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- EMDB-11876: Cryo-EM structure of Arabidopsis thaliana complex-I (closed confo... -

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登録情報
データベース: EMDB / ID: EMD-11876
タイトルCryo-EM structure of Arabidopsis thaliana complex-I (closed conformation)
マップデータ
試料
  • 複合体: Cryo-EM structure of Arabidopsis thaliana complex-I (closed conformation)
    • タンパク質・ペプチド: x 47種
  • リガンド: x 14種
機能・相同性
機能・相同性情報


anther dehiscence / vegetative to reproductive phase transition of meristem / cold acclimation / NADH dehydrogenase complex / P450-containing electron transport chain / 付加脱離酵素（リアーゼ）; 炭素-酸素リアーゼ類; デヒドラターゼ類 / 光呼吸 / embryo development ending in seed dormancy / response to abscisic acid / plant-type vacuole ...anther dehiscence / vegetative to reproductive phase transition of meristem / cold acclimation / NADH dehydrogenase complex / P450-containing electron transport chain / 付加脱離酵素（リアーゼ）; 炭素-酸素リアーゼ類; デヒドラターゼ類 / 光呼吸 / embryo development ending in seed dormancy / response to abscisic acid / plant-type vacuole / ubiquinone-6 biosynthetic process / regulation of reactive oxygen species metabolic process / response to osmotic stress / respiratory chain complex I / 色素体 / cobalt ion binding / NADH:ユビキノン還元酵素 (水素イオン輸送型) / protein homotrimerization / mitochondrial respiratory chain complex I / mitochondrial electron transport, NADH to ubiquinone / mitochondrial respiratory chain complex I assembly / acyl binding / respirasome / NADH dehydrogenase (ubiquinone) activity / acyl carrier activity / quinone binding / ATP synthesis coupled electron transport / response to salt stress / respiratory electron transport chain / 葉緑体 / 電子伝達系 / ミトコンドリア / carbonate dehydratase activity / ミトコンドリア / transmembrane transport / 2 iron, 2 sulfur cluster binding / fatty acid biosynthetic process / ペルオキシソーム / NAD binding / FMN binding / 4 iron, 4 sulfur cluster binding / response to oxidative stress / ミトコンドリア内膜 / carbohydrate metabolic process / ミトコンドリアマトリックス / copper ion binding / protein-containing complex binding / 核小体 / ミトコンドリア / zinc ion binding / extracellular region / 生体膜 / identical protein binding / metal ion binding / 細胞核 / 細胞膜 / 細胞質基質
類似検索 - 分子機能
Putative NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 2, plant/fungi / At2g27730-like / NADH-ubiquinone oxidoreductase 11kDa subunit / NADH-ubiquinone oxidoreductase 11 kDa subunit / : / NADH-ubiquinone oxidoreductase, 21kDa subunit, N-terminal / NADH-ubiquinone oxidoreductase complex I, 21 kDa subunit / Adrenodoxin / NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 3, bacterial/plastid ...Putative NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 2, plant/fungi / At2g27730-like / NADH-ubiquinone oxidoreductase 11kDa subunit / NADH-ubiquinone oxidoreductase 11 kDa subunit / : / NADH-ubiquinone oxidoreductase, 21kDa subunit, N-terminal / NADH-ubiquinone oxidoreductase complex I, 21 kDa subunit / Adrenodoxin / NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 3, bacterial/plastid / NAD(P)H-quinone oxidoreductase, subunit N/subunit 2 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 6, mitochondrial / NADH-ubiquinone oxidoreductase, subunit 10 / NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit 10 / Hexapeptide repeat / Soluble ligand binding domain / NADH dehydrogenase [ubiquinone] (complex I), alpha subcomplex subunit 1 / NADH-ubiquinone oxidoreductase MWFE subunit / SLBB domain / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 10 / Zinc finger, CHCC-type / Zinc-finger domain / GRIM-19 / GRIM-19 protein / Bacterial transferase hexapeptide (six repeats) / NADH dehydrogenase subunit 5, C-terminal / NADH dehydrogenase subunit 5 C-terminus / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 3 / NADH-ubiquinone oxidoreductase B12 subunit family / NDUFA6, LYR domain / NADH:ubiquinone oxidoreductase, NDUFS5-15kDa / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 7, NDUB7 / NADH-ubiquinone oxidoreductase B18 subunit (NDUFB7) / NADH dehydrogenase ubiquinone Fe-S protein 4-like superfamily / NADH dehydrogenase ubiquinone Fe-S protein 4 / NADH dehydrogenase ubiquinone Fe-S protein 4, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] (complex I), alpha subcomplex, subunit 2 / NDUFB9, LYR domain / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12 / NADH ubiquinone oxidoreductase subunit NDUFA12 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 5 / NADH:ubiquinone oxidoreductase, iron-sulphur subunit 5 / ETC complex I subunit conserved region / NADH dehydrogenase [ubiquinone] (complex I), alpha subcomplex, subunit 6 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] (complex I), alpha subcomplex, subunit 8 / NADH-quinone oxidoreductase, chain G, C-terminal / NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit G, C-terminal / Respiratory-chain NADH dehydrogenase 20 Kd subunit signature. / NADH-ubiquinone oxidoreductase, 20 Kd subunit / NADH-quinone oxidoreductase, chain I / NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit D/H / NADH:ubiquinone oxidoreductase, 49kDa subunit, conserved site / Respiratory chain NADH dehydrogenase 49 Kd subunit signature. / NADH-quinone oxidoreductase, subunit D / Respiratory-chain NADH dehydrogenase, 49 Kd subunit / NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit G / Respiratory-chain NADH dehydrogenase 75 Kd subunit signature 3. / Respiratory-chain NADH dehydrogenase 75 Kd subunit signature 2. / NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6, subunit NuoJ / NADH dehydrogenase, subunit C / NADH ubiquinone oxidoreductase, F subunit / NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5 subgroup / NADH:ubiquinone oxidoreductase, 30kDa subunit, conserved site / Respiratory chain NADH dehydrogenase 30 Kd subunit signature. / Trimeric LpxA-like superfamily / NADH-quinone oxidoreductase, chain M/4 / 2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain / Respiratory-chain NADH dehydrogenase 75 Kd subunit signature 1. / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L/K / NADH:ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase, chain 6 / NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6 / NADH:ubiquinone oxidoreductase, 75kDa subunit, conserved site / NADH:ubiquinone oxidoreductase, 30kDa subunit / NADH-Ubiquinone oxidoreductase (complex I), chain 5 N-terminal / NADH-quinone oxidoreductase, chain 5-like / NADH:ubiquinone oxidoreductase, 30kDa subunit superfamily / Respiratory-chain NADH dehydrogenase, 30 Kd subunit / NADH-Ubiquinone oxidoreductase (complex I), chain 5 N-terminus / NADH-ubiquinone oxidoreductase-G iron-sulfur binding region / NADH-ubiquinone oxidoreductase-G iron-sulfur binding region / Respiratory-chain NADH dehydrogenase 51 Kd subunit signature 1. / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L/Mnh complex subunit C1-like / NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 4L / NADH:ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase, chain 3 / NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit 3 superfamily / NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase, chain 3 / Respiratory-chain NADH dehydrogenase 24 Kd subunit signature. / NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit 1, conserved site / Respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1 signature 1. / Respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1 signature 2. / NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit 1/F420H2 oxidoreductase subunit H / NADHデヒドロゲナーゼ / NuoE domain / CHCH / NADH:ubiquinone oxidoreductase / CHCH domain / NADH-quinone oxidoreductase subunit E-like / Thioredoxin-like [2Fe-2S] ferredoxin / NADH:quinone oxidoreductase/Mrp antiporter, membrane subunit
類似検索 - ドメイン・相同性
(thale cress) hypothetical protein / (thale cress) hypothetical protein / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 2 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L / (thale cress) hypothetical protein / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 5 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 2 ...(thale cress) hypothetical protein / (thale cress) hypothetical protein / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 2 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L / (thale cress) hypothetical protein / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 5 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 2 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 2, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 3-A / Acyl carrier protein 2, mitochondrial / Acyl carrier protein 1, mitochondrial / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 7, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8-A, mitochondrial / At4g16450 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 2 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8-B / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13-A / 膜貫通型タンパク質 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9 / Excitatory amino acid transporter / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 10-B / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3 / Gamma carbonic anhydrase 2, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 1 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 1, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 2 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial / Probable NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 5, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial / Gamma carbonic anhydrase 1, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 6 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 5-B / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 6, mitochondrial / Probable NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12 / Furry / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 7 / ESSS subunit of NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I) protein / Gamma carbonic anhydrase-like 2, mitochondrial / At2g46540/F11C10.23 / Uncharacterized protein At2g27730, mitochondrial
類似検索 - 構成要素
生物種Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ) / Mouse-ear cress (シロイヌナズナ)
手法単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.53 Å
データ登録者Klusch N / Kuelbrandt W / Yildiz O
資金援助 ドイツ, 1件
OrganizationGrant number国
Max Planck Society ドイツ
引用ジャーナル: Plant Cell / 年: 2021
タイトル: A ferredoxin bridge connects the two arms of plant mitochondrial complex I.
著者: Niklas Klusch / Jennifer Senkler / Özkan Yildiz / Werner Kühlbrandt / Hans-Peter Braun /
要旨: Mitochondrial complex I is the main site for electron transfer to the respiratory chain and generates much of the proton gradient across the inner mitochondrial membrane. Complex I is composed of two ...Mitochondrial complex I is the main site for electron transfer to the respiratory chain and generates much of the proton gradient across the inner mitochondrial membrane. Complex I is composed of two arms, which form a conserved L-shape. We report the structures of the intact, 47-subunit mitochondrial complex I from Arabidopsis thaliana and the 51-subunit complex I from the green alga Polytomella sp., both at around 2.9 Å resolution. In both complexes, a heterotrimeric γ-carbonic anhydrase domain is attached to the membrane arm on the matrix side. Two states are resolved in A. thaliana complex I, with different angles between the two arms and different conformations of the ND1 (NADH dehydrogenase subunit 1) loop near the quinol binding site. The angle appears to depend on a bridge domain, which links the peripheral arm to the membrane arm and includes an unusual ferredoxin. We propose that the bridge domain participates in regulating the activity of plant complex I.
履歴
登録2020年10月23日-
ヘッダ(付随情報) 公開2021年12月15日-
マップ公開2021年12月15日-
更新2021年12月15日-
現状2021年12月15日処理サイト: PDBe / 状態: 公開

