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Structure paper

タイトルCryo-EM reveals how cardiomyopathy therapeutic drugs modulate the myosin motors of the heart.
ジャーナル・号・ページSci Adv, Vol. 12, Issue 18, Page eaed6472, Year 2026
掲載日2026年4月29日
著者Arun Kumar Somavarapu / Jinghua Ge / Christopher M Yengo / Roger Craig / Raul Padron /
PubMed 要旨Genetic mutations in myosin, the motor protein that powers the heartbeat, are linked to inherited hypertrophic and dilated cardiomyopathies. Mavacamten and omecamtiv mecarbil are therapeutic, myosin- ...Genetic mutations in myosin, the motor protein that powers the heartbeat, are linked to inherited hypertrophic and dilated cardiomyopathies. Mavacamten and omecamtiv mecarbil are therapeutic, myosin-targeted drugs designed to treat these myopathies, but their mechanism of action has remained unclear. Using single-particle cryo-EM, we determined near-atomic resolution structures of wild-type, mavacamten-bound, and omecamtiv mecarbil-bound myosin molecules. Across all conditions, we observe two distinct, alternate conformations of myosin, not previously reported. We show how mavacamten stabilizes one conformation by reinforcing key electrostatic interfaces in the molecule, whereas omecamtiv mecarbil weakens these interfaces, favoring the second structure. This remodeling elucidates previously unclear allosteric mechanisms through which these drugs either inhibit or enhance myosin activity, countering the deleterious impacts of disease. These findings reveal how drugs modulate myosin structure to control cardiac contractility.
リンクSci Adv / PubMed:42054467 / PubMed Central
手法EM (単粒子)
解像度3.0 - 4.5 Å
構造データ

73268

9yop

EMDB-73268, PDB-9yop:
Cryo-EM structure of human beta-cardiac myosin in the interacting-heads motif and S2-FH docked state
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.5 Å

73283

9yp4

EMDB-73283, PDB-9yp4:
Cryo-EM structure of human beta-cardiac myosin bound to omecamtiv mecarbil in the interacting-heads motif and S2-FH docked state
手法: EM (単粒子) / 解像度: 4.5 Å

73288

9yp9

EMDB-73288, PDB-9yp9:
Cryo-EM structure of human beta-cardiac myosin bound to mavacamten in the interacting-heads motif and S2-FH docked state
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.0 Å

73362

9yr7

EMDB-73362, PDB-9yr7:
Cryo-EM structure of human beta-cardiac myosin bound to mavacamten in the interacting-heads motif and S2-FH undocked state
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.0 Å

73367

9yrg

EMDB-73367, PDB-9yrg:
Cryo-EM structure of human beta-cardiac myosin in the interacting-heads motif and S2-FH undocked state
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.2 Å

73368

9yrh

EMDB-73368, PDB-9yrh:
Cryo-EM structure of human beta-cardiac myosin bound to omecamtiv mecarbil in the interacting-heads motif and S2-FH undocked state
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.8 Å

化合物

ChemComp-ADP:
ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE / ADP, エネルギー貯蔵分子*YM

ChemComp-PO4:
PHOSPHATE ION

ChemComp-2OW:
methyl 4-(2-fluoro-3-{[(6-methylpyridin-3-yl)carbamoyl]amino}benzyl)piperazine-1-carboxylate

ChemComp-XB2:
6-[[(1~{S})-1-phenylethyl]amino]-3-propan-2-yl-1~{H}-pyrimidine-2,4-dione

由来
  • homo sapiens (ヒト)
  • mus musculus (ハツカネズミ)
  • aequorea victoria (オワンクラゲ)
  • saccharomyces cerevisiae (パン酵母)
キーワードCONTRACTILE PROTEIN / Cardiac Myosin / Interacting Heads Motif / Actin Binding / Omecamtiv Mecarbil / Mavacamten

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見文献

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  • EMDB/PDB/SASBDBのエントリから引用されている文献のデータベースです
  • Pubmedのデータを利用しています

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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