温度: 283 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 詳細: 0.02 M phosphate buffer pH 7.5, 27% PEG 8000, 100 mM NaCl
-
データ収集
回折
平均測定温度: 100 K / Serial crystal experiment: N
放射光源
由来: 回転陽極 / タイプ: RIGAKU MICROMAX-007 / 波長: 1.54187 Å
検出器
タイプ: MAR scanner 345 mm plate / 検出器: IMAGE PLATE / 日付: 2010年9月30日
放射
プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長
波長: 1.54187 Å / 相対比: 1
反射
解像度: 1.939→43.187 Å / Num. obs: 23907 / % possible obs: 91 % / 冗長度: 3.4 % / Rpim(I) all: 0.071 / Rrim(I) all: 0.133 / Rsym value: 0.112 / Net I/av σ(I): 5.8 / Net I/σ(I): 8.1
反射 シェル
Diffraction-ID: 1
解像度 (Å)
冗長度 (%)
Rmerge(I) obs
Mean I/σ(I) obs
Num. unique obs
Rpim(I) all
Rrim(I) all
Rsym value
% possible all
1.939-2.03
3.3
0.58
1.3
2905
0.372
0.69
0.58
76.2
2.03-2.15
3.4
0.364
2
3292
0.232
0.432
0.364
91.2
2.15-2.3
3.4
0.267
2.7
3131
0.17
0.317
0.267
92.1
2.3-2.49
3.4
0.215
3.4
2944
0.137
0.255
0.215
92.6
2.49-2.73
3.4
0.163
4.4
2709
0.104
0.194
0.163
93.4
2.73-3.05
3.4
0.113
6.3
2489
0.072
0.135
0.113
94.2
3.05-3.52
3.4
0.075
9.2
2220
0.048
0.089
0.075
95
3.52-4.31
3.4
0.059
10.6
1893
0.038
0.07
0.059
95.9
4.31-6.09
3.3
0.057
10.3
1488
0.036
0.067
0.057
96.2
6.09-43.187
3.2
0.053
10.9
836
0.034
0.063
0.053
97
-
位相決定
位相決定
手法: 分子置換
-
解析
ソフトウェア
名称
バージョン
分類
NB
MOSFLM
データ削減
SCALA
3.3.15
データスケーリング
PHASER
位相決定
REFMAC
5.8.0158
精密化
PDB_EXTRACT
3.25
データ抽出
精密化
構造決定の手法: 分子置換 開始モデル: inhouse 解像度: 1.94→43.187 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.959 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.921 / SU B: 7.284 / SU ML: 0.107 / SU R Cruickshank DPI: 0.1553 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 0 / ESU R: 0.155 / ESU R Free: 0.147 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS U VALUES : WITH TLS ADDED
Rfactor
反射数
%反射
Selection details
Rfree
0.212
1221
5.1 %
RANDOM
Rwork
0.1637
-
-
-
obs
0.1662
22685
92.37 %
-
溶媒の処理
イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: BABINET MODEL WITH MASK