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タイトルPromiscuous G-protein activation by the calcium-sensing receptor.
ジャーナル・号・ページNature, Vol. 629, Issue 8011, Page 481-488, Year 2024
掲載日2024年4月17日
著者Hao Zuo / Jinseo Park / Aurel Frangaj / Jianxiang Ye / Guanqi Lu / Jamie J Manning / Wesley B Asher / Zhengyuan Lu / Guo-Bin Hu / Liguo Wang / Joshua Mendez / Edward Eng / Zhening Zhang / Xin Lin / Robert Grassucci / Wayne A Hendrickson / Oliver B Clarke / Jonathan A Javitch / Arthur D Conigrave / Qing R Fan /
PubMed 要旨The human calcium-sensing receptor (CaSR) detects fluctuations in the extracellular Ca concentration and maintains Ca homeostasis. It also mediates diverse cellular processes not associated with Ca ...The human calcium-sensing receptor (CaSR) detects fluctuations in the extracellular Ca concentration and maintains Ca homeostasis. It also mediates diverse cellular processes not associated with Ca balance. The functional pleiotropy of CaSR arises in part from its ability to signal through several G-protein subtypes. We determined structures of CaSR in complex with G proteins from three different subfamilies: G, G and G. We found that the homodimeric CaSR of each complex couples to a single G protein through a common mode. This involves the C-terminal helix of each Gα subunit binding to a shallow pocket that is formed in one CaSR subunit by all three intracellular loops (ICL1-ICL3), an extended transmembrane helix 3 and an ordered C-terminal region. G-protein binding expands the transmembrane dimer interface, which is further stabilized by phospholipid. The restraint imposed by the receptor dimer, in combination with ICL2, enables G-protein activation by facilitating conformational transition of Gα. We identified a single Gα residue that determines G and G versus G selectivity. The length and flexibility of ICL2 allows CaSR to bind all three Gα subtypes, thereby conferring capacity for promiscuous G-protein coupling.
リンクNature / PubMed:38632411
手法EM (単粒子)
解像度2.9 - 4.0 Å
構造データ

EMDB-43811, PDB-9asb:
Structure of human calcium-sensing receptor in complex with chimeric Gq (miniGisq) protein in nanodiscs
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.4 Å

EMDB-43836: Consensus map of human CaSR-miniGisq complex in nanodiscs
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.4 Å

EMDB-43837: Local refinement map of CaSR extracellular domain in nanodisc-reconstituted human CaSR-miniGisq complex
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.0 Å

EMDB-43840: Local refinement map of CaSR transmembrane domain in nanodisc-reconstituted human CaSR-miniGisq complex
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.3 Å

EMDB-43841: Local refinement map of G protein in nanodisc-reconstituted human CaSR-miniGisq complex
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.7 Å

EMDB-43897: Consensus map of human CaSR-miniGis complex in nanodiscs
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.6 Å

EMDB-43898: Local refinement map of CaSR extracellular domain in nanodisc-reconstituted human CaSR-miniGis complex
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.9 Å

EMDB-43899: Local refinement map of CaSR transmembrane domain in nanodisc-reconstituted human CaSR-miniGis complex
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.4 Å

EMDB-43900: Local refinement map of G protein in nanodisc-reconstituted human CaSR-miniGis complex
手法: EM (単粒子) / 解像度: 4.0 Å

EMDB-43901, PDB-9avg:
Structure of human calcium-sensing receptor in complex with chimeric Gs (miniGis) protein in nanodiscs
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.6 Å

EMDB-43904: Consensus map of human CaSR-Gi3 complex in nanodiscs
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.8 Å

EMDB-43905: Local refinement map of CaSR extracellular domain in nanodisc-reconstituted human CaSR-Gi3 complex
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.1 Å

EMDB-43906: Local refinement map of CaSR transmembrane domain in nanodisc-reconstituted human CaSR-Gi3 complex
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.5 Å

EMDB-43907: Local refinement map of G protein in nanodisc-reconstituted human CaSR-Gi3 complex
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.3 Å

