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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2kos | ||||||
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タイトル | NMR solution structures of octanoyl-ACP from Streptomyces coelicolor Fatty Acid Synthase | ||||||
![]() | Acyl carrier protein | ||||||
![]() | TRANSPORT PROTEIN / acyl carrier protein / intermediate binding / fatty acid synthase | ||||||
機能・相同性 | ![]() | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | 溶液NMR / simulated annealing | ||||||
Model details | closest to the average, model 1 | ||||||
![]() | Ploskon, E. / Arthur, C. / Crump, M.P. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Recognition of intermediate functionality by acyl carrier protein over a complete cycle of fatty acid biosynthesis 著者: Ploskon, E. / Arthur, C.J. / Kanari, A.L. / Wattana-amorn, P. / Williams, C. / Crosby, J. / Simpson, T.J. / Willis, C.L. / Crump, M.P. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 549.8 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 485 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 8793.774 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() 遺伝子: acpP, SCO2389, SC4A7.17 / プラスミド: Sc-apoFAS-pET21 / 発現宿主: ![]() ![]() |
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#2: 化合物 | ChemComp-SXO / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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試料調製
詳細 | 内容: 50mM potassium phosphate-1, 0.5mM sodium azide-2, 1mM octanoyl phosphopantetheine-3, 1mM [U-99% 13C; U-99% 15N] ACP-4, 95% H2O/5% D2O 溶媒系: 95% H2O/5% D2O | ||||||||||||||||||||
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試料 |
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試料状態 | イオン強度: 50 / pH: 7 / 圧: ambient / 温度: 298 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター |
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解析
NMR software |
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精密化 | 手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 1 詳細: 20 best structures from last iteration were selected for water refinement. Water refined structures were calculated using the slightly modified refinement script applied to the RECOORD database. | ||||||||||||||||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: closest to the average | ||||||||||||||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 20 / 代表コンフォーマー: 1 |