登録情報 | データベース: PDB / ID: 3kvr |
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タイトル | Trapping of an oxocarbenium ion intermediate in UP crystals |
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要素 | Uridine phosphorylase |
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キーワード | TRANSFERASE / Oxocarbenium Ion / Glycal / Pyrimidine Salvage / Uridine Phosphorylase |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
uridine catabolic process / uridine phosphorylase / nucleotide catabolic process / uridine phosphorylase activity / UMP salvage / cytosol類似検索 - 分子機能 Uridine phosphorylase, eukaryotic / Nucleoside phosphorylase, conserved site / Purine and other phosphorylases family 1 signature. / Nucleoside phosphorylase domain / Nucleoside phosphorylase domain / Phosphorylase superfamily / Nucleoside phosphorylase superfamily / Rossmann fold / 3-Layer(aba) Sandwich / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 2,5-anhydro-4-deoxy-D-erythro-pent-4-enitol / 5-FLUOROURACIL / Uridine phosphorylase類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Bos taurus (ウシ) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.6 Å |
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データ登録者 | Paul, D. / O'Leary, S. / Rajashankar, K. / Bu, W. / Toms, A. / Settembre, E. / Sanders, J. / Begley, T.P. / Ealick, S.E. |
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引用 | ジャーナル: Biochemistry / 年: 2010 タイトル: Glycal formation in crystals of uridine phosphorylase. 著者: Paul, D. / O'Leary, S.E. / Rajashankar, K. / Bu, W. / Toms, A. / Settembre, E.C. / Sanders, J.M. / Begley, T.P. / Ealick, S.E. |
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履歴 | 登録 | 2009年11月30日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2010年4月28日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2011年7月13日 | Group: Version format compliance |
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改定 2.0 | 2020年4月22日 | Group: Atomic model / Data collection / カテゴリ: atom_site / chem_comp Item: _atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x ..._atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x / _atom_site.Cartn_y / _atom_site.Cartn_z / _atom_site.auth_atom_id / _atom_site.label_atom_id / _chem_comp.type |
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改定 2.1 | 2020年7月29日 | Group: Derived calculations / カテゴリ: struct_site / struct_site_gen / 解説: Carbohydrate remediation / Provider: repository / タイプ: Remediation |
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改定 2.2 | 2024年2月21日 | Group: Data collection / Database references / カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession |
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