PDB-2vx3: Crystal structure of the human dual specificity tyrosine- phospho...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 2vx3

タイトル

Crystal structure of the human dual specificity tyrosine- phosphorylation-regulated kinase 1A

要素

DUAL SPECIFICITY TYROSINE-PHOSPHORYLATION- REGULATED KINASE 1A

キーワード

TRANSFERASE / SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE / MINIBRAIN HOMOLOG / NUCLEOTIDE-BINDING / PHOSPHOPROTEIN / TYROSINE-PROTEIN KINASE / CASP8 / KINASE

機能・相同性

機能・相同性情報

histone H3T45 kinase activity / positive regulation of protein deacetylation / peptidyl-serine autophosphorylation / negative regulation of DNA methylation-dependent heterochromatin formation / dual-specificity kinase / [RNA-polymerase]-subunit kinase / negative regulation of microtubule polymerization / tau-protein kinase activity / negative regulation of mRNA splicing, via spliceosome / amyloid-beta formation ...
類似検索 - 分子機能

生物種

HOMO SAPIENS (ヒト)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 2.4 Å

データ登録者

Roos, A.K. / Soundararajan, M. / Pike, A.C.W. / Federov, O. / King, O. / Burgess-Brown, N. / Philips, C. / Filippakopoulos, P. / Arrowsmith, C.H. / Wikstrom, M. ...

引用

ジャーナル: Structure / 年: 2013
タイトル: Structures of Down Syndrome Kinases, Dyrks, Reveal Mechanisms of Kinase Activation and Substrate Recognition.
著者: Soundararajan, M. / Roos, A.K. / Savitsky, P. / Filippakopoulos, P. / Kettenbach, A.N. / Olsen, J.V. / Gerber, S.A. / Eswaran, J. / Knapp, S. / Elkins, J.M.

履歴

登録	2008年6月30日	登録サイト: PDBE / 処理サイト: PDBE
改定 1.0	2008年9月16日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2011年7月13日	Group: Advisory / Version format compliance
改定 1.2	2012年12月5日	Group: Database references
改定 1.3	2013年6月26日	Group: Database references / Derived calculations
改定 1.4	2023年12月13日	Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Other / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_database_status / pdbx_initial_refinement_model / struct_conn / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_database_status.status_code_sf / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	2vx3.cif.gz	297.6 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb2vx3.ent.gz	240.3 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	2vx3.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

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検証レポート

文書・要旨	2vx3_validation.pdf.gz	3.6 MB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	2vx3_full_validation.pdf.gz	3.6 MB	表示
XML形式データ	2vx3_validation.xml.gz	52.8 KB	表示
CIF形式データ	2vx3_validation.cif.gz	70.1 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/vx/2vx3 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/vx/2vx3	HTTPS FTP

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関連構造データ

関連構造データ	2wo6C 3k2lC 1exeS 1z57S C: 同じ文献を引用 (文献) S: 精密化の開始モデル
類似構造データ	6uwy-2 6eis-1 6s1i-1 6t6a-4 4mq2-1 6s1i-3 4yu2-4 4ylk-d 4mq2-3 4ylj-3 2b11-1 2wo6-1 6s11-1 5ynf-d 5a4e-1 Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#236 - 2019年8月サイクリンとサイクリン依存性キナーゼ (Cyclin and Cyclin-dependent Kinase) 類似性 (1)

登録構造単位

A: DUAL SPECIFICITY TYROSINE-PHOSPHORYLATION- REGULATED KINASE 1A

B: DUAL SPECIFICITY TYROSINE-PHOSPHORYLATION- REGULATED KINASE 1A

C: DUAL SPECIFICITY TYROSINE-PHOSPHORYLATION- REGULATED KINASE 1A

D: DUAL SPECIFICITY TYROSINE-PHOSPHORYLATION- REGULATED KINASE 1A

ヘテロ分子

183 kDa, 4 ポリマー
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1

A: DUAL SPECIFICITY TYROSINE-PHOSPHORYLATION- REGULATED KINASE 1A

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
46 kDa, 1 ポリマー
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2