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構造の表示

ムービー
  • 表面図（断面を密度値に従い着色）
  • 表面レベル: 0.011
  • UCSF Chimeraによる作画
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  • 表面レベル: 0.011
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  • 原子モデル: PDB-7ar8
  • 表面レベル: 0.011
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ムービービューア
構造ビューアEMマップ:
SurfViewMolmilJmol/JSmol
添付画像

emd_11876.png

ダウンロードとリンク

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マップ

ファイルダウンロード / ファイル: emd_11876.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 824 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
ボクセルのサイズX=Y=Z: 0.837 Å
密度
表面レベル登録者による: 0.011 / ムービー #1: 0.011
最小 - 最大-0.03772901 - 0.118650965
平均 (標準偏差)6.4309934e-05 (±0.0010541334)
対称性空間群: 1
詳細

EMDB XML:

マップ形状
Axis orderXYZ
Origin000
サイズ600600600
Spacing600600600
セルA=B=C: 502.2 Å
α=β=γ: 90.0 °

CCP4マップ ヘッダ情報:

modeImage stored as Reals
Å/pix. X/Y/Z0.8370.8370.837
M x/y/z600600600
origin x/y/z0.0000.0000.000
length x/y/z502.200502.200502.200
α/β/γ90.00090.00090.000
MAP C/R/S123
start NC/NR/NS000
NC/NR/NS600600600
D min/max/mean-0.0380.1190.000

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添付データ

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ハーフマップ: #2

ファイルemd_11876_half_map_1.map
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

-
ハーフマップ: #1

ファイルemd_11876_half_map_2.map
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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試料の構成要素

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全体 : Cryo-EM structure of Arabidopsis thaliana complex-I (closed confo...

全体名称: Cryo-EM structure of Arabidopsis thaliana complex-I (closed conformation)
要素
  • 複合体: Cryo-EM structure of Arabidopsis thaliana complex-I (closed conformation)
    • タンパク質・ペプチド: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 7, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase subunit 7NADHデヒドロゲナーゼ
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 2, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 1, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8-A, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase subunit 4LNADHデヒドロゲナーゼ
    • タンパク質・ペプチド: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 5
    • タンパク質・ペプチド: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4
    • タンパク質・ペプチド: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 2
    • タンパク質・ペプチド: AT3G07480.1
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 6, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 2
    • タンパク質・ペプチド: Acyl carrier protein 1, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: Acyl carrier protein 2, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: Probable NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 5, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 6
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8-B
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13-A
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 1
    • タンパク質・ペプチド: At2g46540/F11C10.23
    • タンパク質・ペプチド: Transmembrane protein膜貫通型タンパク質
    • タンパク質・ペプチド: Excitatory amino acid transporter
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 5-B
    • タンパク質・ペプチド: At4g16450
    • タンパク質・ペプチド: ESSS subunit of NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I) protein
    • タンパク質・ペプチド: P1
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 2
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 3-A
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: B15 -- 1 beta subcomplex subunit 4
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 7
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 10-B
    • タンパク質・ペプチド: Probable NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12
    • タンパク質・ペプチド: Furry
    • タンパク質・ペプチド: unknown
    • タンパク質・ペプチド: Uncharacterized protein At2g27730, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: Gamma carbonic anhydrase-like 2, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: Gamma carbonic anhydrase 2, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: Gamma carbonic anhydrase 1, mitochondrial
  • リガンド: IRON/SULFUR CLUSTER鉄・硫黄クラスター
  • リガンド: FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER
  • リガンド: FLAVIN MONONUCLEOTIDEフラビンモノヌクレオチド
  • リガンド: Ubiquinone-9ユビキノン
  • リガンド: PHOSPHATIDYLETHANOLAMINEホスファチジルエタノールアミン
  • リガンド: (7S)-4-HYDROXY-N,N,N-TRIMETHYL-9-OXO-7-[(PALMITOYLOXY)METHYL]-3,5,8-TRIOXA-4-PHOSPHAHEXACOSAN-1-AMINIUM 4-OXIDE
  • リガンド: (1S)-2-{[{[(2R)-2,3-DIHYDROXYPROPYL]OXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(PALMITOYLOXY)METHYL]ETHYL STEARATE
  • リガンド: FE (III) ION
  • リガンド: NADPH DIHYDRO-NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE
  • リガンド: ZINC ION
  • リガンド: S-[2-({N-[(2R)-2-hydroxy-3,3-dimethyl-4-(phosphonooxy)butanoyl]-beta-alanyl}amino)ethyl] dodecanethioate
  • リガンド: Lauryl Maltose Neopentyl Glycol
  • リガンド: 1,2-DICAPROYL-SN-PHOSPHATIDYL-L-SERINE
  • リガンド: Phosphatidylinositolホスファチジルイノシトール

+
超分子 #1: Cryo-EM structure of Arabidopsis thaliana complex-I (closed confo...

