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キーワード
構造解析手法	All X線回折 NMR 電子顕微鏡小角散乱中性子線回折線維回折粉末回折赤外分光 EPR FRET 理論モデルハイブリッド
著者・登録者
ジャーナル
IF	>30 >20 >10 >5 all

タイトル	Lysine relay mechanism coordinates intermediate transfer in vitamin B6 biosynthesis.
ジャーナル・号・ページ	Nat. Chem. Biol., Vol. 13, Page 290-294, Year 2017
掲載日	2016年8月6日 (構造データの登録日)
著者	Rodrigues, M.J. / Windeisen, V. / Zhang, Y. / Guedez, G. / Weber, S. / Strohmeier, M. / Hanes, J.W. / Royant, A. / Evans, G. / Sinning, I. ...Rodrigues, M.J. / Windeisen, V. / Zhang, Y. / Guedez, G. / Weber, S. / Strohmeier, M. / Hanes, J.W. / Royant, A. / Evans, G. / Sinning, I. / Ealick, S.E. / Begley, T.P. / Tews, I.
リンク	Nat. Chem. Biol. / PubMed:28092359
手法	X線回折
解像度	1.61 - 2.32 Å
構造データ	PDB-5lnr: Crystal structure of Arabidopsis thaliana Pdx1-PLP complex 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.61 Å PDB-5lns: Crystal structure of Arabidopsis thaliana Pdx1-R5P complex 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.91 Å PDB-5lnt: Crystal structure of Arabidopsis thaliana Pdx1K166R-preI320 complex 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2.32 Å PDB-5lnu: Crystal structure of Arabidopsis thaliana Pdx1-I320 complex 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.73 Å PDB-5lnv: Crystal structure of Arabidopsis thaliana Pdx1-I320 complex from multiple crystals 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2.24 Å PDB-5lnw: Crystal structure of Arabidopsis thaliana Pdx1-I320-G3P complex 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.9 Å
化合物	ChemComp-PLP: PYRIDOXAL-5'-PHOSPHATE / ピリドキサ-ル5′-りん酸 ChemComp-GOL: GLYCEROL / グリセロ-ル ChemComp-HOH: WATER ChemComp-5RP: RIBULOSE-5-PHOSPHATE / リブロ-ス5-りん酸 ChemComp-PO4: PHOSPHATE ION / ホスファ-ト ChemComp-KPR: [(~{E},4~{S})-4-azanyl-3-oxidanylidene-pent-1-enyl] dihydrogen phosphate ChemComp-SO4: SULFATE ION / 硫酸ジアニオン ChemComp-KIK: (4~{S})-4-azanyl-5-oxidanyl-pent-1-en-3-one ChemComp-K8P: [(2~{R},3~{R})-2,3-bis(oxidanyl)-3-[[(2~{S})-3-oxidanylidenepent-4-en-2-yl]amino]propyl] dihydrogen phosphate ChemComp-RP5: 5-O-phosphono-beta-D-ribofuranose / β-D-リボフラノ-ス5-りん酸 ChemComp-HG3: [(2~{R})-2,3,3-tris(oxidanyl)propyl] dihydrogen phosphate
由来	arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
キーワード	LYASE / beta/alpha barrel / pyridoxal phosphate synthase / glutamine amidotransferase / vitamin B6 biosythesis / vitamin B6 biosynthesis