BG6
Bonds
First atom | Second atom | Bond order type | Distance (experimental model) | Distance (ideal model) | Properties |
C1 | C2 | sing | 1.53Å | 1.54Å | |
C1 | O1 | sing | 1.43Å | 1.39Å | |
C1 | O5 | sing | 1.43Å | 1.44Å | |
C1 | H1 | sing | 1.09Å | 1.11Å | |
C2 | C3 | sing | 1.53Å | 1.53Å | |
C2 | O2 | sing | 1.43Å | 1.42Å | |
C2 | H2 | sing | 1.09Å | 1.12Å | |
O1 | HO1 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
O5 | C5 | sing | 1.43Å | 1.45Å | |
C3 | C4 | sing | 1.53Å | 1.53Å | |
C3 | O3 | sing | 1.43Å | 1.42Å | |
C3 | H3 | sing | 1.09Å | 1.11Å | |
O2 | HO2 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
C4 | C5 | sing | 1.53Å | 1.53Å | |
C4 | O4 | sing | 1.43Å | 1.42Å | |
C4 | H4 | sing | 1.09Å | 1.12Å | |
O3 | HO3 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
C5 | C6 | sing | 1.53Å | 1.52Å | |
C5 | H5 | sing | 1.09Å | 1.11Å | |
O4 | HO4 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
C6 | O6 | sing | 1.43Å | 1.44Å | |
C6 | H61 | sing | 1.09Å | 1.11Å | |
C6 | H62 | sing | 1.09Å | 1.12Å | |
O6 | P | sing | 1.61Å | 1.62Å | |
P | O1P | sing | 1.61Å | 1.48Å | |
P | O2P | sing | 1.61Å | 1.48Å | |
P | O3P | doub | 1.48Å | 1.47Å | |
O1P | H1O1 | sing | 0.97Å | 0.95Å | |
O2P | H2O2 | sing | 0.97Å | 0.95Å |
Angles
First atom | Second atom | Third atom | Angle (experimental model) | Angle (ideal model) |
C2 | C1 | O1 | 109.3° | 109.4° |
C2 | C1 | O5 | 110.6° | 109.8° |
C2 | C1 | H1 | 108.2° | 109.4° |
C1 | C2 | C3 | 110.7° | 109.0° |
C1 | C2 | O2 | 109.9° | 109.6° |
C1 | C2 | H2 | 108.6° | 109.6° |
O1 | C1 | O5 | 107.3° | 109.4° |
O1 | C1 | H1 | 111.4° | 109.4° |
C1 | O1 | HO1 | 109.3° | 106.8° |
O5 | C1 | H1 | 110.1° | 109.4° |
C1 | O5 | C5 | 113.2° | 107.6° |
C3 | C2 | O2 | 110.2° | 109.6° |
C3 | C2 | H2 | 108.3° | 109.5° |
C2 | C3 | C4 | 108.9° | 108.6° |
C2 | C3 | O3 | 109.9° | 109.7° |
C2 | C3 | H3 | 109.8° | 109.7° |
O2 | C2 | H2 | 109.1° | 109.5° |
C2 | O2 | HO2 | 109.9° | 106.8° |
O5 | C5 | C4 | 110.3° | 109.8° |
O5 | C5 | C6 | 107.3° | 109.5° |
O5 | C5 | H5 | 111.6° | 109.4° |
C4 | C3 | O3 | 110.2° | 109.6° |
C4 | C3 | H3 | 109.6° | 109.6° |
C3 | C4 | C5 | 109.7° | 109.0° |
C3 | C4 | O4 | 110.3° | 109.6° |
C3 | C4 | H4 | 108.9° | 109.5° |
O3 | C3 | H3 | 108.5° | 109.6° |
C3 | O3 | HO3 | 110.0° | 106.8° |
C5 | C4 | O4 | 109.7° | 109.6° |