超分子名称: Cryo-EM structure of Arabidopsis thaliana complex-I (closed conformation)
タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#47
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)

+
分子 #1: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3

分子名称: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
EC番号: NADH:ユビキノン還元酵素 (水素イオン輸送型)
由来(天然)生物種: Mouse-ear cress (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 13.941387 KDa
配列文字列:
MMLEFAPIFI YLVISLLVSL ILLGVPFLFA SNSSTYPEKL SAYECGFDPF GDARSRFDIR FYLVSILFLI FDLEVTFFFP WAVSLNKID LFGFWSMMAF LFILTIGFLY EWKRGALDWE

+
分子 #2: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 7, mitochondrial

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 7, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
EC番号: NADH:ユビキノン還元酵素 (水素イオン輸送型)
由来(天然)生物種: Mouse-ear cress (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 24.071949 KDa
配列文字列: MAMITRNTAT RLPLLLQSQR AVAAASVSHL HTSLPALSPS TSPTSYTRPG PPSTSPPPPG LSKAAEFVIS KVDDLMNWAR TGSIWPMTF GLACCAVEMM HTGAARYDLD RFGIIFRPSP RQSDCMIVAG TLTNKMAPAL RKVYDQMPEP RWVISMGSCA N GGGYYHYS ...文字列:
MAMITRNTAT RLPLLLQSQR AVAAASVSHL HTSLPALSPS TSPTSYTRPG PPSTSPPPPG LSKAAEFVIS KVDDLMNWAR TGSIWPMTF GLACCAVEMM HTGAARYDLD RFGIIFRPSP RQSDCMIVAG TLTNKMAPAL RKVYDQMPEP RWVISMGSCA N GGGYYHYS YSVVRGCDRI VPVDIYVPGC PPTAEALLYG LLQLQKKINR RKDFLHWWNK

+
分子 #3: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3
タイプ: protein_or_peptide / ID: 3 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
EC番号: NADH:ユビキノン還元酵素 (水素イオン輸送型)
由来(天然)生物種: Mouse-ear cress (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 22.91091 KDa
配列文字列: MDNQFIFKYS WETLPKKWVK KMERSEHGNR FDTNTDYLFQ LLCFLKLHTY TRVQVLIDIC GVDYPSRKRR FEVVYNLLST RYNSRIRVQ TSADEVTRIS SVVSLFPSAG WWEREVWDMF GVSFINHPDL RRILTDYGFE GHPLRKDFPL SGYVQVRYDD P EKRVVSEP ...文字列:
MDNQFIFKYS WETLPKKWVK KMERSEHGNR FDTNTDYLFQ LLCFLKLHTY TRVQVLIDIC GVDYPSRKRR FEVVYNLLST RYNSRIRVQ TSADEVTRIS SVVSLFPSAG WWEREVWDMF GVSFINHPDL RRILTDYGFE GHPLRKDFPL SGYVQVRYDD P EKRVVSEP IEMTQEFRYF DFASPWEQRS DG

+
分子 #4: NADH dehydrogenase subunit 7

分子名称: NADH dehydrogenase subunit 7 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 4 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mouse-ear cress (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 45.036844 KDa
配列文字列: MTTRKRQIKN FTLNFGPQHP AAHGVLRLVL EMNGEVVERA EPHIGLLHRG TEKLIEYKTY LQALPYFDRL DYVSMMAQEH AYSLAVEKL LNCEVPLRAQ YIRVLFCEIT RILNHLLALT THAMDVGALT PFLWAFEERE KLLEFYERVS GARMHASFIR P GGVAQDLP ...文字列:
MTTRKRQIKN FTLNFGPQHP AAHGVLRLVL EMNGEVVERA EPHIGLLHRG TEKLIEYKTY LQALPYFDRL DYVSMMAQEH AYSLAVEKL LNCEVPLRAQ YIRVLFCEIT RILNHLLALT THAMDVGALT PFLWAFEERE KLLEFYERVS GARMHASFIR P GGVAQDLP LGLCRDIDSF TQQFASRIDE LEEMLTGNRI WKQRLVDIGT VTAQQAKDWG FSGVMLRGSG VCWDLRRAAP YD VYDQLDF DVPVGTRGDC YDRYCIRIEE MRQSLRIIVQ CLNQMPSGMI KADDRKLCPP SRCRMKLSME SLIHHFELYT EGF SVPASS TYTAVEAPKG EFGVFLVSNG SNRPYRCKIR APGFAHSQGL DFMSKHHMLA DVVTIIGTQD IVFGEVDR

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分子 #5: NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 2, mitochondrial

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 2, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 5 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
EC番号: NADH:ユビキノン還元酵素 (水素イオン輸送型)
由来(天然)生物種: Mouse-ear cress (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 28.423607 KDa
配列文字列: MLARLAAKRL LEIRQVFRQP TSQVTRSLST ALNYHLDSPD NKPDLPWEFS EANQSKVKEI LSYYPSNYKQ SAVIPLLDLA QQQNGGWLP VSAMNAVAKV IEVAPIRVYE VATFYSMFNR AKVGKYHLLV CGTTPCMIRG SRDIESALLD HLGVKRGEVT K DGLFSVGE ...文字列:
MLARLAAKRL LEIRQVFRQP TSQVTRSLST ALNYHLDSPD NKPDLPWEFS EANQSKVKEI LSYYPSNYKQ SAVIPLLDLA QQQNGGWLP VSAMNAVAKV IEVAPIRVYE VATFYSMFNR AKVGKYHLLV CGTTPCMIRG SRDIESALLD HLGVKRGEVT K DGLFSVGE MECMGCCVNA PMITVADYSN GSEGYTYNYF EDVTPEKVVE IVEKLRKGEK PPHGTQNPKR IKCGPEGGNK TL LGEPKPP QFRDLDAC

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分子 #6: NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 6 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
EC番号: NADH:ユビキノン還元酵素 (水素イオン輸送型)
由来(天然)生物種: Mouse-ear cress (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 53.522418 KDa
配列文字列: MAPVRGILGL QRAVSIWKES NRLTPALRSF STQAASTSTT PQPPPPPPPP EKTHFGGLKD EDRIFTNLYG LHDPFLKGAM KRGDWHRTK DLVLKGTDWI VNEMKKSGLR GRGGAGFPSG LKWSFMPKVS DGRPSYLVVN ADESEPGTCK DREIMRHDPH K LLEGCLIA ...文字列:
MAPVRGILGL QRAVSIWKES NRLTPALRSF STQAASTSTT PQPPPPPPPP EKTHFGGLKD EDRIFTNLYG LHDPFLKGAM KRGDWHRTK DLVLKGTDWI VNEMKKSGLR GRGGAGFPSG LKWSFMPKVS DGRPSYLVVN ADESEPGTCK DREIMRHDPH K LLEGCLIA GVGMRASAAY IYIRGEYVNE RLNLEKARRE AYAAGLLGKN ACGSGYDFEV YIHFGAGAYI CGEETALLES LE GKQGKPR LKPPFPANAG LYGCPTTVTN VETVAVSPTI LRRGPEWFSS FGRKNNAGTK LFCISGHVNK PCTVEEEMSI PLK ELIERH CGGVRGGWDN LLAIIPGGSS VPLIPKNICE DVLMDFDALK AVQSGLGTAA VIVMDKSTDV VDAIARLSYF YKHE SCGQC TPCREGTGWL WMIMERMKVG NAKLEEIDML QEVTKQIEGH TICALGDAAA WPVQGLIRHF RPELERRIRE RAERE LLQA AA

