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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 3zlq | ||||||
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タイトル | BACE2 XAPERONE COMPLEX | ||||||
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![]() | HYDROLASE/IMMUNE SYSTEM / HYDROLASE-IMMUNE SYSTEM COMPLEX | ||||||
機能・相同性 | ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() | ||||||
![]() | Kuglstatter, A. / Stihle, M. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Beta-Secretase (Bace1) Inhibitors with High in Vivo Efficacy Suitable for Clinical Evaluation in Alzheimer'S Disease. 著者: Hilpert, H. / Guba, W. / Woltering, T.J. / Wostl, W. / Pinard, E. / Mauser, H. / Mayweg, A.V. / Rogers-Evans, M. / Humm, R. / Krummenacher, D. / Muser, T. / Schnider, C. / Jacobsen, H. / ...著者: Hilpert, H. / Guba, W. / Woltering, T.J. / Wostl, W. / Pinard, E. / Mauser, H. / Mayweg, A.V. / Rogers-Evans, M. / Humm, R. / Krummenacher, D. / Muser, T. / Schnider, C. / Jacobsen, H. / Ozmen, L. / Bergadano, A. / Banner, D.W. / Hochstrasser, R. / Kuglstatter, A. / David-Pierson, P. / Fischer, H. / Polara, A. / Narquizian, R. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 362.7 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 309.9 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | ![]() 分子量: 42047.355 Da / 分子数: 2 / 断片: EXTRACELLULAR, RESIDUES 75-460 / 変異: YES / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() #2: 抗体 | 分子量: 13152.520 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() #3: 化合物 | #4: 水 | ChemComp-HOH / | ![]() 配列の詳細 | THE PDB FILE IS NUMBERED AFTER PDB-ENTRY 2EWY WHICH HAS NUMBERS 62 LESS THAN THE DATA BANK SEQUENCE. ...THE PDB FILE IS NUMBERED AFTER PDB-ENTRY 2EWY WHICH HAS NUMBERS 62 LESS THAN THE DATA BANK SEQUENCE. THE MUTATION HERE IS E269A IN THE PDB FILE AND E331A IN THE DATA BANK SEQUENCE. ANTIBODY RAISED IN LLAMA AGAINST BACE2. V(HH) EXPRESSED IN E. COLI. WITH 6HIS AND EPEA TAG. | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.3 Å3/Da / 溶媒含有率: 46.54 % / 解説: NONE |
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結晶化![]() | pH: 7 / 詳細: 25% PEG1500, pH 7.0 |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: DECTRIS PILATUS 6M / 検出器: PIXEL / 日付: 2012年6月20日 |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長![]() |
反射 | 解像度: 1.98→46.26 Å / Num. obs: 67998 / % possible obs: 98.5 % / Observed criterion σ(I): -3 / 冗長度: 3 % / Rmerge(I) obs: 0.1 / Net I/σ(I): 7.2 |
反射 シェル | 解像度: 1.98→2.09 Å / 冗長度: 3 % / Rmerge(I) obs: 0.88 / Mean I/σ(I) obs: 1.2 / % possible all: 98.4 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法![]() 開始モデル: NONE 解像度: 2.1→46.26 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.919 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.874 / SU B: 15.407 / SU ML: 0.199 / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R: 0.343 / ESU R Free: 0.261 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS.
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溶媒の処理 | イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: MASK | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | Biso mean: 29.83 Å2
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.1→46.26 Å
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拘束条件 |
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