[日本語] English
文献
- EMDB/PDB/SASBDBから引用されている文献のデータベース -

+
検索条件

キーワード
構造解析手法
著者・登録者
ジャーナル
IF

-
Structure paper

タイトルEctopic NMDAR expression in cancer unmasks germline-encoded autoimmunity.
ジャーナル・号・ページNature, Year 2026
掲載日2026年3月25日
著者Sam O Kleeman / Kevin Michalski / Xiang Zhao / Ruben Steigerwald / Miriam Ferrer / Llewelyn Levett / Ethan Ertel / Austin Schultz / Noriko Simorowski / Pamela Moody / Tse-Luen Wee / Cristina Valente / Sharon Fox / Mateusz Makuch / Selina Thomsen / Ruby Harrison / Claire Regan / Jonathan Preall / Qing Gao / Dennis Thomas / Jill Habel / Rachel Rubino / Sarosh Irani / Hiro Furukawa / Tobias Janowitz /
PubMed 要旨Autoimmunity and anti-cancer immunity lie on the same biological continuum, but their link remains obscure. The paraneoplastic neurological syndrome ANRE (anti-NMDA receptor (NMDAR) encephalitis) is ...Autoimmunity and anti-cancer immunity lie on the same biological continuum, but their link remains obscure. The paraneoplastic neurological syndrome ANRE (anti-NMDA receptor (NMDAR) encephalitis) is a paradigm for their connectivity, given that intratumoural NMDAR expression is correlated with the generation of anti-NMDAR antibodies. Here we verify ectopic expression of GluN1 and GluN2B NMDAR subunits in triple-negative breast cancer (TNBC) and model this using orthotopic TNBC tumours with inducible expression of GluN1-GluN2B NMDARs. We show that NMDAR expression is sufficient to induce the recruitment of B cells and their affinity maturation, consistent with an integrated adaptive immune response. Reconstruction of extended intratumoural B cell phylogenies and cryogenic electron microscopy structural analyses demonstrate that affinity-matured hypermutated and class-switched antibodies emerged from pre-existing germline-configuration lower-affinity anti-NMDAR antibodies. Distinct matured antibodies targeted specific epitopes and induced conformational rearrangements within the NMDAR amino-terminal domain, predictive of their functional effects, ranging from inhibition to potentiation. Passive transfer of an NMDAR-potentiating antibody caused autonomic dysregulation and lowered the seizure threshold in healthy female mice, recapitulating key diagnostic criteria of ANRE. We further identify a correlation between intratumoural NMDAR expression and anti-NMDAR antibody titres in patients with TNBC. Taken together, our data establish a direct connection between intratumoural NMDAR expression, antibody maturation and the onset of autoimmunity. These findings suggest that germline-encoded anti-NMDAR antibodies contribute to immune surveillance but can also trigger autoimmune disease after maturation, revealing a mechanistic trade-off between cancer immunity and neurotoxicity.
リンクNature / PubMed:41882353
手法EM (単粒子)
解像度3.09 - 4.55 Å
構造データ

EMDB-75112, PDB-10en:
SK3D-Matured in complex with GluN1-GluN2B, full refinement
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.7 Å

EMDB-75120, PDB-10ev:
OX1-Matured in complex with GluN1-GluN2B, full refinement
手法: EM (単粒子) / 解像度: 4.2 Å

EMDB-75121, PDB-10ex:
SK5A-Matured apo state in complex with GluN1-GluN2B, full refinement
手法: EM (単粒子) / 解像度: 4.08 Å

EMDB-75122, PDB-10ey:
SK5B-Matured in complex with GluN1-GluN2B, full refinement
手法: EM (単粒子) / 解像度: 4.1 Å

EMDB-75123, PDB-10ez:
SK3D-Germline in complex with GluN1-GluN2B, full refinement
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.76 Å

EMDB-75127, PDB-10fd:
SK5G-Matured in complex with GluN1-GluN2B, full refinement
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.09 Å

EMDB-75128, PDB-10fe:
OX1-Germline in complex with GluN1-GluN2B, full refinement
手法: EM (単粒子) / 解像度: 4.55 Å

EMDB-75129, PDB-10ff:
SK5A-Matured glycine/glutamate in complex with GluN1-GluN2B, full refinement
手法: EM (単粒子) / 解像度: 4.06 Å

EMDB-75134, PDB-10fl:
SK5G-Germline
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.81 Å

EMDB-75136, PDB-10fn:
SK5A-Germline in complex with GluN1-GluN2B, full refinement
手法: EM (単粒子) / 解像度: 4.52 Å

EMDB-75138, PDB-10fo:
SK5B-Germline in complex with GluN1-GluN2B, full refinement
手法: EM (単粒子) / 解像度: 4.46 Å

由来
  • homo sapiens (ヒト)
  • mus musculus (ハツカネズミ)
キーワードSIGNALING PROTEIN/Immune System / NMDAR / antibody / SIGNALING PROTEIN / SIGNALING PROTEIN-Immune System complex / SIGNALING PROTEIN/Imuune System / SIGNALING PROTEIN-Imuune System complex

+
万見文献について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月:コロナウイルスプロテーアーゼ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか? / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例:em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

-
万見文献

EMDB/PDB/SASBDBから引用されている文献のデータベース

  • EMDB/PDB/SASBDBのエントリから引用されている文献のデータベースです
  • Pubmedのデータを利用しています

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

他の情報も見る