+
分子 #7: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 1, mitochondrial

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 1, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 7 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
EC番号: NADH:ユビキノン還元酵素 (水素イオン輸送型)
由来(天然)生物種: Mouse-ear cress (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 81.619367 KDa
配列文字列: MGLGILASRT IRPASRLLQS QTSNFFLRTI VSKPELQSPE SAAVSEPEPP TQILPPRNPV GGARVHFSNP EDAIEVFVDG YAVKVPKGF TVLQACEVAG VDIPRFCYHS RLSIAGNCRM CLVEVEKSPK PVASCAMPAL PGMKIKTDTP IAKKAREGVM E FLLMNHPL ...文字列:
MGLGILASRT IRPASRLLQS QTSNFFLRTI VSKPELQSPE SAAVSEPEPP TQILPPRNPV GGARVHFSNP EDAIEVFVDG YAVKVPKGF TVLQACEVAG VDIPRFCYHS RLSIAGNCRM CLVEVEKSPK PVASCAMPAL PGMKIKTDTP IAKKAREGVM E FLLMNHPL DCPICDQGGE CDLQDQSMAF GSDRGRFTEM KRSVVDKNLG PLVKTVMTRC IQCTRCVRFA SEVAGVQDLG IL GRGSGEE IGTYVEKLMT SELSGNVIDI CPVGALTSKP FAFKARNWEL KATETIDVSD AVGSNIRVDS RGPEVMRIIP RLN EDINEE WISDKTRFCY DGLKRQRLSD PMIRDSDGRF KAVSWRDALA VVGDIIHQVK PDEIVGVAGQ LSDAESMMVL KDFV NRMGS DNVWCEGTAA GVDADLRYSY LMNTSISGLE NADLFLLIGT QPRVEAAMVN ARICKTVRAS NAKVGYVGPP AEFNY DCKH LGTGPDTLKE IAEGRHPFCT ALKNAKNPAI IVGAGLFNRT DKNAILSSVE SIAQANNVVR PDWNGLNFLL QYAAQA AAL DLGLIQQSAK ALESAKFVYL MGADDVNVDK IPKDAFVVYQ GHHGDKAVYR ANVILPASAF TEKEGTYENT EGFTQQT VP AVPTVGDARD DWKIVRALSE VSGVKLPYNS IEGVRSRIKS VAPNLVHTDE REPAAFGPSL KPECKEAMST TPFQTVVE N FYMTNSITRA SKIMAQCSAV LLKKPFV

+
分子 #8: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1

分子名称: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 8 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
EC番号: NADH:ユビキノン還元酵素 (水素イオン輸送型)
由来(天然)生物種: Mouse-ear cress (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 36.02007 KDa
配列文字列: MYIAVPAEIL GIILPLLLGV AFLVLAERKV MAFVQRRKGP DVVGSFGLLQ PLADGLKLIL KEPISPSSAN FFLFRMAPVA TFMLSLVAW AVVPFDYGMV LSDLNIGLLY LFAISSLGVY GIIIAGRSSN SKYAFLGALR SAAQMVSYEV SIGLILITVL I CVGSCNLS ...文字列:
MYIAVPAEIL GIILPLLLGV AFLVLAERKV MAFVQRRKGP DVVGSFGLLQ PLADGLKLIL KEPISPSSAN FFLFRMAPVA TFMLSLVAW AVVPFDYGMV LSDLNIGLLY LFAISSLGVY GIIIAGRSSN SKYAFLGALR SAAQMVSYEV SIGLILITVL I CVGSCNLS EIVMAQKQIW FGIPLFPVLV MFFISCLAET NRAPFDLPEA EAELVAGYNV EYSSMGFALF FLGEYANMIL MS GLCTLFF LGGWLPILDL PIFKKIPGSI WFSIKVLFFL FLYIWVRAAF PRYRYDQLMG LGWKVFLPLS LAWVVSVSGL LVT FQWLP

+
分子 #9: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8-A, mitochondrial

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8-A, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 9 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
EC番号: NADH:ユビキノン還元酵素 (水素イオン輸送型)
由来(天然)生物種: Mouse-ear cress (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 25.536801 KDa
配列文字列: MASILARRSL NTLRARHLVL SGQALQGSHL SRLQSRGISY GSNKDDEEAE QLSKEISKDW NTVFERSINT LFLTEMVRGL SLTLKYFFD PKVTINYPFE KGPLSPRFRG EHALRRYPTG EERCIACKLC EAVCPAQAIT IEAEEREDGS RRTTRYDIDM T KCIYCGFC ...文字列:
MASILARRSL NTLRARHLVL SGQALQGSHL SRLQSRGISY GSNKDDEEAE QLSKEISKDW NTVFERSINT LFLTEMVRGL SLTLKYFFD PKVTINYPFE KGPLSPRFRG EHALRRYPTG EERCIACKLC EAVCPAQAIT IEAEEREDGS RRTTRYDIDM T KCIYCGFC QEACPVDAIV EGPNFEFATE THEELLYDKE KLLENGDRWE TEIAENLRSE SLYR

+
分子 #10: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6

分子名称: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 10 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
EC番号: NADH:ユビキノン還元酵素 (水素イオン輸送型)
由来(天然)生物種: Mouse-ear cress (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 23.690385 KDa
配列文字列: MILSVLSSLA LVSGLMVVRA KNPVHSVLFF ILVFCDTSGL LLLLGLDFFA MIFLVVYIGA IAVLFLFVVM MFHIQIAEIH EEVLRYLPV SGIIGLIFWW EMFFILDNES IPLLPTQRNT TSLRYTVYAG KVRSWTNLET LGNLLYTYYF VWFLVSSLIL L VAMIGAIV ...文字列:
MILSVLSSLA LVSGLMVVRA KNPVHSVLFF ILVFCDTSGL LLLLGLDFFA MIFLVVYIGA IAVLFLFVVM MFHIQIAEIH EEVLRYLPV SGIIGLIFWW EMFFILDNES IPLLPTQRNT TSLRYTVYAG KVRSWTNLET LGNLLYTYYF VWFLVSSLIL L VAMIGAIV LTMHRTTKVK RQDVFRRNAI DFRRTIMRRT TDPLTIY

+
分子 #11: NADH dehydrogenase subunit 4L

分子名称: NADH dehydrogenase subunit 4L / タイプ: protein_or_peptide / ID: 11 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mouse-ear cress (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 11.165549 KDa
配列文字列:
MDLIKYFTFS MIIFILGIWG ILLNRRNILI MLMSIELMLL AVNLNFLVFS VSLDDMMGQV FALLVLTVAA AESAIGLAIF VITFRVRGT IAVEFINSIQ G

