ChemComp-NGS: 2-acetamido-2-deoxy-6-O-sulfo-beta-D-glucopyranose

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: NGS
• 名称: 名称: 2-acetamido-2-deoxy-6-O-sulfo-beta-D-glucopyranose; 別称: 2-(acetylamino)-2-deoxy-6-O-sulfo-beta-D-glucopyranose; N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE-6-SULFATE;; 日化辞名称: 6-O-スルホ-2-(アセチルアミノ)-2-デオキシ-β-D-グルコピラノ-ス

Chemical information

組成

組成式: C₈H₁₅NO₉S / 原子数: 34 / 化学式量: 301.271 / 形式電荷: 0

その他

1kes

NAG

タイプ: D-saccharide, beta linking / PDB分類: ATOMS / 3文字コード: NGS / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 1KES / 親要素: NAG

履歴

作成	1999年7月8日
記述子を修正	2011年6月4日
Other modification	2020年7月3日
Modify parent residue	2020年7月17日
Modify name	2020年7月17日
Modify synonyms	2020年7月17日
Modify linking type	2020年7月17日
Modify atom id	2020年7月17日
Modify component atom id	2020年7月17日
Modify leaving atom flag	2020年7月17日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / Brenda / ChEBI / HMDB / KEGG_Ligand / 日化辞 / PubChem / PubChem_TPharma / ZINC / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 10.04: O=S(=O)(O)OCC1OC(O)C(NC(=O)C)C(O)C1O
• CACTVS 3.341: CC(=O)N[CH]1[CH](O)O[CH](CO[S](O)(=O)=O)[CH](O)[CH]1O
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: CC(=O)NC1C(C(C(OC1O)COS(=O)(=O)O)O)O

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.341: CC(=O)N[C@H]1[C@H](O)O[C@H](CO[S](O)(=O)=O)[C@@H](O)[C@@H]1O
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: CC(=O)N[C@@H]1[C@H]([C@@H]([C@H](O[C@H]1O)COS(=O)(=O)O)O)O

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C8H15NO9S/c1-3(10)9-5-7(12)6(11)4(18-8(5)13)2-17-19(14,15)16/h4-8,11-13H,2H2,1H3,(H,9,10)(H,14,15,16)/t4-,5-,6-,7-,8-/m1/s1

InChIKey

• InChI 1.03: WJFVEEAIYIOATH-FMDGEEDCSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 10.04: 2-(acetylamino)-2-deoxy-6-O-sulfo-beta-D-glucopyranose
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: [(2R,3S,4R,5R,6R)-5-acetamido-3,4,6-trihydroxy-oxan-2-yl]methyl hydrogen sulfate

CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL

• GMML 1.0: DGlcpNAc[6S]b

一般名

• GMML 1.0: N-acetyl-6-sulfo-b-D-glucopyranose

IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL

• PDB-CARE 1.0: b-D-GlcpNAc6SO3

PDBエントリ

全6件を表示しています

PDB-4krv:
Crystal structure of catalytic domain of bovine beta1,4-galactosyltransferase mutant M344H-GalT1 complex with 6-sulfo-GlcNAc

PDB-7dva:
Structure of wild type Bt4394, a GH20 family sulfoglycosidase, in complex with 6S-GlcNAc

PDB-7dvb:
D335N variant of Bt4394 in complex with 6SO3-NAG-oxazoline intermediate

PDB-7oz8:
Sulfated host glycan recognition by carbohydrate sulfatases of the human gut microbiota (BT1918_S1_46)

PDB-7p24:
Sulfated host glycan recognition by carbohydrate sulfatases of the human gut microbiota (BT3177_S1_11)

PDB-7wdt:
6-sulfo-beta-D-N-acetylglucosaminidase from Bifidobacterium bifidum in complex with GlcNAc-6S