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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1fnc | ||||||
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タイトル | REFINED CRYSTAL STRUCTURE OF SPINACH FERREDOXIN REDUCTASE AT 1.7 ANGSTROMS RESOLUTION: OXIDIZED, REDUCED, AND 2'-PHOSPHO-5'-AMP BOUND STATES | ||||||
![]() | FERREDOXIN-NADP+ REDUCTASE![]() | ||||||
![]() | OXIDOREDUCTASE (NADP+(A) / FERREDOXIN(A)) | ||||||
機能・相同性 | ![]() chloroplast thylakoid membrane protein complex / ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Bruns, C.M. / Karplus, P.A. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Refined crystal structure of spinach ferredoxin reductase at 1.7 A resolution: oxidized, reduced and 2'-phospho-5'-AMP bound states. 著者: Bruns, C.M. / Karplus, P.A. #1: ![]() タイトル: Atomic Structure of Ferredoxin-Nadp+ Reductase: Prototype for a Structurally Novel Flavoenzyme Family 著者: Karplus, P.A. / Daniels, M.J. / Herriott, J.R. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 80.2 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 59 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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Atom site foot note | 1: CIS PROLINE - PRO 150 |
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要素
#1: タンパク質 | ![]() 分子量: 35381.699 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() 参照: UniProt: P00455, ![]() |
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#2: 化合物 | ChemComp-SO4 / ![]() |
#3: 化合物 | ChemComp-FDA / |
#4: 化合物 | ChemComp-A2P / ![]() |
#5: 水 | ChemComp-HOH / ![]() |
非ポリマーの詳細 | COMPND PH 4.6, FAD IS CHEMICALLY |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.48 Å3/Da / 溶媒含有率: 50.38 % | ||||||||||||||||||
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結晶 | *PLUS 溶媒含有率: 49 % | ||||||||||||||||||
結晶化![]() | *PLUS 温度: 4 ℃ / pH: 4.9 / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 | ||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
反射 | *PLUS 最高解像度: 2 Å / Num. obs: 21432 / % possible obs: 89 % / Observed criterion σ(I): 3 / 冗長度: 1.7 % / Num. measured all: 44245 / Rmerge(I) obs: 0.059 |
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解析
ソフトウェア | 名称: TNT / バージョン: 5A / 分類: 精密化 | ||||||||||||||||||||||||||||||
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精密化 | 最高解像度: 2 Å / σ(I): 3 詳細: DURING REFINEMENT, THE MAXIMUM TEMPERATURE FACTOR ALLOWED WAS 100.00.
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 最高解像度: 2 Å
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拘束条件 |
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精密化 | *PLUS 最低解像度: 9999 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS Biso mean: 28 Å2 |