登録情報 | データベース: PDB / ID: 4do4 |
---|
タイトル | Pharmacological chaperones for human alpha-N-acetylgalactosaminidase |
---|
要素 | Alpha-N-acetylgalactosaminidase |
---|
キーワード | HYDROLASE/HYDROLASE INHIBITOR / PHARMACOLOGICAL CHAPERONE / (BETA/ALPHA)8 BARREL / GLYCOSIDASE / CARBOHYDRATE-BINDING PROTEIN / GLYCOPROTEIN / LYSOSOME / HYDROLASE-HYDROLASE INHIBITOR complex |
---|
機能・相同性 | 機能・相同性情報
alpha-N-acetylgalactosaminidase / alpha-N-acetylgalactosaminidase activity / glycolipid catabolic process / alpha-galactosidase activity / oligosaccharide metabolic process / glycoside catabolic process / carbohydrate catabolic process / lysosome / protein homodimerization activity / extracellular exosome / cytoplasm類似検索 - 分子機能 Alpha galactosidase A, C-terminal beta-sandwich domain / Alpha galactosidase A C-terminal beta sandwich domain / Alpha galactosidase A / Glycoside hydrolase, family 27 / Glycoside hydrolase family 27/36, conserved site / Alpha-galactosidase signature. / Golgi alpha-mannosidase II / Glycosyl hydrolase, all-beta / Aldolase class I / Aldolase-type TIM barrel ...Alpha galactosidase A, C-terminal beta-sandwich domain / Alpha galactosidase A C-terminal beta sandwich domain / Alpha galactosidase A / Glycoside hydrolase, family 27 / Glycoside hydrolase family 27/36, conserved site / Alpha-galactosidase signature. / Golgi alpha-mannosidase II / Glycosyl hydrolase, all-beta / Aldolase class I / Aldolase-type TIM barrel / Glycoside hydrolase superfamily / TIM Barrel / Alpha-Beta Barrel / Immunoglobulin-like / Sandwich / Mainly Beta / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 ACETIC ACID / CITRIC ACID / Chem-DJN / Alpha-N-acetylgalactosaminidase類似検索 - 構成要素 |
---|
生物種 | Homo sapiens (ヒト) |
---|
手法 | X線回折 / シンクロトロン / フーリエ合成 / 解像度: 1.4 Å |
---|
データ登録者 | Clark, N.E. / Garman, S.C. |
---|
引用 | ジャーナル: Proc.Natl.Acad.Sci.USA / 年: 2012 タイトル: Pharmacological chaperones for human alpha-N-acetylgalactosaminidase 著者: Clark, N.E. / Metcalf, M.C. / Best, D. / Fleet, G.W. / Garman, S.C. |
---|
履歴 | 登録 | 2012年2月9日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
---|
改定 1.0 | 2012年10月10日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
---|
改定 1.1 | 2012年11月21日 | Group: Database references |
---|
改定 1.2 | 2017年11月15日 | Group: Refinement description / カテゴリ: software |
---|
改定 2.0 | 2020年7月29日 | Group: Advisory / Atomic model ...Advisory / Atomic model / Data collection / Database references / Derived calculations / Structure summary カテゴリ: atom_site / atom_site_anisotrop ...atom_site / atom_site_anisotrop / chem_comp / database_PDB_caveat / entity / pdbx_branch_scheme / pdbx_chem_comp_identifier / pdbx_entity_branch / pdbx_entity_branch_descriptor / pdbx_entity_branch_link / pdbx_entity_branch_list / pdbx_entity_nonpoly / pdbx_nonpoly_scheme / pdbx_struct_assembly_gen / pdbx_struct_special_symmetry / struct_asym / struct_conn / struct_ref_seq_dif / struct_site / struct_site_gen Item: _atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x ..._atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x / _atom_site.Cartn_y / _atom_site.Cartn_z / _atom_site.auth_asym_id / _atom_site.auth_atom_id / _atom_site.auth_comp_id / _atom_site.auth_seq_id / _atom_site.label_asym_id / _atom_site.label_atom_id / _atom_site.label_comp_id / _atom_site.label_entity_id / _atom_site.type_symbol / _atom_site_anisotrop.U[1][1] / _atom_site_anisotrop.U[1][2] / _atom_site_anisotrop.U[1][3] / _atom_site_anisotrop.U[2][2] / _atom_site_anisotrop.U[2][3] / _atom_site_anisotrop.U[3][3] / _atom_site_anisotrop.pdbx_auth_asym_id / _atom_site_anisotrop.pdbx_auth_atom_id / _atom_site_anisotrop.pdbx_auth_comp_id / _atom_site_anisotrop.pdbx_auth_seq_id / _atom_site_anisotrop.pdbx_label_asym_id / _atom_site_anisotrop.pdbx_label_atom_id / _atom_site_anisotrop.pdbx_label_comp_id / _atom_site_anisotrop.type_symbol / _chem_comp.name / _chem_comp.pdbx_synonyms / _chem_comp.type / _entity.formula_weight / _entity.pdbx_description / _entity.pdbx_number_of_molecules / _entity.src_method / _entity.type / _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.pdbx_role / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_ref_seq_dif.details 解説: Carbohydrate remediation / Provider: repository / タイプ: Remediation |
---|
改定 2.1 | 2023年9月13日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Refinement description / Structure summary カテゴリ: chem_comp / chem_comp_atom ...chem_comp / chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model Item: _chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession |
---|
|
---|