ChemComp-RG1: Rhodopin b-D-glucoside

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: RG1
• 名称: 名称: Rhodopin b-D-glucoside; 別称: (3E)-3,4-didehydro-1',2'-dihydro-psi,psi-caroten-1'-yl beta-D-glucopyranoside

Chemical information

組成

組成式: C₄₆H₆₆O₆ / 原子数: 118 / 化学式量: 715.013 / 形式電荷: 0

その他

2fkw

タイプ: D-saccharide / PDB分類: ATOMS / 3文字コード: RG1 / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 2FKW

履歴

作成	1999年7月8日
記述子を修正	2011年6月4日
Other modification	2016年3月18日
Modify synonyms	2020年6月5日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / PubChem / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 12.01: C1(OC(C(C(C1O)O)O)CO)OC(C)(C)CCCC(C)=[C@H][C@H]=[C@H]C(C)=[C@H][C@H]=[C@H]C(C)=[C@H][C@H]=[C@H][C@H]=C(C)[C@H]=[C@H][C@H]=C(C)[C@H]=[C@H][C@H]=C(C)[C@H]=[C@H][C@H]=C(C)C
• CACTVS 3.385: CC(C)=CC=CC(C)=CC=CC(C)=CC=CC(C)=CC=CC=C(C)C=CC=C(C)C=CC=C(C)CCCC(C)(C)O[CH]1O[CH](CO)[CH](O)[CH](O)[CH]1O
• OpenEye OEToolkits 2.0.4: CC(=CC=CC(=CC=CC(=CC=CC(=CC=CC=C(C)C=CC=C(C)C=CC=C(C)CCCC(C)(C)OC1C(C(C(C(O1)CO)O)O)O)C)C)C)C

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.385: CC(C)=C\C=C\C(C)=C\C=C\C(C)=C\C=C\C(C)=C\C=C\C=C(C)\C=C\C=C(C)\C=C\C=C(C)\CCCC(C)(C)O[C@@H]1O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H]1O
• OpenEye OEToolkits 2.0.4: CC(=C/C=C/C(=C/C=C/C(=C/C=C/C(=C/C=C/C=C(\C)/C=C/C=C(\C)/C=C/C=C(\C)/CCCC(C)(C)O[C@H]1[C@@H]([C@H]([C@@H]([C@H](O1)CO)O)O)O)/C)/C)/C)C

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C46H66O6/c1-34(2)19-13-22-37(5)25-16-28-38(6)26-14-23-35(3)20-11-12-21-36(4)24-15-27-39(7)29-17-30-40(8)31-18-32-46(9,10)52-45-44(50)43(49)42(48)41(33-47)51-45/h11-17,19-30,41-45,47-50H,18,31-33H2,1-10H3/b12-11+,22-13+,23-14+,24-15+,28-16+,29-17+,35-20+,36-21+,37-25+,38-26+,39-27+,40-30+/t41-,42-,43+,44-,45+/m1/s1

InChIKey

• InChI 1.03: ISHBHDBCVQRMDY-GZIKAPSJSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 12.01: (3E)-3,4-didehydro-1',2'-dihydro-psi,psi-caroten-1'-yl beta-D-glucopyranoside
• OpenEye OEToolkits 2.0.4: (2~{R},3~{S},4~{S},5~{R},6~{S})-2-(hydroxymethyl)-6-[(6~{E},8~{E},10~{E},12~{E},14~{E},16~{E},18~{E},20~{E},22~{E},24~{E},26~{E},28~{E})-2,6,10,14,19,23,27,31-octamethyldotriaconta-6,8,10,12,14,16,18,20,22,24,26,28,30-tridecaen-2-yl]oxy-oxane-3,4,5-triol

PDBエントリ

全3件を表示しています

PDB-1kzu:
INTEGRAL MEMBRANE PERIPHERAL LIGHT HARVESTING COMPLEX FROM RHODOPSEUDOMONAS ACIDOPHILA STRAIN 10050

PDB-1nkz:
Crystal structure of LH2 B800-850 from Rps. acidophila at 2.0 Angstrom resolution

PDB-2fkw:
Structure of LH2 from Rps. acidophila crystallized in lipidic mesophases