登録情報 | データベース: PDB / ID: 5t4k |
---|
タイトル | PLP and GABA Trigger GabR-Mediated Transcription Regulation in Bacillus subsidies via External Aldimine Formation |
---|
要素 | HTH-type transcriptional regulatory protein GabR |
---|
キーワード | TRANSCRIPTION / GabR / MocR / PLP / GABA / external aldimine |
---|
機能・相同性 | 機能・相同性情報
transaminase activity / biosynthetic process / pyridoxal phosphate binding / DNA-binding transcription factor activity / DNA binding類似検索 - 分子機能 GntR-type HTH domain profile. / helix_turn_helix gluconate operon transcriptional repressor / Transcription regulator HTH, GntR / Bacterial regulatory proteins, gntR family / Aminotransferase, class I/classII / Aminotransferase class I and II / Aspartate Aminotransferase; domain 2 / Type I PLP-dependent aspartate aminotransferase-like (Major domain) / Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major domain / Pyridoxal phosphate-dependent transferase ...GntR-type HTH domain profile. / helix_turn_helix gluconate operon transcriptional repressor / Transcription regulator HTH, GntR / Bacterial regulatory proteins, gntR family / Aminotransferase, class I/classII / Aminotransferase class I and II / Aspartate Aminotransferase; domain 2 / Type I PLP-dependent aspartate aminotransferase-like (Major domain) / Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major domain / Pyridoxal phosphate-dependent transferase / Winged helix DNA-binding domain superfamily / Winged helix-like DNA-binding domain superfamily / 3-Layer(aba) Sandwich / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 Chem-76U / HTH-type transcriptional regulatory protein GabR類似検索 - 構成要素 |
---|
生物種 | ![](img/tx_bacteria.gif) Bacillus subtilis (枯草菌) |
---|
手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.245 Å |
---|
データ登録者 | Wu, R. / Sanishvili, R. / Belitsky, B.R. / Juncosa, J.I. / Le, H.V. / Lehrer, H.J.S. / Farley, M. / Silverman, R.B. / Petsko, G.A. / Ringe, D. / Liu, D. |
---|
資金援助 | 米国, 1件 組織 | 認可番号 | 国 |
---|
National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS) | 1R151GM113229-01 | 米国 |
|
---|
引用 | ジャーナル: Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. / 年: 2017 タイトル: PLP and GABA trigger GabR-mediated transcription regulation in Bacillus subtilis via external aldimine formation. 著者: Wu, R. / Sanishvili, R. / Belitsky, B.R. / Juncosa, J.I. / Le, H.V. / Lehrer, H.J. / Farley, M. / Silverman, R.B. / Petsko, G.A. / Ringe, D. / Liu, D. |
---|
履歴 | 登録 | 2016年8月29日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
---|
改定 1.0 | 2017年3月29日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
---|
改定 1.1 | 2017年4月12日 | Group: Database references |
---|
改定 1.2 | 2017年4月19日 | Group: Database references |
---|
改定 1.3 | 2017年9月27日 | Group: Author supporting evidence / カテゴリ: pdbx_audit_support / Item: _pdbx_audit_support.funding_organization |
---|
改定 1.4 | 2019年12月25日 | Group: Author supporting evidence / カテゴリ: pdbx_audit_support / Item: _pdbx_audit_support.funding_organization |
---|
改定 1.5 | 2023年10月4日 | Group: Data collection / Database references / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession |
---|
|
---|