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構造論文のリスト

全データ121,602件中、1から20件目までを表示しています

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Surface Morphometrics reveals local membrane thickness variation in organellar subcompartments.

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Crystal structure of SdrD A2-A3-B1-B2 domains from Staphylococcus aureus JH1

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Structural basis of unidirectional DNA recombination by the PhiC31 serine integrase

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Crystal structure of SdrD A2-A3 domains from Staphylococcus aureus JH1

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Crystal structure of TsaGH11

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Crystal Structure of Apurinic endonuclease (APN1) from Babesia bovis

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Structural Rearrangements Enable LrhA Activation and Control of Flagella

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Crystal structure of Streptococcus thermophilus SHP pheromone receptor Rgg3 in complex with Rgg3bp13

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Phosphoglycerate mutase 1 complexed with a fragment

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D-Ornithine/D-lysine decarboxylase complexed with putrescine and agmatine

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Evaluating the Volta Phase Plate for Improved Tomogram Alignment in Cryo-Electron Tomography

To Be Published,
Yu Y
手法: EM (単粒子)

75265
EMDBエントリ 画像なし

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Crystal structure of Capsular polysaccharide biosynthesis protein from Bordetella pertussis in complex with NAD and uridine-diphosphate-n-acetylgalactosamine (cocrystallization)

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Chaperonin TRiC bridges radial spokes for folding locally translated proteins to sustain mammalian sperm flagellar motilities

To Be Published,
Meng XM / Li L / Lin C / Zhu Y / Zhang LH / Sun F / Yan XM / Zhu XL / Cong Y
手法: EM (サブトモグラム平均)

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Crystal Structure of serine/threonine-protein kinase (AEK1) T376D, S395D Mutant from Trypanosoma brucei (AMP-PNP)

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Mechanism of membrane perforation in rotavirus cell entry

To Be Published,
de Sautu M / Leistner C / Kirchhausen T / Jenni S / Harrison SC
手法: EM (サブトモグラム平均)

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Phosphoglycerate mutase 1 complexed with a novel scaffold inhibitor

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Ozureprubart: Mechanistic and Functional Insights into a Long-Acting Anti-IgE Therapy

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Molecular basis of mitogen-activated protein kinase ERK2 activation by its upstream kinase MEK1

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Generation of Conformational Energy Landscape from Lactoferrin cryo-EM images with Mitigated Preferred Orientations by cryoTWIN

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An evolutionarily conserved salt bridge stabilizes the active site for GTP hydrolysis in Rho GTPases

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月:コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか? / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例:em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見文献

EMDB/PDB/SASBDBから引用されている文献のデータベース

  • EMDB/PDB/SASBDBのエントリから引用されている文献のデータベースです
  • Pubmedのデータを利用しています

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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