+
分子 #12: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 5

分子名称: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 12 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
EC番号: NADH:ユビキノン還元酵素 (水素イオン輸送型)
由来(天然)生物種: Mouse-ear cress (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 74.497977 KDa
配列文字列: MYLLIVFLPL LGSSVAGFFG RFLGSEGSAI MTTTCVSFSS ILSLIAFYEV ALGASACYLR IAPWISSEMF DASWGFLFDS LTVVMLIVV TFISSLVHLY SISYMSEDPH SPRFMCYLSI FTFFMLMLVT GDNFLQLFLG WEGVGLASYL LIHFWFTRLQ A DKAAIKAM ...文字列:
MYLLIVFLPL LGSSVAGFFG RFLGSEGSAI MTTTCVSFSS ILSLIAFYEV ALGASACYLR IAPWISSEMF DASWGFLFDS LTVVMLIVV TFISSLVHLY SISYMSEDPH SPRFMCYLSI FTFFMLMLVT GDNFLQLFLG WEGVGLASYL LIHFWFTRLQ A DKAAIKAM LVNRVGDFGL ALGILGCFTL FQTVDFSTIF ACASVPRNSW IFCNMRLNAI SLICILLFIG AVGKSAQIGL HT WLPDAME GPTPVSALIH AATMVTAGVF MIARCSPLFE YSPTALIVIT FAGAMTSFLA ATTGILQNDL KRVIAYSTCS QLG YMIFAC GISNYSVSVF HLMNHAFFKA LLFLSAGSVI HAMSDEQDMR KMGGLASSFP LTYAMMLIGS LSLIGFPFLT GFYS KDVIL ELAYTKYTIS GNFAFWLGSV SVLFTSYYSF RLLFLTFLVP TNSFGRDISR CHDAPIPMAI PLILLALGSL FVGYL AKDM MIGLGTNFWA NSLLVLPKNE ILAESEFAAP TIIKLIPILF STLGAFVAYN VNLVADQFQR AFQTSTFCNR LYSFFN KRW FFDQVLNDFL VRSFLRFGYE VSFEALDKGA IEILGPYGIS YTFRRLAERI SQLQSGFVYH YAFAMLLGLT LFVTFFC MW DSLSSWVDNR LSFILIVSSF YTKSSQE

+
分子 #13: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4

分子名称: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 13 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
EC番号: NADH:ユビキノン還元酵素 (水素イオン輸送型)
由来(天然)生物種: Mouse-ear cress (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 55.995664 KDa
配列文字列: MLEHFCECYF NLSGLILCPV LGSIILLFIP NSRIRLIRLI GLCASLITFL YSLVLWIQFD SSTAKFQFVE SLRWLPYENI NFYLGIDGI SLFFVILTTF LIPICILVGW SGMRSYGKEY IIAFLICEFL MIAVFCMLDL LLFYVFFESV LIPMFIIIGV W GSRQRKIK ...文字列:
MLEHFCECYF NLSGLILCPV LGSIILLFIP NSRIRLIRLI GLCASLITFL YSLVLWIQFD SSTAKFQFVE SLRWLPYENI NFYLGIDGI SLFFVILTTF LIPICILVGW SGMRSYGKEY IIAFLICEFL MIAVFCMLDL LLFYVFFESV LIPMFIIIGV W GSRQRKIK AAYQFFLYTL LGSLFMLLAI LLILFQTGTT DLQILLTTEF SERRQIFLWI AFFASFAVKV PMVPVHIWLP EA HVEAPTA GSVILAGILL KFGTYGFLRF SIPMFPEATL CFTPFIYTLS AIAIIYTSLT TLRQIDLKKI IAYSSVAHMN LVT IGMFSL NIQGIGGSIL LMLSHGLVSS ALFLCVGVLY DRHKTRLVRY YGGLVSTMPN FSTIFFFFTL ANMSLPGTSS FIGE FLILV GAFQRNSLVA TLAALGMILG AAYSLWLYNR VVSGNLKPDF LHKFSDLNGR EVFIFIPFLV GLVWMGVYPK VFLDC MHTS VSNLVQHGKF H

+
分子 #14: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 2

分子名称: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 14 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
EC番号: NADH:ユビキノン還元酵素 (水素イオン輸送型)
由来(天然)生物種: Mouse-ear cress (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 55.486836 KDa
配列文字列: MKAEFVRILP HMFNLFLAVF PEIFIINATF ILLIHGVVFS TSKKYDYPPL ASNVGWLGLL SVLITLLLLA AGAPLLTIAH LFWNNLFRR DNFTYFCQIF LLLSTAGTIS MCFDFFDQER FDAFEFIVLI LLSTCGMLFM ISAYDLIAMY LAIELQSLCF Y VIAASKRK ...文字列:
MKAEFVRILP HMFNLFLAVF PEIFIINATF ILLIHGVVFS TSKKYDYPPL ASNVGWLGLL SVLITLLLLA AGAPLLTIAH LFWNNLFRR DNFTYFCQIF LLLSTAGTIS MCFDFFDQER FDAFEFIVLI LLSTCGMLFM ISAYDLIAMY LAIELQSLCF Y VIAASKRK SEFSTEAGLK YLILGAFSSG ILLFGCSMIY GSTGATHFDQ LAKILTGYEI TGARSSGIFM GILFIAVGFL FK ITAVPFH MWAPDIYEGS PTPVTAFLSI APKISIFANI LRVFIYGSYG ATLQQIFFFC SIASMILGAL AAMAQTKVKR LLA YSSIGH VGYICIGFSC GTIEGIQSLL IGIFIYALMT MDAFAIVLAL RQTRVKYIAD LGALAKTNPI LAITFSITMF SYAG IPPLA GFCSKFYLFF AALGCGAYFL ALVGVVTSVI GCFYYIRLVK RMFFDTPRTW ILYEPMDRNK SLLLAMTSFF ITLFL LYPS PLFSVTHQMA LSLYL

+
分子 #15: AT3G07480.1

分子名称: AT3G07480.1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 15 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mouse-ear cress (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 17.626197 KDa
配列文字列:
MATTLQKLSS QIHRLSPFTR SLIVRTSATS APSPSLGSKK VSDRIVKLSA IDPDGYKQDI IGLSGQTLLR ALTHTGLIDP ASHRLDDIE ACSAECEVQI AEEWLEKLPP RTYDEEYVLK RSSRSRILNK HSRLGCQVVL TQELQGMVVA VPEAKPWDIP

+
分子 #16: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mit...

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 16 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mouse-ear cress (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 43.988652 KDa
配列文字列: MQVVSRRLVQ RPLVGGASIY SSSSLRSLYG VSNHLNGTDN CRYSSSLATK GVGHLARKGT GGRSSVSGIV ATVFGATGFL GRYLVQQLA KMGSQVLVPF RGSEDSPRHL KLMGDLGQVV PMKFDPRDED SIKAVMAKAN VVINLIGREY ETRNFSFEDA N HHIAEKLA ...文字列:
MQVVSRRLVQ RPLVGGASIY SSSSLRSLYG VSNHLNGTDN CRYSSSLATK GVGHLARKGT GGRSSVSGIV ATVFGATGFL GRYLVQQLA KMGSQVLVPF RGSEDSPRHL KLMGDLGQVV PMKFDPRDED SIKAVMAKAN VVINLIGREY ETRNFSFEDA N HHIAEKLA LVAKEHGGIM RYIQVSCLGA SVSSPSRMLR AKAAAEEAVL NALPEATIMR PATMIGTEDR ILNPWSMFVK KY GFLPLIG GGTTKFQPVY VVDVAAAIVA ALKDDGSSMG KTYELGGPDV FTTHELAEIM YDMIREWPRY VKLPFPIAKA MAA PRDFMV NKVPFPLPSP QIFNLDQINA LTTDTLVSDN ALKFQDLDLV PHKLKGYPVE FLIQYRKGGP NFGSTVSEKI PTDF YP

