[日本語] English
EMN文献
- 3DEM構造データから引用されている文献のデータベース -

+
検索条件

キーワード
著者・登録者
ジャーナル
IF

-
Structure paper

タイトル3.2-Å-resolution structure of the 90S preribosome before A1 pre-rRNA cleavage.
ジャーナル・号・ページNat Struct Mol Biol, Vol. 24, Issue 11, Page 954-964, Year 2017
掲載日2017年10月2日
著者Jingdong Cheng / Nikola Kellner / Otto Berninghausen / Ed Hurt / Roland Beckmann /
PubMed 要旨The 40S small ribosomal subunit is cotranscriptionally assembled in the nucleolus as part of a large chaperone complex called the 90S preribosome or small-subunit processome. Here, we present the 3.2- ...The 40S small ribosomal subunit is cotranscriptionally assembled in the nucleolus as part of a large chaperone complex called the 90S preribosome or small-subunit processome. Here, we present the 3.2-Å-resolution structure of the Chaetomium thermophilum 90S preribosome, which allowed us to build atomic structures for 34 assembly factors, including the Mpp10 complex, Bms1, Utp14 and Utp18, and the complete U3 small nucleolar ribonucleoprotein. Moreover, we visualized the U3 RNA heteroduplexes with a 5' external transcribed spacer (5' ETS) and pre-18S RNA, and their stabilization by 90S factors. Overall, the structure explains how a highly intertwined network of assembly factors and pre-rRNA guide the sequential, independent folding of the individual pre-40S domains while the RNA regions forming the 40S active sites are kept immature. Finally, by identifying the unprocessed A1 cleavage site and the nearby Utp24 endonuclease, we suggest a proofreading model for regulated 5'-ETS separation and 90S-pre-40S transition.
リンクNat Struct Mol Biol / PubMed:28967883
手法EM (単粒子)
解像度3.2 Å
構造データ

EMDB-3847, PDB-5oql:
Cryo-EM structure of the 90S pre-ribosome from Chaetomium thermophilum
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.2 Å

化合物

ChemComp-ZN:
Unknown entry

由来
  • chaetomium thermophilum (strain dsm 1495 / cbs 144.50 / imi 039719) (菌類)
キーワードRIBOSOME / Ribosome biogenesis

+
EMN文献について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

-
2021年10月5日: 温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

  • 2021年のノーベル医学・生理学賞は、温度と触覚の受容体を発見したデビッド・ジュリアスとアーデム・パタポウティアンに共同で授与されました
  • EM Navigatorでは、両先駆者によるクライオEM構造データを見つけることができます

外部リンク:The Nobel Prize in Physiology or Medicine 2021 - NobelPrize.org / Structure data by Ardem Patapoutian / Structure data by David Julius

+
2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbjlvh1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月:コロナウイルスプロテーアーゼ

+
2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

テキストデータのダウンロード

EM Navigatorの以下のサービスのデータが、テキスト形式でダウンロードできるようになりました。ダウンロードしたデータをExcelなどで読み込むことができます。

ページデータフォーマット
EM Navigator 検索検索結果CSV, TSV, JSON
EM Navigator 統計情報表データCSV, TSV

関連情報:EMN検索 / EMN統計情報

-
EMN文献

3DEM構造データから引用されている文献のデータベース

  • EMDDBとPDBの3次元電子顕微鏡エントリから引用されている文献のデータベースです。
  • PubMedのデータを利用しています。

関連情報:EMDB / PDB / Q: EM Navigatorの情報源は? / EM Navigator / 万見文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

他の情報も見る