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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1aba | ||||||
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タイトル | THE STRUCTURE OF OXIDIZED BACTERIOPHAGE T4 GLUTAREDOXIN (THIOREDOXIN). REFINEMENT OF NATIVE AND MUTANT PROTEINS | ||||||
![]() | GLUTAREDOXIN | ||||||
![]() | ELECTRON TRANSPORT | ||||||
機能・相同性 | ![]() | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Eklund, H. / Ingelman, M. / Soderberg, B.-O. / Uhlin, T. / Nordlund, P. / Nikkola, M. / Sonnerstam, U. / Joelson, T. / Petratos, K. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Structure of oxidized bacteriophage T4 glutaredoxin (thioredoxin). Refinement of native and mutant proteins. 著者: Eklund, H. / Ingelman, M. / Soderberg, B.O. / Uhlin, T. / Nordlund, P. / Nikkola, M. / Sonnerstam, U. / Joelson, T. / Petratos, K. #1: ![]() タイトル: Three-Dimensional Structure of Thioredoxin Induced by Bacteriophage T4 著者: Soderberg, B.-O. / Sjoberg, B.-M. / Sonnerstam, U. / Branden, C.-I. #2: ![]() タイトル: Thioredoxin Induced by Bacteriophage T4. Crystallization and Preliminary Crystallographic Data 著者: Sjoberg, B.-M. / Soderberg, B.-O. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 33.4 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 21.8 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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Atom site foot note | 1: RESIDUE PRO 66 IS A CIS PROLINE. |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 9955.492 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() 属: T4-like viruses / 生物種: Enterobacteria phage T4 sensu lato / 参照: UniProt: P00276 |
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#2: 化合物 | ChemComp-MES / |
#3: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.22 Å3/Da / 溶媒含有率: 44.62 % | ||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS 温度: 20 ℃ / pH: 6 / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 | ||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
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放射波長 | 相対比: 1 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 1.45 Å / Num. obs: 15227 / % possible obs: 92 % / Rmerge(I) obs: 0.052 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | Rfactor Rwork: 0.175 / Rfactor obs: 0.175 / 最高解像度: 1.45 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 最高解像度: 1.45 Å
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拘束条件 |
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精密化 | *PLUS 最高解像度: 1.45 Å / Rfactor obs: 0.175 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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