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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2fad | ||||||
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タイトル | Crystal structure of E. coli heptanoyl-ACP | ||||||
![]() | Acyl carrier protein | ||||||
![]() | BIOSYNTHETIC PROTEIN / acyl carrier protein / acyl chain binding / fatty acid biosynthesis | ||||||
機能・相同性 | ![]() lipid biosynthetic process / lipid A biosynthetic process / phosphopantetheine binding / acyl binding / acyl carrier activity / fatty acid biosynthetic process / response to xenobiotic stimulus / lipid binding / cytoplasm / cytosol 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Roujeinikova, A. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Structural Studies of Fatty Acyl-(Acyl Carrier Protein) Thioesters Reveal a Hydrophobic Binding Cavity that Can Expand to Fit Longer Substrates. 著者: Roujeinikova, A. / Simon, W.J. / Gilroy, J. / Rice, D.W. / Rafferty, J.B. / Slabas, A.R. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 50.4 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 35.4 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 754.9 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 739.4 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 11.4 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 15.7 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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2 | ![]()
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3 | ![]()
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単位格子 |
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Components on special symmetry positions |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 8514.264 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() ![]() #2: 化合物 | ChemComp-NA / | #3: 化合物 | ChemComp-ZN / #4: 化合物 | #5: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.17 Å3/Da / 溶媒含有率: 43.21 % |
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結晶化 | 温度: 290 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 6 詳細: 8-12% PEG 4000, 30 mM zinc acetate, 50 mM sodium cocadylate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 0.933 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 1.6→15 Å / Num. obs: 16351 / % possible obs: 80 % / Observed criterion σ(F): 0 / Observed criterion σ(I): 0 / 冗長度: 2.7 % / Biso Wilson estimate: 16 Å2 / Rmerge(I) obs: 0.056 / Net I/σ(I): 19.3 |
反射 シェル | 解像度: 1.6→1.66 Å / Rmerge(I) obs: 0.4 / Mean I/σ(I) obs: 2.2 / Num. unique all: 1477 / % possible all: 74 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]() 開始モデル: PDB 1L0I 解像度: 1.6→10 Å / σ(F): 0
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溶媒の処理 | Bsol: 60.276 Å2 | ||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | Biso mean: 21.289 Å2
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.6→10 Å
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拘束条件 |
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Xplor file |
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