登録情報 データベース : PDB / ID : 3ei8 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル Crystal structure of K270N variant of LL-diaminopimelate aminotransferase from Arabidopsis thaliana complexed with LL-DAP: External aldimine form 要素LL-diaminopimelate aminotransferase 詳細 キーワード TRANSFERASE / aminotransferase / lysine biosynthesis / Pyridoxal 5' phosphate / external aldimine / LL-diaminopimelate / Chloroplast / Pyridoxal phosphate / Transit peptide機能・相同性 機能・相同性情報分子機能 ドメイン・相同性 構成要素
LL-diaminopimelate aminotransferase / L,L-diaminopimelate aminotransferase activity / systemic acquired resistance, salicylic acid mediated signaling pathway / transaminase activity / lysine biosynthetic process via diaminopimelate / chloroplast stroma / chloroplast / pyridoxal phosphate binding / copper ion binding / plasma membrane 類似検索 - 分子機能 LL-diaminopimelate aminotransferase/aminotransferase ALD1 / Aminotransferase, class I/classII / Aminotransferase class I and II / Aspartate Aminotransferase, domain 1 / Aspartate Aminotransferase, domain 1 / Aspartate Aminotransferase; domain 2 / Type I PLP-dependent aspartate aminotransferase-like (Major domain) / Pyridoxal phosphate-dependent transferase, small domain / Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major domain / Pyridoxal phosphate-dependent transferase ... LL-diaminopimelate aminotransferase/aminotransferase ALD1 / Aminotransferase, class I/classII / Aminotransferase class I and II / Aspartate Aminotransferase, domain 1 / Aspartate Aminotransferase, domain 1 / Aspartate Aminotransferase; domain 2 / Type I PLP-dependent aspartate aminotransferase-like (Major domain) / Pyridoxal phosphate-dependent transferase, small domain / Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major domain / Pyridoxal phosphate-dependent transferase / Alpha-Beta Complex / 3-Layer(aba) Sandwich / Alpha Beta 類似検索 - ドメイン・相同性 Chem-PL5 / PYRIDOXAL-5'-PHOSPHATE / LL-diaminopimelate aminotransferase, chloroplastic 類似検索 - 構成要素生物種 Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)手法 X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度 : 1.6 Å 詳細データ登録者 Watanabe, N. / Clay, M.D. / van Belkum, M.J. / Cherney, M.M. / Vederas, J.C. / James, M.N.G. 引用ジャーナル : J.Mol.Biol. / 年 : 2008タイトル : Mechanism of substrate recognition and PLP-induced conformational changes in LL-diaminopimelate aminotransferase from Arabidopsis thaliana.著者 : Watanabe, N. / Clay, M.D. / van Belkum, M.J. / Cherney, M.M. / Vederas, J.C. / James, M.N. 履歴 登録 2008年9月15日 登録サイト : RCSB / 処理サイト : RCSB改定 1.0 2008年10月14日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.1 2011年7月13日 Group : Non-polymer description / Version format compliance改定 1.2 2021年10月20日 Group : Database references / Derived calculations / カテゴリ : database_2 / struct_ref_seq_dif / struct_siteItem : _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ... _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id 改定 1.3 2023年8月30日 Group : Data collection / Refinement descriptionカテゴリ : chem_comp_atom / chem_comp_bond / pdbx_initial_refinement_model
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