C5 | C4 | H4 | 109.4° | 109.5° |
C4 | C5 | C6 | 112.8° | 109.4° |
C4 | C5 | H5 | 105.9° | 109.4° |
O4 | C4 | H4 | 108.9° | 109.5° |
C4 | O4 | HO4 | 110.2° | 106.9° |
C6 | C5 | H5 | 109.0° | 109.4° |
C5 | C6 | O6 | 109.7° | 109.5° |
C5 | C6 | H61 | 112.2° | 109.6° |
C5 | C6 | H62 | 112.1° | 109.5° |
O6 | C6 | H61 | 112.1° | 109.5° |
O6 | C6 | H62 | 112.1° | 109.4° |
C6 | O6 | P | 122.1° | 106.8° |
H61 | C6 | H62 | 98.3° | 109.4° |
O6 | P | O1P | 104.8° | 109.5° |
O6 | P | O2P | 98.8° | 109.5° |
O6 | P | O3P | 103.5° | 109.5° |
O1P | P | O2P | 117.8° | 109.5° |
O1P | P | O3P | 115.4° | 109.5° |
P | O1P | H1O1 | 104.7° | 106.8° |
O2P | P | O3P | 113.4° | 109.4° |
P | O2P | H2O2 | 98.8° | 106.8° |
Dihedrals
First atom | Second atom | Third atom | Fourth atom | Torsion (experimental model) | Torsion (ideal model) |
C2 | C1 | O1 | O5 | 120.0° | 120.3° |
C2 | C1 | O1 | H1 | 119.5° | 119.8° |
C2 | C1 | O5 | H1 | 119.5° | 120.1° |
C1 | C2 | C3 | O2 | 121.8° | 119.9° |
C1 | C2 | C3 | H2 | 118.9° | 119.9° |
C1 | C2 | O2 | H2 | 118.9° | 120.3° |
C2 | C1 | O1 | HO1 | 180.0° | 179.9° |
C2 | C1 | O5 | C5 | 58.2° | 67.6° |
C1 | C2 | C3 | C4 | 55.1° | 53.8° |
C1 | C2 | C3 | O3 | 175.9° | 173.6° |
C1 | C2 | C3 | H3 | 64.8° | 66.0° |
C1 | C2 | O2 | HO2 | 180.0° | 60.4° |
O1 | C1 | O5 | H1 | 121.4° | 119.8° |
O1 | C1 | C2 | C3 | 173.5° | 178.6° |
O1 | C1 | C2 | O2 | 64.5° | 58.7° |
O1 | C1 | C2 | H2 | 54.7° | 61.6° |
O1 | C1 | O5 | C5 | 177.2° | 172.3° |
O5 | C1 | C2 | C3 | 55.6° | 61.3° |
O5 | C1 | C2 | O2 | 177.6° | 178.8° |
O5 | C1 | C2 | H2 | 63.2° | 58.5° |
O5 | C1 | O1 | HO1 | 60.0° | 59.8° |
C1 | O5 | C5 | C4 | 59.8° | 67.5° |
C1 | O5 | C5 | C6 | 176.9° | 172.4° |
C1 | O5 | C5 | H5 | 57.7° | 52.5° |
H1 | C1 | C2 | C3 | 65.1° | 58.8° |
H1 | C1 | C2 | O2 | 56.9° | 61.1° |
H1 | C1 | C2 | H2 | 176.2° | 178.6° |
H1 | C1 | O1 | HO1 | 60.5° | 60.0° |
H1 | C1 | O5 | C5 | 61.4° | 52.5° |
C3 | C2 | O2 | H2 | 118.8° | 120.2° |
C2 | C3 | C4 | O3 | 120.6° | 119.9° |
C2 | C3 | C4 | H3 | 120.1° | 119.8° |
C2 | C3 | O3 | H3 | 120.1° | 120.4° |
C3 | C2 | O2 | HO2 | 57.7° | 179.9° |
C2 | C3 | C4 | C5 | 56.2° | 53.7° |
C2 | C3 | C4 | O4 | 177.1° | 173.7° |
C2 | C3 | C4 | H4 | 63.5° | 66.1° |
C2 | C3 | O3 | HO3 | 180.0° | 60.8° |
O2 | C2 | C3 | C4 | 176.9° | 173.7° |
O2 | C2 | C3 | O3 | 62.3° | 66.5° |
O2 | C2 | C3 | H3 | 57.0° | 53.9° |
