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Structure paper

タイトルIn situ architecture of the human prohibitin complex.
ジャーナル・号・ページNat Cell Biol, Vol. 27, Issue 4, Page 633-640, Year 2025
掲載日2025年3月21日
著者Felix Lange / Michael Ratz / Jan-Niklas Dohrke / Maxence Le Vasseur / Dirk Wenzel / Peter Ilgen / Dietmar Riedel / Stefan Jakobs /
PubMed 要旨Prohibitins are a highly conserved family of proteins that have been implicated in a variety of functions including mitochondrial stress signalling and housekeeping, cell cycle progression, ...Prohibitins are a highly conserved family of proteins that have been implicated in a variety of functions including mitochondrial stress signalling and housekeeping, cell cycle progression, apoptosis, lifespan regulation and many others. The human prohibitins prohibitin 1 and prohibitin 2 have been proposed to act as scaffolds within the mitochondrial inner membrane, but their molecular organization has remained elusive. Here we determined the molecular organization of the human prohibitin complex within the mitochondrial inner membrane using an integrative structural biology approach combining quantitative western blotting, cryo-electron tomography, subtomogram averaging and molecular modelling. The proposed bell-shaped structure consists of 11 alternating prohibitin 1 and prohibitin 2 molecules. This study reveals an average of about 43 prohibitin complexes per crista, covering 1-3% of the crista membrane area. These findings provide a structural basis for understanding the functional contributions of prohibitins to the integrity and spatial organization of the mitochondrial inner membrane.
リンクNat Cell Biol / PubMed:40119201 / PubMed Central
手法EM (サブトモグラム平均)
解像度16.3 Å
構造データ

19459

8rrh

EMDB-19459, PDB-8rrh:
The human prohibitin complex
手法: EM (サブトモグラム平均) / 解像度: 16.3 Å

由来
  • homo sapiens (ヒト)
キーワードMEMBRANE PROTEIN / Chaperone / Lipid organization / Protease regulator

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見文献

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  • EMDB/PDB/SASBDBのエントリから引用されている文献のデータベースです
  • Pubmedのデータを利用しています

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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