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Structure paper

タイトルStructure of the mechanosensitive OSCA channels.
ジャーナル・号・ページNat Struct Mol Biol, Vol. 25, Issue 9, Page 850-858, Year 2018
掲載日2018年9月6日
著者Mingfeng Zhang / Dali Wang / Yunlu Kang / Jing-Xiang Wu / Fuqiang Yao / Chengfang Pan / Zhiqiang Yan / Chen Song / Lei Chen /
PubMed 要旨Mechanosensitive ion channels convert mechanical stimuli into a flow of ions. These channels are widely distributed from bacteria to higher plants and humans, and are involved in many crucial ...Mechanosensitive ion channels convert mechanical stimuli into a flow of ions. These channels are widely distributed from bacteria to higher plants and humans, and are involved in many crucial physiological processes. Here we show that two members of the OSCA protein family in Arabidopsis thaliana, namely AtOSCA1.1 and AtOSCA3.1, belong to a new class of mechanosensitive ion channels. We solve the structure of the AtOSCA1.1 channel at 3.5-Å resolution and AtOSCA3.1 at 4.8-Å resolution by cryo-electron microscopy. OSCA channels are symmetric dimers that are mediated by cytosolic inter-subunit interactions. Strikingly, they have structural similarity to the mammalian TMEM16 family proteins. Our structural analysis accompanied with electrophysiological studies identifies the ion permeation pathway within each subunit and suggests a conformational change model for activation.
リンクNat Struct Mol Biol / PubMed:30190597
手法EM (単粒子)
解像度3.52 - 4.8 Å
構造データ

6822

6jpf

EMDB-6822: Structure of atOSCA1.1 channel
PDB-6jpf: Structure of atOSCA1.1 channel at 3.52A
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.52 Å

6875

5z1f

EMDB-6875, PDB-5z1f:
Structure of atOSCA3.1 channel
手法: EM (単粒子) / 解像度: 4.8 Å

由来
  • arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
キーワードMETAL TRANSPORT / osca / TMEM63 / ion channel / mechanosensitive / membrane protein / osmosensing

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbjlvh1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見文献

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  • EMDB/PDB/SASBDBのエントリから引用されている文献のデータベースです
  • Pubmedのデータを利用しています

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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