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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1mer | ||||||
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タイトル | HIV-1 MUTANT (I84V) PROTEASE COMPLEXED WITH DMP450 | ||||||
![]() | HIV-1 PROTEASE | ||||||
![]() | ASPARTYL PROTEASE / HYDROLASE / ACID PROTEINASE | ||||||
機能・相同性 | ![]() HIV-1 retropepsin / retroviral ribonuclease H / exoribonuclease H / exoribonuclease H activity / host multivesicular body / DNA integration / viral genome integration into host DNA / RNA-directed DNA polymerase / establishment of integrated proviral latency / viral penetration into host nucleus ...HIV-1 retropepsin / retroviral ribonuclease H / exoribonuclease H / exoribonuclease H activity / host multivesicular body / DNA integration / viral genome integration into host DNA / RNA-directed DNA polymerase / establishment of integrated proviral latency / viral penetration into host nucleus / RNA stem-loop binding / RNA-directed DNA polymerase activity / host cell / RNA-DNA hybrid ribonuclease activity / 転移酵素; リンを含む基を移すもの; 核酸を移すもの / symbiont-mediated suppression of host gene expression / viral nucleocapsid / DNA recombination / DNA-directed DNA polymerase / 加水分解酵素; エステル加水分解酵素 / aspartic-type endopeptidase activity / DNA-directed DNA polymerase activity / symbiont entry into host cell / lipid binding / host cell nucleus / host cell plasma membrane / structural molecule activity / virion membrane / proteolysis / DNA binding / zinc ion binding / membrane 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Ala, P. / Chang, C.-H. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Molecular basis of HIV-1 protease drug resistance: structural analysis of mutant proteases complexed with cyclic urea inhibitors. 著者: Ala, P.J. / Huston, E.E. / Klabe, R.M. / McCabe, D.D. / Duke, J.L. / Rizzo, C.J. / Korant, B.D. / DeLoskey, R.J. / Lam, P.Y. / Hodge, C.N. / Chang, C.H. #1: ![]() タイトル: Erratum. Molecular Basis of HIV-1 Protease Drug Resistance: Structural Analysis of Mutant Proteases Complexed with Cyclic Urea Inhibitors 著者: Ala, P.J. / Huston, E.E. / Klabe, R.M. / Mccabe, D.D. / Duke, J.L. / Rizzo, C.J. / Korant, B.D. / Deloskey, R.J. / Lam, P.Y. / Hodge, C.N. / Chang, C.H. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 56.4 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 41.6 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 485 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 486.5 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 5.8 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 8.3 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 10775.703 Da / 分子数: 2 / 変異: I84V / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() 属: Lentivirus / 株: BH102 ISOLATE / 発現宿主: ![]() ![]() #2: 化合物 | ChemComp-DMQ / [ | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.2 Å3/Da / 溶媒含有率: 44.2 % | ||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS 温度: 18 ℃ / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / PH range low: 5.6 / PH range high: 5 | ||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
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放射波長 | 相対比: 1 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 1.9 Å / Num. obs: 14673 / % possible obs: 91.1 % / Num. measured all: 41830 / Rmerge(I) obs: 0.093 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 開始モデル: PDB ENTRY 1HVR Rfactor Rwork: 0.187 / Rfactor obs: 0.187 / 最高解像度: 1.9 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 最高解像度: 1.9 Å
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拘束条件 |
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精密化 | *PLUS σ(F): 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS |