登録情報 | データベース: PDB / ID: 4zsk |
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タイトル | Crystal structure of the effector-binding domain of DasR (DasR-EBD) in complex with N-acetylglucosamine-6-phosphate |
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要素 | HTH-type transcriptional repressor DasR |
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キーワード | TRANSCRIPTION / Repressor / Bacterial transcription regulation / Transcription factor / GntR/HutC family / Effector-binding domain / N-acetylglucosamine utilization / Master regulator / N-acetylglucosamine-6-phosphate |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
DNA-binding transcription factor activity / negative regulation of DNA-templated transcription / DNA binding / cytoplasm類似検索 - 分子機能 : / UTRA / UbiC transcription regulator-associated / UTRA domain / Chorismate lyase / Chorismate lyase-like / Chorismate pyruvate-lyase/UbiC transcription regulator-associated domain superfamily / GntR-type HTH domain profile. / helix_turn_helix gluconate operon transcriptional repressor / Transcription regulator HTH, GntR ...: / UTRA / UbiC transcription regulator-associated / UTRA domain / Chorismate lyase / Chorismate lyase-like / Chorismate pyruvate-lyase/UbiC transcription regulator-associated domain superfamily / GntR-type HTH domain profile. / helix_turn_helix gluconate operon transcriptional repressor / Transcription regulator HTH, GntR / Bacterial regulatory proteins, gntR family / Winged helix DNA-binding domain superfamily / Winged helix-like DNA-binding domain superfamily / 3-Layer(aba) Sandwich / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 Chem-16G / Chem-4QY / HTH-type transcriptional repressor DasR類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Streptomyces coelicolor A3 |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 1.85 Å |
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データ登録者 | Fillenberg, S.B. / Muller, Y.A. |
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資金援助 | ドイツ, 1件 組織 | 認可番号 | 国 |
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German Research Foundation | | ドイツ |
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引用 | ジャーナル: Plos One / 年: 2016 タイトル: Crystal Structures of the Global Regulator DasR from Streptomyces coelicolor: Implications for the Allosteric Regulation of GntR/HutC Repressors. 著者: Fillenberg, S.B. / Friess, M.D. / Korner, S. / Bockmann, R.A. / Muller, Y.A. |
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履歴 | 登録 | 2015年5月13日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: PDBE |
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改定 1.0 | 2016年6月8日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2016年7月13日 | Group: Database references |
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改定 2.0 | 2020年7月29日 | Group: Atomic model / Author supporting evidence ...Atomic model / Author supporting evidence / Data collection / Derived calculations / Structure summary カテゴリ: atom_site / chem_comp ...atom_site / chem_comp / entity / pdbx_audit_support / pdbx_chem_comp_identifier / pdbx_entity_nonpoly / pdbx_nonpoly_scheme / struct_site / struct_site_gen Item: _atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x ..._atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x / _atom_site.Cartn_y / _atom_site.Cartn_z / _chem_comp.mon_nstd_flag / _chem_comp.name / _chem_comp.type / _entity.pdbx_description / _pdbx_audit_support.funding_organization / _pdbx_entity_nonpoly.name / _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num 解説: Carbohydrate remediation / Provider: repository / タイプ: Remediation |
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改定 2.1 | 2024年1月10日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Refinement description / Structure summary カテゴリ: chem_comp / chem_comp_atom ...chem_comp / chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model Item: _chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession |
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