B: DUAL SPECIFICITY TYROSINE-PHOSPHORYLATION- REGULATED KINASE 1A

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
46.2 kDa, 1 ポリマー
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3

C: DUAL SPECIFICITY TYROSINE-PHOSPHORYLATION- REGULATED KINASE 1A

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
45.6 kDa, 1 ポリマー
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4

D: DUAL SPECIFICITY TYROSINE-PHOSPHORYLATION- REGULATED KINASE 1A

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
45.5 kDa, 1 ポリマー
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単位格子

Length a, b, c (Å)	264.203, 65.105, 140.282
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 115.44, 90.00
Int Tables number	5
Space group name H-M	C121

非結晶学的対称性 (NCS)

NCSドメイン:

ID	Ens-ID	詳細
1	1	A
2	1	B
3	1	C
4	1	D

NCSドメイン領域:

Dom-ID	Component-ID	Ens-ID	Refine code	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	1	1	5	A	136 - 212
2	1	1	5	B	136 - 212
3	1	1	5	C	136 - 212
4	1	1	5	D	136 - 212
1	2	1	4	A	220 - 406
2	2	1	4	B	220 - 406
3	2	1	4	C	220 - 406
4	2	1	4	D	220 - 406
1	3	1	4	A	413 - 480
2	3	1	4	B	413 - 480
3	3	1	4	C	413 - 480
4	3	1	4	D	413 - 480

NCS oper:

ID	Code	Matrix	ベクター
1	given	(-0.603, -0.797, -0.028), (-0.796, 0.599, 0.084), (-0.05, 0.073, -0.996)	22.05035, 15.78841, -104.34769
2	given	(0.843, 0.482, -0.238), (0.473, -0.875, -0.1), (-0.256, -0.029, -0.966)	-20.29074, -10.69172, -41.35233
3	given	(0.885, -0.404, -0.23), (-0.391, -0.915, 0.102), (-0.252, -0.968)	-63.48191, 28.85044, -65.01735

-
タンパク質 , 1種, 4分子 ABCD

#1: タンパク質	DUAL SPECIFICITY TYROSINE-PHOSPHORYLATION- REGULATED KINASE 1A / PROTEIN KINASE MINIBRAIN HOMOLOG / MNBH / HMNB / HP86 / DUAL SPECIFICITY YAK1-RELATED KINASE 分子量: 44553.188 Da / 分子数: 4 / 断片: RESIDUES 127-485 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) HOMO SAPIENS (ヒト) / プラスミド: PNIC28-BSA4 / 発現宿主: ESCHERICHIA COLI (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21(DE3) / Variant (発現宿主): R3-PRARE2 / 参照: UniProt: Q13627, dual-specificity kinase

#1: タンパク質

DUAL SPECIFICITY TYROSINE-PHOSPHORYLATION- REGULATED KINASE 1A / PROTEIN KINASE MINIBRAIN HOMOLOG / MNBH / HMNB / HP86 / DUAL SPECIFICITY YAK1-RELATED KINASE

分子量: 44553.188 Da / 分子数: 4 / 断片: RESIDUES 127-485 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現)

HOMO SAPIENS (ヒト) / プラスミド: PNIC28-BSA4 / 発現宿主:

ESCHERICHIA COLI (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21(DE3) / Variant (発現宿主): R3-PRARE2 / 参照: UniProt: Q13627, dual-specificity kinase

