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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 7dlu | ||||||
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タイトル | Mechanosensitive channel MscS K180R mutant | ||||||
要素 | Mechanosensitive ion channel MscS | ||||||
キーワード | MEMBRANE PROTEIN / Ion channel | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 | ||||||
生物種 | Pseudomonas aeruginosa (緑膿菌) | ||||||
手法 | 電子顕微鏡法 / 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 2.5 Å | ||||||
データ登録者 | Wu, J. / Ke, M. | ||||||
引用 | ジャーナル: To Be Published タイトル: Mechanosensitive channel MscS K180R mutant 著者: Wu, J. / Ke, M. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
ムービー |
ムービービューア |
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構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 7dlu.cif.gz | 296.2 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb7dlu.ent.gz | 246.9 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 7dlu.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 7dlu_validation.pdf.gz | 1.1 MB | 表示 | wwPDB検証レポート |
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文書・詳細版 | 7dlu_full_validation.pdf.gz | 1.2 MB | 表示 | |
XML形式データ | 7dlu_validation.xml.gz | 56.3 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 7dlu_validation.cif.gz | 74.2 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/dl/7dlu ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/dl/7dlu | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 29870.738 Da / 分子数: 7 / 変異: K180R / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) Pseudomonas aeruginosa (strain ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1) (緑膿菌) 遺伝子: PA4394 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: Q9HW12 |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 電子顕微鏡法 |
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EM実験 | 試料の集合状態: PARTICLE / 3次元再構成法: 単粒子再構成法 |
-試料調製
構成要素 | 名称: Heptameric MscS K180R / タイプ: COMPLEX / Entity ID: all / 由来: RECOMBINANT |
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分子量 | 実験値: NO |
由来(天然) | 生物種: Pseudomonas aeruginosa (緑膿菌) |
由来(組換発現) | 生物種: Escherichia coli (大腸菌) |
緩衝液 | pH: 7.5 |
試料 | 包埋: NO / シャドウイング: NO / 染色: NO / 凍結: YES |
急速凍結 | 凍結剤: ETHANE |
-電子顕微鏡撮影
実験機器 | モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |
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顕微鏡 | モデル: FEI TITAN KRIOS |
電子銃 | 電子線源: FIELD EMISSION GUN / 加速電圧: 300 kV / 照射モード: FLOOD BEAM |
電子レンズ | モード: BRIGHT FIELD |
撮影 | 電子線照射量: 50 e/Å2 / フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 (6k x 4k) |
-解析
CTF補正 | タイプ: NONE |
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3次元再構成 | 解像度: 2.5 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 粒子像の数: 158968 / 対称性のタイプ: POINT |