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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 3fp0 | |||||||||
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タイトル | Structural and Functional Characterization of TRI3 Trichothecene 15-O-acetyltransferase from Fusarium sporotrichioides | |||||||||
![]() | 15-O-acetyltransferase | |||||||||
![]() | TRANSFERASE / Fusarium Head Blight / Trichothecene mycotoxin / Deoxynivalenol / T-2 toxin / Fusarium graminearum / Fusarium sporotrichioides / acetyltransferase / coenzyme A / BAHD superfamily | |||||||||
機能・相同性 | ![]() mycotoxin biosynthetic process / 転移酵素; アシル基を移すもの; アミノアシル基を移すもの / acetyltransferase activity 類似検索 - 分子機能 | |||||||||
生物種 | ![]() | |||||||||
手法 | ![]() ![]() | |||||||||
![]() | Garvey, G.S. / Rayment, I. / McCormick, S.P. / Alexander, N.J. | |||||||||
![]() | ![]() タイトル: Structural and functional characterization of TRI3 trichothecene 15-O-acetyltransferase from Fusarium sporotrichioides 著者: Garvey, G.S. / McCormick, S.P. / Alexander, N.J. / Rayment, I. | |||||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 125.6 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 93.7 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 1.1 MB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 1.1 MB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 24.5 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 36.4 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 58244.867 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() |
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#2: 多糖 | alpha-D-fructofuranose-(2-1)-alpha-D-glucopyranose / surcrose isoform |
#3: 化合物 | ChemComp-FP0 / ( |
#4: 化合物 | ChemComp-EPE / |
#5: 水 | ChemComp-HOH / |
配列の詳細 | THE AUTHORS STATE THAT THESE RESIDUES WERE OBSERVED IN THE SPECIFIC STRAIN OF FUSARIUM ...THE AUTHORS STATE THAT THESE RESIDUES WERE OBSERVED IN THE SPECIFIC STRAIN OF FUSARIUM SPOROTRICH |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.16 Å3/Da / 溶媒含有率: 43.03 % |
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結晶化 | 温度: 277 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 7.5 詳細: 2M Ammonium sulfate, 100 mM HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: Bruker Platinum 135 / 検出器: CCD / 日付: 2007年3月6日 |
放射 | プロトコル: MAD / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.5416 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 1.9→62.2 Å / Num. all: 40792 / Num. obs: 40098 / % possible obs: 98 % / 冗長度: 4.96 % / Biso Wilson estimate: 15 Å2 / Rsym value: 0.092 |
反射 シェル | 解像度: 1.9→2 Å / 冗長度: 2.35 % / Mean I/σ(I) obs: 1.9 / Num. unique all: 5384 / Rsym value: 0.373 / % possible all: 90 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]() 開始モデル: PDB entry 3FOT 解像度: 1.9→62.14 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.946 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.912 / SU B: 3.542 / SU ML: 0.105 / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R: 0.166 / ESU R Free: 0.158 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS
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溶媒の処理 | イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: MASK | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | Biso mean: 14.602 Å2
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.9→62.14 Å
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拘束条件 |
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LS精密化 シェル | 解像度: 1.9→1.948 Å / Total num. of bins used: 20
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