EMDB-43908, PDB-9avl:
Structure of human calcium-sensing receptor in complex with Gi3 protein in nanodiscs
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.8 Å

EMDB-43961: Consensus map of human CaSR-miniGisq complex in detergent
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.5 Å

EMDB-43962: Local refinement map of CaSR extracellular domain (ECD) in detergent-solubilized human CaSR-miniGisq complex
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.1 Å

EMDB-43963: Local refinement map of CaSR transmembrane domain (TMD) in detergent-solubilized human CaSR-miniGisq complex
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.3 Å

EMDB-43964: Local refinement map of G protein in detergent-solubilized human CaSR-miniGisq complex
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.1 Å

EMDB-43966, PDB-9axf:
Structure of human calcium-sensing receptor in complex with chimeric Gq (miniGisq) protein in detergent
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.5 Å

EMDB-43986: Consensus map of human CaSR-miniGi1 complex in detergent
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.6 Å

EMDB-43987: Local refinement map of CaSR extracellular domain (ECD) in detergent-solubilized human CaSR-miniGi1 complex
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.1 Å

EMDB-43988: Local refinement map of CaSR transmembrane domain (TMD) in detergent-solubilized human CaSR-miniGi1 complex
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.6 Å

EMDB-43989: Local refinement map of G protein in detergent-solubilized human CaSR-miniGi1 complex
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.2 Å

EMDB-43990, PDB-9ayf:
Structure of human calcium-sensing receptor in complex with Gi1 (miniGi1) protein in detergent
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.6 Å

化合物

ChemComp-NAG:
2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose / N-アセチル-β-D-グルコサミン / N-アセチルグルコサミン

ChemComp-PO4:
PHOSPHATE ION / ホスファ-ト / リン酸塩

ChemComp-CA:
Unknown entry / カルシウムジカチオン

ChemComp-9IG:
3-(2-chlorophenyl)-N-[(1R)-1-(3-methoxyphenyl)ethyl]propan-1-amine / NPS-R-568

ChemComp-Y01:
CHOLESTEROL HEMISUCCINATE / コレステリルヘミスクシナ-ト

PDB-1af7:
CHER FROM SALMONELLA TYPHIMURIUM

ChemComp-AV0:
Lauryl Maltose Neopentyl Glycol / ラウリルマルト-スネオペンチルグリコ-ル

ChemComp-CLR:
CHOLESTEROL / コレステロ-ル / コレステロール

由来
  • homo sapiens (ヒト)
  • mus musculus (ハツカネズミ)
  • lama glama (ラマ)
キーワードMEMBRANE PROTEIN (膜タンパク質) / Calcium-sensing receptor (カルシウム感知受容体) / G-protein-coupled receptor (Gタンパク質共役受容体) / G protein (Gタンパク質) / signal transduction (シグナル伝達)

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EMN文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2021年10月5日: 温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

  • 2021年のノーベル医学・生理学賞は、温度と触覚の受容体を発見したデビッド・ジュリアスとアーデム・パタポウティアンに共同で授与されました
  • EM Navigatorでは、両先駆者によるクライオEM構造データを見つけることができます

外部リンク:The Nobel Prize in Physiology or Medicine 2021 - NobelPrize.org / Structure data by Ardem Patapoutian / Structure data by David Julius

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月:コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

テキストデータのダウンロード

EM Navigatorの以下のサービスのデータが、テキスト形式でダウンロードできるようになりました。ダウンロードしたデータをExcelなどで読み込むことができます。

ページデータフォーマット
EM Navigator 検索検索結果CSV, TSV, JSON
EM Navigator 統計情報表データCSV, TSV

関連情報:EMN検索 / EMN統計情報

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EMN文献

3DEM構造データから引用されている文献のデータベース

  • EMDDBとPDBの3次元電子顕微鏡エントリから引用されている文献のデータベースです。
  • PubMedのデータを利用しています。

関連情報:EMDB / PDB / Q: EM Navigatorの情報源は? / EM Navigator / 万見文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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