-
非ポリマー , 5種, 233分子

#2: 化合物	ChemComp-D15 / N-(5-{[(2S)-4-amino-2-(3-chlorophenyl)butanoyl]amino}-1H-indazol-3-yl)benzamide 分子量: 447.917 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₂₄H₂₂ClN₅O₂
#3: 化合物	ChemComp-CL / CHLORIDE ION / クロリド分子量: 35.453 Da / 分子数: 8 / 由来タイプ: 合成 / 式: Cl
#4: 化合物	ChemComp-P6G / HEXAETHYLENE GLYCOL / POLYETHYLENE GLYCOL PEG400 / ヘキサエチレングリコ-ル分子量: 282.331 Da / 分子数: 8 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₁₂H₂₆O₇ / コメント: 沈殿剤*YM
#5: 化合物	ChemComp-SO4 / SULFATE ION / 硫酸ジアニオン分子量: 96.063 Da / 分子数: 8 / 由来タイプ: 合成 / 式: SO₄
#6: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 205 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
詳細

非ポリマーの詳細	PHOSPHOTYROSINE (PTR): PHOSPHORYLATED TYROSINE

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 3.02 Å³/Da / 溶媒含有率: 59 % / 解説: NONE
結晶化	pH: 8.5 / 詳細: 34% PEG 300, 0.1 M LISO4, TRIS PH 8.5

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: SLS / ビームライン: X10SA / 波長: 0.9792
検出器	タイプ: MARRESEARCH / 検出器: CCD / 日付: 2008年5月9日
放射	プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 0.9792 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 2.4→26.35 Å / Num. obs: 92815 / % possible obs: 99.9 % / Observed criterion σ(I): 2 / 冗長度: 3.5 % / B_iso Wilson estimate: 55.7 Å² / R_merge(I) obs: 0.08 / Net I/σ(I): 10.2
反射シェル	解像度: 2.4→2.53 Å / 冗長度: 3.5 % / R_merge(I) obs: 0.68 / Mean I/σ(I) obs: 2 / % possible all: 99.9

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
REFMAC	5.4.0066	精密化
MOSFLM		データ削減
SCALA		データスケーリング
PHASER		位相決定

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: PDB ENTRY 1EXE AND 1Z57

1exe

1z57

解像度: 2.4→26 Å / Cor.coef. F_o:F_c: 0.96 / Cor.coef. F_o:F_c free: 0.941 / SU B: 13.127 / SU ML: 0.15 / TLS residual ADP flag: LIKELY RESIDUAL / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R: 0.252 / ESU R Free: 0.208 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS.

	R_factor	反射数	%反射	Selection details
R_free	0.23	1799	2.1 %	RANDOM
R_work	0.185	-	-	-
obs	0.186	82846	99.9 %	-

溶媒の処理

イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: MASK

原子変位パラメータ

B_iso mean: 27 Å²

	B_aniso -1	B_aniso -2	B_aniso -3
1-	0.39 Å²	0 Å²	-1.13 Å²
2-	-	0.4 Å²	0 Å²
3-	-	-	-1.76 Å²

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 2.4→26 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	11050	0	280	205	11535

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	Dev ideal target	数
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_refined_d	0.014	0.022	11620
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_other_d	0.001	0.02	8055
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_refined_deg	1.518	1.986	15676
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_other_deg	0.919	3.002	19456
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_1_deg	5.867	5	1367
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_2_deg	35.901	23.569	538
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_3_deg	14.738	15	1996
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_4_deg	20.285	15	75
X-RAY DIFFRACTION	r_chiral_restr	0.091	0.2	1652
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_refined	0.006	0.021	12651
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_other	0.001	0.02	2400
X-RAY DIFFRACTION	r_nbd_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_nbd_other
X-RAY DIFFRACTION	r_nbtor_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_nbtor_other
X-RAY DIFFRACTION	r_xyhbond_nbd_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_xyhbond_nbd_other
X-RAY DIFFRACTION	r_metal_ion_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_metal_ion_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_vdw_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_vdw_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_hbond_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_hbond_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_metal_ion_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_metal_ion_other
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_it	1.781	3	6822
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_other
X-RAY DIFFRACTION	r_mcangle_it	2.988	5	10974
X-RAY DIFFRACTION	r_mcangle_other
X-RAY DIFFRACTION	r_scbond_it	5.643	8	4798
X-RAY DIFFRACTION	r_scbond_other
X-RAY DIFFRACTION	r_scangle_it	7.017	11	4699
X-RAY DIFFRACTION	r_scangle_other
X-RAY DIFFRACTION	r_long_range_B_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_long_range_B_other
X-RAY DIFFRACTION	r_rigid_bond_restr
X-RAY DIFFRACTION	r_sphericity_free
X-RAY DIFFRACTION	r_sphericity_bonded

