登録情報 | データベース: PDB / ID: 5wfd |
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タイトル | Humanized mutant of the Chaetomium thermophilum Polycomb Repressive Complex 2 bound to the inhibitor GSK126 |
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要素 | - Histone-lysine-N-methyltransferase EZH2, Polycomb protein SUZ12 chimera
- Polycomb Protein EED
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キーワード | TRANSFERASE/TRANSFERASE INHIBITOR / transferase (転移酵素) / inhibitor (酵素阻害剤) / complex / epigenetics (エピジェネティクス) / TRANSFERASE-TRANSFERASE INHIBITOR complex |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
histone H3K27 methyltransferase activity / ESC/E(Z) complex / RSC-type complex / nucleosome binding / heterochromatin formation / chromatin DNA binding / メチル化 / chromatin binding / negative regulation of transcription by RNA polymerase II / metal ion binding類似検索 - 分子機能 EZH2, N-terminal domain / MCSS domain / : / Fungal MCSS domain / EZH2 N-terminal domain / Fungal polycomb repressive complex 2, Ezh2-like, preSET CXC domain / Polycomb protein, VEFS-Box / VEFS-Box of polycomb protein / Histone-lysine N-methyltransferase EZH1/2-like / CXC domain ...EZH2, N-terminal domain / MCSS domain / : / Fungal MCSS domain / EZH2 N-terminal domain / Fungal polycomb repressive complex 2, Ezh2-like, preSET CXC domain / Polycomb protein, VEFS-Box / VEFS-Box of polycomb protein / Histone-lysine N-methyltransferase EZH1/2-like / CXC domain / CXC domain profile. / SET (Su(var)3-9, Enhancer-of-zeste, Trithorax) domain / SET domain superfamily / SET domain / SET domain profile. / SET domain / Trp-Asp (WD) repeats profile. / Trp-Asp (WD) repeats circular profile. / WD domain, G-beta repeat / WD40リピート / WD40リピート / WD40-repeat-containing domain superfamily / WD40/YVTN repeat-like-containing domain superfamily類似検索 - ドメイン・相同性 Chem-A9G / Zinc finger domain-containing protein / Uncharacterized protein / SET domain-containing protein類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Chaetomium thermophilum (菌類) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.654 Å |
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データ登録者 | Bratkowski, M.A. / Liu, X. |
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資金援助 | 米国, 6件 組織 | 認可番号 | 国 |
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National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS) | GM114576 | 米国 | Welch Foundation | I-1790 | 米国 | Cancer Prevention and Research Institute of Texas (CPRIT) | R1119 | 米国 | Rita Allen Foundation | | 米国 | University of Texas Medical Center Endowed Scholar Fund | | 米国 | National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS) | GM121662 | 米国 |
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引用 | ジャーナル: Sci Rep / 年: 2018 タイトル: An Evolutionarily Conserved Structural Platform for PRC2 Inhibition by a Class of Ezh2 Inhibitors. 著者: Bratkowski, M. / Yang, X. / Liu, X. |
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履歴 | 登録 | 2017年7月11日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2018年6月27日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2019年4月24日 | Group: Author supporting evidence / Data collection / カテゴリ: pdbx_audit_support / Item: _pdbx_audit_support.funding_organization |
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改定 1.2 | 2020年1月8日 | Group: Author supporting evidence / カテゴリ: pdbx_audit_support / Item: _pdbx_audit_support.funding_organization |
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改定 1.3 | 2022年3月23日 | Group: Author supporting evidence / Database references / Derived calculations カテゴリ: database_2 / pdbx_audit_support ...database_2 / pdbx_audit_support / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id |
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改定 1.4 | 2023年10月4日 | Group: Data collection / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond / pdbx_initial_refinement_model |
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