- PDB-5f01: CRYSTAL STRUCTURE OF BACE-1 IN COMPLEX WITH (1SR,2SR)-2-((R)-2-am... -
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基本情報
登録情報
データベース: PDB / ID: 5f01
タイトル
CRYSTAL STRUCTURE OF BACE-1 IN COMPLEX WITH (1SR,2SR)-2-((R)-2-amino-5,5-difluoro-4-methyl-5,6-dihydro-4H-1,3-oxazin-4-yl)-N-(3-chloroquinolin-8-yl)cyclopropanecarboxamide
プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長
波長: 1 Å / 相対比: 1
反射
解像度: 1.52→47.78 Å / Num. obs: 75036 / % possible obs: 100 % / 冗長度: 12.81 % / Rsym value: 0.0393 / Net I/σ(I): 14.01
反射 シェル
解像度: 1.52→1.62 Å / 冗長度: 12.45 % / Rmerge(I) obs: 0.5483 / Mean I/σ(I) obs: 1.83 / % possible all: 100
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解析
ソフトウェア
名称
バージョン
分類
REFMAC
5.6.0077
精密化
XDS
データ削減
XSCALE
データスケーリング
PHASER
位相決定
精密化
構造決定の手法: 分子置換 開始モデル: in-house structure 解像度: 1.52→47.78 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.967 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.96 / SU B: 1.401 / SU ML: 0.05 / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R: 0.071 / ESU R Free: 0.07 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN USED IF PRESENT IN THE INPUT
Rfactor
反射数
%反射
Selection details
Rfree
0.2061
4011
5.1 %
RANDOM
Rwork
0.18604
-
-
-
obs
0.18704
75036
97.15 %
-
溶媒の処理
イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: BABINET MODEL WITH MASK