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タイトルCortactin stabilizes actin branches by bridging activated Arp2/3 to its nucleated actin filament.
ジャーナル・号・ページNat Struct Mol Biol, Vol. 31, Issue 5, Page 801-809, Year 2024
掲載日2024年1月24日
著者Tianyang Liu / Luyan Cao / Miroslav Mladenov / Antoine Jegou / Michael Way / Carolyn A Moores /
PubMed 要旨Regulation of the assembly and turnover of branched actin filament networks nucleated by the Arp2/3 complex is essential during many cellular processes, including cell migration and membrane ...Regulation of the assembly and turnover of branched actin filament networks nucleated by the Arp2/3 complex is essential during many cellular processes, including cell migration and membrane trafficking. Cortactin is important for actin branch stabilization, but the mechanism by which this occurs is unclear. Given this, we determined the structure of vertebrate cortactin-stabilized Arp2/3 actin branches using cryogenic electron microscopy. We find that cortactin interacts with the new daughter filament nucleated by the Arp2/3 complex at the branch site, rather than the initial mother actin filament. Cortactin preferentially binds activated Arp3. It also stabilizes the F-actin-like interface of activated Arp3 with the first actin subunit of the new filament, and its central repeats extend along successive daughter-filament subunits. The preference of cortactin for activated Arp3 explains its retention at the actin branch and accounts for its synergy with other nucleation-promoting factors in regulating branched actin network dynamics.
リンクNat Struct Mol Biol / PubMed:38267598 / PubMed Central
手法EM (単粒子)
解像度3.2 - 3.8 Å
構造データ

EMDB-17553: Cryo-EM structure of cortactin-stabilized Arp2/3 complex nucleated actin branches-Daughter filament consensus map
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.3 Å

EMDB-17554: Cryo-EM structure of cortactin-stabilized Arp2/3 nucleated actin branches-Local refined map on Arp2/3 complex
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.2 Å

EMDB-17555: Cryo-EM structure of cortactin-stabilized Arp2/3-complex nucleated actin branches-Local refined map on the daughter filament and cortactin density
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.3 Å

EMDB-17556: Cryo-EM structure of cortactin-stabilized Arp2/3-complex nucleated actin branches-Local refined map on capping protein
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.8 Å

EMDB-17557: Cryo-EM structure of cortactin-stabilized Arp2/3-complex nucleated actin branches-Local refined map on mother filament
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.3 Å

17558

8p94

EMDB-17558, PDB-8p94:
Cryo-EM structure of cortactin stabilized Arp2/3-complex nucleated actin branches
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.3 Å

化合物

ChemComp-ADP:
ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE / ADP / ADP, エネルギー貯蔵分子*YM

ChemComp-MG:
Unknown entry / マグネシウムジカチオン

由来
  • homo sapiens (ヒト)
  • sus scrofa (ブタ)
  • mus musculus (ハツカネズミ)
  • amanita phalloides (タマゴテングタケ)
キーワードCONTRACTILE PROTEIN / Complex

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbjlvh1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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