+データを開く
-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2fow | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
タイトル | THE RNA BINDING DOMAIN OF RIBOSOMAL PROTEIN L11: THREE-DIMENSIONAL STRUCTURE OF THE RNA-BOUND FORM OF THE PROTEIN, NMR, 26 STRUCTURES | ||||||
要素 | RIBOSOMAL PROTEIN L11 | ||||||
キーワード | RIBOSOME (リボソーム) / PROTEIN:RNA / THIOSTREPTON (チオストレプトン) | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 large ribosomal subunit rRNA binding / リボソーム / structural constituent of ribosome / ribonucleoprotein complex / 翻訳 (生物学) / DNA binding 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Geobacillus stearothermophilus (Bacillus stearothermophilus) | ||||||
手法 | 溶液NMR / SUBSTRUCTURE DISTANCE GEOMETRY, SIMULATING ANNEALING | ||||||
データ登録者 | Hinck, A.P. / Markus, M.A. / Huang, S. / Grzesiek, S. / Kustanovich, I. / Draper, D.E. / Torchia, D.A. | ||||||
引用 | ジャーナル: J.Mol.Biol. / 年: 1997 タイトル: The RNA binding domain of ribosomal protein L11: three-dimensional structure of the RNA-bound form of the protein and its interaction with 23 S rRNA. 著者: Hinck, A.P. / Markus, M.A. / Huang, S. / Grzesiek, S. / Kustonovich, I. / Draper, D.E. / Torchia, D.A. | ||||||
履歴 |
|
-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
---|
-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 2fow.cif.gz | 587.4 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
---|---|---|---|---|
PDB形式 | pdb2fow.ent.gz | 491.8 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 2fow.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/fo/2fow ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/fo/2fow | HTTPS FTP |
---|
-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
| |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 |
| |||||||||
NMR アンサンブル |
|
-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 8152.554 Da / 分子数: 1 / 断片: C-TERMINAL DOMAIN, 75 RESIDUES / 変異: F1M / 由来タイプ: 組換発現 詳細: STRUCTURE OF THE PROTEIN IN THIS ENTRY WAS DETERMINED AS A 1\:1 COMPLEX WITH ITS TARGET RNA OF 58 NUCLEOTIDES, BASES 1051 - 1108 OF THE E. COLI SEQUENCE 由来: (組換発現) Geobacillus stearothermophilus (Bacillus stearothermophilus) 細胞株: BL21 / プラスミド: BL21 / 生物種 (発現宿主): Escherichia coli / 発現宿主: Escherichia coli BL21(DE3) (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21 (DE3) / 参照: UniProt: P56210 |
---|
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR |
---|
-試料調製
試料状態 | pH: 6.1 / 温度: 320 K |
---|---|
結晶化 | *PLUS 手法: その他 / 詳細: NMR |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター |
|
---|
-解析
ソフトウェア |
| ||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NMR software |
| ||||||||||||
精密化 | 手法: SUBSTRUCTURE DISTANCE GEOMETRY, SIMULATING ANNEALING ソフトェア番号: 1 詳細: SUBSTRUCTURE DISTANCE GEOMETRY/ SIMULATED ANNEALING PROTOCOL | ||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: NOE VIOL < 0.3 ANGSTROMS DIHEDRAL VIOL < 3 DEGREES; 3JHNHA COUPLING VIOLATED < 1.5 HZ 計算したコンフォーマーの数: 50 / 登録したコンフォーマーの数: 26 |