCUACG CCUGUCUGAG CGUCGCUU

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分子 #43: 5S ribosomal RNA

分子名称: 5S ribosomal RNA / タイプ: rna / ID: 43 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 38.38575 KDa
配列文字列:
GUCUACGGCC AUACCACCCU GAACGCGCCC GAUCUCGUCU GAUCUCGGAA GCUAAGCAGG GUCGGGCCUG GUUAGUACUU GGAUGGGAG ACCGCCUGGG AAUACCGGGU GCUGUAGGCU

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分子 #87: MAGNESIUM ION

分子名称: MAGNESIUM ION / タイプ: ligand / ID: 87 / コピー数: 327 / 式: MG
分子量理論値: 24.305 Da

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分子 #88: ZINC ION

分子名称: ZINC ION / タイプ: ligand / ID: 88 / コピー数: 5 / 式: ZN
分子量理論値: 65.409 Da

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分子 #89: PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER

分子名称: PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER / タイプ: ligand / ID: 89 / コピー数: 1 / 式: GNP
分子量理論値: 522.196 Da
Chemical component information

ChemComp-GNP:
PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER / Gpp(NH)p / GppNHp, GMPPNP, エネルギー貯蔵分子類似体*YM

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実験情報

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構造解析

手法クライオ電子顕微鏡法
解析単粒子再構成法
試料の集合状態particle

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試料調製

緩衝液pH: 7.4
凍結凍結剤: ETHANE

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電子顕微鏡法

顕微鏡FEI POLARA 300
撮影フィルム・検出器のモデル: GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k)
平均電子線量: 30.0 e/Å2
電子線加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD
実験機器
モデル: Tecnai Polara / 画像提供: FEI Company

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画像解析

最終 再構成解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 3.6 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 使用した粒子像数: 37941
初期 角度割当タイプ: PROJECTION MATCHING
最終 角度割当タイプ: PROJECTION MATCHING

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原子モデル構築 1

精密化空間: REAL / プロトコル: RIGID BODY FIT
得られたモデル

PDB-6gz4:
tRNA translocation by the eukaryotic 80S ribosome and the impact of GTP hydrolysis, Translocation-intermediate-POST-2 (TI-POST-2)

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万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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