+
分子 #17: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 17 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mouse-ear cress (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 17.160445 KDa
配列文字列:
MALCATTQRT IRIAATLRRV ARPFATDAVV ESDYKRGEIG KVSGIPEEHL SRKVIIYSPA RTATQSGSGK LGKWKINFVS TLKWENPLM GWTSTGDPYA NVGDSALAFD SEEAAKSFAE RHGWDYKVKK PNTPLLKVKS YSDNFKWKGN PQPEN

+
分子 #18: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 6, mitochondrial

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 6, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 18 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mouse-ear cress (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 12.251122 KDa
配列文字列:
MASNLLKALI RSQILPSSRR NFSVATTQLG IPTDDLVGNH TAKWMQDRSK KSPMELISEV PPIKVDGRIV ACEGDTNPAL GHPIEFICL DLNEPAICKY CGLRYVQDHH H

+
分子 #19: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 2

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 2
タイプ: protein_or_peptide / ID: 19 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mouse-ear cress (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 10.865765 KDa
配列文字列:
MAWRGSISKS MKELRILLCQ SSPASAPTRT FVEKNYKDLK SLNPKLPILI RECSGVQPQM WARYDMGVER CVNLDGLTEP QILKALENL VKSGATKA

+
分子 #20: Acyl carrier protein 1, mitochondrial

分子名称: Acyl carrier protein 1, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 20 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mouse-ear cress (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 13.735628 KDa
配列文字列:
MALRNAILRH LRVPVQTLGL NQSKIGFLGT IRSFSSHDDH LSREAVVDRV LDVVKSFPKV DPSKVTPEVH FQNDLGLDSL DTVEIVMAI EEEFKLEIPD KEADKIDSCS LAIEYVYNHP MSS

+
分子 #21: Acyl carrier protein 2, mitochondrial

分子名称: Acyl carrier protein 2, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 21 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mouse-ear cress (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 14.183111 KDa
配列文字列:
MAARGAMLRY LRVNVNPTIQ NPRECVLPFS ILLRRFSEEV RGSFLDKSEV TDRVLSVVKN FQKVDPSKVT PKANFQNDLG LDSLDSVEV VMALEEEFGF EIPDNEADKI QSIDLAVDFI ASHPQAK

+
分子 #22: Probable NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subun...

分子名称: Probable NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 5, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 22 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mouse-ear cress (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 19.201906 KDa
配列文字列:
MFLRAIGRPL LAKVKQTTGI VGLDVVPNAR AVLIDLYSKT LKEIQAVPED EGYRKAVESF TRQRLNVCKE EEDWEMIEKR LGCGQVEEL IEEARDELTL IGKMIEWDPW GVPDDYECEV IENDAPIPKH VPQHRPGPLP EQFYKTLEGL IAESKTEIPA A TPSDPQLK E

+
分子 #23: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 6

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 6
タイプ: protein_or_peptide / ID: 23 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mouse-ear cress (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 15.102261 KDa
配列文字列:
MAAPFALRKI GVPPNSANLT EARRRVFDFF RAACRSIPTI MDIYNLQDVV APSQLRYAIS AQIRNNAHIT DPKVIDLLIF KGMEELTDI VDHAKQRHHI IGQYVVGEGL VQNTGNKDQG KTDFLKNFYT SNYF

+
分子 #24: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8-B

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8-B
タイプ: protein_or_peptide / ID: 24 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mouse-ear cress (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 11.985954 KDa
配列文字列:
MSSAVDATGN PIPTSAVLTA SAKHIGMRCM PENVAFLKCK KNDPNPEKCL DKGRDVTRCV LGLLKDLHQK CQKEMDDYVG CMYYYTNEF DLCRKEQEAF EKVCPLK

+
分子 #25: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13-A

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13-A
タイプ: protein_or_peptide / ID: 25 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mouse-ear cress (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 16.145584 KDa
配列文字列:
MTEAMIRNKP GMASVKDMPL LQDGPPPGGF APVRYARRIS NTGPSAMAMF LAVSGAFAWG MYQVGQGNKI RRALKEEKYA ARRTILPIL QAEEDERFVS EWKKYLEYEA DVMKDVPGWK VGENVYNSGR WMPPATGELR PDVW

+
分子 #26: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 1

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 1
タイプ: protein_or_peptide / ID: 26 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mouse-ear cress (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 7.349628 KDa
配列文字列:
MSLVWLEAML PLGIIGGMLC IMGNSQYYIH KAYHGRPKHI GHDEWDVAME RRDKKVVEKA AAPSS

+
分子 #27: At2g46540/F11C10.23

分子名称: At2g46540/F11C10.23 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 27 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mouse-ear cress (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 6.810177 KDa
配列文字列:
MPVMEKLRMF VAQEPVVAAS CLIGGVGLFL PAVVRPILDS LEASKQVKAP PLTDVIAGVT GKKQS

+
分子 #28: Transmembrane protein

分子名称: Transmembrane protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 28 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mouse-ear cress (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 9.876422 KDa
配列文字列:
MGGGDHGHGA EGGDFRAKVW SMTGGPNCRP KHWRRNTAIA MFGVFLVCIP IAKLSAKLEQ RPHMPVRPIP SQIWCKNFGT KDDYEKEH

+
分子 #29: Excitatory amino acid transporter

分子名称: Excitatory amino acid transporter / タイプ: protein_or_peptide / ID: 29 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mouse-ear cress (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 9.220749 KDa
配列文字列:
MPISATMVGA LLGLGTQMYS NALRKLPYMR HPWEHVVGMG LGAVFANQLV KWDVKLKEDL DVMLAKARAA NERRYFDEDR D

+
分子 #30: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 5-B

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 5-B
タイプ: protein_or_peptide / ID: 30 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mouse-ear cress (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 9.914133 KDa
配列文字列:
MASGWGITGN KGRCYDFWMD FSECMSHCRE PKDCTLLRED YLECLHHSKE FQRRNRIYKE EQRKLRAASR KGEETGDGTH THH

+
分子 #31: At4g16450

分子名称: At4g16450 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 31 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mouse-ear cress (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 11.355008 KDa
配列文字列:
MNTDITALEK AQYPVVDRNP AFTKVVGNFS TLDYLRFSTI TGISVTVGYL SGIKPGIKGP SMVTGGLIGL MGGFMYAYQN SAGRLMGFF PNDGEVASYQ KRGGFSK

+
分子 #32: ESSS subunit of NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I) protein

分子名称: ESSS subunit of NADH:ubiquinone oxidoreductase (Complex I) protein
タイプ: protein_or_peptide / ID: 32 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mouse-ear cress (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 12.648286 KDa
配列文字列:
MPSTQSLTVA AKTLRNRIFS RSGSTSAGPS RWATPGHEER PKGYFMNRTP PAPGQSRKWE DWELPCYITS FLTIVILGVG LNAKPDLSI ETWAHQKALE RLEMEKLATA GDSSD

+
分子 #33: P1

分子名称: P1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 33 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mouse-ear cress (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 11.808244 KDa
配列文字列:
MGFIMEFAEN LVLRLMENPE ERDRKAREHI YEMHERCKKI KEMWALPIRP YGFWTFERHN AQLRWDPQIS QVAGRRDPYD DLLEDNYTP PSSSSSSSD

+
分子 #34: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 2

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 2
タイプ: protein_or_peptide / ID: 34 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mouse-ear cress (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 7.58259 KDa
配列文字列:
MGGGGHGGGI TYKGVTVHTP KTWHTVTGKG LCAVMWFWIL YRAKQDGPVV MGWRHPWDGH GDHGHGDHH

+
分子 #35: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 3-A

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 3-A
タイプ: protein_or_peptide / ID: 35 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mouse-ear cress (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 8.064313 KDa
配列文字列:
MAKPLGTTGE FFRRRDEWRK HPMLSNQMRH ALPGIGIGVG AFCVYLVGEQ IYSKLMAPSS QSSHQKQPAP SH

+
分子 #36: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mito...