Refine LS restraints NCS

Ens-ID: 1 / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

Dom-ID	Auth asym-ID	数	タイプ	Rms dev position (Å)	Weight position
1	A	3780	medium positional	0.22	0.5
2	B	3780	medium positional	0.28	0.5
3	C	3780	medium positional	0.22	0.5
4	D	3780	medium positional	0.2	0.5
1	A	596	loose positional	0.35	5
2	B	596	loose positional	0.31	5
3	C	596	loose positional	0.33	5
4	D	596	loose positional	0.36	5
1	A	3780	medium thermal	1.09	2
2	B	3780	medium thermal	0.99	2
3	C	3780	medium thermal	0.87	2
4	D	3780	medium thermal	0.89	2
1	A	596	loose thermal	0.9	10
2	B	596	loose thermal	0.96	10
3	C	596	loose thermal	0.88	10
4	D	596	loose thermal	1.02	10

LS精密化シェル

解像度: 2.4→2.46 Å / Total num. of bins used: 20 /

	R_factor	反射数
R_free	0.383	138
R_work	0.34	6015

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	3.3682	-0.5159	0.536	3.8009	0.4514	2.6374	-0.0031	-0.2004	-0.0876	0.2206	0.0447	-0.3336	0.0072	0.1444	-0.0417	0.2484	-0.0172	-0.0648	0.07	-0.0523	0.0709	42.21	29.3901	-30.5632
2	1.1419	0.0138	0.22	1.2875	-0.0894	1.4263	0.0767	-0.0786	0.0069	0.1602	-0.019	0.0019	-0.1034	-0.0682	-0.0576	0.1047	-0.0158	-0.0008	-0.0524	0.0252	0.0454	25.3235	20.1484	-46.8043
3	5.1437	-2.5307	-3.4987	5.6629	1.8629	4.6462	0.4374	0.8792	0.14	-0.7925	-0.2614	0.2857	-0.6857	-0.774	-0.1761	0.1907	0.0422	-0.0713	0.1906	0.0805	0.0191	12.7255	28.2429	-69.555
4	1.8881	-0.3212	0.2214	1.7016	0.0036	1.7791	0.0316	-0.0805	-0.2646	0.1528	-0.0086	0.1125	0.1541	-0.0347	-0.0229	-0.0061	-0.035	-0.0216	-0.0488	0.0283	0.104	19.7372	7.5585	-52.0806
5	2.4165	0.6738	0.8007	5.004	-0.6363	2.4926	0.0298	-0.0094	-0.3099	-0.1337	-0.0206	0.0934	0.0811	-0.0359	-0.0093	0.0611	0.0576	-0.0733	0.2892	-0.0351	0.1067	-26.9832	-3.043	-72.9511
6	3.1504	0.3143	1.322	0.7461	-0.2063	1.4543	0.1187	0.1997	-0.1383	-0.0578	-0.088	-0.0154	-0.0263	-0.0568	-0.0306	0.0335	0.0187	0.0311	0.2012	-0.0122	0.0866	-11.7401	-1.4935	-67.1036
7	2.2182	-0.1776	-0.1006	2.1437	0.3783	1.2506	0.1292	-0.3506	0.0224	0.4285	-0.0669	-0.06	-0.0083	-0.1712	-0.0624	0.0909	-0.0689	0.0138	0.1953	0.0291	0.0952	-4.4308	7.5777	-47.2344
8	3.3199	0.0549	0.9215	0.8681	0.0147	1.4818	0.1134	0.2314	-0.192	-0.1579	0.0525	-0.2254	0.0165	0.0618	-0.1659	-0.0178	-0.0199	-0.0129	0.1062	0.0605	0.1415	6.8133	3.1219	-58.2994