H2 | C2 | C3 | C4 | 63.8° | 66.1° |
H2 | C2 | C3 | O3 | 57.0° | 53.7° |
H2 | C2 | C3 | H3 | 176.3° | 174.1° |
H2 | C2 | O2 | HO2 | 61.1° | 59.9° |
O5 | C5 | C4 | C3 | 58.2° | 61.2° |
O5 | C5 | C4 | C6 | 120.0° | 120.2° |
O5 | C5 | C4 | H5 | 120.9° | 120.1° |
O5 | C5 | C4 | O4 | 179.4° | 178.8° |
O5 | C5 | C4 | H4 | 61.2° | 58.7° |
O5 | C5 | C6 | H5 | 121.0° | 119.9° |
O5 | C5 | C6 | O6 | 51.1° | 60.0° |
O5 | C5 | C6 | H61 | 176.3° | 179.9° |
O5 | C5 | C6 | H62 | 74.2° | 60.0° |
C4 | C3 | O3 | H3 | 119.9° | 120.3° |
C3 | C4 | C5 | O4 | 121.2° | 120.0° |
C3 | C4 | C5 | H4 | 119.4° | 119.9° |
C3 | C4 | O4 | H4 | 119.4° | 120.2° |
C4 | C3 | O3 | HO3 | 60.0° | 180.0° |
C3 | C4 | C5 | C6 | 178.1° | 178.6° |
C3 | C4 | C5 | H5 | 62.7° | 58.9° |
C3 | C4 | O4 | HO4 | 180.0° | 60.4° |
O3 | C3 | C4 | C5 | 176.9° | 173.6° |
O3 | C3 | C4 | O4 | 62.2° | 66.4° |
O3 | C3 | C4 | H4 | 57.2° | 53.8° |
H3 | C3 | C4 | C5 | 63.8° | 66.1° |
H3 | C3 | C4 | O4 | 57.1° | 53.9° |
H3 | C3 | C4 | H4 | 176.5° | 174.1° |
H3 | C3 | O3 | HO3 | 60.0° | 59.6° |
C5 | C4 | O4 | H4 | 119.7° | 120.2° |
C4 | C5 | C6 | H5 | 117.3° | 119.8° |
C5 | C4 | O4 | HO4 | 59.1° | 180.0° |
C4 | C5 | C6 | O6 | 172.8° | 179.7° |
C4 | C5 | C6 | H61 | 61.9° | 59.6° |
C4 | C5 | C6 | H62 | 47.6° | 60.4° |
O4 | C4 | C5 | C6 | 60.6° | 58.6° |
O4 | C4 | C5 | H5 | 58.5° | 61.1° |
H4 | C4 | C5 | C6 | 58.7° | 61.5° |
H4 | C4 | C5 | H5 | 177.9° | 178.7° |
H4 | C4 | O4 | HO4 | 60.6° | 59.9° |
C5 | C6 | O6 | H61 | 125.3° | 120.1° |
C5 | C6 | O6 | H62 | 125.3° | 120.0° |
C5 | C6 | H61 | H62 | 118.1° | 120.0° |
C5 | C6 | O6 | P | 122.5° | 180.0° |
H5 | C5 | C6 | O6 | 69.9° | 59.9° |
H5 | C5 | C6 | H61 | 55.4° | 60.2° |
H5 | C5 | C6 | H62 | 164.9° | 179.9° |
O6 | C6 | H61 | H62 | 118.0° | 119.9° |
C6 | O6 | P | O1P | 31.5° | 180.0° |
C6 | O6 | P | O2P | 153.4° | 60.0° |
C6 | O6 | P | O3P | 89.8° | 60.0° |
H61 | C6 | O6 | P | 2.8° | 59.9° |
H62 | C6 | O6 | P | 112.2° | 60.0° |
O6 | P | O1P | O2P | 108.5° | 120.0° |
O6 | P | O1P | O3P | 113.1° | 120.0° |
O6 | P | O2P | O3P | 108.9° | 120.0° |
O6 | P | O1P | H1O1 | 179.9° | 180.0° |
O6 | P | O2P | H2O2 | 179.9° | 60.0° |
O1P | P | O2P | O3P | 139.2° | 120.0° |
O1P | P | O2P | H2O2 | 68.2° | 60.0° |
O2P | P | O1P | H1O1 | 71.6° | 60.0° |
O3P | P | O1P | H1O1 | 66.8° | 59.9° |
O3P | P | O2P | H2O2 | 71.0° | 180.0° |