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タイトルStructural requirements of blood factors binding to soluble hexon trimers with implications for adenovirus cell targeting and immune evasion.
ジャーナル・号・ページPLoS Pathog, Vol. 22, Issue 7, Page e1014389, Year 2026
掲載日2026年7月13日
著者Olivia X Ma / Shao-Chia Lu / Haley E Mudrick / Mary E Barry / Jarrod B French / Michael A Barry / Vijay S Reddy /
PubMed 要旨Human adenovirus serotype 5 (HAdV-C5) is widely used as a gene delivery vector in both experimental and clinical settings. Upon intravenous administration, HAdV-C5 exhibits strong liver tropism, ...Human adenovirus serotype 5 (HAdV-C5) is widely used as a gene delivery vector in both experimental and clinical settings. Upon intravenous administration, HAdV-C5 exhibits strong liver tropism, largely mediated by interactions between its major capsid protein, hexon (Hx), and coagulation factor X (FX). In contrast, the closely related species C adenovirus 6 (HAdV-C6) also targets the liver but shows reduced dependency on coagulation factors, whereas species D adenovirus 26 (HAdV-D26) does not bind coagulation factors altogether. To define the structural basis of this serotype-specific host factor recognition, we determined high-resolution cryo-electron microscopy structures of isolated hexon trimers from HAdV-C5 and HAdV-C6 in complex with coagulation factors FX and prothrombin (factor II, FII). The resulting atomic models reveal conserved binding interfaces involving the γ-carboxyglutamic acid (Gla) domains of both coagulation factors and the hypervariable regions HVR5 and HVR7 lining the surface cavities of HAdV-C5 and HAdV-C6 hexons. Structures of hexon complexes formed by co-incubation with both FX and FII further reveal serotype-specific binding preferences under physiologically relevant conditions, showing that HAdV-C5 hexon preferentially engages FX, whereas HAdV-C6 hexon favors FII. By contrast, HAdV-D26 hexon does not bind either factor, likely due to an insertion constrained by proline residues in the HVR5 loop that restricts the factor access to the hexon cavity. Together, these findings provide a detailed structural framework for adenovirus-coagulation factor interactions and support the rational engineering of adenovirus vectors with improved targeting and safety profiles.
リンクPLoS Pathog / PubMed:42441716 / PubMed Central
手法EM (単粒子)
解像度3.17 - 3.26 Å
構造データ

76963

13cm

EMDB-76963, PDB-13cm:
HAdV-C5 Hexon with coagulation factor II
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.2 Å

76991

13dj

EMDB-76991, PDB-13dj:
HAdV-C5 hexon trimer
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.17 Å

76994

13dm

EMDB-76994, PDB-13dm:
HAdV-C6 Hexon trimer
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.26 Å

77024

13er

EMDB-77024, PDB-13er:
Cryo-EM structure of HAdV-C6 hexon trimer in complex with prothrombin (FII)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.22 Å

77025

13es

EMDB-77025, PDB-13es:
Cryo-EM structure of HAdV-C5 hexon trimer in complex with human coagulation factor X (FX)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.23 Å

77027

13eu

EMDB-77027, PDB-13eu:
Cryo-EM structure of HAdV-C6 hexon trimer in complex with human coagulation factor X (FX)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.26 Å

化合物

ChemComp-CA:
Unknown entry

由来
  • human adenovirus 5 (ヒトアデノウイルス)
  • homo sapiens (ヒト)
  • human adenovirus 6 (ヒトアデノウイルス)
キーワードVIRAL PROTEIN / adenovirus / hexon / coagulation factor II / virus-host interaction / cryo-EM / virus capsid / HAdV-C5 / coagulation factor X

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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