9	2.2197	-0.088	-0.1126	3.688	-0.1155	4.1351	0.0042	-0.1723	0.1966	0.0778	0.0799	-0.127	-0.0563	-0.1002	-0.0841	0.3254	-0.0035	-0.0281	0.0532	-0.0376	0.0887	37.1335	-13.4616	-23.476
10	1.2218	-0.1797	0.0389	0.8608	-0.1155	4.3148	0.0149	-0.0845	0.0708	-0.1042	-0.0356	0.1664	-0.1711	-0.6265	0.0207	0.254	0.0427	-0.0007	0.3202	-0.0252	0.1728	21.7658	-12.0176	-3.2084
11	4.6295	-1.0595	1.0645	0.631	1.5243	8.2884	0.3315	-1.3986	-0.0115	1.1404	0.0615	0.2492	0.9022	-0.8835	-0.393	0.4949	-0.1442	0.062	0.6498	0.0008	0.1855	19.4135	-23.84	20.843
12	1.8368	-0.4994	0.1565	1.5953	-0.9777	4.083	-0.0291	-0.2115	0.3238	0.004	0.0135	0.3777	-0.8201	-1.2347	0.0155	0.3732	0.2478	0.0197	0.657	-0.0771	0.3308	12.8668	-3.6233	4.3984
13	3.2217	1.1887	-0.6278	2.2131	0.1506	2.5916	0.1431	-0.029	-0.186	0.1252	-0.0424	-0.2108	0.0047	-0.1274	-0.1008	0.0674	-0.0406	-0.0881	0.2579	0.0607	0.1312	-29.6735	-19.5457	-45.4911
14	1.9387	1.4405	0.0712	2.5647	2.2033	3.0972	0.0707	0.2301	0.059	-0.0648	0.1578	-0.0422	-0.3388	-0.0607	-0.2285	0.0704	-0.0019	-0.0157	0.2596	0.1184	0.1141	-30.6787	-11.1567	-44.294
15	16.223	-3.6339	-4.3533	2.473	-2.21	8.2282	-0.084	-0.1514	0.1531	0.1577	0.1324	-0.4814	-0.4417	0.4728	-0.0484	0.2979	-0.0505	-0.0068	0.322	0.0138	0.2506	-19.2095	-1.1041	-24.0512
16	1.2306	0.0607	-0.1545	1.3114	-0.0001	3.8559	0.0426	-0.0847	0.262	0.2212	-0.0222	0.2431	-0.6144	-0.4533	-0.0204	0.2612	0.1006	0.0854	0.2627	0.0641	0.2294	-39.8198	-0.4864	-22.6985

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	A	135 - 239
2	X-RAY DIFFRACTION	2	A	240 - 398
3	X-RAY DIFFRACTION	3	A	399 - 413
4	X-RAY DIFFRACTION	4	A	414 - 481
5	X-RAY DIFFRACTION	5	B	135 - 219
6	X-RAY DIFFRACTION	6	B	220 - 322
7	X-RAY DIFFRACTION	7	B	323 - 441
8	X-RAY DIFFRACTION	8	B	442 - 480
9	X-RAY DIFFRACTION	9	C	135 - 239
10	X-RAY DIFFRACTION	10	C	240 - 399
11	X-RAY DIFFRACTION	11	C	400 - 410
12	X-RAY DIFFRACTION	12	C	412 - 480
13	X-RAY DIFFRACTION	13	D	135 - 213
14	X-RAY DIFFRACTION	14	D	219 - 248
15	X-RAY DIFFRACTION	15	D	249 - 255
16	X-RAY DIFFRACTION	16	D	256 - 480

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbjlvh1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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