ChemComp-5HU: 5-HYDROXYMETHYLURIDINE-2'-DEOXY-5'-MONOPHOSPHATE

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: 5HU
• 名称: 名称: 5-hydroxymethyluridine-2'-deoxy-5'-monophosphate; 日化辞名称: 5-(ヒドロキシメチル)-2′-デオキシウリジン5′-りん酸

Chemical information

組成

組成式: C₁₀H₁₅N₂O₉P / 原子数: 37 / 化学式量: 338.208 / 形式電荷: 0

その他

1mrs

DU

タイプ: DNA LINKING / PDB分類: ATOMN / 1文字コード: U / 3文字コード: 5HU / モデル座標のPDB-ID: 1MRS / 親要素: DU

履歴

作成	2002年9月26日
記述子を修正	2011年6月4日

• 外部リンク: Brenda / UniChem / ChEMBL / DrugBank / 日化辞 / PubChem / ZINC / ChemSpider / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 10.04: O=C1NC(=O)N(C=C1CO)C2OC(C(O)C2)COP(=O)(O)O
• CACTVS 3.341: OCC1=CN([CH]2C[CH](O)[CH](CO[P](O)(O)=O)O2)C(=O)NC1=O
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: C1C(C(OC1N2C=C(C(=O)NC2=O)CO)COP(=O)(O)O)O

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.341: OCC1=CN([C@H]2C[C@H](O)[C@@H](CO[P](O)(O)=O)O2)C(=O)NC1=O
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: C1[C@@H]([C@H](O[C@H]1N2C=C(C(=O)NC2=O)CO)COP(=O)(O)O)O

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C10H15N2O9P/c13-3-5-2-12(10(16)11-9(5)15)8-1-6(14)7(21-8)4-20-22(17,18)19/h2,6-8,13-14H,1,3-4H2,(H,11,15,16)(H2,17,18,19)/t6-,7+,8+/m0/s1

InChIKey

• InChI 1.03: WEBVWKFGRVLCNS-XLPZGREQSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 10.04: 2'-deoxy-5-(hydroxymethyl)uridine 5'-(dihydrogen phosphate)
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: [(2R,3S,5R)-3-hydroxy-5-[5-(hydroxymethyl)-2,4-dioxo-pyrimidin-1-yl]oxolan-2-yl]methyl dihydrogen phosphate

PDBエントリ

全3件を表示しています

PDB-1mrs:
CRYSTAL STRUCTURE OF MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS THYMIDYLATE KINASE COMPLEXED WITH 5-CH2OH DEOXYURIDINE MONOPHOSPHATE

PDB-7jxf:
E. coli TSase complex with a bi-substrate reaction intermediate diastereomer analog

PDB-8qhq:
Crystal structure of human DNPH1 bound to hmdUMP