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構造ビューアでスケールを表示 - 万見(JSmol)

構造ビューアJSmolで単位講師の軸を表示し、 目盛りをつけることでものさし(スケール)相当のものを表示することができます。 万見での表示例を以下に示します。

1. 万見にアクセス

万見にアクセスします。

2. 構造ビューアをJSmolに変更

画面右のメニューパネルの一番下にある「オプション」をクリック。

万見 - 生体分子構造を簡単に閲覧するためのサービス

構造ビューアの分子を「Molmil」から「Jmol/JSmol」に変更。

表示ソフトをJmol/JSmolに変更 - 万見

3. 構造を読み込み構造ビューアで開く

任意の構造を読み込む(例:PDB-1crn)

構造を選択 - 万見

4. コンソールを開く

分子表示エリア内で右クリックするとポップアップメニューが出ます。このメニューの「コンソール」をクリック。

JSmolポップアップメニューを表示 - 万見

JSmolコマンドで目盛り付き軸を表示 - 万見

コマンドウインドウが枠外に出ていたらタイトルバーをドラッグしてウインドウを移動する。

JSmolコマンドウインドウを移動 - 万見

5. 以下のコマンドを入力し「RUN」ボタンをクリック
axes on; axes unitcell; axes ticks x {10,5,1} format ["%0.0f"]; axes lables "X(Å)" "" ""

JSmolコマンドを入力 - 万見

6. 「close」をクリックしてコマンドウインドウを閉じる

JSmolコマンドウインドウを閉じる - 万見

JSmolでスケールを表示したところ - 万見


作成日: 2018-02-07 (最終更新日: more than 1 year ago)2018-02-07

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件を2026-02-04に公開中

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