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Yorodumi- PDB-5oeb: Structure of large terminase from the thermophilic bacteriophage ... -
+Open data
-Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 5oeb | |||||||||
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Title | Structure of large terminase from the thermophilic bacteriophage D6E in complex with ADP (Crystal form 3) | |||||||||
Components | Large subunit terminase | |||||||||
Keywords | VIRAL PROTEIN / large terminase | |||||||||
Function / homology | Bacteriophage terminase, large subunit / Terminase large subunit, T4likevirus-type, N-terminal / nucleotide binding / P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase / metal ion binding / ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE / Large subunit terminase Function and homology information | |||||||||
Biological species | Deep-sea thermophilic phage D6E (virus) | |||||||||
Method | X-RAY DIFFRACTION / SYNCHROTRON / MOLECULAR REPLACEMENT / Resolution: 3.1 Å | |||||||||
Authors | Xu, R.G. / Jenkins, H.T. / Greive, S.J. / Antson, A.A. | |||||||||
Funding support | United Kingdom, 2items
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Citation | Journal: Nucleic Acids Res. / Year: 2017 Title: Structure of the large terminase from a hyperthermophilic virus reveals a unique mechanism for oligomerization and ATP hydrolysis. Authors: Xu, R.G. / Jenkins, H.T. / Antson, A.A. / Greive, S.J. | |||||||||
History |
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-Structure visualization
Structure viewer | Molecule: MolmilJmol/JSmol |
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-Downloads & links
-Download
PDBx/mmCIF format | 5oeb.cif.gz | 485.2 KB | Display | PDBx/mmCIF format |
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PDB format | pdb5oeb.ent.gz | 394.4 KB | Display | PDB format |
PDBx/mmJSON format | 5oeb.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
Others | Other downloads |
-Validation report
Summary document | 5oeb_validation.pdf.gz | 760.1 KB | Display | wwPDB validaton report |
---|---|---|---|---|
Full document | 5oeb_full_validation.pdf.gz | 766.6 KB | Display | |
Data in XML | 5oeb_validation.xml.gz | 78.2 KB | Display | |
Data in CIF | 5oeb_validation.cif.gz | 107 KB | Display | |
Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/oe/5oeb ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/oe/5oeb | HTTPS FTP |
-Related structure data
-Links
-Assembly
Deposited unit |
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Unit cell |
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Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS domain:
NCS domain segments: Component-ID: _ / End auth comp-ID: GLY / End label comp-ID: GLY / Refine code: _
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