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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 7d14 | ||||||
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タイトル | Mouse KCC2 | ||||||
要素 | Solute carrier family 12 member 5 | ||||||
キーワード | MEMBRANE PROTEIN (膜タンパク質) / transporter (運搬体タンパク質) | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 Cation-coupled Chloride cotransporters / ammonium transmembrane transport => GO:0072488 / thermosensory behavior / intracellular pH reduction / potassium:chloride symporter activity / hypotonic response / intracellular chloride ion homeostasis / response to xenobiotic stimulus => GO:0009410 / intracellular monoatomic ion homeostasis / chloride ion homeostasis ...Cation-coupled Chloride cotransporters / ammonium transmembrane transport => GO:0072488 / thermosensory behavior / intracellular pH reduction / potassium:chloride symporter activity / hypotonic response / intracellular chloride ion homeostasis / response to xenobiotic stimulus => GO:0009410 / intracellular monoatomic ion homeostasis / chloride ion homeostasis / ammonium transmembrane transporter activity / dendritic spine development / potassium ion homeostasis / cell volume homeostasis / chloride transport / chloride transmembrane transporter activity / potassium ion import across plasma membrane / plasma membrane => GO:0005886 / monoatomic ion transport / chloride transmembrane transport / dendrite membrane / dendritic shaft / 学習 / cell periphery / multicellular organism growth / potassium ion transport / perikaryon / chemical synaptic transmission / membrane => GO:0016020 / neuron projection / neuronal cell body / シナプス / protein kinase binding / 細胞膜 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Mus musculus (ハツカネズミ) | ||||||
手法 | 電子顕微鏡法 / 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.8 Å | ||||||
データ登録者 | Zhang, S. / Yang, M. | ||||||
引用 | ジャーナル: Commun Biol / 年: 2021 タイトル: The structural basis of function and regulation of neuronal cotransporters NKCC1 and KCC2. 著者: Sensen Zhang / Jun Zhou / Yuebin Zhang / Tianya Liu / Perrine Friedel / Wei Zhuo / Suma Somasekharan / Kasturi Roy / Laixing Zhang / Yang Liu / Xianbin Meng / Haiteng Deng / Wenwen Zeng / ...著者: Sensen Zhang / Jun Zhou / Yuebin Zhang / Tianya Liu / Perrine Friedel / Wei Zhuo / Suma Somasekharan / Kasturi Roy / Laixing Zhang / Yang Liu / Xianbin Meng / Haiteng Deng / Wenwen Zeng / Guohui Li / Biff Forbush / Maojun Yang / 要旨: NKCC and KCC transporters mediate coupled transport of Na+K+Cl and K+Cl across the plasma membrane, thus regulating cell Cl concentration and cell volume and playing critical roles in transepithelial ...NKCC and KCC transporters mediate coupled transport of Na+K+Cl and K+Cl across the plasma membrane, thus regulating cell Cl concentration and cell volume and playing critical roles in transepithelial salt and water transport and in neuronal excitability. The function of these transporters has been intensively studied, but a mechanistic understanding has awaited structural studies of the transporters. Here, we present the cryo-electron microscopy (cryo-EM) structures of the two neuronal cation-chloride cotransporters human NKCC1 (SLC12A2) and mouse KCC2 (SLC12A5), along with computational analysis and functional characterization. These structures highlight essential residues in ion transport and allow us to propose mechanisms by which phosphorylation regulates transport activity. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
ムービー |
ムービービューア |
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構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 7d14.cif.gz | 280.3 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb7d14.ent.gz | 220.3 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 7d14.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/d1/7d14 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/d1/7d14 | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 126402.328 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Mus musculus (ハツカネズミ) / 遺伝子: Slc12a5, Kcc2, Kiaa1176 / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q91V14 |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 電子顕微鏡法 |
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EM実験 | 試料の集合状態: PARTICLE / 3次元再構成法: 単粒子再構成法 |
-試料調製
構成要素 | 名称: mouse KCC2 / タイプ: ORGANELLE OR CELLULAR COMPONENT / Entity ID: all / 由来: RECOMBINANT |
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由来(天然) | 生物種: Mus musculus (ハツカネズミ) |
由来(組換発現) | 生物種: Homo sapiens (ヒト) |
緩衝液 | pH: 7.4 |
試料 | 包埋: NO / シャドウイング: NO / 染色: NO / 凍結: YES |
急速凍結 | 凍結剤: ETHANE |
-電子顕微鏡撮影
実験機器 | モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |
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顕微鏡 | モデル: FEI TITAN KRIOS |
電子銃 | 電子線源: FIELD EMISSION GUN / 加速電圧: 300 kV / 照射モード: FLOOD BEAM |
電子レンズ | モード: BRIGHT FIELDBright-field microscopy |
撮影 | 電子線照射量: 50 e/Å2 フィルム・検出器のモデル: GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k) |
-解析
CTF補正 | タイプ: PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION |
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3次元再構成 | 解像度: 3.8 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 粒子像の数: 66000 / 対称性のタイプ: POINT |