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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 4lbp | ||||||
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タイトル | 5-chloro-2-hydroxyhydroquinone dehydrochlorinase (TftG) from Burkholderia phenoliruptrix AC1100: Complex with 2,5-dihydroxybenzoquinone | ||||||
![]() | 5-chloro-2-hydroxyhydroquinone dehydrochlorinase (TftG) | ||||||
![]() | LYASE | ||||||
機能・相同性 | ![]() : / YCII-related / YCII-related domain / Dimeric alpha+beta barrel / Dimeric alpha-beta barrel / Alpha-Beta Plaits / 2-Layer Sandwich / Alpha Beta 類似検索 - ドメイン・相同性 | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Hayes, R.P. / Lewis, K.M. / Xun, L. / Kang, C. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Catalytic Mechanism of 5-Chlorohydroxyhydroquinone Dehydrochlorinase from the YCII Superfamily of Largely Unknown Function. 著者: Hayes, R.P. / Lewis, K.M. / Xun, L. / Kang, C. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 30.2 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 23.5 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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単位格子 |
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Components on special symmetry positions |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 11322.350 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() 発現宿主: ![]() ![]() |
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#2: 化合物 | ChemComp-1WG / |
#3: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.64 Å3/Da / 溶媒含有率: 53.41 % |
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結晶化 | 温度: 277.15 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 7.5 詳細: 30% (w/v) polyethylene glycol 1500, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.15K |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K | |||||||||||||||||||||
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() | |||||||||||||||||||||
検出器 | タイプ: ADSC QUANTUM 315r / 検出器: CCD / 日付: 2012年12月19日 | |||||||||||||||||||||
放射 | モノクロメーター: Double crystal, Si(111) / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray | |||||||||||||||||||||
放射波長 | 波長: 1 Å / 相対比: 1 | |||||||||||||||||||||
反射 | 解像度: 1.87→50 Å / Num. all: 10578 / Num. obs: 10578 / % possible obs: 99.9 % / Observed criterion σ(I): -3 | |||||||||||||||||||||
反射 シェル |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]()
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溶媒の処理 | 減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.87→45.096 Å
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拘束条件 |
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LS精密化 シェル |
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