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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2mgx | ||||||
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タイトル | NMR structure of SRA1p C-terminal domain | ||||||
要素 | Steroid receptor RNA activator 1 | ||||||
キーワード | UNKNOWN FUNCTION | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 steroid receptor RNA activator RNA binding / SCAR complex / negative regulation of myoblast differentiation / 細胞結合 / cellular response to estrogen stimulus / regulation of mitotic cell cycle / nuclear receptor coactivator activity / microtubule cytoskeleton / regulation of apoptotic process / 細胞分化 ...steroid receptor RNA activator RNA binding / SCAR complex / negative regulation of myoblast differentiation / 細胞結合 / cellular response to estrogen stimulus / regulation of mitotic cell cycle / nuclear receptor coactivator activity / microtubule cytoskeleton / regulation of apoptotic process / 細胞分化 / transcription coactivator activity / ribonucleoprotein complex / apoptotic process / 核質 / 細胞核 / 細胞膜 / 細胞質基質 / 細胞質 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Homo sapiens (ヒト) | ||||||
手法 | 溶液NMR / simulated annealing | ||||||
データ登録者 | Bilinovich, S.M. / Davis, C.M. / Morris, D.L. / Ray, L.A. / Prokop, J.W. / Buchan, G.J. / Leeper, T.C. | ||||||
引用 | ジャーナル: J.Mol.Biol. / 年: 2014 タイトル: The C-Terminal Domain of SRA1p Has a Fold More Similar to PRP18 than to an RRM and Does Not Directly Bind to the SRA1 RNA STR7 Region. 著者: Bilinovich, S.M. / Davis, C.M. / Morris, D.L. / Ray, L.A. / Prokop, J.W. / Buchan, G.J. / Leeper, T.C. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 2mgx.cif.gz | 674.2 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb2mgx.ent.gz | 573.3 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 2mgx.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/mg/2mgx ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/mg/2mgx | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
類似構造データ | |
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その他のデータベース |
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 14769.751 Da / 分子数: 1 / 断片: C-terminal domain (UNP residues 107-236) / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: SRA1, PP7684 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: Q9HD15 |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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-試料調製
詳細 |
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試料 |
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試料状態 | イオン強度: 100 / pH: 7.4 / 圧: ambient / 温度: 298 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Varian INOVA / 製造業者: Varian / モデル: INOVA / 磁場強度: 750 MHz |
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-解析
NMR software |
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精密化 | 手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 1 | ||||||||||||||||||||
NMR constraints | NOE constraints total: 2036 / NOE intraresidue total count: 985 / NOE long range total count: 213 / NOE medium range total count: 120 / NOE sequential total count: 385 / Protein phi angle constraints total count: 92 / Protein psi angle constraints total count: 92 | ||||||||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: lowest energy | ||||||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 30 / 登録したコンフォーマーの数: 15 |