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Structure paper

タイトルAtypical chemoreceptor arrays accommodate high membrane curvature.
ジャーナル・号・ページNat Commun, Vol. 11, Issue 1, Page 5763, Year 2020
掲載日2020年11月13日
著者Alise R Muok / Davi R Ortega / Kurni Kurniyati / Wen Yang / Zachary A Maschmann / Adam Sidi Mabrouk / Chunhao Li / Brian R Crane / Ariane Briegel /
PubMed 要旨The prokaryotic chemotaxis system is arguably the best-understood signaling pathway in biology. In all previously described species, chemoreceptors organize into a hexagonal (P6 symmetry) extended ...The prokaryotic chemotaxis system is arguably the best-understood signaling pathway in biology. In all previously described species, chemoreceptors organize into a hexagonal (P6 symmetry) extended array. Here, we report an alternative symmetry (P2) of the chemotaxis apparatus that emerges from a strict linear organization of the histidine kinase CheA in Treponema denticola cells, which possesses arrays with the highest native curvature investigated thus far. Using cryo-ET, we reveal that Td chemoreceptor arrays assume an unusual arrangement of the supra-molecular protein assembly that has likely evolved to accommodate the high membrane curvature. The arrays have several atypical features, such as an extended dimerization domain of CheA and a variant CheW-CheR-like fusion protein that is critical for maintaining an ordered chemosensory apparatus. Furthermore, the previously characterized Td oxygen sensor ODP influences CheA ordering. These results suggest a greater diversity of the chemotaxis signaling system than previously thought.
リンクNat Commun / PubMed:33188180 / PubMed Central
手法EM (サブトモグラム平均) / EM (トモグラフィー) / X線回折
解像度1.5 - 46.0 Å
構造データ

EMDB-11381:
Treponema denticola chemotaxis signalling arrays in an ODP (TDE2498) deletion mutant
手法: EM (サブトモグラム平均) / 解像度: 28.2 Å

EMDB-11384:
Treponema denticola chemotaxis signalling arrays in an ODP (TDE2498) and TDE2496 deletion mutant
手法: EM (サブトモグラム平均) / 解像度: 25.0 Å

EMDB-11385:
Treponema denticola chemotaxis signalling arrays
手法: EM (サブトモグラム平均) / 解像度: 16.0 Å

EMDB-11386:
Treponema denticola chemotaxis signalling arrays
手法: EM (トモグラフィー) / 解像度: 46.0 Å

PDB-6y1y:
CheA dimerization domain of Treponema denticola
手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.5 Å

化合物

ChemComp-HOH:
WATER

由来
  • treponema denticola (バクテリア)
キーワードSIGNALING PROTEIN / Histidine kinase / dimerization domain / coiled-coil

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EMN文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2021年10月5日: 温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

  • 2021年のノーベル医学・生理学賞は、温度と触覚の受容体を発見したデビッド・ジュリアスとアーデム・パタポウティアンに共同で授与されました
  • EM Navigatorでは、両先駆者によるクライオEM構造データを見つけることができます

外部リンク:The Nobel Prize in Physiology or Medicine 2021 - NobelPrize.org / Structure data by Ardem Patapoutian / Structure data by David Julius

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbjlvh1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月:コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

テキストデータのダウンロード

EM Navigatorの以下のサービスのデータが、テキスト形式でダウンロードできるようになりました。ダウンロードしたデータをExcelなどで読み込むことができます。

ページデータフォーマット
EM Navigator 検索検索結果CSV, TSV, JSON
EM Navigator 統計情報表データCSV, TSV

関連情報:EMN検索 / EMN統計情報

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EMN文献

3DEM構造データから引用されている文献のデータベース

  • EMDDBとPDBの3次元電子顕微鏡エントリから引用されている文献のデータベースです。
  • PubMedのデータを利用しています。

関連情報:EMDB / PDB / Q: EM Navigatorの情報源は? / EM Navigator / 万見文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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