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タイトルHuman monoclonal antibodies that target clade 2.3.4.4b H5N1 hemagglutinin.
ジャーナル・号・ページNat Commun, Vol. 17, Issue 1, Page 135, Year 2025
掲載日2025年12月13日
著者Garazi Peña Alzua / André Nicolás León / Temima Yellin / Disha Bhavsar / Madhumathi Loganathan / Kaitlyn Bushfield / Philip J M Brouwer / Alesandra J Rodriguez / Trushar Jeevan / Richard Webby / Christine Marizzi / Julianna Han / Andrew B Ward / J Andrew Duty / Florian Krammer /
PubMed 要旨The highly pathogenic avian influenza H5N1 virus clade 2.3.4.4b has been spreading globally since 2022, causing mortality and morbidity in domestic and wild birds, as well as in mammals, which ...The highly pathogenic avian influenza H5N1 virus clade 2.3.4.4b has been spreading globally since 2022, causing mortality and morbidity in domestic and wild birds, as well as in mammals, which underscores its potential to cause a pandemic. Here, we generate a panel of anti-hemagglutinin (HA) human monoclonal antibodies (mAbs) against the H5 protein of clade 2.3.4.4b. To develop human chimeric antibodies, H2L2 Harbor Mice®, which express human immunoglobulin germline genes, were immunized with H5 and N1 recombinant proteins from A/mallard/New York/22-008760-007- original/2022 H5N1 virus. Through hybridoma technology, sixteen fully human mAbs are generated, most of which show cross-reactivity against H5 proteins from different clade 2.3.4.4 virus variants. Fourteen out of the sixteen mAbs neutralize the virus in vitro. The mAbs with the strongest hemagglutination inhibition activity also demonstrate greater neutralizing capacity and show increased protective effects in vivo when administered prophylactically or therapeutically in a murine H5N1 challenge model. Using cryo-electron microscopy, we identify a cross-clonotype conserved motif that bound a hydrophobic groove on the head domain of H5 HA. Akin to mAbs against severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 during the coronavirus 2019 pandemic, these mAbs could serve as treatments in case of a widespread H5N1 epidemic or pandemic.
リンクNat Commun / PubMed:41390501 / PubMed Central
手法EM (単粒子)
解像度3.06 - 25.0 Å
構造データ

EMDB-48510: Cryo-EM map of H5 HA (A/Jiangsu/NJ210/2023) in complex with monoclonal fab 20D10 and CR9114
PDB-9mq1: Cryo-EM map of H5 HA (A/Jiangsu/NJ210/2023) in complex with monoclonal fab 20D10
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.37 Å

EMDB-48511: Cryo-EM map of H5 HA (A/Jiangsu/NJ210/2023) in complex with monoclonal fab 12G1 and CR9114
PDB-9mq2: Cryo-EM map of H5 HA (A/Jiangsu/NJ210/2023) in complex with monoclonal fab 12G1
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.06 Å

EMDB-48512: Cryo-EM map of H5 HA (A/Jiangsu/NJ210/2023) in complex with monoclonal fab 6G1, 1A1 and CR9114
PDB-9mq3: Cryo-EM map of H5 HA (A/Jiangsu/NJ210/2023) in complex with monoclonal fab 6G1
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.22 Å

EMDB-48679: Negative stain EM map of H5 HA (A/Jiangsu/NJ210/2023) in complex with monoclonal fab 1A1
手法: EM (単粒子) / 解像度: 20.0 Å

EMDB-48680: Negative stain EM map of H5 HA (A/Jiangsu/NJ210/2023) in complex with monoclonal fab 1H2
手法: EM (単粒子) / 解像度: 20.0 Å

EMDB-48681: Negative stain EM map of H5 HA (A/Jiangsu/NJ210/2023) in complex with monoclonal fab 6G1
手法: EM (単粒子) / 解像度: 20.0 Å

EMDB-48682: Negative stain EM map of H5 HA (A/Jiangsu/NJ210/2023) in complex with monoclonal fab 7G4
手法: EM (単粒子) / 解像度: 20.0 Å

EMDB-48683: Negative stain EM map of H5 HA (A/Jiangsu/NJ210/2023) in complex with monoclonal fab 7G11
手法: EM (単粒子) / 解像度: 20.0 Å

EMDB-48684: Negative stain EM map of H5 HA (A/Jiangsu/NJ210/2023) in complex with monoclonal fab 12C11
手法: EM (単粒子) / 解像度: 20.0 Å

EMDB-48685: Negative stain EM map of H5 HA (A/Jiangsu/NJ210/2023) in complex with monoclonal fab 12G1
手法: EM (単粒子) / 解像度: 20.0 Å

EMDB-48686: Negative stain EM map of H5 HA (A/Jiangsu/NJ210/2023) in complex with monoclonal fab 12G8
手法: EM (単粒子) / 解像度: 20.0 Å

EMDB-48687: Negative stain EM map of H5 HA (A/Jiangsu/NJ210/2023) in complex with monoclonal fab 12G9
手法: EM (単粒子) / 解像度: 20.0 Å

EMDB-48688: Negative stain EM map of H5 HA (A/Jiangsu/NJ210/2023) in complex with monoclonal fab 13E8
手法: EM (単粒子) / 解像度: 20.0 Å

EMDB-48689: Negative stain EM map of H5 HA (A/Jiangsu/NJ210/2023) in complex with monoclonal fab 17C12
手法: EM (単粒子) / 解像度: 20.0 Å

EMDB-48690: Negative stain EM map of H5 HA (A/Jiangsu/NJ210/2023) in complex with monoclonal fab 17E3
手法: EM (単粒子) / 解像度: 20.0 Å

EMDB-48692: Negative stain EM map of H5 HA (A/Jiangsu/NJ210/2023) in complex with monoclonal fab 20D10
手法: EM (単粒子) / 解像度: 20.0 Å

EMDB-48693: A/Red-tailed hawk/New York/NYCVH 22-8477/2022 H5 in complex with monoclonal fab 1A1
手法: EM (単粒子) / 解像度: 25.0 Å

EMDB-48694: Negative stain map of A/Red-tailed hawk/New York/NYCVH 22-8477/2022 H5 in complex with monoclonal Fab 20D10
手法: EM (単粒子) / 解像度: 25.0 Å

EMDB-48695: Negative stain map of A/Red-tailed hawk/New York/NYCVH 22-8477/2022 H5 in complex with monoclonal Fab 6G1
手法: EM (単粒子) / 解像度: 25.0 Å

EMDB-48696: Negative stain map of A/Red-tailed hawk/New York/NYCVH 22-8477/2022 H5 in complex with monoclonal Fab 12G1
手法: EM (単粒子) / 解像度: 25.0 Å

EMDB-48822: Cryo-EM map of H5 HA (A/Jiangsu/NJ210/2023) in complex with monoclonal fabs 1A1, 6G1, and CR9114.
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.47 Å

化合物

ChemComp-NAG:
2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose / N-アセチル-β-D-グルコサミン

由来
  • homo sapiens (ヒト)
  • influenza a virus (A型インフルエンザウイルス)
  • Mus musculus (ハツカネズミ)
キーワードVIRAL PROTEIN/IMMUNE SYSTEM / influenza / hemaglutinin / antibody-antigen complex / VIRAL PROTEIN / VIRAL PROTEIN-IMMUNE SYSTEM complex / hemagglutinin / H5 / monoclonal / complex / fab complex / viral fusion protein

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月:コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか? / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例:em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見文献

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  • EMDB/PDB/SASBDBのエントリから引用されている文献のデータベースです
  • Pubmedのデータを利用しています

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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