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 36 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mouse-ear cress (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 13.225222 KDa
配列文字列:
MAGRLSGVAS RIMGGNGVVA RSVGSSLRQR AGMGLPVGKH IVPDKPLSVN DELMWDNGTA FPEPCIDRIA DTVGKYEALA WLSGGLGFF VGLGLLAVLN DKASKVPFTP RVYPYDNLRV ELGGEP

+
分子 #37: B15 -- 1 beta subcomplex subunit 4

分子名称: B15 -- 1 beta subcomplex subunit 4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 37 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mouse-ear cress (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 8.305539 KDa
配列文字列:
MGGGMETNKN KFIEDWGSAR ENLEHNFRWT RRNFALIGIF GIALPIIVYK GIVKDFHMQD EDAGRPHRKF L

+
分子 #38: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9
タイプ: protein_or_peptide / ID: 38 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mouse-ear cress (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 13.638335 KDa
配列文字列:
MSGVSTAAYF ARRAAQKERV RILYRRALKD TLNWAVHRHI FYRDASDLRE KFNVNQDVED VDRIDKLIAH GEAEYNKWRH PDPYIVPWA PGGSKFCRNP TPPAGIEIVY NYGLEDNP

+
分子 #39: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 7

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 7
タイプ: protein_or_peptide / ID: 39 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mouse-ear cress (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 11.757832 KDa
配列文字列:
MEVPGSSKKM IATQEEMSAA KIALGSRDMC AHLLIPLNKC RQAEFYLPWK CEDERHVYEK CEYELVMERM LAMKKIREEE ALAKQNKLQ GNAAVPLIPK TANA

+
分子 #40: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 10-B

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 10-B
タイプ: protein_or_peptide / ID: 40 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mouse-ear cress (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 12.462276 KDa
配列文字列:
MGRKKGLPEF EESAPDGFDP ENPYKDPVAM VEMREHIVRE KWIQIEKAKI LREKVKWCYR VEGVNHYQKC RHLVQQYLDS TRGVGWGKD HRPISLHGPK PEAVEAE

+
分子 #41: Probable NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12

分子名称: Probable NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12
タイプ: protein_or_peptide / ID: 41 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mouse-ear cress (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 18.346736 KDa
配列文字列:
MALTVAKSAL EAIREKGLGG FMRMIREEGF MRCLPDGNLL QTKIHNIGAT LVGVDKFGNK YYQKLGDTQY GRHRWVEYAS KDRYNASQV PAEWHGWLHF ITDHTGDELL SLKPKRYGLE HKENFSGEGD AYIYHSKGHT LNPGQKNWTR YQSWVPTKTQ

+
分子 #42: Furry

分子名称: Furry / タイプ: protein_or_peptide / ID: 42 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mouse-ear cress (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 15.060062 KDa
配列文字列:
MAKSVSTAAS SLVQNLRRYI KKPWQITGPC AHPEYLEAVP KATEYRLRCP ATIDEEAIVP SSDPETVYNI VYHGRDQRRN RPPIRRYVL TKDNVVQMMN EKKSFDVSDF PKVYLTTTVE EDLDTRGGGY EK

+
分子 #43: unknown

分子名称: unknown / タイプ: protein_or_peptide / ID: 43 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 2.571161 KDa
配列文字列:
(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)

+
分子 #44: Uncharacterized protein At2g27730, mitochondrial

分子名称: Uncharacterized protein At2g27730, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 44 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mouse-ear cress (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 11.96552 KDa
配列文字列:
MATRNALRIV SRRFSSGKVL SEEERAAENV FIKKMEQEKL QKLARQGPGE QAAGSASEAK VAGATASASA ESGPKVSEDK NRNYAVVAG VVAIVGSIGW YLKAGGKKQP EVQE

+
分子 #45: Gamma carbonic anhydrase-like 2, mitochondrial

分子名称: Gamma carbonic anhydrase-like 2, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 45 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mouse-ear cress (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 27.985113 KDa
配列文字列: MATSLARISK RSITSAVSSN LIRRYFAAEA VAVATTETPK PKSQVTPSPD RVKWDYRGQR QIIPLGQWLP KVAVDAYVAP NVVLAGQVT VWDGSSVWNG AVLRGDLNKI TVGFCSNVQE RCVVHAAWSS PTGLPAQTLI DRYVTVGAYS LLRSCTIEPE C IIGQHSIL ...文字列:
MATSLARISK RSITSAVSSN LIRRYFAAEA VAVATTETPK PKSQVTPSPD RVKWDYRGQR QIIPLGQWLP KVAVDAYVAP NVVLAGQVT VWDGSSVWNG AVLRGDLNKI TVGFCSNVQE RCVVHAAWSS PTGLPAQTLI DRYVTVGAYS LLRSCTIEPE C IIGQHSIL MEGSLVETRS ILEAGSVLPP GRRIPSGELW GGNPARFIRT LTNEETLEIP KLAVAINHLS GDYFSEFLPY ST IYLEVEK FKKSLGIAI

+
分子 #46: Gamma carbonic anhydrase 2, mitochondrial

分子名称: Gamma carbonic anhydrase 2, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 46 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
EC番号: 付加脱離酵素（リアーゼ）; 炭素-酸素リアーゼ類; デヒドラターゼ類
由来(天然)生物種: Mouse-ear cress (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 30.102207 KDa
配列文字列: MGTLGRAIYT VGNWIRGTGQ ALDRVGSLLQ GSHRIEEHLS RHRTLMNVFD KSPLVDKDVF VAPSASVIGD VQIGKGSSIW YGCVLRGDV NNISVGSGTN IQDNTLVHVA KTNISGKVLP TLIGDNVTVG HSAVIHGCTV EDDAFVGMGA TLLDGVVVEK H AMVAAGSL ...文字列:
MGTLGRAIYT VGNWIRGTGQ ALDRVGSLLQ GSHRIEEHLS RHRTLMNVFD KSPLVDKDVF VAPSASVIGD VQIGKGSSIW YGCVLRGDV NNISVGSGTN IQDNTLVHVA KTNISGKVLP TLIGDNVTVG HSAVIHGCTV EDDAFVGMGA TLLDGVVVEK H AMVAAGSL VKQNTRIPSG EVWGGNPAKF MRKLTDEEIV YISQSAKNYI NLAQIHASEN SKSFEQIEVE RALRKKYARK DE DYDSMLG ITRETPPELI LPDNVLPGGK PVAKVPSTQY F

