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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2v31 | ||||||
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タイトル | Structure of First Catalytic Cysteine Half-domain of mouse ubiquitin- activating enzyme | ||||||
要素 | UBIQUITIN-ACTIVATING ENZYME E1 X | ||||||
キーワード | LIGASE (リガーゼ) / PHOSPHORYLATION (リン酸化) / CATALYTIC DOMAIN / HETERONUCLEAR NMR / FIRST CATALYTIC CYSTEINE HALF-DOMAIN / E1 PROTEIN / ATP-BINDING / UBIQUITINATION (ユビキチン) / NUCLEOTIDE-BINDING / UBL CONJUGATION PATHWAY | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 ユビキチン活性化酵素 / Synthesis of active ubiquitin: roles of E1 and E2 enzymes / ubiquitin activating enzyme activity / 接着斑 / rough endoplasmic reticulum membrane / Antigen processing: Ubiquitination & Proteasome degradation / ヘテロクロマチン / ubiquitin-dependent protein catabolic process / protein ubiquitination / endosome membrane ...ユビキチン活性化酵素 / Synthesis of active ubiquitin: roles of E1 and E2 enzymes / ubiquitin activating enzyme activity / 接着斑 / rough endoplasmic reticulum membrane / Antigen processing: Ubiquitination & Proteasome degradation / ヘテロクロマチン / ubiquitin-dependent protein catabolic process / protein ubiquitination / endosome membrane / lysosomal membrane / DNA damage response / ミトコンドリア / 核質 / ATP binding / 細胞核 / 細胞質基質 / 細胞質 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | MUS MUSCULUS (ハツカネズミ) | ||||||
手法 | 溶液NMR / CYANA | ||||||
データ登録者 | Jaremko, L. / Jaremko, M. / Wojciechowski, W. / Filipek, R. / Szczepanowski, R.H. / Bochtler, M. / Zhukov, I. | ||||||
引用 | ジャーナル: To be Published タイトル: Structure of First Catalytic Cysteine Half-Domain of Mouse Ubiquitin-Activating Enzyme 著者: Jaremko, L. / Jaremko, M. / Wojciechowski, W. / Filipek, R. / Szczepanowski, R.H. / Bohtler, M. / Zhukov, I. #1: ジャーナル: J.Biomol.NMR / 年: 2006 タイトル: NMR Assignment of Structurally Uncharacterised Fragment of Recombinant Mouse Ubiquitin-Activating Enzyme 著者: Jaremko, L. / Jaremko, M. / Filipek, R. / Wojciechowski, W. / Szczepanowski, R.H. / Bochtler, M. / Zhukov, I. | ||||||
履歴 |
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Remark 650 | HELIX DETERMINATION METHOD: AUTHOR PROVIDED. | ||||||
Remark 700 | SHEET DETERMINATION METHOD: AUTHOR PROVIDED. |
-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 2v31.cif.gz | 659.6 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb2v31.ent.gz | 549.4 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 2v31.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/v3/2v31 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/v3/2v31 | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
関連構造データ | |
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類似構造データ | |
その他のデータベース |
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 12195.825 Da / 分子数: 1 断片: FIRST CATALYTIC CYSTEINE HALF-DOMAIN, RESIDUES 203-312 由来タイプ: 天然 / 詳細: TWO ADDITIONAL RESIDUES EF ON N-TERMINI / 由来: (天然) MUS MUSCULUS (ハツカネズミ) / 参照: UniProt: Q02053 |
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配列の詳細 | EXTRA EF ON N-TERMINI |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR |
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NMR実験の詳細 | Text: NONE |
-試料調製
詳細 | 内容: 90% H2O/10% D2O |
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試料状態 | イオン強度: 50 mM / pH: 6.5 / 温度: 287.0 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Varian UNITYPLUS / 製造業者: Varian / モデル: UNITYPLUS / 磁場強度: 500 MHz |
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-解析
NMR software |
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精密化 | 手法: CYANA / ソフトェア番号: 1 | |||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: LOWEST ENERGY / 計算したコンフォーマーの数: 200 / 登録したコンフォーマーの数: 20 |