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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2mh8 | ||||||
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タイトル | GA-79-MBP cs-rosetta structures | ||||||
要素 | GA-79-MBP, maltose binding protein | ||||||
キーワード | PROTEIN BINDING (タンパク質) / MBP / maltose binding protein / GA / human serum albumin binding protein | ||||||
機能・相同性 | Albumin-binding domain / GA-like domain / GA-like domain / Immunoglobulin/albumin-binding domain superfamily / : / Helicase, Ruva Protein; domain 3 / Orthogonal Bundle / Mainly Alpha / GA-79-MBP, maltose binding protein 機能・相同性情報 | ||||||
生物種 | Streptococcus dysgalactiae (バクテリア) | ||||||
手法 | 溶液NMR / simulated annealing | ||||||
Model details | lowest energy, model1 | ||||||
データ登録者 | He, Y. / Chen, Y. / Porter, L. / Bryan, P. / Orban, J. | ||||||
引用 | ジャーナル: Biophys.J. / 年: 2015 タイトル: Subdomain interactions foster the design of two protein pairs with 80% sequence identity but different folds. 著者: Porter, L.L. / He, Y. / Chen, Y. / Orban, J. / Bryan, P.N. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 2mh8.cif.gz | 175.7 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb2mh8.ent.gz | 152.2 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 2mh8.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/mh/2mh8 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/mh/2mh8 | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
類似構造データ | |
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その他のデータベース |
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 6312.251 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) Streptococcus dysgalactiae (バクテリア) 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: A0A0J9X1W7*PLUS |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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-試料調製
詳細 | 内容: 0.27 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] GA-79-MBP, 100 mM potassium phosphate, 95% H2O/5% D2O 溶媒系: 95% H2O/5% D2O | ||||||||||||
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試料 |
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試料状態 | イオン強度: 0.1 / pH: 7.0 / 圧: ambient / 温度: 283 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター |
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-解析
NMR software |
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精密化 | 手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 1 | |||||||||||||||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: lowest energy | |||||||||||||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 3000 / 登録したコンフォーマーの数: 10 |