+
分子 #47: Gamma carbonic anhydrase 1, mitochondrial

分子名称: Gamma carbonic anhydrase 1, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 47 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
EC番号: 付加脱離酵素（リアーゼ）; 炭素-酸素リアーゼ類; デヒドラターゼ類
由来(天然)生物種: Mouse-ear cress (シロイヌナズナ)
分子量理論値: 30.010039 KDa
配列文字列: MGTLGRAFYS VGFWIRETGQ ALDRLGCRLQ GKNYFREQLS RHRTLMNVFD KAPIVDKEAF VAPSASVIGD VHIGRGSSIW YGCVLRGDV NTVSVGSGTN IQDNSLVHVA KSNLSGKVHP TIIGDNVTIG HSAVLHGCTV EDETFIGMGA TLLDGVVVEK H GMVAAGAL ...文字列:
MGTLGRAFYS VGFWIRETGQ ALDRLGCRLQ GKNYFREQLS RHRTLMNVFD KAPIVDKEAF VAPSASVIGD VHIGRGSSIW YGCVLRGDV NTVSVGSGTN IQDNSLVHVA KSNLSGKVHP TIIGDNVTIG HSAVLHGCTV EDETFIGMGA TLLDGVVVEK H GMVAAGAL VRQNTRIPSG EVWGGNPARF LRKLTDEEIA FISQSATNYS NLAQAHAAEN AKPLNVIEFE KVLRKKHALK DE EYDSMLG IVRETPPELN LPNNILPDKE TKRPSNVN

+
分子 #48: IRON/SULFUR CLUSTER

分子名称: IRON/SULFUR CLUSTER / タイプ: ligand / ID: 48 / コピー数: 6 / 式: SF4
分子量理論値: 351.64 Da
Chemical component information

ChemComp-FS1:
IRON/SULFUR CLUSTER / 一硫化鉄 / 鉄・硫黄クラスター

+
分子 #49: FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER

分子名称: FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER / タイプ: ligand / ID: 49 / コピー数: 2 / 式: FES
分子量理論値: 175.82 Da
Chemical component information

ChemComp-FES:
FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER / 鉄・硫黄クラスター

+
分子 #50: FLAVIN MONONUCLEOTIDE

分子名称: FLAVIN MONONUCLEOTIDE / タイプ: ligand / ID: 50 / コピー数: 1 / 式: FMN
分子量理論値: 456.344 Da
Chemical component information

ChemComp-FMN:
FLAVIN MONONUCLEOTIDE / FMN / フラビンモノヌクレオチド

+
分子 #51: Ubiquinone-9

分子名称: Ubiquinone-9 / タイプ: ligand / ID: 51 / コピー数: 1 / 式: UQ9
分子量理論値: 795.226 Da
Chemical component information

ChemComp-UQ9:
Ubiquinone-9

+
分子 #52: PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE

分子名称: PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE / タイプ: ligand / ID: 52 / コピー数: 3 / 式: PTY
分子量理論値: 734.039 Da
Chemical component information

ChemComp-PTY:
PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE / リン脂質*YM / ホスファチジルエタノールアミン

+
分子 #53: (7S)-4-HYDROXY-N,N,N-TRIMETHYL-9-OXO-7-[(PALMITOYLOXY)METHYL]-3,5...

分子名称: (7S)-4-HYDROXY-N,N,N-TRIMETHYL-9-OXO-7-[(PALMITOYLOXY)METHYL]-3,5,8-TRIOXA-4-PHOSPHAHEXACOSAN-1-AMINIUM 4-OXIDE
タイプ: ligand / ID: 53 / コピー数: 2 / 式: PC7
分子量理論値: 763.1 Da
Chemical component information

ChemComp-PC7:
(7S)-4-HYDROXY-N,N,N-TRIMETHYL-9-OXO-7-[(PALMITOYLOXY)METHYL]-3,5,8-TRIOXA-4-PHOSPHAHEXACOSAN-1-AMINIUM 4-OXIDE / リン脂質*YM / ホスファチジルコリン

+
分子 #54: (1S)-2-{[{[(2R)-2,3-DIHYDROXYPROPYL]OXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-...

分子名称: (1S)-2-{[{[(2R)-2,3-DIHYDROXYPROPYL]OXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(PALMITOYLOXY)METHYL]ETHYL STEARATE
タイプ: ligand / ID: 54 / コピー数: 1 / 式: PGT
分子量理論値: 751.023 Da
Chemical component information

ChemComp-PGT:
(1S)-2-{[{[(2R)-2,3-DIHYDROXYPROPYL]OXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(PALMITOYLOXY)METHYL]ETHYL STEARATE / リン脂質*YM / Phosphatidylglycerol

+
分子 #55: FE (III) ION

分子名称: FE (III) ION / タイプ: ligand / ID: 55 / コピー数: 1 / 式: FE
分子量理論値: 55.845 Da

+
分子 #56: NADPH DIHYDRO-NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE

分子名称: NADPH DIHYDRO-NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE
タイプ: ligand / ID: 56 / コピー数: 1 / 式: NDP
分子量理論値: 745.421 Da
Chemical component information

ChemComp-NDP:
NADPH DIHYDRO-NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE / NADPH / ニコチンアミドアデニンジヌクレオチドリン酸

+
分子 #57: ZINC ION

分子名称: ZINC ION / タイプ: ligand / ID: 57 / コピー数: 2 / 式: ZN
分子量理論値: 65.409 Da

+
分子 #58: S-[2-({N-[(2R)-2-hydroxy-3,3-dimethyl-4-(phosphonooxy)butanoyl]-b...

分子名称: S-[2-({N-[(2R)-2-hydroxy-3,3-dimethyl-4-(phosphonooxy)butanoyl]-beta-alanyl}amino)ethyl] dodecanethioate
タイプ: ligand / ID: 58 / コピー数: 2 / 式: 8Q1
分子量理論値: 540.651 Da
Chemical component information

ChemComp-8Q1:
S-[2-({N-[(2R)-2-hydroxy-3,3-dimethyl-4-(phosphonooxy)butanoyl]-beta-alanyl}amino)ethyl] dodecanethioate

+
分子 #59: Lauryl Maltose Neopentyl Glycol

分子名称: Lauryl Maltose Neopentyl Glycol / タイプ: ligand / ID: 59 / コピー数: 1 / 式: LMN
分子量理論値: 1.005188 KDa
Chemical component information

ChemComp-AV0:
Lauryl Maltose Neopentyl Glycol / ラウリルマルト-スネオペンチルグリコ-ル

+
分子 #60: 1,2-DICAPROYL-SN-PHOSPHATIDYL-L-SERINE

分子名称: 1,2-DICAPROYL-SN-PHOSPHATIDYL-L-SERINE / タイプ: ligand / ID: 60 / コピー数: 1 / 式: PSF
分子量理論値: 455.437 Da
Chemical component information

ChemComp-PSF:
1,2-DICAPROYL-SN-PHOSPHATIDYL-L-SERINE / 1,2-ジカプロイル-sn-ホスファチジル-L-セリン / ホスファチジルセリン

+
分子 #61: Phosphatidylinositol

分子名称: Phosphatidylinositol / タイプ: ligand / ID: 61 / コピー数: 1 / 式: T7X
分子量理論値: 887.128 Da
Chemical component information

ChemComp-T7X:
Phosphatidylinositol / ホスファチジルイノシトール

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実験情報

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構造解析

手法クライオ電子顕微鏡法
解析単粒子再構成法
試料の集合状態particle

-
試料調製

緩衝液pH: 7.8
凍結凍結剤: ETHANE

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電子顕微鏡法

顕微鏡FEI TITAN KRIOS
電子線加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELDBright-field microscopy
撮影フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 (6k x 4k) / 平均電子線量: 43.0 e/Å2
実験機器
モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company

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画像解析

初期 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD
最終 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD
最終 再構成解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 3.53 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 使用した粒子像数: 42096
FSC曲線 (解像度の算出)

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万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

他の情報も見る